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3m9s

Crystal structure of respiratory complex I from Thermus thermophilus

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 220.3 Å Quality: EXCELLENT
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NADH-quinone oxidoreductase subunit 1

物种未注明

UniProt Q56222

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白拷贝数一致 链 1； UniProt 1–438 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit C × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit B × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit I × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunits 7, 10 and 11 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；16% PEG 4000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 2.04 mM n-octyl- -maltoside fluorinated, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 4.50 Å
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–438 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit C × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit B × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit I × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunits 7, 10 and 11 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；16% PEG 4000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 2.04 mM n-octyl- -maltoside fluorinated, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 4.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3M9S Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 1 1–438（438 aa） 片段：Hydrophilic domain
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–438（438 aa） 片段：Hydrophilic domain
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 J 1–438（438 aa） 片段：Hydrophilic domain
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 S 1–438（438 aa） 片段：Hydrophilic domain
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2YBB Fitted model for bovine mitochondrial supercomplex I1III2IV1 by single particle cryo-EM (EMD-1876) 提交 2011-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric
链 1 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 4 CA CALCIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 5 SMA STIGMATELLIN A × 2 UQ1 UBIQUINONE-1 × 2 HEC HEME C × 2 CDL CARDIOLIPIN × 4 HEA HEME-A × 2 CU COPPER (II) ION × 3 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE；pH 7.7；10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 70, TEMPERATURE- 95, INSTRUMENT- CUSTOM-MADE HAND PLUNGER, METHOD- ONE- SIDED BLOTTING FOR 26 - 30 SECONDS BEFORE PLUNGING, DETAILS- SAMPLE WAS ADSORBED TO CARBON FILM FOR 30 SECONDS BEFORE BLOTTING
分辨率 19.00 Å
3I9V Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/ASU 提交 2009-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 1 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 MN MANGANESE (II) ION × 7 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M MnCl2, 6% PEG4000, 2.5% PEG400, 20 mM NAD+, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
3I9V Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/ASU 提交 2009-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 MN MANGANESE (II) ION × 5 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M MnCl2, 6% PEG4000, 2.5% PEG400, 20 mM NAD+, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
3IAM Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, reduced, 2 mol/ASU, with bound NADH 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 1 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.05 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 7% PEG4000, 3 mM NADH, 5 mM sodium dithionite, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.262
3IAM Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, reduced, 2 mol/ASU, with bound NADH 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.05 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 7% PEG4000, 3 mM NADH, 5 mM sodium dithionite, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.262
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 1 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 J 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 S 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
4HEA Crystal structure of the entire respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2012-10-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 1 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.239
4HEA Crystal structure of the entire respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2012-10-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 B 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.239
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 1 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 B 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 1 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 B 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 1 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 B 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 1 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 B 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 1 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 B 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 1 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 B 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6ZIY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, major state 提交 2020-06-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 1 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6ZJL Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, major state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 1 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6ZJN Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 1 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
6ZJY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 1 1–438（438 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å

共 16 个其他 PDB 条目、31 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 NQO1_THET8
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 1； PDB构建体 1–438； UniProt 1–438 作者链 A； PDB构建体 1–438； UniProt 1–438

