4c4d

Covalent glycosyl-enzyme intermediate of Hypocrea jecorina Cel7a E217Q mutant trapped using DNP-2-deoxy-2-fluoro-cellotrioside

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 68.0 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

CELLULOSE 1,4-BETA-CELLOBIOSIDASE

TRICHODERMA REESEI

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合单体蛋白 × 1 其他聚合物 2 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 18–451	片段：CATALYTIC MODULE, RESIDUES 18-451 突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose × 1 ;beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-deoxy-2-fluoro-alpha-D-glucopyranose ; × 1 CO COBALT (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：pH 6；PROTEIN FIRST INCUBATED WITH 80 UM 2,4-DINITROPHENYL-2-DEOXY-2-FLUORO-BETA-CELLOTRIOSIDE (DNP-2F-G3)4 IN 10 MM SODIUM MES, PH 6.0. ALIQUOTS WERE TAKEN AT REGULAR TIME INTERVALS AND CONCENTRATED FOR CRYSTALLISATION IN THE PRESENCE OF 1 MM FRESH DNP-2F-G3 ADDED TO THE CRYSTALLISATION DROPS. CRYSTALLISATION CONDITION: 0.1 M MES (PH 6.0), 20% MONOMETHYL ETHER PEG 5000, 0.01 M COCL2, 12% GLYCEROL.	分辨率 1.32 Å R-free 0.187

