SAXSdb — 4j8f

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Heat shock 70 kDa protein 1A/1B, Hsc70-interacting protein

Rattus norvegicus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–382	片段：P08107 residues 1-382, P50503 residues 77-247	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 IOD IODIDE ION × 34	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；291 K；17 % PEG-3350 and 0.2 M NH4I, pH 7.4, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K	分辨率 2.70 Å R-free 0.261
2	信息不足单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–382	片段：P08107 residues 1-382, P50503 residues 77-247	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 IOD IODIDE ION × 17	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；291 K；17 % PEG-3350 and 0.2 M NH4I, pH 7.4, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K	分辨率 2.70 Å R-free 0.261

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4J8F	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1HJO ATPase domain of human heat shock 70kDa protein 1 提交 1998-10-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 3–382（380 aa）片段：42KD ATPASE N-TERMINAL FRAGMENT	未记录	CA CALCIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；8% PEG-8000 25 MM IMIDAZOLE, PH 7.0 20MM CACL2 1MM GAMMA-S-ATP	分辨率 2.30 Å R-free 0.253
1S3X The crystal structure of the human Hsp70 ATPase domain 提交 2004-01-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–382（382 aa）片段：ATPASE DOMAIN	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；imidazole buffer, PEG 8000, CaCl2, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.84 Å R-free 0.219
1XQS Crystal structure of the HspBP1 core domain complexed with the fragment of Hsp70 ATPase domain 提交 2004-10-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 184–371（188 aa）片段：LOBE II OF ATPASE DOMAIN (184-371)	未记录	AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG8000, Potassium chloride, Magnesium chloride, AMP-PNP, DTT, HEPES KOH, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.296
1XQS Crystal structure of the HspBP1 core domain complexed with the fragment of Hsp70 ATPase domain 提交 2004-10-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 184–371（188 aa）片段：LOBE II OF ATPASE DOMAIN (184-371)	未记录	AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG8000, Potassium chloride, Magnesium chloride, AMP-PNP, DTT, HEPES KOH, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.296
2LMG Solution Structure of The C-terminal Domain (537-610) of Human Heat Shock Protein 70 提交 2011-12-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 537–610（74 aa）片段：UNP residues 537-610	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；压力 ambient NMR样品组成 1 mM [U-100% 15N] protein-1, 20 mM sodium phosphate-2, 50 mM sodium chloride-3, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein-4, 20 mM sodium phosphate-5, 50 mM sodium chloride-6, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein-7, 20 mM sodium phosphate-8, 50 mM sodium chloride-9, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
3A8Y Crystal structure of the complex between the BAG5 BD5 and Hsp70 NBD 提交 2009-10-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–388（388 aa）片段：Nucleotide-binding domain, UNP residues 1-388	未记录	TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M Tris-HCL, 0.25M Trimethylamine n-oxide, 20% PEG MME 2000, 3% Hexanediol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.30 Å R-free 0.281
3A8Y Crystal structure of the complex between the BAG5 BD5 and Hsp70 NBD 提交 2009-10-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–388（388 aa）片段：Nucleotide-binding domain, UNP residues 1-388	未记录	TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；0.1M Tris-HCL, 0.25M Trimethylamine n-oxide, 20% PEG MME 2000, 3% Hexanediol , pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.30 Å R-free 0.281
3ATU Crystal structure of human Hsp70 NBD in the ADP- and Mg ion-bound state 提交 2011-01-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–388（388 aa）片段：Nucleotide-binding domain (UNP RESIDUES 1-388)	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 PG0 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.1M HEPES-NaOH (pH 7.0), 0.15M MgCl2, 30 % PEG MME 500, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.65 Å R-free 0.218
3ATV Crystal structure of human Hsp70 NBD in the ADP-bound and Mg ion-free state 提交 2011-01-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–388（388 aa）片段：Nucleotide-binding domain (UNP RESIDUES 1-388)	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 K POTASSIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M Bis-Tris (pH 5.5), 0.25M KNO3, 25% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.58 Å R-free 0.208
3AY9 Crystal structure of human Hsp70 NBD in the ADP-, Mg ion-, and K ion-bound state 提交 2011-05-03	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–388（388 aa）片段：nucleotide-binding domain (UNP RESIDUES 1-388)	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；293 K；0.05M calcium chloride, 0.1M bis-tris (pH6.5), 30% PEG MME 550, pH 5.7, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.75 Å R-free 0.213
3D2E Crystal structure of a complex of Sse1p and Hsp70, Selenomethionine-labeled crystals 提交 2008-05-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–382（382 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；277 K；17 % (w/v) polyethyleneglycol-6000, 50 mM KCl, 100 mM HEPES-KOH pH 7.5, vapor diffusion, temperature 277K	分辨率 2.35 Å R-free 0.262
3D2E Crystal structure of a complex of Sse1p and Hsp70, Selenomethionine-labeled crystals 提交 2008-05-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–382（382 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；277 K；17 % (w/v) polyethyleneglycol-6000, 50 mM KCl, 100 mM HEPES-KOH pH 7.5, vapor diffusion, temperature 277K	分辨率 2.35 Å R-free 0.262
