3t92

Crystal structure of the Taz2:C/EBPepsilon-TAD chimera protein

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 75.9 Å Quality: REASONABLE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HISTONE ACETYLTRANSFERASE P300 TAZ2-CCAAT/ENHANCER-BINDING PROTEIN EPSILON

Homo sapiens

UniProt Q09472

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1723–1818 片段:unp residues 1723-1818; unp residues 37-61 突变:C1738A, C1746A, C1789A, C1790A, ZN ZINC ION × 3 TCE 3,3',3''-phosphanetriyltripropanoic acid × 1 TAM TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 ACN ACETONE × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:Micro batch under oil;pH 8.5;277 K;200mM NaCl, 5mM TCEP and 20% isopropanol, pH 8.5, Micro batch under oil, temperature 277K 分辨率 1.50 Å R-free 0.228

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 58 个其他 PDB 条目、92 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 EP300_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–96; UniProt 1723–1818

HISTONE ACETYLTRANSFERASE P300 TAZ2-CCAAT/ENHANCER-BINDING PROTEIN EPSILON

Homo sapiens

UniProt Q15744

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 37–61 片段:unp residues 1723-1818; unp residues 37-61 突变:C1738A, C1746A, C1789A, C1790A, ZN ZINC ION × 3 TCE 3,3',3''-phosphanetriyltripropanoic acid × 1 TAM TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 ACN ACETONE × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:Micro batch under oil;pH 8.5;277 K;200mM NaCl, 5mM TCEP and 20% isopropanol, pH 8.5, Micro batch under oil, temperature 277K 分辨率 1.50 Å R-free 0.228

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CEBPE_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 97–121; UniProt 37–61

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 3t92

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 3t92
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3t92
沉积日期 deposition_date2011-08-02
结构标题 titleCrystal structure of the Taz2:C/EBPepsilon-TAD chimera protein
关键词 keywordsTaz2 domain, zinc finger, transcription, 300/CBP, C/EBP proteins, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier19.70
回转半径 Rg (电子) rg_electron19.43
零角强度 I(0) i03915530.00
分子量 molecular_weight13226.0 kDa
排除体积 excluded_volume16235 ų
包络体积 envelope_volume22461 ų
水化壳体积 shell_volume11263 ų
包络直径 envelope_diameter75.9
壳层 Rg shell_rg23.06
包络 Rg envelope_rg20.24
形状 Rg shape_rg19.53
总 Rg total_rg19.84
总原子数 total_atoms907
残基数 n_residues113
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax75.9
Rg (实空间) rg_real20.08
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.88
I(0) (实空间) i0_real3.9160e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error6.2660e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal20.02
I(0) (倒空间) i0_reciprocal3915000.0000
解质量估计 total_estimate0.7411
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary22.4
偏度 Skewness skewness0.704
峰度 Kurtosis kurtosis0.130
角度范围 angular_range— – 0.4050 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha210000.0000
实空间数据点数 n_real_points72
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.417; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.387; Smooth: 0.992

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id3t92A00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology1020 — CREB-binding Protein; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — TAZ domain

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)