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4C4D	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1AZ6 THREE-DIMENSIONAL STRUCTURES OF THREE ENGINEERED CELLULOSE-BINDING DOMAINS OF CELLOBIOHYDROLASE I FROM TRICHODERMA REESEI, NMR, 23 STRUCTURES 提交 1997-11-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）片段：CELLULOSE-BINDING DOMAIN	突变：Y5A	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 3.9；288 K	分辨率未提供
1AZH THREE-DIMENSIONAL STRUCTURES OF THREE ENGINEERED CELLULOSE-BINDING DOMAINS OF CELLOBIOHYDROLASE I FROM TRICHODERMA REESEI, NMR, 14 STRUCTURES 提交 1997-11-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）片段：CELLULOSE-BINDING DOMAIN	突变：Y5A	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 3.9；288 K	分辨率未提供
1AZJ THREE-DIMENSIONAL STRUCTURES OF THREE ENGINEERED CELLULOSE-BINDING DOMAINS OF CELLOBIOHYDROLASE I FROM TRICHODERMA REESEI, NMR, 18 STRUCTURES 提交 1997-11-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）片段：CELLULOSE-BINDING DOMAIN	突变：Y31A	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 3.9；288 K	分辨率未提供
1AZK THREE-DIMENSIONAL STRUCTURES OF THREE ENGINEERED CELLULOSE-BINDING DOMAINS OF CELLOBIOHYDROLASE I FROM TRICHODERMA REESEI, NMR, 19 STRUCTURES 提交 1997-11-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）片段：CELLULOSE-BINDING DOMAIN	突变：Y32A	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 3.9；288 K	分辨率未提供
1CBH DETERMINATION OF THE THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF THE C-TERMINAL DOMAIN OF CELLOBIOHYDROLASE I FROM TRICHODERMA REESEI. A STUDY USING NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE AND HYBRID DISTANCE GEOMETRY-DYNAMICAL SIMULATED ANNEALING 提交 1989-05-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
1DY4 CBH1 IN COMPLEX WITH S-PROPRANOLOL 提交 2000-01-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 18–451（434 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 18-451	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 SNP 1-(ISOPROPYLAMINO)-3-(1-NAPHTHYLOXY)-2-PROPANOL × 1 CO COBALT (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；HANGING DROPS. EQUAL VOLUMES OF 9 MG/ML PROTEIN/7.5 MM S-PROPRANOLOL AND RESERVOIR SOLUTION CONTAINING 0.1 M MES (PH 7.0), 24% (W/V) MONOMETHYL ETHER PEG 5000, 15% GLYCEROL AND 10 MM COCL2.	分辨率 1.90 Å R-free 0.220
1EGN CELLOBIOHYDROLASE CEL7A (E223S, A224H, L225V, T226A, D262G) MUTANT 提交 2000-02-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 18–451（434 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 1 - 434	突变：E223S, A224H, L225V, T226A, D262G 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CO COBALT (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；sodium acetate, PEG 5000 monomethyl-ether, glycerol, sodium morpholine-ethane-sulphonic acid, cobalt chloride , pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.60 Å R-free 0.270
1Q2B CELLOBIOHYDROLASE CEL7A WITH DISULPHIDE BRIDGE ADDED ACROSS EXO-LOOP BY MUTATIONS D241C AND D249C 提交 2003-07-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 18–451（434 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN 1-434	突变：D241C, D249C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CO COBALT (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；PEG 5000 monomethyl ether, sodium morpholine-ethane-sulphonic acid, glycerol, cobalt chloride, sodium acetate, pH 6.00, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.60 Å R-free 0.223
2CBH DETERMINATION OF THE THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF THE C-TERMINAL DOMAIN OF CELLOBIOHYDROLASE I FROM TRICHODERMA REESEI. A STUDY USING NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE AND HYBRID DISTANCE GEOMETRY-DYNAMICAL SIMULATED ANNEALING 提交 1989-05-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件	分辨率未提供
2CEL ACTIVE-SITE MUTANT E212Q DETERMINED AT PH 6.0 WITH NO LIGAND BOUND IN THE ACTIVE SITE 提交 1996-08-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 19–451（433 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 1 - 434	突变：E212Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；4.5 MM MES PH 6.0, 4.5% MONOMETHYL ETHER PEG 5000, 4.5 MM CACL2	分辨率 2.00 Å R-free 0.208
2CEL ACTIVE-SITE MUTANT E212Q DETERMINED AT PH 6.0 WITH NO LIGAND BOUND IN THE ACTIVE SITE 提交 1996-08-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 19–451（433 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 1 - 434	突变：E212Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；4.5 MM MES PH 6.0, 4.5% MONOMETHYL ETHER PEG 5000, 4.5 MM CACL2	分辨率 2.00 Å R-free 0.208
2MWJ Solution structure of Family 1 Carbohydrate-Binding Module from Trichoderma reesei Cel7A with O-mannose residues at Thr1 and Ser3 提交 2014-11-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）片段：CBM1 DOMAIN RESIDUES 478-513;	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）30；压力 ambient NMR测量条件 pH 5；288 K；离子强度（mmCIF原始值）30；压力 ambient NMR样品组成 1.7 mg CBM_2M, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.7 mg CBM_2M, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
2MWK Family 1 Carbohydrate-Binding Module from Trichoderma reesei Cel7A with O-mannose residues at Thr1, Ser3, and Ser14 提交 2014-11-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）片段：CBM1 domain residues 478-513	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）30；压力 ambient NMR测量条件 pH 5；288 K；离子强度（mmCIF原始值）30；压力 ambient NMR样品组成 1.5 mg CBM_3M, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.5 mg CBM_3M, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
2V3I Hypocrea jecorina Cel7A in complex with (R)-dihydroxy-phenanthrenolol 提交 2007-06-18	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 18–451（434 aa）片段：CATALYTIC MODULE, RESIDUES 18-451	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CO COBALT (II) ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 XX6 2-{[(2R)-2-HYDROXY-3-(9-PHENANTHRYLOXY)PROPYL]AMINO}PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；POLYETHYLENE GLYCOL MONOMETHYL ETHER 5000, GLYCEROL, COBALT CHLORIDE, SODIUM ACETATE, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298 K	分辨率 1.05 Å R-free 0.140
2V3R Hypocrea jecorina Cel7A in complex with (S)-dihydroxy-phenanthrenolol 提交 2007-06-21	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 18–451（434 aa）片段：CATALYTIC MODULE, RESIDUES 18-451	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CO COBALT (II) ION × 2 XX7 2-{[(2S)-2-HYDROXY-3-(9-PHENANTHRYLOXY)PROPYL]AMINO}PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；POLYETHYLENE GLYCOL MONOMETHYL ETHER, GLYCEROL, COBALT CHLORIDE, SODIUM ACETATE PH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298 K	分辨率 1.60 Å R-free 0.179
