4dk1

Crystal Structure of MacA-MexA chimeric protein, containing the Pseudomonas aeruginosa MexA alpha-hairpin domain.

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Putative MacA, Multidrug resistance protein mexA

Pseudomonas aeruginosa

UniProt P52477

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 同源多聚体 蛋白 6 无其他共同聚合物 与蛋白数一致
2 信息不足 同源多聚体 蛋白 6 无其他共同聚合物 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MEXA_PSEAE
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 64–127; UniProt 95–158 作者链 B; PDB构建体 64–127; UniProt 95–158 作者链 C; PDB构建体 64–127; UniProt 95–158 作者链 D; PDB构建体 64–127; UniProt 95–158

Putative MacA, Multidrug resistance protein mexA

Pseudomonas aeruginosa

UniProt Q2EHL9

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 信息不足 同源多聚体 蛋白 6 无其他共同聚合物 与蛋白数一致
2 信息不足 同源多聚体 蛋白 6 无其他共同聚合物 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q2EHL9_AGGAC
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 5–63; UniProt 30–88 作者链 A; PDB构建体 128–341; UniProt 181–394 作者链 B; PDB构建体 5–63; UniProt 30–88 作者链 B; PDB构建体 128–341; UniProt 181–394 作者链 C; PDB构建体 5–63; UniProt 30–88 作者链 C; PDB构建体 128–341; UniProt 181–394 作者链 D; PDB构建体 5–63; UniProt 30–88 作者链 D; PDB构建体 128–341; UniProt 181–394

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4dk1
沉积日期 deposition_date2012-02-03
结构标题 titleCrystal Structure of MacA-MexA chimeric protein, containing the Pseudomonas aeruginosa MexA alpha-hairpin domain.
关键词 keywordsalpha-hairpin, lipoyl, beta-barrel domains, PERIPLASMIC PROTEIN, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4dk1__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4dk1__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

4dk1__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)43.55 Å
Rg(电子密度)43.26 Å
总 Rg43.43 Å
原子数12807
残基数1656
排除体积228510 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 4dk1__assembly_1__model_1 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 4dk1__assembly_2__model_1 hexameric (6) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

CATH v4.4 (16 domains)

结构域编号 domain_id4dk1A01
类 Class class6 — Special
架构 Architecture architecture20 — Other non-globular
拓扑 Topology topology50 — N-terminal domain of TfIIb
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily140 —
结构域编号 domain_id4dk1A02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology30 — Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 — Efflux pump adaptor protein, beta barrel domain
结构域编号 domain_id4dk1A03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain
结构域编号 domain_id4dk1A04
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily470 — Helix hairpin bin
结构域编号 domain_id4dk1B01
类 Class class6 — Special
架构 Architecture architecture20 — Other non-globular
拓扑 Topology topology50 — N-terminal domain of TfIIb
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily140 —
结构域编号 domain_id4dk1B02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology30 — Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 — Efflux pump adaptor protein, beta barrel domain
结构域编号 domain_id4dk1B03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain
结构域编号 domain_id4dk1B04
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily470 — Helix hairpin bin
结构域编号 domain_id4dk1C01
类 Class class6 — Special
架构 Architecture architecture20 — Other non-globular
拓扑 Topology topology50 — N-terminal domain of TfIIb
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily140 —
结构域编号 domain_id4dk1C02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology30 — Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 — Efflux pump adaptor protein, beta barrel domain
结构域编号 domain_id4dk1C03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain
结构域编号 domain_id4dk1C04
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily470 — Helix hairpin bin
结构域编号 domain_id4dk1D01
类 Class class6 — Special
架构 Architecture architecture20 — Other non-globular
拓扑 Topology topology50 — N-terminal domain of TfIIb
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily140 —
结构域编号 domain_id4dk1D02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology30 — Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 — Efflux pump adaptor protein, beta barrel domain
结构域编号 domain_id4dk1D03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain
结构域编号 domain_id4dk1D04
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily470 — Helix hairpin bin
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7. 引用文献 (1)