NADH-quinone oxidoreductase subunit 2

物种未注明

UniProt Q56221

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白拷贝数一致 链 2； UniProt 1–181 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit C × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit B × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit I × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunits 7, 10 and 11 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；16% PEG 4000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 2.04 mM n-octyl- -maltoside fluorinated, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 4.50 Å
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 1–181 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit C × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit B × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit I × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunits 7, 10 and 11 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；16% PEG 4000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 2.04 mM n-octyl- -maltoside fluorinated, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 4.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3M9S Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 2 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 K 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 T 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2YBB Fitted model for bovine mitochondrial supercomplex I1III2IV1 by single particle cryo-EM (EMD-1876) 提交 2011-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric
链 2 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 4 CA CALCIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 5 SMA STIGMATELLIN A × 2 UQ1 UBIQUINONE-1 × 2 HEC HEME C × 2 CDL CARDIOLIPIN × 4 HEA HEME-A × 2 CU COPPER (II) ION × 3 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE；pH 7.7；10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 70, TEMPERATURE- 95, INSTRUMENT- CUSTOM-MADE HAND PLUNGER, METHOD- ONE- SIDED BLOTTING FOR 26 - 30 SECONDS BEFORE PLUNGING, DETAILS- SAMPLE WAS ADSORBED TO CARBON FILM FOR 30 SECONDS BEFORE BLOTTING
分辨率 19.00 Å
3I9V Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/ASU 提交 2009-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 2 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 MN MANGANESE (II) ION × 7 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M MnCl2, 6% PEG4000, 2.5% PEG400, 20 mM NAD+, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
3I9V Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/ASU 提交 2009-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 MN MANGANESE (II) ION × 5 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M MnCl2, 6% PEG4000, 2.5% PEG400, 20 mM NAD+, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
3IAM Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, reduced, 2 mol/ASU, with bound NADH 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 2 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.05 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 7% PEG4000, 3 mM NADH, 5 mM sodium dithionite, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.262
3IAM Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, reduced, 2 mol/ASU, with bound NADH 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.05 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 7% PEG4000, 3 mM NADH, 5 mM sodium dithionite, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.262
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 2 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 K 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 T 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
4HEA Crystal structure of the entire respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2012-10-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 2 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.239
4HEA Crystal structure of the entire respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2012-10-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 C 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.239
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 2 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 C 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 2 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 C 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 2 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 C 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 2 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 C 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 2 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 C 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 2 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 C 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6ZIY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, major state 提交 2020-06-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 2 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6ZJL Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, major state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 2 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6ZJN Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 2 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
6ZJY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 2 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å

共 16 个其他 PDB 条目、31 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NQO2_THET8
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 2； PDB构建体 1–181； UniProt 1–181 作者链 B； PDB构建体 1–181； UniProt 1–181

NADH-quinone oxidoreductase subunit 3

物种未注明

UniProt Q56223

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白拷贝数一致 链 3； UniProt 1–783 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit C × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit B × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit I × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunits 7, 10 and 11 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；16% PEG 4000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 2.04 mM n-octyl- -maltoside fluorinated, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 4.50 Å
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 1–783 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit C × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit B × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit I × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunits 7, 10 and 11 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；16% PEG 4000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 2.04 mM n-octyl- -maltoside fluorinated, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 4.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3M9S Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 3 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 L 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 U 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2YBB Fitted model for bovine mitochondrial supercomplex I1III2IV1 by single particle cryo-EM (EMD-1876) 提交 2011-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric
链 3 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 4 CA CALCIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 5 SMA STIGMATELLIN A × 2 UQ1 UBIQUINONE-1 × 2 HEC HEME C × 2 CDL CARDIOLIPIN × 4 HEA HEME-A × 2 CU COPPER (II) ION × 3 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE；pH 7.7；10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 70, TEMPERATURE- 95, INSTRUMENT- CUSTOM-MADE HAND PLUNGER, METHOD- ONE- SIDED BLOTTING FOR 26 - 30 SECONDS BEFORE PLUNGING, DETAILS- SAMPLE WAS ADSORBED TO CARBON FILM FOR 30 SECONDS BEFORE BLOTTING
分辨率 19.00 Å
3I9V Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/ASU 提交 2009-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 3 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 MN MANGANESE (II) ION × 7 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M MnCl2, 6% PEG4000, 2.5% PEG400, 20 mM NAD+, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
3I9V Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/ASU 提交 2009-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 MN MANGANESE (II) ION × 5 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M MnCl2, 6% PEG4000, 2.5% PEG400, 20 mM NAD+, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
3IAM Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, reduced, 2 mol/ASU, with bound NADH 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 3 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.05 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 7% PEG4000, 3 mM NADH, 5 mM sodium dithionite, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.262
3IAM Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, reduced, 2 mol/ASU, with bound NADH 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.05 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 7% PEG4000, 3 mM NADH, 5 mM sodium dithionite, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.262
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 3 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 L 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 U 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
4HEA Crystal structure of the entire respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2012-10-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 3 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.239
4HEA Crystal structure of the entire respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2012-10-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.239
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 3 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 3 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 3 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 3 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 3 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 3 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6ZIY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, major state 提交 2020-06-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 3 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6ZJL Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, major state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 3 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6ZJN Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 3 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
6ZJY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 3 1–783（783 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å