4C4C Michaelis complex of Hypocrea jecorina CEL7A E217Q mutant with cellononaose spanning the active site 提交 2013-09-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 18–451（434 aa）片段：CATALYTIC MODULE, RESIDUES 18-451	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CO COBALT (II) ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；0.1 M MES (PH 6.0), 20% MONOMETHYL ETHER PEG 5000, 0.01 M COCL2, 12% GLYCEROL., VAPOR DIFFUSION - HANGING DROP	分辨率 1.45 Å R-free 0.196
4CEL ACTIVE-SITE MUTANT D214N DETERMINED AT PH 6.0 WITH NO LIGAND BOUND IN THE ACTIVE SITE 提交 1996-08-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 19–451（433 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 1 - 434	突变：D214N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；4.5 MM MES PH 6.0, 9% PEG 6000, 4.5 MM CACL2	分辨率 2.20 Å R-free 0.239
4CEL ACTIVE-SITE MUTANT D214N DETERMINED AT PH 6.0 WITH NO LIGAND BOUND IN THE ACTIVE SITE 提交 1996-08-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 19–451（433 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 1 - 434	突变：D214N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6；4.5 MM MES PH 6.0, 9% PEG 6000, 4.5 MM CACL2	分辨率 2.20 Å R-free 0.239
4D5I Hypocrea jecorina cellobiohydrolase Cel7A E212Q soaked with xylotriose. 提交 2014-11-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 18–451（434 aa）片段：CATALYTIC MODULE, RESIDUES 18-451	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CO COBALT (II) ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；0.1 M NA-MES (PH 6.0), 20% MONOMETHYL ETHER PEG 5000, 0.01 M COCL2, 12.5% GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K	分辨率 1.42 Å R-free 0.230
4D5J Hypocrea jecorina cellobiohydrolase Cel7A E217Q soaked with xylotriose. 提交 2014-11-05	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 18–451（434 aa）片段：CATALYTIC MODULE, RESIDUES 18-451	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CO COBALT (II) ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；0.1 M MES (PH 6.0), 20% MONOMETHYL ETHER PEG 5000, 0.01 M COCL2, 12.5% GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION - HANGING DROP	分辨率 1.50 Å R-free 0.199
4D5O Hypocrea jecorina cellobiohydrolase Cel7A E212Q soaked with xylopentaose. 提交 2014-11-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 18–451（434 aa）片段：CATALYTIC MODULE, RESIDUES 18-451	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CO COBALT (II) ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；0.1 M NA-MES (PH 6.0), 20% MONOMETHYL ETHER PEG 5000, 0.01 M COCL2, 12.5% GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K	分辨率 1.52 Å R-free 0.250
4D5P Hypocrea jecorina cellobiohydrolase Cel7A E217Q soaked with xylopentaose. 提交 2014-11-07	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 18–451（434 aa）片段：CATALYTIC MODULE, RESIDUES 18-451	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CO COBALT (II) ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；0.1 M MES (PH 6.0), 20% MONOMETHYL ETHER PEG 5000, 0.01 M COCL2, 12.5% GLYCEROL. VAPOR DIFFUSION - HANGING DROP	分辨率 1.89 Å R-free 0.268
4D5Q Hypocrea jecorina Cel7A (wild type) soaked with xylopentaose. 提交 2014-11-07	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 18–451（434 aa）片段：CATALYTIC MODULE, RESIDUES 18-451	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CO COBALT (II) ION × 4 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 XYP beta-D-xylopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；0.1 M NA-MES (PH 6.0), 20% MONOMETHYL ETHER PEG 5000, 0.01 M COCL2, 12.5% GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K	分辨率 1.68 Å R-free 0.186
4D5V Hypocrea jecorina cellobiohydrolase Cel7A E217Q soaked with xylotetraose. 提交 2014-11-07	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 18–451（434 aa）片段：CATALYTIC MODULE, RESIDUES 18-451	突变：YES [E217Q] 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CO COBALT (II) ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；0.1 M MES (PH 6.0), 20% MONOMETHYL ETHER PEG 5000, 0.01 M COCL2, 12.5% GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION - HANGING DROP	分辨率 1.62 Å R-free 0.179
4P1H Crystal structure of wild type Hypocrea jecorina Cel7a in a monoclinic crystal form 提交 2014-02-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 18–449（432 aa）片段：Catalytic Domain (UNP residues 18-449)	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 SM SAMARIUM (III) ION × 1 BEN BENZAMIDINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；308 K；PEG3350, Benzamidine, Gadolinium(III) chloride hexahydrate, HEPES	分辨率 1.50 Å R-free 0.190
4P1J Crystal structure of wild type Hypocrea jecorina Cel7a in a hexagonal crystal form 提交 2014-02-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 18–451（434 aa）片段：UNP residues 18-451	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 SM SAMARIUM (III) ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；308 K；PEG 6000, Cellohexaose, Samarium(III) chloride hexahydrate, HEPES	分辨率 2.62 Å R-free 0.213
4UWT Hypocrea jecorina Cel7A E212Q mutant in complex with p-nitrophenyl cellobioside 提交 2014-08-14	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 18–451（434 aa）片段：CATALYTIC MODULE, RESIDUES 18-451	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CO COBALT (II) ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 NPO P-NITROPHENOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；0.1 M NA-MES (PH 6.0), 21% MONOMETHYL ETHER PEG 5000, 0.005 M COCL2, 12% GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K	分辨率 1.20 Å R-free 0.159
4V0Z o-nitrophenyl Cellobioside as an Active Site Probe for Family 7 Cellobiohydrolases 提交 2014-09-19	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 18–451（434 aa）片段：CATALYTIC MODULE, RESIDUES 18-451	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CO COBALT (II) ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 OPO O-NITROPHENOL × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；0.1 M NAMES (PH 7.0), 25% M5K, 12.5% GLYCEROL AND 10 MM COCL2	分辨率 1.70 Å R-free 0.157
5OA5 CELLOBIOHYDROLASE I (CEL7A) FROM HYPOCREA JECORINA WITH IMPROVED THERMAL STABILITY 提交 2017-06-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 19–451（433 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 18-451	突变：S8P, T41I, N49S, A68T, N89D, S92T, S113N, S196T, P227L, D249K, T255P, S278P, E295K, T296P, T332Y, V304D, S411F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；25.5% POLYETHYLENE GLYCOL (PEG) 4000, 0.17 M AMSO4 AND 15% GLYCEROL	分辨率 2.10 Å R-free 0.244
5OA5 CELLOBIOHYDROLASE I (CEL7A) FROM HYPOCREA JECORINA WITH IMPROVED THERMAL STABILITY 提交 2017-06-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 19–451（433 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN, RESIDUES 18-451	突变：S8P, T41I, N49S, A68T, N89D, S92T, S113N, S196T, P227L, D249K, T255P, S278P, E295K, T296P, T332Y, V304D, S411F 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；25.5% POLYETHYLENE GLYCOL (PEG) 4000, 0.17 M AMSO4 AND 15% GLYCEROL	分辨率 2.10 Å R-free 0.244
