4ny6

Neutron structure of leucine and valine methyl protonated type III antifreeze

D_max: 42.9 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Type-3 ice-structuring protein HPLC 12

Zoarces americanus

UniProt P19614

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–63	未记录	无其他共同聚合物	实验方法未声明 X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.2；285 K；10mg/ml protein in 50 mM sodium acetate pD 5.2. Drops containing 20 ml protein solution and 30 ml precipitant buffer (2.1 M ammonium sulfate, 9% d8-glycerol) were equilibrated against 1 ml precipitant buffer in the reservoir, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 285K	分辨率未提供

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4NY6	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1AME CRYSTAL STRUCTURE OF TYPE III ANTIFREEZE PROTEIN AT 4 C 提交 1997-06-13	突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–63（63 aa）	突变：INS(0), P64A, P65A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.5；277 K；53% AMMONIUM SULFATE 100 MM SODIUM ACETATE PH 4.5 CRYSTALLIZED AT 4 DEGREES C, temperature 277K	分辨率 1.65 Å R-free 0.282
1B7I TYPE III ANTIFREEZE PROTEIN ISOFORM HPLC 12 K61R 提交 1999-01-24	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–65（65 aa）	突变：K61R, P64A, P65A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.5	分辨率 1.65 Å R-free 0.238
1B7J TYPE III ANTIFREEZE PROTEIN ISOFORM HPLC 12 V20A 提交 1999-01-24	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–65（65 aa）	突变：V20A, P64A, P65A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.5	分辨率 1.65 Å R-free 0.215
1B7K TYPE III ANTIFREEZE PROTEIN ISOFORM HPLC 12 R47H 提交 1999-01-24	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–65（65 aa）	突变：R47H, P64A, P65A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.256
1EKL TYPE III ANTIFREEZE PROTEIN ISOFORM HPLC 12 E35K 提交 1999-01-21	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–65（65 aa）	突变：E35K, P64A, P65A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.5	分辨率 1.65 Å R-free 0.223
1GZI CRYSTAL STRUCTURE OF TYPE III ANTIFREEZE PROTEIN FROM OCEAN POUT, AT 1.8 ANGSTROM RESOLUTION 提交 1996-10-25	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–66（66 aa）	突变：P64A, P65A, DEL(A66)	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.6；50% AMMONIUM SULFATE, 0.1M SODIUM ACETATE, PH 5.6	分辨率 1.80 Å R-free 0.233
1HG7 High resolution structure of HPLC-12 type III antifreeze protein from Ocean Pout Macrozoarces americanus 提交 2000-12-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–65（65 aa）	突变：YES	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.6；50% AMMONIUM SULFATE, 0.1M SODIUM ACETATE, PH 4.6	分辨率 1.15 Å R-free 0.169
1JAB TYPE III ANTIFREEZE PROTEIN ISOFORM HPLC 12 T18S 提交 1999-01-24	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–65（65 aa）	突变：T18S, P64A, P65A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.5	分辨率 1.65 Å R-free 0.217
1KDE NORTH-ATLANTIC OCEAN POUT ANTIFREEZE PROTEIN TYPE III ISOFORM HPLC12 MUTANT, NMR, 22 STRUCTURES 提交 1996-07-08	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–65（65 aa）	突变：INS(M0), P64A, P65A, INS(K66, D67, E68, L69)	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.6；298 K	分辨率未提供
1KDF NORTH-ATLANTIC OCEAN POUT ANTIFREEZE PROTEIN TYPE III ISOFORM HPLC12 MUTANT, NMR, MINIMIZED AVERAGE STRUCTURE 提交 1996-07-08	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–65（65 aa）	突变：INS(M0), P64A, P65A, INS(K66, D67, E68, L69)	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.6；298 K	分辨率未提供
1MSI STRUCTURE OF ANTIFREEZE GLYCOPROTEIN QAE(HPLC 12) 提交 1996-10-08	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–66（65 aa）	突变：P64A, P65A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.25 Å R-free 0.225
1MSJ TYPE III ANTIFREEZE PROTEIN ISOFORM HPLC 12 T15V 提交 1999-01-24	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–65（65 aa）	突变：T15V, P64A, P65A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.5	分辨率 2.30 Å R-free 0.310
2AME TYPE III ANTIFREEZE PROTEIN ISOFORM HPLC 12 N14Q 提交 1999-01-18	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–65（65 aa）	突变：N14Q, P64A, P65A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.5	分辨率 2.00 Å R-free 0.261
2JIA TYPE III ANTIFREEZE PROTEIN ISOFORM HPLC 12 K61I 提交 1999-01-24	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–65（65 aa）	突变：K61I, P64A, P65A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.5	分辨率 1.60 Å R-free 0.259
2MSI TYPE III ANTIFREEZE PROTEIN ISOFORM HPLC 12 提交 1997-09-16	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–63（62 aa）	突变：A16M	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 PROTEIN WAS CRYSTALLIZED IN 50-55% AMMONIUM SULFATE, 0.1 M SODIUM ACETATE PH 4-4.5	分辨率 1.90 Å R-free 0.261
2MSJ TYPE III ANTIFREEZE PROTEIN ISOFORM HPLC 12 N46S 提交 1999-01-24	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–65（65 aa）	突变：N46S, P64A, P65A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.5	分辨率 1.90 Å R-free 0.326
2SPG TYPE III ANTIFREEZE PROTEIN ISOFORM HPLC 12 T15S 提交 1999-01-21	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–65（65 aa）	突变：T15S, P64A, P65A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.5	分辨率 1.75 Å R-free 0.249
3AME TYPE III ANTIFREEZE PROTEIN ISOFORM HPLC 12 Q9TQ44T 提交 1999-01-24	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–65（65 aa）	突变：Q9T, Q44T, P64A, P65A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.5	分辨率 2.30 Å R-free 0.299