共 16 个其他 PDB 条目、31 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NQO3_THET8
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 3； PDB构建体 1–783； UniProt 1–783 作者链 C； PDB构建体 1–783； UniProt 1–783

NADH-quinone oxidoreductase subunit 4

物种未注明

UniProt Q56220

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白拷贝数一致 链 4； UniProt 1–409 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit C × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit B × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit I × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunits 7, 10 and 11 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；16% PEG 4000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 2.04 mM n-octyl- -maltoside fluorinated, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 4.50 Å
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白拷贝数一致 链 D； UniProt 1–409 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit C × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit B × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit I × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunits 7, 10 and 11 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；16% PEG 4000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 2.04 mM n-octyl- -maltoside fluorinated, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 4.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3M9S Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 4 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 D 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 M 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 V 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2YBB Fitted model for bovine mitochondrial supercomplex I1III2IV1 by single particle cryo-EM (EMD-1876) 提交 2011-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric
链 4 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 4 CA CALCIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 5 SMA STIGMATELLIN A × 2 UQ1 UBIQUINONE-1 × 2 HEC HEME C × 2 CDL CARDIOLIPIN × 4 HEA HEME-A × 2 CU COPPER (II) ION × 3 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE；pH 7.7；10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 70, TEMPERATURE- 95, INSTRUMENT- CUSTOM-MADE HAND PLUNGER, METHOD- ONE- SIDED BLOTTING FOR 26 - 30 SECONDS BEFORE PLUNGING, DETAILS- SAMPLE WAS ADSORBED TO CARBON FILM FOR 30 SECONDS BEFORE BLOTTING
分辨率 19.00 Å
3I9V Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/ASU 提交 2009-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 4 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 MN MANGANESE (II) ION × 7 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M MnCl2, 6% PEG4000, 2.5% PEG400, 20 mM NAD+, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
3I9V Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/ASU 提交 2009-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 D 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 MN MANGANESE (II) ION × 5 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M MnCl2, 6% PEG4000, 2.5% PEG400, 20 mM NAD+, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
3IAM Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, reduced, 2 mol/ASU, with bound NADH 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 4 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.05 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 7% PEG4000, 3 mM NADH, 5 mM sodium dithionite, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.262
3IAM Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, reduced, 2 mol/ASU, with bound NADH 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 D 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.05 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 7% PEG4000, 3 mM NADH, 5 mM sodium dithionite, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.262
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 4 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 D 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 M 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 V 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
4HEA Crystal structure of the entire respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2012-10-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 4 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.239
4HEA Crystal structure of the entire respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2012-10-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.239
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 4 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 4 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 4 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 4 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 4 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 4 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6ZIY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, major state 提交 2020-06-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 4 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6ZJL Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, major state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 4 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6ZJN Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 4 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
6ZJY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 4 1–409（409 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å

共 16 个其他 PDB 条目、31 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NQO4_THET8
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 4； PDB构建体 1–409； UniProt 1–409 作者链 D； PDB构建体 1–409； UniProt 1–409

