4aym

Structure of a complex between CCPs 6 and 7 of Human Complement Factor H and Neisseria meningitidis FHbp Variant 3 P106A mutant

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 131.2 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

COMPLEMENT FACTOR H

HOMO SAPIENS

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 321–443	片段：CCPS 6 AND 7, RESIDUES 321-443	FACTOR H BINDING PROTEIN × 1 （Q19KF7）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 6；0.2 M IMIDAZOLE PH 6, 20% PEG 4000	分辨率 3.00 Å R-free 0.257
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 321–443	片段：CCPS 6 AND 7, RESIDUES 321-443	FACTOR H BINDING PROTEIN × 1 （Q19KF7）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 6；0.2 M IMIDAZOLE PH 6, 20% PEG 4000	分辨率 3.00 Å R-free 0.257
3	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 E； UniProt 321–443	片段：CCPS 6 AND 7, RESIDUES 321-443	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 6；0.2 M IMIDAZOLE PH 6, 20% PEG 4000	分辨率 3.00 Å R-free 0.257
4	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 F； UniProt 321–443	片段：CCPS 6 AND 7, RESIDUES 321-443	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 6；0.2 M IMIDAZOLE PH 6, 20% PEG 4000	分辨率 3.00 Å R-free 0.257

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4AYM	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1HAQ FOUR MODELS OF HUMAN FACTOR H DETERMINED BY SOLUTION SCATTERING CURVE-FITTING AND HOMOLOGY MODELLING 提交 2001-04-06	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 19–1231（1213 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION SCATTERING mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1HCC THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF A COMPLEMENT CONTROL PROTEIN MODULE IN SOLUTION 提交 1990-11-28	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 927–985（59 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1HFH SOLUTION STRUCTURE OF A PAIR OF COMPLEMENT MODULES BY NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE 提交 1993-02-23	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 866–985（120 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1HFI SOLUTION STRUCTURE OF A PAIR OF COMPLEMENT MODULES BY NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE 提交 1993-02-23	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 866–927（62 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
2BZM Solution structure of the primary host recognition region of complement factor H 提交 2005-08-18	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1107–1231（125 aa）片段：CCPS 19-20, RESIDUES 1107-1231	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 4；310 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 1.0 NMR样品组成 10% WATER/90% D2O	分辨率未提供
2G7I Structure of Human Complement Factor H Carboxyl Terminal Domains 19-20: a Basis for Atypical Hemolytic Uremic Syndrome 提交 2006-02-28	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1107–1231（125 aa）片段：C-terminal Domains 19-20	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；Before crystallization the protein was concentrated to 10 mg/ml and dialysed into 20 mM Tris, 50 mM NaCl, pH 7.0. The protein was crystallized in sitting drops by mixing 1 ul of protein solution at 10 mg/ml with 1 ul of reservoir solution of 2.2 M (NH4)2SO4, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298.0K	分辨率 1.75 Å R-free 0.225
2IC4 Solution structure of the His402 allotype of the Factor H SCR6-SCR7-SCR8 fragment 提交 2006-09-12	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 321–506（186 aa）片段：Factor H SCR6-SCR7-SCR8	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION SCATTERING X-ray结晶条件 pH 7.3；288 K；SOLUTION, pH 7.3, temperature 288K	分辨率未提供
2JGW Structure of CCP module 7 of complement factor H - The AMD at risk varient (402H) 提交 2007-02-16	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 386–446（61 aa）片段：CCP MODULE 7, RESIDUES 386-446	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1.0 NMR测量条件 pH 5.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1.0 NMR样品组成 10% WATER/90% D2O	分辨率未提供
2JGX Structure of CCP module 7 of complement factor H - The AMD Not at risk varient (402Y) 提交 2007-02-16	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 386–446（61 aa）片段：CCP MODULE 7, RESIDUES 386-446	突变：YES	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1.0 NMR测量条件 pH 5.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1.0 NMR样品组成 10% WATER/90% D2O	分辨率未提供
