SAXSdb — 3p57

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Myocyte-specific enhancer factor 2A

Homo sapiens

UniProt Q02078

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 7 DNA 6	;DNA (5'-D(AAPAPCPTPAPTPTPTPAPTPAPAPGPA)-3') ; × 3 ;DNA (5'-D(TPTPCPTPTPAPTPAPAPAPTPAPGPTPT)-3') ; × 3 Histone acetyltransferase p300 × 1 （Q09472） ZINC ION × 3 water × 13	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MEF2A_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–90； UniProt 2–91 作者链 B； PDB构建体 1–90； UniProt 2–91 作者链 C； PDB构建体 1–90； UniProt 2–91 作者链 D； PDB构建体 1–90； UniProt 2–91 作者链 I； PDB构建体 1–90； UniProt 2–91 作者链 J； PDB构建体 1–90； UniProt 2–91

Histone acetyltransferase p300

Homo sapiens

UniProt Q09472

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 7 DNA 6	Myocyte-specific enhancer factor 2A × 6 （Q02078） ;DNA (5'-D(AAPAPCPTPAPTPTPTPAPTPAPAPGPA)-3') ; × 3 ;DNA (5'-D(TPTPCPTPTPAPTPAPAPAPTPAPGPTPT)-3') ; × 3 ZINC ION × 3 water × 13	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	EP300_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 3–112； UniProt 1726–1835

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3p57
沉积日期 deposition_date	2010-10-08
结构标题 title	Crystal structure of the p300 TAZ2 domain bound to MEF2 on DNA
关键词 keywords	;protein-DNA complex, transcription factor, transcriptional activation, p300, zinc finger, TRANSFERASE-TRANSCRIPTION ACTIVATOR-DNA complex ;; TRANSFERASE/TRANSCRIPTION ACTIVATOR/DNA
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3p57__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3p57__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3p57__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	40.35 Å
Rg（电子密度）	38.29 Å
总 Rg	38.75 Å
原子数	7084
残基数	733
排除体积	121500 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3p57__assembly_1__model_1`	tridecameric （13）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Myocyte-specific enhancer factor 2A
分子量 formula_weight	10628.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,I,J
原子数 atom_count	7346

GRKKIQITRIMDERNRQVTFTKRKFGLMKKAYELSVLCDCEIALIIFNSSNKLFQYASTDMDKVLLKYTEYNEPHESRTNSDIVEALNKK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	;DNA (5'-D(AAPAPCPTPAPTPTPTPAPTPAPAPGP*A)-3') ;
分子量 formula_weight	4600.0 kDa
突变 mutation	C4A
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	E,G,K

AAACTATTTATAAGA

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	;DNA (5'-D(TPTPCPTPTPAPTPAPAPAPTPAPGPTP*T)-3') ;
分子量 formula_weight	4573.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	F,H,L

TTCTTATAAATAGTT

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Histone acetyltransferase p300
分子量 formula_weight	12957.5 kDa
EC 编号 ec_number	2.3.1.48
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P

HMSPGDSRRLSIQRCIQSLVHACQCRNANCSLPSCQKMKRVVQHTKGCKRKTNGGCPICKQLIALCCYHAKHCQENKCPVPFCLNIKQKLRQQQLQHRLQQAQMLRRRMASM

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	262

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d3p57j_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.88 — SRF-like
超家族 Superfamily superfamily	d.88.1 — SRF-like
家族 Family family	d.88.1.1 — SRF-like

CATH v4.4 (7 domains)

结构域编号 domain_id	3p57A01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1810 — SRF-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transcription factor, MADS-box

结构域编号 domain_id	3p57B01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1810 — SRF-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transcription factor, MADS-box

结构域编号 domain_id	3p57C01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1810 — SRF-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transcription factor, MADS-box

结构域编号 domain_id	3p57D01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1810 — SRF-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transcription factor, MADS-box

结构域编号 domain_id	3p57I01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1810 — SRF-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transcription factor, MADS-box

结构域编号 domain_id	3p57J01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	1810 — SRF-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transcription factor, MADS-box

结构域编号 domain_id	3p57P00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1020 — CREB-binding Protein; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — TAZ domain

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晶胞边长 a length_a	74.846 Å
晶胞边长 b length_b	90.926 Å
晶胞边长 c length_c	144.802 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	24

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.192 Å
最低分辨率 resolution_low	29.666 Å
R 因子 r_factor	0.2247
R_work r_work	0.2194
R_free r_free	0.2724

Crystal structure of the p300 TAZ2 domain bound to MEF2 on DNA

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Myocyte-specific enhancer factor 2A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Histone acetyltransferase p300

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3p57__assembly_1__model_1

3p57__assembly_1__model_1 | I(q)

3p57__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (7 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of the p300 TAZ2 domain bound to MEF2 on DNA

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Myocyte-specific enhancer factor 2A

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone acetyltransferase p300

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3p57__assembly_1__model_1

3p57__assembly_1__model_1 | I(q)

3p57__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (7 domains)

7. 引用文献 (1)