4lb9

X-ray study of human serum albumin complexed with etoposide

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

SERUM ALBUMIN

物种未注明

UniProt P02768

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 MYRISTIC ACID × 4 ;(5S,5aR,8aR,9R)-9-(4-hydroxy-3,5-dimethoxyphenyl)-8-oxo-5,5a,6,8,8a,9-hexahydrofuro[3',4':6,7]naphtho[2,3-d][1,3]dioxol -5-yl 4,6-O-[(1R)-ethylidene]-beta-D-glucopyranoside ; × 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ALBU_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–585; UniProt 25–609

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id4lb9
沉积日期 deposition_date2013-06-20
结构标题 titleX-ray study of human serum albumin complexed with etoposide
关键词 keywordsPLASMA PROTEIN, CANCER, ONCOLOGY DRUG COMPLEX, TRANSPORT PROTEIN; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4lb9__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4lb9__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

4lb9__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)28.83 Å
Rg(电子密度)27.82 Å
总 Rg28.54 Å
原子数4741
残基数583
排除体积84959 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 4lb9__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 9 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd4lb9a1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.126 — Serum albumin-like
超家族 Superfamily superfamilya.126.1 — Serum albumin-like
家族 Family familya.126.1.1 — Serum albumin-like
结构域编号 domain_idd4lb9a2
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.126 — Serum albumin-like
超家族 Superfamily superfamilya.126.1 — Serum albumin-like
家族 Family familya.126.1.1 — Serum albumin-like
结构域编号 domain_idd4lb9a3
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.126 — Serum albumin-like
超家族 Superfamily superfamilya.126.1 — Serum albumin-like
家族 Family familya.126.1.1 — Serum albumin-like

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id4lb9A01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id4lb9A02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id4lb9A03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id4lb9A04
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id4lb9A05
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id4lb9A06
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology246 — Serum Albumin; Chain A, Domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
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7. 引用文献 (8)