4asr

Crystal structure of ANCE in complex with Thr6-Bradykinin

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 85.6 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ANGIOTENSIN-CONVERTING ENZYME

DROSOPHILA MELANOGASTER

UniProt Q10714

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 2 其他聚合物 1 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 17–614 片段:RESIDUES 17-614 BRADYKININ × 1 (P01042) ;beta-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 FLC CITRATE ANION × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 7.5;100 MM HEPES 1.3 M SODIUM CITRATE, pH 7.5 分辨率 1.90 Å R-free 0.200

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 26 个其他 PDB 条目、29 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACE_DROME
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–598; UniProt 17–614

BRADYKININ

物种未注明

UniProt P01042

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 2 其他聚合物 1 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 链 P; UniProt 381–389 突变:YES ANGIOTENSIN-CONVERTING ENZYME × 1 (Q10714) ;beta-D-mannopyranose-(1-6)-alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 ZN ZINC ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 FLC CITRATE ANION × 1 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:pH 7.5;100 MM HEPES 1.3 M SODIUM CITRATE, pH 7.5 分辨率 1.90 Å R-free 0.200

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 11 个其他 PDB 条目、13 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 KNG1_HUMA
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 P; PDB构建体 1–9; UniProt 381–389

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 4asr

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 4asr
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4asr
沉积日期 deposition_date2012-05-02
结构标题 titleCrystal structure of ANCE in complex with Thr6-Bradykinin
关键词 keywordsHYDROLASE, ZINC METALLOPROTEASE, SUBSTRATE RECOGNITION; HYDROLASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier25.55
回转半径 Rg (电子) rg_electron24.43
零角强度 I(0) i081597600.00
分子量 molecular_weight71116.0 kDa
排除体积 excluded_volume88917 ų
包络体积 envelope_volume105240 ų
水化壳体积 shell_volume34548 ų
包络直径 envelope_diameter86.8
壳层 Rg shell_rg32.95
包络 Rg envelope_rg24.81
形状 Rg shape_rg24.39
总 Rg total_rg25.46
总原子数 total_atoms5017
残基数 n_residues602
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax85.6
Rg (实空间) rg_real25.43
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.48
I(0) (实空间) i0_real8.1600e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.2400e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal25.46
I(0) (倒空间) i0_reciprocal81600000.0000
解质量估计 total_estimate0.8699
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary31.8
偏度 Skewness skewness0.238
峰度 Kurtosis kurtosis-0.263
角度范围 angular_range— – 0.3100 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha21270000.0000
实空间数据点数 n_real_points63
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.771; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.995; Smooth: 0.996

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)