5X34 Solution structure of the Family 1 carbohydrate-binding module, unglycosylated form 提交 2017-02-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）片段：UNP residues 478-513	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成 5 mg/mL CBM, 50 mM [U-2H] sodium acetate, 0.1 mg/mL DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 5 mg/mL CBM, 50 mM [U-2H] sodium acetate, 0.1 mg/mL DSS, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
5X35 Solution structure of the Family 1 carbohydrate-binding module with mannosylated Thr1 提交 2017-02-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）片段：UNP residues 478-513	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成 5 mg/mL CBM, 50 mM [U-2H] sodium acetate, 0.1 mg/mL DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 5 mg/mL CBM, 50 mM [U-2H] sodium acetate, 0.1 mg/mL DSS, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
5X36 Solution structure of the Family 1 carbohydrate-binding module with mannosylated Ser3 提交 2017-02-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）片段：UNP residues 478-513	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成 5 mg/mL CBM, 50 mM [U-2H] sodium acetate, 0.1 mg/mL DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 5 mg/mL CBM, 50 mM [U-2H] sodium acetate, 0.1 mg/mL DSS, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
5X37 Solution structure of the Family 1 carbohydrate-binding module with mannosylated Ser14 提交 2017-02-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）片段：UNP residues 478-513	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成 5 mg/mL CBM, 50 mM [U-2H] sodium acetate, 0.1 mg/mL DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 5 mg/mL CBM, 50 mM [U-2H] sodium acetate, 0.1 mg/mL DSS, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
5X38 Solution structure of the Family 1 carbohydrate-binding module with glucosylated Ser3 提交 2017-02-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）片段：UNP residues 478-513	未记录	BGC beta-D-glucopyranose × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成 5 mg/mL CBM, 50 mM [U-2H] sodium acetate, 0.1 mg/mL DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 5 mg/mL CBM, 50 mM [U-2H] sodium acetate, 0.1 mg/mL DSS, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
5X39 Solution structure of the Family 1 carbohydrate-binding module Q2A mutant with mannosylated Ser3 提交 2017-02-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）片段：UNP residues 478-513	突变：Q2A	MAN alpha-D-mannopyranose × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成 5 mg/mL CBM-Q2A, 50 mM [U-2H] sodium acetate, 0.1 mg/mL DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 5 mg/mL CBM-Q2A, 50 mM [U-2H] sodium acetate, 0.1 mg/mL DSS, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
5X3C Solution structure of the Family 1 carbohydrate-binding module Y5A mutant with mannosylated Ser3 提交 2017-02-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）片段：UNP residues 478-513	突变：Y5A	MAN alpha-D-mannopyranose × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成 5 mg/mL CBM-Y5A, 50 mM [U-2H] sodium acetate, 0.1 mg/mL DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 5 mg/mL CBM-Y5A, 50 mM [U-2H] sodium acetate, 0.1 mg/mL DSS, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
6GRN CELLOBIOHYDROLASE I (CEL7A) FROM Trichoderma reesei with S-dihydroxypropranolol in the active site 提交 2018-06-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 19–451（433 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CO COBALT (II) ION × 2 F9B 2-[[(2~{S})-3-naphthalen-1-yloxy-2-oxidanyl-propyl]amino]propane-1,3-diol × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；293 K；18% mPEG 5000, 10 mM sodium acetate (ph 5.0), 14% glycerol, 11 mM cobalt chloride	分辨率 1.79 Å R-free 0.188
7NYT Trichoderma reesei Cel7A E212Q mutant in complex with lactose. 提交 2021-03-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 18–451（434 aa）	突变：E212Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 BGC beta-D-glucopyranose × 1 GAL beta-D-galactopyranose × 1 NPO P-NITROPHENOL × 1 CO COBALT (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；294 K；50 mM morpholinoethane sulphonic acid (pH 6.0), 21.25% polyethylene glycol 5000 monomethyl ether, 12.5% glycerol, 5 mM cobalt chloride	分辨率 1.09 Å R-free 0.142
7OC8 Trichoderma reesei Cel7A E212Q mutant in complex with pNPL 提交 2021-04-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 18–451（434 aa）	突变：E212Q 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 NPO P-NITROPHENOL × 2 CO COBALT (II) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；294 K；50 mM morpholinoethane sulphonic acid(pH 6.0), 21.25% polyethylene glycol 5000 monomethyl ether, 12.5% glycerol, 5 mM cobalt chloride	分辨率 1.60 Å R-free 0.184
7YHF Solution structure of S3C mutant of carbohydrate binding module (CBM) of the glycoside hydrolase Family 7 cellobiohydrolase from Trichoderma reesei 提交 2022-07-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）	突变：S3C	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成 4 mg/mL CBMS3C, 50 mM [U-100% 2H] sodium acetate, 0.01 % w/v DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 2 mg/mL CBMS3C, 50 mM [U-100% 2H] sodium acetate, 0.01 % w/v DSS, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
7YHG Solution structure of S-mono-mannosylated S3C mutant of carbohydrate binding module (CBM) of the glycoside hydrolase Family 7 cellobiohydrolase from Trichoderma reesei 提交 2022-07-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）	未记录	MAN alpha-D-mannopyranose × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成 4 mg/mL CBMS3C-Man, 50 mM [U-100% 2H] sodium acetate, 0.01 % w/v DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 4 mg/L CBMS3C-Man, 50 mM [U-100% 2H] sodium acetate, 0.01 % w/v DSS, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
7YHH Solution structure of S-di-mannosylated S3C mutant of carbohydrate binding module (CBM) of the glycoside hydrolase Family 7 cellobiohydrolase from Trichoderma reesei 提交 2022-07-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成 4 mg/mL CBMS3C-ManMan, 50 mM [U-100% 2H] sodium acetate, 0.01 % w/v DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 4 mg/mL CBMS3C-ManMan, 50 mM [U-100% 2H] sodium acetate, 0.01 % w/v DSS, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
7YHI Solution structure of O-di-mannosylated carbohydrate binding module (CBM) of the glycoside hydrolase Family 7 cellobiohydrolase from Trichoderma reesei 提交 2022-07-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 478–513（36 aa）片段：UNP residues 478-513	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 1 NMR样品组成 4 mg/mL CBM020, 50 mM [U-100% 2H] sodium acetate, 0.01 % w/v DSS, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 4 mg/mL CBM020, 50 mM [U-100% 2H] sodium acetate, 0.01 % w/v DSS, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供

