SAXSdb — 4h62

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11

Saccharomyces cerevisiae

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 22 × 1 （P32570） Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17 × 1 （P32569） 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MED11_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 5–36； UniProt 84–115

Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 22

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P32570

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11 × 1 （Q99278） Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17 × 1 （P32569） 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MED22_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 V； PDB构建体 6–31； UniProt 96–121

Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P32569

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11 × 1 （Q99278） Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 22 × 1 （P32570） 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MED17_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 Q； PDB构建体 2–312； UniProt 377–687

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4h62
沉积日期 deposition_date	2012-09-19
结构标题 title	Structure of the Saccharomyces cerevisiae Mediator subcomplex Med17C/Med11C/Med22C
关键词 keywords	TRANSCRIPTION, MEDIATOR COMPLEX, NUCLEUS; TRANSCRIPTION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4h62__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4h62__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4h62__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	24.02 Å
Rg（电子密度）	23.16 Å
总 Rg	23.70 Å
原子数	2556
残基数	306
排除体积	46546 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4h62__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11
分子量 formula_weight	4341.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K
原子数 atom_count	2556

GSHMINVNKKALGQDTEKMEEQLDLLSAILDPSKSKGAGS

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 22
分子量 formula_weight	3404.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	V

GAGSGVTRFDEKQIEELLDNCIETFVAEKTT

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17
分子量 formula_weight	36552.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q

MKGTDFVHSVKKFLRVRIFTKIESEDDYILSGESVMDRDSESEEAETKDIRKQIQLLKKIIFEKELMYQIKKECALLISYGVSIENENKVIIELPNEKFEIELLSLDDDSIVNHEQDLPKINDKRANLMLVMLRLLLVVIFKKTLRSRISSPHGLINLNVDDDILIIRPILGKVRFANYKLLLKKIIKDYVLDIVPGSSITETEVEREQPQENKNIDDENITKLNKEIRAFDKLLNIPRRELKINLPLTEHKSPNLSLMLESPNYCNALIHIKFSAGTEANAVSFDTTFSDFKEVEDFLHFIVAEYIQQKKV

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID
分子量 formula_weight	195.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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晶胞边长 a length_a	261.230 Å
晶胞边长 b length_b	261.230 Å
晶胞边长 c length_c	47.740 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	18

空间群 space_group	H 3 2
空间群编号 int_tables_number	155
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.000 Å
最低分辨率 resolution_low	65.308 Å
R 因子 r_factor	0.2056
R_work r_work	0.2043
R_free r_free	0.2285

Structure of the Saccharomyces cerevisiae Mediator subcomplex Med17C/Med11C/Med22C

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 22

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4h62__assembly_1__model_1

4h62__assembly_1__model_1 | I(q)

4h62__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

7. 引用文献 (1)

Structure of the Saccharomyces cerevisiae Mediator subcomplex Med17C/Med11C/Med22C

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 11

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 22

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4h62__assembly_1__model_1

4h62__assembly_1__model_1 | I(q)

4h62__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

7. 引用文献 (1)