3D2F Crystal structure of a complex of Sse1p and Hsp70 提交 2008-05-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1–382（382 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 3 K POTASSIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；277 K；15 % (w/v) polyethyleneglycol-6000, 100 mM Tris-HCl pH 8.0, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 2.30 Å R-free 0.244
3D2F Crystal structure of a complex of Sse1p and Hsp70 提交 2008-05-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 1–382（382 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 3 K POTASSIUM ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8；277 K；15 % (w/v) polyethyleneglycol-6000, 100 mM Tris-HCl pH 8.0, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, temperature 277K	分辨率 2.30 Å R-free 0.244
3JXU Crystal structure of the human 70kDa heat shock protein 1A (Hsp70-1) ATPase domain in complex with ADP and inorganic phosphate 提交 2009-09-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–387（387 aa）片段：ATPase domain, UNP resiudes 1-387	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.2M magnesium chloride hexahydrate, 0.1M bis-tris, 25% PEG 3350, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.14 Å R-free 0.262
3LOF C-terminal domain of human heat shock 70kDa protein 1B. 提交 2010-02-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 534–641（108 aa）片段：C-terminal domain 链 B 534–641（108 aa）片段：C-terminal domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；294 K；2.4 M sodium malonate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 2.40 Å R-free 0.235
3LOF C-terminal domain of human heat shock 70kDa protein 1B. 提交 2010-02-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 534–641（108 aa）片段：C-terminal domain 链 D 534–641（108 aa）片段：C-terminal domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；294 K；2.4 M sodium malonate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 2.40 Å R-free 0.235
3LOF C-terminal domain of human heat shock 70kDa protein 1B. 提交 2010-02-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 534–641（108 aa）片段：C-terminal domain 链 F 534–641（108 aa）片段：C-terminal domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；294 K；2.4 M sodium malonate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 294K	分辨率 2.40 Å R-free 0.235
4PO2 Crystal Structure of the Stress-Inducible Human Heat Shock Protein HSP70 Substrate-Binding Domain in Complex with Peptide Substrate 提交 2014-02-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 386–613（228 aa）片段：C-TERMINAL SUBSTRATE-BINDING DOMAIN	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M Bis-Tris (pH 5.5), 0.2M Li2SO4, 28~30% PEG3350 in the reservoir and 0.1M Bis-Tris (pH 5.5), 0.2M Li2SO4, 22~25% PEG3350 in the crystallization drop, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.00 Å R-free 0.222
4PO2 Crystal Structure of the Stress-Inducible Human Heat Shock Protein HSP70 Substrate-Binding Domain in Complex with Peptide Substrate 提交 2014-02-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 386–613（228 aa）片段：C-TERMINAL SUBSTRATE-BINDING DOMAIN	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M Bis-Tris (pH 5.5), 0.2M Li2SO4, 28~30% PEG3350 in the reservoir and 0.1M Bis-Tris (pH 5.5), 0.2M Li2SO4, 22~25% PEG3350 in the crystallization drop, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.00 Å R-free 0.222
4PO2 Crystal Structure of the Stress-Inducible Human Heat Shock Protein HSP70 Substrate-Binding Domain in Complex with Peptide Substrate 提交 2014-02-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 386–613（228 aa）片段：C-TERMINAL SUBSTRATE-BINDING DOMAIN 链 B 386–613（228 aa）片段：C-TERMINAL SUBSTRATE-BINDING DOMAIN	未记录	SO4 SULFATE ION × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；0.1M Bis-Tris (pH 5.5), 0.2M Li2SO4, 28~30% PEG3350 in the reservoir and 0.1M Bis-Tris (pH 5.5), 0.2M Li2SO4, 22~25% PEG3350 in the crystallization drop, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K	分辨率 2.00 Å R-free 0.222
4WV5 HEAT SHOCK PROTEIN 70 SUBSTRATE BINDING DOMAIN 提交 2014-11-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 395–543（149 aa）片段：unp residues 395-543	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；294 K；11 mg/ml protein in 25mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, 1 mM TCEP was mixed 1:1 with reservior solution containing 0.1 M Sodium Acetate, pH 4.5, 2M Ammonium Sulfate	分辨率 2.04 Å R-free 0.224
4WV5 HEAT SHOCK PROTEIN 70 SUBSTRATE BINDING DOMAIN 提交 2014-11-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 395–543（149 aa）片段：unp residues 395-543	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；294 K；11 mg/ml protein in 25mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, 1 mM TCEP was mixed 1:1 with reservior solution containing 0.1 M Sodium Acetate, pH 4.5, 2M Ammonium Sulfate	分辨率 2.04 Å R-free 0.224
4WV7 HEAT SHOCK PROTEIN 70 SUBSTRATE BINDING DOMAIN WITH COVALENTLY LINKED NOVOLACTONE 提交 2014-11-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 395–543（149 aa）片段：unp residues 395-543	未记录	3UM (5beta,6alpha,8alpha,14alpha)-13-ethenyl-5,6-dihydroxy-14-methylpodocarp-12-en-15-oic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；294 K；10 mg/ml covalently modified protein in 25 mM Tris-HCl, 50 mM NaCl, 1 mM TCEP was mixed 1:1 with reservior solution containing 0.1 M HEPES, pH 7.0, 70% 2-methyl-2,4-pentanediol	分辨率 2.42 Å R-free 0.272
4WV7 HEAT SHOCK PROTEIN 70 SUBSTRATE BINDING DOMAIN WITH COVALENTLY LINKED NOVOLACTONE 提交 2014-11-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 395–543（149 aa）片段：unp residues 395-543	未记录	3UM (5beta,6alpha,8alpha,14alpha)-13-ethenyl-5,6-dihydroxy-14-methylpodocarp-12-en-15-oic acid × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；294 K；10 mg/ml covalently modified protein in 25 mM Tris-HCl, 50 mM NaCl, 1 mM TCEP was mixed 1:1 with reservior solution containing 0.1 M HEPES, pH 7.0, 70% 2-methyl-2,4-pentanediol	分辨率 2.42 Å R-free 0.272

