SAXSdb — 4a1g

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MITOTIC CHECKPOINT SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE BUB1

HOMO SAPIENS

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	PROTEIN CASC5 × 1 （Q8NG31） water × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	PROTEIN CASC5 × 1 （Q8NG31） water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	PROTEIN CASC5 × 1 （Q8NG31） water × 2	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	PROTEIN CASC5 × 1 （Q8NG31） water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	BUB1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–152； UniProt 1–150 作者链 B； PDB构建体 3–152； UniProt 1–150 作者链 C； PDB构建体 3–152； UniProt 1–150 作者链 D； PDB构建体 3–152； UniProt 1–150

PROTEIN CASC5

HOMO SAPIENS

UniProt Q8NG31

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	MITOTIC CHECKPOINT SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE BUB1 × 1 （O43683） water × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	MITOTIC CHECKPOINT SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE BUB1 × 1 （O43683） water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	MITOTIC CHECKPOINT SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE BUB1 × 1 （O43683） water × 2	与蛋白数一致
4	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	MITOTIC CHECKPOINT SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE BUB1 × 1 （O43683） water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CASC5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 3–53； UniProt 150–200 作者链 F； PDB构建体 3–53； UniProt 150–200 作者链 G； PDB构建体 3–53； UniProt 150–200 作者链 H； PDB构建体 3–53； UniProt 150–200

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4a1g
沉积日期 deposition_date	2011-09-15
结构标题 title	The crystal structure of the human Bub1 TPR domain in complex with the KI motif of Knl1
关键词 keywords	CELL CYCLE, TRANSFERASE, SPINDLE ASSEMBLY CHECKPOINT, MITOSIS, TPR REPEAT, KNL1, KMN NETWORK; CELL CYCLE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4a1g__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4a1g__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4a1g__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	18.11 Å
Rg（电子密度）	16.91 Å
总 Rg	17.84 Å
原子数	1309
残基数	158
排除体积	23157 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4a1g__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`4a1g__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`4a1g__assembly_3__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`4a1g__assembly_4__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	MITOTIC CHECKPOINT SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE BUB1
分子量 formula_weight	18121.3 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.11.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D
原子数 atom_count	5497

GPMDTPENVLQMLEAHMQSYKGNDPLGEWERYIQWVEENFPENKEYLITLLEHLMKEFLDKKKYHNDPRFISYCLKFAEYNSDLHQFFEFLYNHGIGTLSSPLYIAWAGHLEAQGELQHASAVLQRGIQNQAEPREFLQQQYRLFQTRLTET

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	PROTEIN CASC5
分子量 formula_weight	5911.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F,G,H

GPQMDLTSSHTVMITKGLLDNPISEKSTKIDTTSFLANLKLHTEDSRMKKEVN

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	120

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	4a1gA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	430 —

结构域编号 domain_id	4a1gB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	430 —

结构域编号 domain_id	4a1gC00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	430 —

结构域编号 domain_id	4a1gD00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	430 —

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晶胞边长 a length_a	59.279 Å
晶胞边长 b length_b	130.969 Å
晶胞边长 c length_c	74.956 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	110.17 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.600 Å
最低分辨率 resolution_low	61.983 Å
R 因子 r_factor	0.1889
R_work r_work	0.1859
R_free r_free	0.2436

The crystal structure of the human Bub1 TPR domain in complex with the KI motif of Knl1

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MITOTIC CHECKPOINT SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE BUB1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

PROTEIN CASC5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4a1g__assembly_1__model_1

4a1g__assembly_1__model_1 | I(q)

4a1g__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

The crystal structure of the human Bub1 TPR domain in complex with the KI motif of Knl1

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MITOTIC CHECKPOINT SERINE/THREONINE-PROTEIN KINASE BUB1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

PROTEIN CASC5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4a1g__assembly_1__model_1

4a1g__assembly_1__model_1 | I(q)

4a1g__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)