2KMS Combined high- and low-resolution techniques reveal compact structure in central portion of factor H despite long inter-modular linkers 提交 2009-08-04	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 690–804（115 aa）片段：Sushi domain, residues 690-804	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 ambient NMR样品组成 20mM potassium phosphate-1, 93% H2O/7% D2O \| 93% H2O/7% D2O	分辨率未提供
2QFG Solution Structure of the N-terminal SCR-1/5 fragment of Complement Factor H. 提交 2007-06-27	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 19–322（304 aa）片段：SCR domains 1-5 (residues 19-322)	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION SCATTERING mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
2QFH Solution Structure of the C-terminal SCR-16/20 fragment of Complement Factor H. 提交 2007-06-27	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 928–1231（304 aa）片段：SCR domains 16-20 (residues 928-1231)	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION SCATTERING mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
2RLP NMR structure of CCP modules 1-2 of complement factor H 提交 2007-07-28	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 20–142（123 aa）片段：residues in database 20-142	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.2；310 K；压力 ambient NMR样品组成 1mM [U-95% 13C; U-95% 15N] FactorH CCP1-2, 10mM potassium phosphate, 12mg/mL Pf1 phage, 50mM L-Arg, 50mM L-Glu, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1mM FactorH CCP1-2, 10mM potassium phosphate, 50mM L-Arg, 50mM L-Glu, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1mM FactorH CCP1-2, 10mM potassium phosphate, 50mM L-Arg, 50mM L-Glu, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
2RLQ NMR structure of CCP modules 2-3 of complement factor H 提交 2007-07-29	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 84–206（123 aa）片段：residues in database 84-206	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.2；310 K；压力 ambient NMR样品组成 2mM [U-95% 13C; U-95% 15N] FactorH CCP2-3, 10mM potassium phosphate, 12mg/mL Pf1 phage, 50mM L-Arg, 50mM L-Glu, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 3mM FactorH CCP2-3, 10mM potassium phosphate, 50mM L-Arg, 50mM L-Glu, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1mM FactorH CCP2-3, 10mM potassium phosphate, 50mM L-Arg, 50mM L-Glu, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
2UWN Crystal structure of Human Complement Factor H, SCR domains 6-8 (H402 risk variant), in complex with ligand. 提交 2007-03-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 322–506（185 aa）片段：DOMAINS 6,7 AND 8, RESIDUES 322-506	未记录	ACT ACETATE ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.5；0.1M SODIUM ACETATE, PH4.5, 20% (W/V) PEG3000	分辨率 2.35 Å R-free 0.246
2V8E Crystal structure of Human Complement Factor H, SCR domains 6-8 (H402 risk variant), in complex with ligand. 提交 2007-08-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 322–506（185 aa）片段：DOMAINS 6,7 AND 8, RESIDUES 322-506	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CL CHLORIDE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.5；0.1M SODIUM ACETATE, PH4.5, 20% (W/V) PEG3000	分辨率 2.50 Å R-free 0.245
2W80 Structure of a complex between Neisseria meningitidis factor H binding protein and CCPs 6-7 of human complement factor H 提交 2009-01-08	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 321–443（123 aa）片段：CCPS 6 AND 7, RESIDUES 321-443	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 9；20% PEG 6000, 0.1M BICINE PH9.0	分辨率 2.35 Å R-free 0.263
2W80 Structure of a complex between Neisseria meningitidis factor H binding protein and CCPs 6-7 of human complement factor H 提交 2009-01-08	实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 321–443（123 aa）片段：CCPS 6 AND 7, RESIDUES 321-443	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 9；20% PEG 6000, 0.1M BICINE PH9.0	分辨率 2.35 Å R-free 0.263
2W80 Structure of a complex between Neisseria meningitidis factor H binding protein and CCPs 6-7 of human complement factor H 提交 2009-01-08	实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 321–443（123 aa）片段：CCPS 6 AND 7, RESIDUES 321-443	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 9；20% PEG 6000, 0.1M BICINE PH9.0	分辨率 2.35 Å R-free 0.263
2W80 Structure of a complex between Neisseria meningitidis factor H binding protein and CCPs 6-7 of human complement factor H 提交 2009-01-08	实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 321–443（123 aa）片段：CCPS 6 AND 7, RESIDUES 321-443	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 9；20% PEG 6000, 0.1M BICINE PH9.0	分辨率 2.35 Å R-free 0.263
2W81 Structure of a complex between Neisseria meningitidis factor H binding protein and CCPs 6-7 of human complement factor H 提交 2009-01-08	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 321–443（123 aa）片段：CCPS 6 AND 7, RESIDUES 321-443	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 9；20% PEG 6000, 0.1M BICINE PH 9.0	分辨率 2.35 Å R-free 0.283
