SAXSdb — 3u7x

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Eukaryotic translation initiation factor 4E

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1 × 1 （Q13541） SULFATE ION × 1 UNKNOWN ATOM OR ION × 9 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1 × 1 （Q13541） SULFATE ION × 3 UNKNOWN ATOM OR ION × 11 water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1 × 2 （Q13541） SULFATE ION × 4 UNKNOWN ATOM OR ION × 20 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	IF4E_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–217； UniProt 1–217 作者链 B； PDB构建体 1–217； UniProt 1–217

Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1

物种未注明

UniProt Q13541

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Eukaryotic translation initiation factor 4E × 1 （P06730） SULFATE ION × 1 UNKNOWN ATOM OR ION × 9 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Eukaryotic translation initiation factor 4E × 1 （P06730） SULFATE ION × 3 UNKNOWN ATOM OR ION × 11 water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Eukaryotic translation initiation factor 4E × 2 （P06730） SULFATE ION × 4 UNKNOWN ATOM OR ION × 20 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	4EBP1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–20； UniProt 47–66 作者链 D； PDB构建体 1–20； UniProt 47–66

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3u7x
沉积日期 deposition_date	2011-10-14
结构标题 title	Crystal structure of the human eIF4E-4EBP1 peptide complex without cap
关键词 keywords	eIF4E, 4EBP1, mRNA export, structural genomics consortium, SGC, TRANSLATION; TRANSLATION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3u7x__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	排除	—	—
	排除原因：来源记录无法明确判定原子或离子的元素，因此不能可靠计算。
2	1	`3u7x__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	排除	—	—
	排除原因：来源记录无法明确判定原子或离子的元素，因此不能可靠计算。
3	1	`3u7x__assembly_3__model_1`	tetrameric （4）	排除	—	—
	排除原因：来源记录无法明确判定原子或离子的元素，因此不能可靠计算。

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Eukaryotic translation initiation factor 4E
分子量 formula_weight	25130.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	3448

MATVEPETTPTPNPPTTEEEKTESNQEVANPEHYIKHPLQNRWALWFFKNDKSKTWQANLRLISKFDTVEDFWALYNHIQLSSNLMPGCDYSLFKDGIEPMWEDEKNKRGGRWLITLNKQQRRSDLDRFWLETLLCLIGESFDDYSDDVCGAVVNVRAKGDKIAIWTTECENREAVTHIGRVYKERLGLPPKIVIGYQSHADTATKSGSTTKNRFVV

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1
分子量 formula_weight	2357.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

PGGTRIIYDRKFLMECRNSP

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	UNKNOWN ATOM OR ION
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	20

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	123

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	3u7xA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	760 — RNA Cap, Translation Initiation Factor Eif4e
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA Cap, Translation Initiation Factor Eif4e

结构域编号 domain_id	3u7xB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	760 — RNA Cap, Translation Initiation Factor Eif4e
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA Cap, Translation Initiation Factor Eif4e

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晶胞边长 a length_a	86.500 Å
晶胞边长 b length_b	38.263 Å
晶胞边长 c length_c	93.533 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	97.97 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.100 Å
最低分辨率 resolution_low	30.000 Å
R 因子 r_factor	0.1990
R_work r_work	0.1982
R_free r_free	0.2239

Crystal structure of the human eIF4E-4EBP1 peptide complex without cap

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Eukaryotic translation initiation factor 4E

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of the human eIF4E-4EBP1 peptide complex without cap

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Eukaryotic translation initiation factor 4E

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)