NADH-quinone oxidoreductase subunit C

物种未注明

UniProt Q56219

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白拷贝数一致 链 5； UniProt 1–207 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit B × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit I × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunits 7, 10 and 11 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；16% PEG 4000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 2.04 mM n-octyl- -maltoside fluorinated, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 4.50 Å
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白拷贝数一致 链 E； UniProt 1–207 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit B × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit I × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunits 7, 10 and 11 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；16% PEG 4000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 2.04 mM n-octyl- -maltoside fluorinated, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 4.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3M9S Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 5 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 N 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 W 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2YBB Fitted model for bovine mitochondrial supercomplex I1III2IV1 by single particle cryo-EM (EMD-1876) 提交 2011-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric
链 5 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 4 CA CALCIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 5 SMA STIGMATELLIN A × 2 UQ1 UBIQUINONE-1 × 2 HEC HEME C × 2 CDL CARDIOLIPIN × 4 HEA HEME-A × 2 CU COPPER (II) ION × 3 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE；pH 7.7；10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 70, TEMPERATURE- 95, INSTRUMENT- CUSTOM-MADE HAND PLUNGER, METHOD- ONE- SIDED BLOTTING FOR 26 - 30 SECONDS BEFORE PLUNGING, DETAILS- SAMPLE WAS ADSORBED TO CARBON FILM FOR 30 SECONDS BEFORE BLOTTING
分辨率 19.00 Å
3I9V Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/ASU 提交 2009-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 5 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 MN MANGANESE (II) ION × 7 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M MnCl2, 6% PEG4000, 2.5% PEG400, 20 mM NAD+, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
3I9V Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/ASU 提交 2009-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 MN MANGANESE (II) ION × 5 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M MnCl2, 6% PEG4000, 2.5% PEG400, 20 mM NAD+, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
3IAM Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, reduced, 2 mol/ASU, with bound NADH 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 5 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.05 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 7% PEG4000, 3 mM NADH, 5 mM sodium dithionite, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.262
3IAM Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, reduced, 2 mol/ASU, with bound NADH 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.05 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 7% PEG4000, 3 mM NADH, 5 mM sodium dithionite, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.262
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 5 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 N 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 W 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
4HEA Crystal structure of the entire respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2012-10-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 5 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.239
4HEA Crystal structure of the entire respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2012-10-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.239
5B3P Nqo5 of the trypsin-resistant fragment (1-134) in P212121 form 提交 2016-03-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–134（134 aa） 片段：UNP residues 1-134
未记录 CA CALCIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；200mM calcium chloride, 25% PEG 4000
分辨率 1.65 Å R-free 0.209
5B3Q Nqo5 of the trypsin-resistant fragment (1-134) in P63 form 提交 2016-03-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–134（134 aa） 片段：UNP residues 1-134
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；10% PEG 1000, 10% PEG 8000
分辨率 3.00 Å R-free 0.234
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 5 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 5 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 5 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 5 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 5 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 5 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6ZIY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, major state 提交 2020-06-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 5 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6ZJL Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, major state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 5 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6ZJN Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 5 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
6ZJY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 5 1–207（207 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å

共 18 个其他 PDB 条目、33 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 NQO5_THET8
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 5； PDB构建体 1–207； UniProt 1–207 作者链 E； PDB构建体 1–207； UniProt 1–207