2W81 Structure of a complex between Neisseria meningitidis factor H binding protein and CCPs 6-7 of human complement factor H 提交 2009-01-08	实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 321–443（123 aa）片段：CCPS 6 AND 7, RESIDUES 321-443	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 9；20% PEG 6000, 0.1M BICINE PH 9.0	分辨率 2.35 Å R-free 0.283
2W81 Structure of a complex between Neisseria meningitidis factor H binding protein and CCPs 6-7 of human complement factor H 提交 2009-01-08	实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 321–443（123 aa）片段：CCPS 6 AND 7, RESIDUES 321-443	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 9；20% PEG 6000, 0.1M BICINE PH 9.0	分辨率 2.35 Å R-free 0.283
2WII Complement C3b in complex with factor H domains 1-4 提交 2009-05-12	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 18–264（247 aa）片段：RESIDUES 18-264	未记录	CA CALCIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 17 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.1；7.0% (W/V) PEG 3,350, 70 MM AMMONIUM ACETATE, PH 7.1	分辨率 2.70 Å R-free 0.252
2WII Complement C3b in complex with factor H domains 1-4 提交 2009-05-12	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 18–264（247 aa）片段：RESIDUES 18-264	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.1；7.0% (W/V) PEG 3,350, 70 MM AMMONIUM ACETATE, PH 7.1	分辨率 2.70 Å R-free 0.252
2XQW Structure of Factor H domains 19-20 in complex with complement C3d 提交 2010-09-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1103–1231（129 aa）片段：DOMAINS 19-20, RESIDUES 1103-1231	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；295 K；12-18% PEG 4000, 0.1 M HEPES, PH 7.5, AT 22 DEGREES C	分辨率 2.31 Å R-free 0.242
2XQW Structure of Factor H domains 19-20 in complex with complement C3d 提交 2010-09-07	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1103–1231（129 aa）片段：DOMAINS 19-20, RESIDUES 1103-1231	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；295 K；12-18% PEG 4000, 0.1 M HEPES, PH 7.5, AT 22 DEGREES C	分辨率 2.31 Å R-free 0.242
3GAU Solution structure of Human Complement Factor H in 50 mM NaCl buffer 提交 2009-02-18	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 19–1231（1213 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION SCATTERING mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
3GAV Solution structure of Human Complement Factor H in 137 mM NaCl buffer 提交 2009-02-18	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 19–1231（1213 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION SCATTERING mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
3GAW Solution structure of Human Complement Factor H in 250 mM NaCl buffer 提交 2009-02-18	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 19–1231（1213 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION SCATTERING mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
3KXV Structure of complement Factor H variant Q1139A 提交 2009-12-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1103–1231（129 aa）片段：Sushi domains 19-20	突变：Q1139A	SO4 SULFATE ION × 24	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；295.15 K；2M ammonium sulphate, 0.1M Bis-Tris buffer, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.15K	分辨率 2.00 Å R-free 0.244
3KZJ Structure of complement Factor H variant R1203A 提交 2009-12-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1103–1231（129 aa）片段：Sushi domains 19-20	突变：R1203A	SO4 SULFATE ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295.15 K；2M Ammonium Sulphate, 0.1M Bis-Tris buffer, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.15K	分辨率 1.65 Å R-free 0.222
3R62 Structure of complement regulator Factor H mutant, T1184R. 提交 2011-03-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1107–1231（125 aa）片段：Complement Factor H modules 19 and 20	突变：T1184R	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；290 K；0.1M Tris HCl, pH 8.5 and 12% polyethylene glycol 8000 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 1.52 Å R-free 0.208
3R62 Structure of complement regulator Factor H mutant, T1184R. 提交 2011-03-21	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1107–1231（125 aa）片段：Complement Factor H modules 19 and 20	突变：T1184R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；290 K；0.1M Tris HCl, pH 8.5 and 12% polyethylene glycol 8000 , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 1.52 Å R-free 0.208