共 15 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称	HSP71_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 8–389； UniProt 1–382

Heat shock 70 kDa protein 1A/1B, Hsc70-interacting protein

Rattus norvegicus

UniProt P50503

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足同源多聚体蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 77–247	片段：P08107 residues 1-382, P50503 residues 77-247	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 IOD IODIDE ION × 34	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；291 K；17 % PEG-3350 and 0.2 M NH4I, pH 7.4, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K	分辨率 2.70 Å R-free 0.261
2	信息不足单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 77–247	片段：P08107 residues 1-382, P50503 residues 77-247	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 IOD IODIDE ION × 17	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；291 K；17 % PEG-3350 and 0.2 M NH4I, pH 7.4, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K	分辨率 2.70 Å R-free 0.261

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4J8F	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4J8C Crystal structure of the dimerization domain of Hsc70-interacting protein 提交 2013-02-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–44（44 aa）片段：UNP residues 1-44 链 B 1–44（44 aa）片段：UNP residues 1-44	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；2.52 Na-malonate, pH 7.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K	分辨率 1.10 Å R-free 0.162
4J8D Middle domain of Hsc70-interacting protein, crystal form II 提交 2013-02-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 79–248（170 aa）片段：UNP residues 78-247	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；2.15 Na-malonate, pH 7.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K	分辨率 2.80 Å R-free 0.299
4J8D Middle domain of Hsc70-interacting protein, crystal form II 提交 2013-02-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 79–248（170 aa）片段：UNP residues 78-247	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；2.15 Na-malonate, pH 7.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K	分辨率 2.80 Å R-free 0.299
4J8D Middle domain of Hsc70-interacting protein, crystal form II 提交 2013-02-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 79–248（170 aa）片段：UNP residues 78-247	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；2.15 Na-malonate, pH 7.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K	分辨率 2.80 Å R-free 0.299
4J8D Middle domain of Hsc70-interacting protein, crystal form II 提交 2013-02-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 79–248（170 aa）片段：UNP residues 78-247	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；2.15 Na-malonate, pH 7.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K	分辨率 2.80 Å R-free 0.299
4J8E Middle domain of Hsc70-interacting protein, crystal form I 提交 2013-02-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 78–247（170 aa）片段：UNP residues 78-247	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；2.3 Na-malonate, pH 6.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K	分辨率 2.60 Å R-free 0.248
4J8E Middle domain of Hsc70-interacting protein, crystal form I 提交 2013-02-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 78–247（170 aa）片段：UNP residues 78-247	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；2.3 Na-malonate, pH 6.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K	分辨率 2.60 Å R-free 0.248
4J8E Middle domain of Hsc70-interacting protein, crystal form I 提交 2013-02-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 78–247（170 aa）片段：UNP residues 78-247 链 B 78–247（170 aa）片段：UNP residues 78-247	未记录	GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；2.3 Na-malonate, pH 6.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K	分辨率 2.60 Å R-free 0.248