共 41 个其他 PDB 条目、44 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GUX1_HYPJE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–434； UniProt 18–451

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4c4d
沉积日期 deposition_date	2013-09-05
结构标题 title	Covalent glycosyl-enzyme intermediate of Hypocrea jecorina Cel7a E217Q mutant trapped using DNP-2-deoxy-2-fluoro-cellotrioside
关键词 keywords	HYDROLASE, GLYCOSIDE HYDROLASE, CELLOBIOHYDROLASE, CELLULASE.; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	21.54 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	20.37 Å
零角强度 I(0) i0	44499600.00
分子量 molecular_weight	48036.0 kDa
排除体积 excluded_volume	58209 Å³
包络体积 envelope_volume	65039 Å³
水化壳体积 shell_volume	25654 Å³
包络直径 envelope_diameter	70.9 Å
壳层 Rg shell_rg	28.05 Å
包络 Rg envelope_rg	20.71 Å
形状 Rg shape_rg	20.34 Å
总 Rg total_rg	21.27 Å
总原子数 total_atoms	3351
残基数 n_residues	433
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	68.0 Å
Rg (实空间) rg_real	21.39 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.32 Å
I(0) (实空间) i0_real	4.4500e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.8040e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	21.42 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	44500000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8911
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	67.0 Å
偏度 Skewness skewness	0.171
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.397
角度范围 angular_range	— – 0.3700 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	9073000.0000
实空间数据点数 n_real_points	69
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.880; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.992; Smooth: 0.948

