SAXSdb — 3si5

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Mitotic checkpoint serine/threonine-protein kinase BUB1 beta

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Protein CASC5 × 1 （Q8NG31） water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Protein CASC5 × 1 （Q8NG31） water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BUB1B_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 13–176； UniProt 67–230 作者链 B； PDB构建体 13–176； UniProt 67–230

Protein CASC5

Homo sapiens

UniProt Q8NG31

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Mitotic checkpoint serine/threonine-protein kinase BUB1 beta × 1 （O60566） water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Mitotic checkpoint serine/threonine-protein kinase BUB1 beta × 1 （O60566） water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CASC5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 X； PDB构建体 6–24； UniProt 234–252 作者链 Y； PDB构建体 6–24； UniProt 234–252

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3si5
沉积日期 deposition_date	2011-06-17
结构标题 title	Kinetochore-BUBR1 kinase complex
关键词 keywords	BUBR1-Blinkin complex, mitotic checkpoint, BUBR1, Blinkin/KNL1, chromosome segregation, CELL CYCLE; CELL CYCLE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3si5__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3si5__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3si5__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	18.78 Å
Rg（电子密度）	17.69 Å
总 Rg	18.66 Å
原子数	1410
残基数	170
排除体积	24719 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3si5__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`3si5__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Mitotic checkpoint serine/threonine-protein kinase BUB1 beta
分子量 formula_weight	20578.6 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.11.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	3044

TGSTGSTGSTGSQQKRAFEYEIRFYTGNDPLDVWDRYISWTEQNYPQGGKESNMSTLLERAVEALQGEKRYYSDPRFLNLWLKLGRLCNEPLDMYSYLHNQGIGVSLAQFYISWAEEYEARENFRKADAIFQEGIQQKAEPLERLQSQHRQFQARVSRQTLLALEKEEEEEVFESS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Protein CASC5
分子量 formula_weight	2657.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X,Y

GPLGSSSENKIDFNDFIKRLKTGK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	250

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	3si5A00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	430 —

结构域编号 domain_id	3si5B00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	430 —

▶

晶胞边长 a length_a	124.398 Å
晶胞边长 b length_b	40.143 Å
晶胞边长 c length_c	75.391 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	91.38 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.200 Å
最低分辨率 resolution_low	38.200 Å
R 因子 r_factor	0.1963
R_work r_work	0.1934
R_free r_free	0.2467

Kinetochore-BUBR1 kinase complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Mitotic checkpoint serine/threonine-protein kinase BUB1 beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Protein CASC5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3si5__assembly_1__model_1

3si5__assembly_1__model_1 | I(q)

3si5__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)

Kinetochore-BUBR1 kinase complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Mitotic checkpoint serine/threonine-protein kinase BUB1 beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Protein CASC5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3si5__assembly_1__model_1

3si5__assembly_1__model_1 | I(q)

3si5__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)