共 3 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	F10A1_RAT
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 391–561； UniProt 77–247

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4j8f
沉积日期 deposition_date	2013-02-14
结构标题 title	Crystal structure of a fusion protein containing the NBD of Hsp70 and the middle domain of Hip
关键词 keywords	actin-like fold, nucleotide binding domain, tetratricopeptide repeat, solenoid, Molecular chaperone complex, cytosol, Chaperone; CHAPERONE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	26.80 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	25.98 Å
零角强度 I(0) i0	76561000.00
分子量 molecular_weight	62938.0 kDa
排除体积 excluded_volume	75954 Å³
包络体积 envelope_volume	95620 Å³
水化壳体积 shell_volume	30957 Å³
包络直径 envelope_diameter	87.4 Å
壳层 Rg shell_rg	33.20 Å
包络 Rg envelope_rg	25.99 Å
形状 Rg shape_rg	25.97 Å
总 Rg total_rg	26.71 Å
总原子数 total_atoms	4293
残基数 n_residues	551
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	83.1 Å
Rg (实空间) rg_real	26.77 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.56 Å
I(0) (实空间) i0_real	7.6560e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.1070e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	26.78 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	76560000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9000
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	81.7 Å
偏度 Skewness skewness	0.318
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.389
角度范围 angular_range	— – 0.2950 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	15030000.0000
实空间数据点数 n_real_points	60
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.945; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.998; Smooth: 0.861

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Heat shock 70 kDa protein 1A/1B, Hsc70-interacting protein
分子量 formula_weight	62418.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	4338

GAMDPEFMAKAAAIGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVINDGDKPKVQVSYKGETKAFYPEEISSMVLTKMKEIAEAYLGYPVTNAVITVPAYFNDSQRQATKDAGVIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDRTGKGERNVLIFDLGGGTFDVSILTIDDGIFEVKATAGDTHLGGEDFDNRLVNHFVEEFKRKHKKDISQNKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASLEIDSLFEGIDFYTSITRARFEELCSDLFRSTLEPVEKALRDAKLDKAQIHDLVLVGGSTRIPKVQKLLQDFFNGRDLNKSINPDEAVAYGAAVQAAILMGLESDLEIDNEGVIEADTDAPQEMGDENAEITEAMMDEANEKKGAAIDALNDGELQKAIDLFTDAIKLNPRLAILYAKRASVFVKLQKPNAAIRDCDRAIEINPDSAQPYKWRGKAHRLLGHWEEAARDLALACKLDYDEDASAMLREVQPRAQKIAEHRRKYERKREEREIK

来源 Source

来源生物 organism	Rattus norvegicus
通用名 common_name	human, brown rat,rat,rats
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10116
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	PHOSPHATE ION
分子量 formula_weight	95.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	IODIDE ION
分子量 formula_weight	126.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	17

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	45

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	4j8fA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	4j8fA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	4j8fA03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

结构域编号 domain_id	4j8fA04
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	25 — Alpha Horseshoe
拓扑 Topology topology	40 — Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Tetratricopeptide repeat domain

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	65.596 Å
晶胞边长 b length_b	65.596 Å
晶胞边长 c length_c	141.470 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 41
空间群编号 int_tables_number	76
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.700 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	0.1970
R_work r_work	0.1937
R_free r_free	0.2613

fit	/app/data/saxs_computation/j8/4j8f/4j8f.fit
pddf	/app/data/pr_computation/j8/4j8f/4j8f.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/j8/4j8f/4j8f.dat

Crystal structure of a fusion protein containing the NBD of Hsp70 and the middle domain of Hip

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Heat shock 70 kDa protein 1A/1B, Hsc70-interacting protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Heat shock 70 kDa protein 1A/1B, Hsc70-interacting protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)