3SW0 Structure of the C-terminal region (modules 18-20) of complement regulator Factor H 提交 2011-07-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 X 1046–1231（186 aa）片段：unp residues 1046-1231	未记录	GOL GLYCEROL × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；290 K；0.1M Sodium Acetate trihydrate, pH 4.6, 2% v/v Tacsimate, pH 4.0 (Hampton Research formulation containing: 1.8305 M Malonic acid, 0.25 M Ammonium citrate tribasic, 0.12 M Succinic acid, 0.3 M DL-Malic acid, 0.4 M Sodium acetate trihydrate, 0.5 M Sodium formate, 0.16 M Ammonium tartrate dibasic and pH adjusted using NaOH) and 16% w/v polyethylene glycol 3350 as the precipitant, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K	分辨率 1.80 Å R-free 0.226
4AYD Structure of a complex between CCPs 6 and 7 of Human Complement Factor H and Neisseria meningitidis FHbp Variant 1 R106A mutant 提交 2012-06-20	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 321–443（123 aa）片段：CCPS 6 AND 7, RESIDUES 321-443	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 9；20% PEG 6000, 0.1M BICINE PH 9.0	分辨率 2.40 Å R-free 0.231
4AYD Structure of a complex between CCPs 6 and 7 of Human Complement Factor H and Neisseria meningitidis FHbp Variant 1 R106A mutant 提交 2012-06-20	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 321–443（123 aa）片段：CCPS 6 AND 7, RESIDUES 321-443	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 9；20% PEG 6000, 0.1M BICINE PH 9.0	分辨率 2.40 Å R-free 0.231
4AYD Structure of a complex between CCPs 6 and 7 of Human Complement Factor H and Neisseria meningitidis FHbp Variant 1 R106A mutant 提交 2012-06-20	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 321–443（123 aa）片段：CCPS 6 AND 7, RESIDUES 321-443	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 9；20% PEG 6000, 0.1M BICINE PH 9.0	分辨率 2.40 Å R-free 0.231
4AYE Structure of a complex between CCPs 6 and 7 of Human Complement Factor H and Neisseria meningitidis FHbp Variant 1 E283AE304A mutant 提交 2012-06-20	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 321–443（123 aa）片段：CCPS 6 AND 7, RESIDUES 321-443	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 9；20% PEG 6000, 0.1M BICINE PH 9.0	分辨率 2.80 Å R-free 0.226
4AYE Structure of a complex between CCPs 6 and 7 of Human Complement Factor H and Neisseria meningitidis FHbp Variant 1 E283AE304A mutant 提交 2012-06-20	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 321–443（123 aa）片段：CCPS 6 AND 7, RESIDUES 321-443	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 9；20% PEG 6000, 0.1M BICINE PH 9.0	分辨率 2.80 Å R-free 0.226
4AYE Structure of a complex between CCPs 6 and 7 of Human Complement Factor H and Neisseria meningitidis FHbp Variant 1 E283AE304A mutant 提交 2012-06-20	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 321–443（123 aa）片段：CCPS 6 AND 7, RESIDUES 321-443	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 9；20% PEG 6000, 0.1M BICINE PH 9.0	分辨率 2.80 Å R-free 0.226
4AYI Structure of a complex between CCPs 6 and 7 of Human Complement Factor H and Neisseria meningitidis FHbp Variant 3 Wild type 提交 2012-06-21	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 321–443（123 aa）片段：CCPS 6 AND 7, RESIDUES 321-443	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；0.2 M IMIDAZOLE PH 6 20% PEG 4000	分辨率 2.31 Å R-free 0.252
4AYI Structure of a complex between CCPs 6 and 7 of Human Complement Factor H and Neisseria meningitidis FHbp Variant 3 Wild type 提交 2012-06-21	实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 321–443（123 aa）片段：CCPS 6 AND 7, RESIDUES 321-443	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；0.2 M IMIDAZOLE PH 6 20% PEG 4000	分辨率 2.31 Å R-free 0.252
4B2R Solution structure of CCP modules 10-11 of complement factor H 提交 2012-07-17	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 566–687（122 aa）片段：CCPS 10-11, RESIDUES 566-687	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.02；压力 1.0 NMR测量条件 pH 6.7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.02；压力 1.0 NMR测量条件 pH 6.7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.02；压力 1.0 NMR测量条件 pH 6.7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.02；压力 1.0 NMR样品组成 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
4B2S Solution structure of CCP modules 11-12 of complement factor H 提交 2012-07-17	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 627–747（121 aa）片段：CCPS 11-12, RESIDUES 627-747	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.3；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.02；压力 1.0 NMR测量条件 pH 6.3；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.02；压力 1.0 NMR样品组成 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