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	CELLULOSE 1,4-BETA-CELLOBIOSIDASE
分子量 formula_weight	46067.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.2.1.91
突变 mutation	YES
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	4127

QSACTLQSETHPPLTWQKCSSGGTCTQQTGSVVIDANWRWTHATNSSTNCYDGNTWSSTLCPDNETCAKNCCLDGAAYASTYGVTTSGNSLSIDFVTQSAQKNVGARLYLMASDTTYQEFTLLGNEFSFDVDVSQLPCGLNGALYFVSMDADGGVSKYPTNTAGAKYGTGYCDSQCPRDLKFINGQANVEGWEPSSNNANTGIGGHGSCCSEMDIWQANSISEALTPHPCTTVGQEICEGDGCGGTYSDNRYGGTCDPDGCDWNPYRLGNTSFYGPGSSFTLDTTKKLTVVTQFETSGAINRYYVQNGVTFQQPNAELGSYSGNELNDDYCTAEEAEFGGSSFSDKGGLTQFKKATSGGMVLVMSLWDDYYANMLWLDSTYPTNETSSTPGAVRGSCSTSSGVPAQVESQSPNAKVTFSNIKFGPIGSTGNPSG

来源 Source

来源生物 organism	TRICHODERMA REESEI
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	51453
宿主生物 host_organism	TRICHODERMA REESEI

实体 2 Entity 2 branched

描述 description	beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	342.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 branched

描述 description	;beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-deoxy-2-fluoro-alpha-D-glucopyranose ;
分子量 formula_weight	992.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	COBALT (II) ION
分子量 formula_weight	58.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	DI(HYDROXYETHYL)ETHER
分子量 formula_weight	106.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	618

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d4c4da_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.29 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
超家族 Superfamily superfamily	b.29.1 — Concanavalin A-like lectins/glucanases
家族 Family family	b.29.1.10 — Glycosyl hydrolase family 7 catalytic core

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	4c4dA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	100 — 1,4-Beta-D-Glucan Cellobiohydrolase I; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Glycoside hydrolase, family 7, domain

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	82.930 Å
晶胞边长 b length_b	83.290 Å
晶胞边长 c length_c	110.760 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	I 2 2 2
空间群编号 int_tables_number	23
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.320 Å
最低分辨率 resolution_low	66.570 Å
R 因子 r_factor	0.1677
R_work r_work	0.1668
R_free r_free	0.1867

fit	/app/data/saxs_computation/c4/4c4d/4c4d.fit
pddf	/app/data/pr_computation/c4/4c4d/4c4d.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/c4/4c4d/4c4d.dat