Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Invasin ipaA × 1 （P18010） CACODYLATE ION × 1 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Invasin ipaA × 1 （P18010） CACODYLATE ION × 1 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| 3 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 4 | Invasin ipaA × 2 （P18010） CACODYLATE ION × 2 water × 4 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | VINC_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–258； UniProt 1–258 作者链 B； PDB构建体 1–258； UniProt 1–258 |
Shigella flexneri
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Vinculin × 1 （P18206） CACODYLATE ION × 1 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Vinculin × 1 （P18206） CACODYLATE ION × 1 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| 3 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 4 | Vinculin × 2 （P18206） CACODYLATE ION × 2 water × 4 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | IPAA_SHIFL |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 C； PDB构建体 5–29； UniProt 488–512 作者链 D； PDB构建体 5–29； UniProt 488–512 |
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| 条目编号 entry_id | 3rf3 |
| 沉积日期 deposition_date | 2011-04-05 |
| 结构标题 title | Shigella IpaA-VBS3 in complex with human vinculin |
| 关键词 keywords | ;alpha-helix bundle domain, cytoskeletal protein, protein-protein interactions, cell adhesion, cytoskeleton, bacterial toxins, pathogen-host interactions, IpaA, Talin, F-actin, phosphatidylinositol 4 5-bisphosphate, Cytosol, Focal adhesion, protein binding-toxin complex ;; protein binding/toxin |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 26.16 Å |
| Rg（电子密度） | 26.38 Å |
| 总 Rg | 26.68 Å |
| 原子数 | 4398 |
| 残基数 | 280 |
| 排除体积 | 39139 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d3rf3a1 |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.24 — Four-helical up-and-down bundle |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.24.9 — alpha-catenin/vinculin-like |
| 家族 Family family | a.24.9.1 — alpha-catenin/vinculin |
| 结构域编号 domain_id | d3rf3b1 |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.24 — Four-helical up-and-down bundle |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.24.9 — alpha-catenin/vinculin-like |
| 家族 Family family | a.24.9.1 — alpha-catenin/vinculin |
| 结构域编号 domain_id | d3rf3b2 |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.24 — Four-helical up-and-down bundle |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.24.9 — alpha-catenin/vinculin-like |
| 家族 Family family | a.24.9.1 — alpha-catenin/vinculin |
| 结构域编号 domain_id | 3rf3A01 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 230 — Alpha-catenin/vinculin-like |
| 结构域编号 domain_id | 3rf3A02 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 230 — Alpha-catenin/vinculin-like |
| 结构域编号 domain_id | 3rf3B01 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 230 — Alpha-catenin/vinculin-like |
| 结构域编号 domain_id | 3rf3B02 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 230 — Alpha-catenin/vinculin-like |