4J38 Structure of Borrelia burgdorferi Outer surface protein E in complex with Factor H domains 19-20 提交 2013-02-05	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1103–1231（129 aa）片段：FH domains 19-20, UNP residues 1103-1231	突变：D1119G, Q1139A	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；2M Ammonium sulfate, 0.1M Citric acid, 0.2M Sodium chloride, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.83 Å R-free 0.255
4K12 Structural Basis for Host Specificity of Factor H Binding by Streptococcus pneumoniae 提交 2013-04-04	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 508–567（60 aa）片段：sushi domain (UNP residues 508-567)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；20% PEG3500, 0.1 M sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；20% PEG3500, 0.1 M sodium acetate, soaked in 0.5 M sodium iodide, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.08 Å R-free 0.170
4ONT Ternary host recognition complex of complement factor H, C3d, and sialic acid 提交 2014-01-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1107–1231（125 aa）片段：Sushi 19-20 domains (UNP residues 1107-1231)	未记录	GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；0.1 M Tris-HCl, pH 9.0, 8% w/v PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.15 Å R-free 0.223
4ONT Ternary host recognition complex of complement factor H, C3d, and sialic acid 提交 2014-01-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 1107–1231（125 aa）片段：Sushi 19-20 domains (UNP residues 1107-1231)	未记录	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；0.1 M Tris-HCl, pH 9.0, 8% w/v PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.15 Å R-free 0.223
4ONT Ternary host recognition complex of complement factor H, C3d, and sialic acid 提交 2014-01-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1107–1231（125 aa）片段：Sushi 19-20 domains (UNP residues 1107-1231)	未记录	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；0.1 M Tris-HCl, pH 9.0, 8% w/v PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.15 Å R-free 0.223
4ZH1 Complement factor H in complex with the GM1 glycan 提交 2015-04-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 1107–1231（125 aa）片段：residues 1107-1231	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M TRIS-HCL, PH 9.0, 8% W/V PRG 8000	分辨率 2.24 Å R-free 0.228
4ZH1 Complement factor H in complex with the GM1 glycan 提交 2015-04-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1107–1231（125 aa）片段：residues 1107-1231	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M TRIS-HCL, PH 9.0, 8% W/V PRG 8000	分辨率 2.24 Å R-free 0.228
4ZH1 Complement factor H in complex with the GM1 glycan 提交 2015-04-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1107–1231（125 aa）片段：residues 1107-1231	未记录	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M TRIS-HCL, PH 9.0, 8% W/V PRG 8000	分辨率 2.24 Å R-free 0.228
5NBQ The structure of the tripartite complex between OspE, the C-terminal domains of factor H and C3dg 提交 2017-03-02	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 1104–1230（127 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG3350, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M MgCl2 or 24% PEG3350, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M MgCl2 or 16% PEG3350, Tris pH 8.5, 0.2 M ammonium acetate	分辨率 3.18 Å R-free 0.261
5NBQ The structure of the tripartite complex between OspE, the C-terminal domains of factor H and C3dg 提交 2017-03-02	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 1104–1230（127 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG3350, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M MgCl2 or 24% PEG3350, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M MgCl2 or 16% PEG3350, Tris pH 8.5, 0.2 M ammonium acetate	分辨率 3.18 Å R-free 0.261
5NBQ The structure of the tripartite complex between OspE, the C-terminal domains of factor H and C3dg 提交 2017-03-02	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 1104–1230（127 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG3350, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M MgCl2 or 24% PEG3350, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M MgCl2 or 16% PEG3350, Tris pH 8.5, 0.2 M ammonium acetate	分辨率 3.18 Å R-free 0.261
5O32 The structure of complement complex 提交 2017-05-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 C 19–264（246 aa）片段：UNP residues 19-264,UNP residues 1107-1230,UNP residues 19-264,UNP residues 1107-1230 链 C 1107–1230（124 aa）片段：UNP residues 19-264,UNP residues 1107-1230,UNP residues 19-264,UNP residues 1107-1230 链 G 19–264（246 aa）片段：UNP residues 19-264,UNP residues 1107-1230,UNP residues 19-264,UNP residues 1107-1230 链 G 1107–1230（124 aa）片段：UNP residues 19-264,UNP residues 1107-1230,UNP residues 19-264,UNP residues 1107-1230	未记录	CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 MLI MALONATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；60mM sodium malonate PH5.0 6% w/v PEG3350	分辨率 4.21 Å R-free 0.254