3MSI TYPE III ANTIFREEZE PROTEIN ISOFORM HPLC 12 提交 1997-09-17	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–63（62 aa）	突变：A16H	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 PROTEIN WAS CRYSTALLIZED IN 50-55% AMMONIUM SULFATE, 0.1 M SODIUM ACETATE PH 4-4.5	分辨率 1.43 Å R-free 0.287
3QF6 Neutron structure of type-III Antifreeze Protein allows the reconstruction of AFP-ice interface 提交 2011-01-21	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–66（66 aa）	未记录	未记录非水小分子	NEUTRON DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.8；285 K；2.2M ammonium sulfate, 9% d8-glycerol, 50mM sodium acetate, pD 5.2, pH 4.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 285K	分辨率 1.85 Å R-free 0.216
4AME TYPE III ANTIFREEZE PROTEIN ISOFORM HPLC 12 T18A 提交 1999-01-24	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–65（65 aa）	突变：T18A, P64A, P65A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.5	分辨率 2.05 Å R-free 0.238
4MSI TYPE III ANTIFREEZE PROTEIN ISOFORM HPLC 12 提交 1997-09-16	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–63（62 aa）	突变：A16T	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED IN 50-55% AMMONIUM SULFATE, 0.1 M SODIUM ACETATE PH 4-4.5	分辨率 1.60 Å R-free 0.199
5C7R Revealing surface waters on an antifreeze protein by fusion protein crystallography 提交 2015-06-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–63（63 aa）片段：UNP P0AEY0 residues 27-384, UNP P19614 residues 1-63	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.4；298 K；1.75 M (NH4)2SO4, 100 mM NaOAC (pH 4.4)	分辨率 1.94 Å R-free 0.234
5C7R Revealing surface waters on an antifreeze protein by fusion protein crystallography 提交 2015-06-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1–63（63 aa）片段：UNP P0AEY0 residues 27-384, UNP P19614 residues 1-63	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.4；298 K；1.75 M (NH4)2SO4, 100 mM NaOAC (pH 4.4)	分辨率 1.94 Å R-free 0.234
5MSI TYPE III ANTIFREEZE PROTEIN ISOFORM HPLC 12 提交 1997-09-17	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–63（62 aa）	突变：A16C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED IN 50-55% AMMONIUM SULFATE, 0.1 M SODIUM ACETATE PH 4-4.5	分辨率 1.60 Å R-free 0.199
6AME TYPE III ANTIFREEZE PROTEIN ISOFORM HPLC 12 M21A 提交 1999-01-24	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–65（65 aa）	突变：M21A, P64A, P65A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.5	分辨率 2.10 Å R-free 0.237
6MSI TYPE III ANTIFREEZE PROTEIN ISOFORM HPLC 12 提交 1997-09-17	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–63（62 aa）	突变：A16R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED IN 50-55% AMMONIUM SULFATE, 0.1 M SODIUM ACETATE PH 4-4.5	分辨率 1.65 Å
7AME TYPE III ANTIFREEZE PROTEIN ISOFORM HPLC 12 T15A 提交 1999-01-24	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–65（65 aa）	突变：T15A, P64A, P65A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.5	分辨率 1.70 Å R-free 0.237
7MSI TYPE III ANTIFREEZE PROTEIN ISOFORM HPLC 12 提交 1997-09-17	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–63（62 aa）	突变：A16Y	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 4.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED IN 50-55% AMMONIUM SULFATE, 0.1 M SODIUM ACETATE PH 4-4.5	分辨率 1.70 Å R-free 0.207
7Q3V Re-refined structure of a type III antifreeze protein isoform HPLC 12 提交 2021-10-28	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 2–63（62 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50-55% AMMONIUM SULFATE, 0.1 M SODIUM ACETATE PH 4-4.5	分辨率 1.90 Å R-free 0.194
7Q3V Re-refined structure of a type III antifreeze protein isoform HPLC 12 提交 2021-10-28	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 2–63（62 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50-55% AMMONIUM SULFATE, 0.1 M SODIUM ACETATE PH 4-4.5	分辨率 1.90 Å R-free 0.194
7Q3V Re-refined structure of a type III antifreeze protein isoform HPLC 12 提交 2021-10-28	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 2–63（62 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50-55% AMMONIUM SULFATE, 0.1 M SODIUM ACETATE PH 4-4.5	分辨率 1.90 Å R-free 0.194
7Q3V Re-refined structure of a type III antifreeze protein isoform HPLC 12 提交 2021-10-28	构建体不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 2–63（62 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；50-55% AMMONIUM SULFATE, 0.1 M SODIUM ACETATE PH 4-4.5	分辨率 1.90 Å R-free 0.194
8AME TYPE III ANTIFREEZE PROTEIN ISOFORM HPLC 12 N14SA16H 提交 1999-01-24	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–65（65 aa）	突变：N14S, A16H, P64A, P65A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.5	分辨率 1.90 Å R-free 0.260
8MSI TYPE III ANTIFREEZE PROTEIN ISOFORM HPLC 12 N14SQ44T 提交 1999-01-24	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–65（65 aa）	突变：N14S, Q44T, P64A, P65A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.5	分辨率 2.60 Å R-free 0.268
9AME TYPE III ANTIFREEZE PROTEIN ISOFORM HPLC 12 S42G 提交 1999-01-24	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–65（65 aa）	突变：S42G, P64A, P65A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.5	分辨率 1.80 Å R-free 0.269
9CBE Structure of a type III antifreeze protein isoform HPLC12 re-refined using standard protocols 提交 2024-06-19	实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–63（63 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 PROTEIN WAS CRYSTALLIZED IN 50-55% AMMONIUM SULFATE, 0.1 M SODIUM ACETATE PH 4-4.5	分辨率 1.90 Å R-free 0.189
9MSI TYPE III ANTIFREEZE PROTEIN ISOFORM HPLC 12 T18N 提交 1999-01-24	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–65（65 aa）	突变：T18N, P64A, P65A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5.5；pH 5.5	分辨率 2.60 Å R-free 0.244