NADH-quinone oxidoreductase subunit B

物种未注明

UniProt Q56218

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白拷贝数一致 链 6； UniProt 1–181 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit C × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit I × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunits 7, 10 and 11 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；16% PEG 4000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 2.04 mM n-octyl- -maltoside fluorinated, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 4.50 Å
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白拷贝数一致 链 F； UniProt 1–181 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit C × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit I × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunits 7, 10 and 11 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；16% PEG 4000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 2.04 mM n-octyl- -maltoside fluorinated, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 4.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3M9S Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 6 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 F 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 O 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 X 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2YBB Fitted model for bovine mitochondrial supercomplex I1III2IV1 by single particle cryo-EM (EMD-1876) 提交 2011-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric
链 6 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 4 CA CALCIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 5 SMA STIGMATELLIN A × 2 UQ1 UBIQUINONE-1 × 2 HEC HEME C × 2 CDL CARDIOLIPIN × 4 HEA HEME-A × 2 CU COPPER (II) ION × 3 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE；pH 7.7；10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 70, TEMPERATURE- 95, INSTRUMENT- CUSTOM-MADE HAND PLUNGER, METHOD- ONE- SIDED BLOTTING FOR 26 - 30 SECONDS BEFORE PLUNGING, DETAILS- SAMPLE WAS ADSORBED TO CARBON FILM FOR 30 SECONDS BEFORE BLOTTING
分辨率 19.00 Å
3I9V Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/ASU 提交 2009-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 6 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 MN MANGANESE (II) ION × 7 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M MnCl2, 6% PEG4000, 2.5% PEG400, 20 mM NAD+, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
3I9V Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/ASU 提交 2009-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 F 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 MN MANGANESE (II) ION × 5 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M MnCl2, 6% PEG4000, 2.5% PEG400, 20 mM NAD+, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
3IAM Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, reduced, 2 mol/ASU, with bound NADH 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 6 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.05 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 7% PEG4000, 3 mM NADH, 5 mM sodium dithionite, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.262
3IAM Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, reduced, 2 mol/ASU, with bound NADH 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 F 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.05 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 7% PEG4000, 3 mM NADH, 5 mM sodium dithionite, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.262
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 6 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 F 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 O 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 X 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
4HEA Crystal structure of the entire respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2012-10-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 6 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.239
4HEA Crystal structure of the entire respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2012-10-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 G 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.239
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 6 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 G 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 6 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 G 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 6 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 G 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 6 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 G 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 6 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 G 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 6 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 G 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6ZIY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, major state 提交 2020-06-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 6 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6ZJL Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, major state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 6 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6ZJN Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 6 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
6ZJY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 6 1–181（181 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å

共 16 个其他 PDB 条目、31 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NQO6_THET8
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 6； PDB构建体 1–181； UniProt 1–181 作者链 F； PDB构建体 1–181； UniProt 1–181

NADH-quinone oxidoreductase subunit I

物种未注明

UniProt Q56224

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白拷贝数一致 链 9； UniProt 1–182 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit C × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit B × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunits 7, 10 and 11 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；16% PEG 4000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 2.04 mM n-octyl- -maltoside fluorinated, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 4.50 Å
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白拷贝数一致 链 G； UniProt 1–182 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit C × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit B × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit 15 × 1 （Q5SKZ7） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunits 7, 10 and 11 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；16% PEG 4000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 2.04 mM n-octyl- -maltoside fluorinated, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 4.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3M9S Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 9 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 P 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2FUG Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2006-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 Y 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M HEPES pH 7.5, 0.4-0.5M NaCl, 0.1M CaCl2 and 8-10% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.298
2YBB Fitted model for bovine mitochondrial supercomplex I1III2IV1 by single particle cryo-EM (EMD-1876) 提交 2011-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric
链 8 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 4 CA CALCIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 5 SMA STIGMATELLIN A × 2 UQ1 UBIQUINONE-1 × 2 HEC HEME C × 2 CDL CARDIOLIPIN × 4 HEA HEME-A × 2 CU COPPER (II) ION × 3 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE；pH 7.7；10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 70, TEMPERATURE- 95, INSTRUMENT- CUSTOM-MADE HAND PLUNGER, METHOD- ONE- SIDED BLOTTING FOR 26 - 30 SECONDS BEFORE PLUNGING, DETAILS- SAMPLE WAS ADSORBED TO CARBON FILM FOR 30 SECONDS BEFORE BLOTTING
分辨率 19.00 Å
3I9V Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/ASU 提交 2009-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 9 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 MN MANGANESE (II) ION × 7 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M MnCl2, 6% PEG4000, 2.5% PEG400, 20 mM NAD+, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
3I9V Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/ASU 提交 2009-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 MN MANGANESE (II) ION × 5 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M MnCl2, 6% PEG4000, 2.5% PEG400, 20 mM NAD+, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
3IAM Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, reduced, 2 mol/ASU, with bound NADH 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 9 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.05 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 7% PEG4000, 3 mM NADH, 5 mM sodium dithionite, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.262
3IAM Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, reduced, 2 mol/ASU, with bound NADH 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.05 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 7% PEG4000, 3 mM NADH, 5 mM sodium dithionite, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.262
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 9 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 G 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 P 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 Y 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
4HEA Crystal structure of the entire respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2012-10-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 9 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.239
4HEA Crystal structure of the entire respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2012-10-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 O 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.239
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 9 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 O 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 9 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 O 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 9 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 O 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 9 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 O 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 9 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 O 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 9 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 O 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6ZIY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, major state 提交 2020-06-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 9 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6ZJL Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, major state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 9 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6ZJN Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 9 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
6ZJY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 9 1–182（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å