5O35 Structure of complement proteins complex 提交 2017-05-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 19–264（246 aa）链 C 1107–1231（125 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；60mM Ammonium sulfate, 6% w/v PEG3350	分辨率 4.20 Å R-free 0.246
5WTB Complex Structure of Staphylococcus aureus SdrE with human complement factor H 提交 2016-12-10	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1206–1226（21 aa）片段：UNP residues 1206-1226	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1M HEPES sodium pH 7.5, 0.2M Magnesium chloride, 30% PEG 400 (v/v)	分辨率 3.30 Å R-free 0.281
5WTB Complex Structure of Staphylococcus aureus SdrE with human complement factor H 提交 2016-12-10	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 1206–1226（21 aa）片段：UNP residues 1206-1226	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1M HEPES sodium pH 7.5, 0.2M Magnesium chloride, 30% PEG 400 (v/v)	分辨率 3.30 Å R-free 0.281
5WTB Complex Structure of Staphylococcus aureus SdrE with human complement factor H 提交 2016-12-10	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1206–1226（21 aa）片段：UNP residues 1206-1226	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1M HEPES sodium pH 7.5, 0.2M Magnesium chloride, 30% PEG 400 (v/v)	分辨率 3.30 Å R-free 0.281
5WTB Complex Structure of Staphylococcus aureus SdrE with human complement factor H 提交 2016-12-10	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 1206–1226（21 aa）片段：UNP residues 1206-1226	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1M HEPES sodium pH 7.5, 0.2M Magnesium chloride, 30% PEG 400 (v/v)	分辨率 3.30 Å R-free 0.281
6ZH1 Crystal structure of complex between FH19-20 and FhbA protein from Borrelia hermsii 提交 2020-06-20	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1104–1231（128 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4 SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.7；293.15 K；0.1 M MES pH6.7, 0.2 M Ammonium Sulfate, 20% (v/v) PEG 4000	分辨率 2.20 Å R-free 0.240
7WKI Structure of the ultra-affinity complex between CFH and a nanobody 提交 2022-01-10	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1046–1231（186 aa）片段：C-terminal domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium Phosphate monohydrate, 20% PEG 3350	分辨率 2.60 Å R-free 0.239
7ZJM Crystal structure of a complex between CspZ from Borrelia burgdorferi strain B408 and human FH SCR domains 6-7 提交 2022-04-11	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 321–444（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 7 IMD IMIDAZOLE × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；294 K；0.2 M Zinc acetate 0.1 M imidazole (pH 7.4) 10% PEG 3000	分辨率 2.59 Å R-free 0.276
9F7I Crystal structure of Borrelia burgdorferi B31 CspZ in complex with human FH SCR6-7 提交 2024-05-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 321–444（124 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；294 K；0.25 M ammonium sulfate 0.1 M MES pH 6.5 10% PEG 3000	分辨率 2.85 Å R-free 0.261
9MLU FbaA with Factor H 6-7 domain 提交 2024-12-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 321–443（123 aa）	未记录	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；MES pH 6.0, Sodium chloride, PEG 6000, Ethylene Glycol	分辨率 1.82 Å R-free 0.276
9MLU FbaA with Factor H 6-7 domain 提交 2024-12-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 321–443（123 aa）	未记录	MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；MES pH 6.0, Sodium chloride, PEG 6000, Ethylene Glycol	分辨率 1.82 Å R-free 0.276
9MMU M5 protein with Factor H 6-7 domain 提交 2024-12-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 321–443（123 aa）链 D 321–443（123 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 6000, Ethylene glycol, Sodium Chloride	分辨率 2.25 Å R-free 0.287
9MMU M5 protein with Factor H 6-7 domain 提交 2024-12-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 G 321–443（123 aa）链 H 321–443（123 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 6000, Ethylene glycol, Sodium Chloride	分辨率 2.25 Å R-free 0.287
9MMX M6 protein with Factor H 6-7 domain 提交 2024-12-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 321–443（123 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 6000, ethylene glycol, Sodium chloride	分辨率 1.90 Å R-free 0.302
9MMX M6 protein with Factor H 6-7 domain 提交 2024-12-20	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 321–443（123 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 6000, ethylene glycol, Sodium chloride	分辨率 1.90 Å R-free 0.302