共 34 个其他 PDB 条目、38 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ANP12_ZOAAM
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–63； UniProt 1–63

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4ny6
沉积日期 deposition_date	2013-12-10
结构标题 title	Neutron structure of leucine and valine methyl protonated type III antifreeze
关键词 keywords	Antifreeze Protein; ANTIFREEZE PROTEIN

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	13.30 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	10.91 Å
零角强度 I(0) i0	712430.00
分子量 molecular_weight	8547.0 kDa
排除体积 excluded_volume	11839 Å³
包络体积 envelope_volume	12388 Å³
水化壳体积 shell_volume	9274 Å³
包络直径 envelope_diameter	39.4 Å
壳层 Rg shell_rg	17.13 Å
包络 Rg envelope_rg	11.82 Å
形状 Rg shape_rg	11.11 Å
总 Rg total_rg	12.47 Å
总原子数 total_atoms	1106
残基数 n_residues	65
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	42.9 Å
Rg (实空间) rg_real	13.21 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.24 Å
I(0) (实空间) i0_real	7.1240e+05
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	7.8150e+03
Rg (倒空间) rg_reciprocal	13.21 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	712400.0000
解质量估计 total_estimate	0.8765
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	16.8 Å
偏度 Skewness skewness	0.138
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.221
角度范围 angular_range	— – 0.5000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	315600.0000
实空间数据点数 n_real_points	80
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.805; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.992; Smooth: 0.985

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d4ny6a1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.85 — beta-clip
超家族 Superfamily superfamily	b.85.1 — AFP III-like domain
家族 Family family	b.85.1.1 — AFP III-like domain

结构域编号 domain_id	d4ny6a2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	4ny6A00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1210 — Type Iii Antifreeze Protein Isoform Hplc 12
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Antifreeze-like/N-acetylneuraminic acid synthase C-terminal domain

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	32.730 Å
晶胞边长 b length_b	39.120 Å
晶胞边长 c length_c	46.540 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

描述 description	Type-3 ice-structuring protein HPLC 12
分子量 formula_weight	6894.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	1240

来源生物 organism	Zoarces americanus
通用名 common_name	North-Atlantic ocean pout,mother-of-eels,muttonfish,poodler
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	8199
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

Neutron structure of leucine and valine methyl protonated type III antifreeze

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Type-3 ice-structuring protein HPLC 12

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	42

fit	/app/data/saxs_computation/ny/4ny6/4ny6.fit
pddf	/app/data/pr_computation/ny/4ny6/4ny6.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/ny/4ny6/4ny6.dat