共 16 个其他 PDB 条目、31 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NQO9_THET8
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 9； PDB构建体 1–182； UniProt 1–182 作者链 G； PDB构建体 1–182； UniProt 1–182

NADH-quinone oxidoreductase subunit 15

物种未注明

UniProt Q5SKZ7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白拷贝数一致 链 7； UniProt 1–129 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit C × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit B × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit I × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunits 7, 10 and 11 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；16% PEG 4000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 2.04 mM n-octyl- -maltoside fluorinated, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 4.50 Å
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白拷贝数一致 链 J； UniProt 1–129 未记录 NADH-quinone oxidoreductase subunit 1 × 1 （Q56222） NADH-quinone oxidoreductase subunit 2 × 1 （Q56221） NADH-quinone oxidoreductase subunit 3 × 1 （Q56223） NADH-quinone oxidoreductase subunit 4 × 1 （Q56220） NADH-quinone oxidoreductase subunit C × 1 （Q56219） NADH-quinone oxidoreductase subunit B × 1 （Q56218） NADH-quinone oxidoreductase subunit I × 1 （Q56224） NADH-quinone oxidoreductase subunit 12 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 13 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 14 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunits 7, 10 and 11 × 1 NADH-quinone oxidoreductase subunit 8 × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；16% PEG 4000, 100 mM Bis-Tris, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 2.04 mM n-octyl- -maltoside fluorinated, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K 分辨率 4.50 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3M9S Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2YBB Fitted model for bovine mitochondrial supercomplex I1III2IV1 by single particle cryo-EM (EMD-1876) 提交 2011-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：48-meric
链 7 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 4 CA CALCIUM ION × 1 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 5 SMA STIGMATELLIN A × 2 UQ1 UBIQUINONE-1 × 2 HEC HEME C × 2 CDL CARDIOLIPIN × 4 HEA HEME-A × 2 CU COPPER (II) ION × 3 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE；pH 7.7；10 MM KCL, 15 MM HEPES, RESIDUAL TREHALOSE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 70, TEMPERATURE- 95, INSTRUMENT- CUSTOM-MADE HAND PLUNGER, METHOD- ONE- SIDED BLOTTING FOR 26 - 30 SECONDS BEFORE PLUNGING, DETAILS- SAMPLE WAS ADSORBED TO CARBON FILM FOR 30 SECONDS BEFORE BLOTTING
分辨率 19.00 Å
3I9V Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/ASU 提交 2009-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 7 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 MN MANGANESE (II) ION × 7 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M MnCl2, 6% PEG4000, 2.5% PEG400, 20 mM NAD+, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
3I9V Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 2 mol/ASU 提交 2009-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 H 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 MN MANGANESE (II) ION × 5 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M MnCl2, 6% PEG4000, 2.5% PEG400, 20 mM NAD+, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.283
3IAM Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, reduced, 2 mol/ASU, with bound NADH 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 7 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 6 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.05 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 7% PEG4000, 3 mM NADH, 5 mM sodium dithionite, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.262
3IAM Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, reduced, 2 mol/ASU, with bound NADH 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 H 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.05 M NaCl, 0.1 M MgCl2, 7% PEG4000, 3 mM NADH, 5 mM sodium dithionite, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.10 Å R-free 0.262
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 7 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 H 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 Q 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
3IAS Crystal structure of the hydrophilic domain of respiratory complex I from Thermus thermophilus, oxidized, 4 mol/ASU, re-refined to 3.15 angstrom resolution 提交 2009-07-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 Z 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1 M HEPES pH 7.5, 0.4 M NaCl, 0.1 M CaCl2, 8% PEG4000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.15 Å R-free 0.270
4HEA Crystal structure of the entire respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2012-10-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 7 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.239
4HEA Crystal structure of the entire respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2012-10-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 I 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 19% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 2.2 mM FOS-CHOLINE-8 fluorinated , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 3.30 Å R-free 0.239
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 7 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I0D Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Decyl-Ubiquinone 提交 2018-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 I 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 DCQ 2-decyl-5,6-dimethoxy-3-methylcyclohexa-2,5-diene-1,4-dione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 50 mM NDSB-201
分辨率 3.60 Å R-free 0.225
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 7 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6I1P Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound NADH 提交 2018-10-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 I 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 23% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.01 mM n-tetradecyl-beta-D-maltopyranoside
分辨率 3.21 Å R-free 0.231
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 7 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8O Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Piericidin A 提交 2018-12-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 I 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQH Piericidin A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 24% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 0.59 mM n-undecyl-beta-maltoside
分辨率 3.60 Å R-free 0.235
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 7 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8W Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Aureothin. 提交 2018-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 I 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQW Aureothin × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 25% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 7.6 mM 4-cyclohexyl-1-butyl-beta-D-maltoside
分辨率 3.40 Å R-free 0.234
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 7 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Q8X Respiratory complex I from Thermus thermophilus with bound Pyridaben. 提交 2018-12-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 I 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 HQK Pyridaben × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；296 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 21% (w/v) PEG 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid and 1.02 mM octyl-maltoside fluorinated
分辨率 3.51 Å R-free 0.232
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 7 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6Y11 Respiratory complex I from Thermus thermophilus 提交 2020-02-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric
链 I 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；100 mM Bis-Tris pH 6.0, 26% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 4000, 100 mM KCl, 100 mM glutaric acid pH 6.0 and 0.6% DDM
分辨率 3.11 Å R-free 0.229
6ZIY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, major state 提交 2020-06-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 7 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 NAI 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6ZJL Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, major state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 7 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FMN FLAVIN MONONUCLEOTIDE × 1 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
6ZJN Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NADH dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 7 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
6ZJY Respiratory complex I from Thermus thermophilus, NAD+ dataset, minor state 提交 2020-06-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric
链 7 1–129（129 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 7 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å