共 47 个其他 PDB 条目、72 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CFAH_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–125； UniProt 321–443 作者链 B； PDB构建体 3–125； UniProt 321–443 作者链 E； PDB构建体 3–125； UniProt 321–443 作者链 F； PDB构建体 3–125； UniProt 321–443

FACTOR H BINDING PROTEIN

NEISSERIA MENINGITIDIS MC58

UniProt Q19KF7

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 32–281	片段：RESIDUES 32-281 突变：YES	COMPLEMENT FACTOR H × 1 （P08603）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 6；0.2 M IMIDAZOLE PH 6, 20% PEG 4000	分辨率 3.00 Å R-free 0.257
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 32–281	片段：RESIDUES 32-281 突变：YES	COMPLEMENT FACTOR H × 1 （P08603）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 6；0.2 M IMIDAZOLE PH 6, 20% PEG 4000	分辨率 3.00 Å R-free 0.257

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 4AYM	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4AYI Structure of a complex between CCPs 6 and 7 of Human Complement Factor H and Neisseria meningitidis FHbp Variant 3 Wild type 提交 2012-06-21	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 32–281（250 aa）片段：RESIDUES 32-281	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；0.2 M IMIDAZOLE PH 6 20% PEG 4000	分辨率 2.31 Å R-free 0.252
6H2Y human Fab 1E6 bound to fHbp variant 3 from Neisseria meningitidis serogroup B 提交 2018-07-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 32–281（250 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 12 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 P33 3,6,9,12,15,18-HEXAOXAICOSANE-1,20-DIOL × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293.15 K；Molecular Dimensions Morpheus HT-96 screen, well D9	分辨率 2.65 Å R-free 0.275

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q19KF7_NEIME
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 13–262； UniProt 32–281 作者链 D； PDB构建体 13–262； UniProt 32–281