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查看构建体与数据证据
UniProt名称 NQO15_THET8
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 7； PDB构建体 1–129； UniProt 1–129 作者链 J； PDB构建体 1–129； UniProt 1–129

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 3m9s

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 3m9s
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3m9s
沉积日期 deposition_date2010-03-22
结构标题 titleCrystal structure of respiratory complex I from Thermus thermophilus
关键词 keywordsMEMBRANE PROTEIN, COMPLEX I, OXIDOREDUCTASE, ELECTRON TRANSPORT, RESPIRATORY CHAIN; OXIDOREDUCTASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier84.71 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron82.90 Å
零角强度 I(0) i06844270000.00
分子量 molecular_weight671710.0 kDa
排除体积 excluded_volume825890 ų
包络体积 envelope_volume1819900 ų
水化壳体积 shell_volume177060 ų
包络直径 envelope_diameter360.1 Å
壳层 Rg shell_rg73.74 Å
包络 Rg envelope_rg95.70 Å
形状 Rg shape_rg84.20 Å
总 Rg total_rg78.26 Å
总原子数 total_atoms47664
残基数 n_residues8122
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax220.3 Å
Rg (实空间) rg_real78.14 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.76 Å
I(0) (实空间) i0_real6.5050e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.1710e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal81.07 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal6774000000.0000
解质量估计 total_estimate0.9173
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary97.9 Å
偏度 Skewness skewness0.241
峰度 Kurtosis kurtosis-0.669
角度范围 angular_range— – 0.0900 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.6707
最高正则化参数 α highest_alpha165000000.0000
实空间数据点数 n_real_points19
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.008; Oscil: 1.000; Stabil: 0.988; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.960; Smooth: 0.002
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (16)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)