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4aym
沉积日期 deposition_date	2012-06-21
结构标题 title	Structure of a complex between CCPs 6 and 7 of Human Complement Factor H and Neisseria meningitidis FHbp Variant 3 P106A mutant
关键词 keywords	IMMUNE SYSTEM, ANTIGENS, VACCINES; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	37.75 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	37.64 Å
零角强度 I(0) i0	182703000.00
分子量 molecular_weight	106360.0 kDa
排除体积 excluded_volume	131820 Å³
包络体积 envelope_volume	188340 Å³
水化壳体积 shell_volume	43476 Å³
包络直径 envelope_diameter	139.0 Å
壳层 Rg shell_rg	41.76 Å
包络 Rg envelope_rg	37.29 Å
形状 Rg shape_rg	37.63 Å
总 Rg total_rg	37.98 Å
总原子数 total_atoms	7500
残基数 n_residues	946
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	131.2 Å
Rg (实空间) rg_real	37.96 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.17 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.8270e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.0300e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	37.83 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	182700000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8660
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	40.6 Å
偏度 Skewness skewness	0.440
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.363
角度范围 angular_range	— – 0.2100 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	14430000.0000
实空间数据点数 n_real_points	43
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.793; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.944; Smooth: 0.932

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	COMPLEMENT FACTOR H
分子量 formula_weight	14410.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,E,F
原子数 atom_count	7506

MGTLKPCDYPDIKHGGLYHENMRRPYFPVAVGKYYSYYCDEHFETPSGSYWDHIHCTQDGWSPAVPCLRKCYFPYLENGYNQNHGRKFVQGKSIDVACHPGYALPKAQTTVTCMENGWSPTPRCI

来源 Source

来源生物 organism	HOMO SAPIENS
通用名 common_name	HUMAN
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	FACTOR H BINDING PROTEIN
分子量 formula_weight	29487.8 kDa
突变 mutation	YES
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

MGPDSDRLQQRRVAADIGTGLADALTAPLDHKDKGLKSLTLEDSIAQNGTLTLSAQGAEKTFKAGDKDNSLNTGKLKNDKISRFDFVQKIEVDGQTITLASGEFQIYKQNHSAVVALQIEKINNPDKTDSLINQRSFLVSGLGGEHTAFNQLPGGKAEYHGKAFSSDDPNGRLHYSIDFTKKQGYGRIEHLKTLEQNVELAAAELKADEKSHAVILGDTRYGSEEKGTYHLALFGDRAQEIAGSATVKIGEKVHEIGIAGKQLEHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	NEISSERIA MENINGITIDIS MC58
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	122586
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	6

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

CATH v4.4 (12 domains)

结构域编号 domain_id	4aymA01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	70 — Complement Module; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Complement Module, domain 1

结构域编号 domain_id	4aymA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	70 — Complement Module; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Complement Module, domain 1

结构域编号 domain_id	4aymB01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	70 — Complement Module; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Complement Module, domain 1

结构域编号 domain_id	4aymB02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	70 — Complement Module; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Complement Module, domain 1

结构域编号 domain_id	4aymC01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1980 —

结构域编号 domain_id	4aymC02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	160 — Porin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 —

结构域编号 domain_id	4aymD01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1980 —

结构域编号 domain_id	4aymD02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	160 — Porin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 —

结构域编号 domain_id	4aymE01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	70 — Complement Module; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Complement Module, domain 1

结构域编号 domain_id	4aymE02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	70 — Complement Module; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Complement Module, domain 1

结构域编号 domain_id	4aymF01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	70 — Complement Module; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Complement Module, domain 1

结构域编号 domain_id	4aymF02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	10 — Ribbon
拓扑 Topology topology	70 — Complement Module; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Complement Module, domain 1

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	78.090 Å
晶胞边长 b length_b	83.490 Å
晶胞边长 c length_c	361.430 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	32

空间群 space_group	C 2 2 21
空间群编号 int_tables_number	20
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.000 Å
最低分辨率 resolution_low	15.000 Å
R 因子 r_factor	0.2545
R_work r_work	0.2543
R_free r_free	0.2567

fit	/app/data/saxs_computation/ay/4aym/4aym.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ay/4aym/4aym.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ay/4aym/4aym.dat

Structure of a complex between CCPs 6 and 7 of Human Complement Factor H and Neisseria meningitidis FHbp Variant 3 P106A mutant

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

COMPLEMENT FACTOR H

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

FACTOR H BINDING PROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

CATH v4.4 (12 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)