SAXSdb — 4ons

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Catenin alpha-2

Mus musculus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 18–264	片段：beta-catenin binding domain, UNP residues 18-264	Catenin beta-1 × 1 （Q02248）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；283 K；100mM Tris-Cl, 22% polyethylene glycol monomethryl ether, pH 8.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 283K	分辨率 2.80 Å R-free 0.264
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 18–264	片段：beta-catenin binding domain, UNP residues 18-264	Catenin beta-1 × 1 （Q02248）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；283 K；100mM Tris-Cl, 22% polyethylene glycol monomethryl ether, pH 8.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 283K	分辨率 2.80 Å R-free 0.264

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4ONS	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4K1O Crystal structure of the alphaN-catenin actin-binding domain 提交 2013-04-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 651–905（255 aa）片段：C-terminal actin-binding domain	未记录	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；277 K；0.1M HEPES, pH 7.0, 1.6 M (NH4)2SO4, 0.2 M NaCl,and 0.1M K/Na tartate, vapor diffusion, temperature 277K	分辨率 2.60 Å R-free 0.231
4K1O Crystal structure of the alphaN-catenin actin-binding domain 提交 2013-04-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 651–905（255 aa）片段：C-terminal actin-binding domain	未记录	SO4 SULFATE ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；277 K；0.1M HEPES, pH 7.0, 1.6 M (NH4)2SO4, 0.2 M NaCl,and 0.1M K/Na tartate, vapor diffusion, temperature 277K	分辨率 2.60 Å R-free 0.231
4P9T Structure of the free form of the N-terminal VH1 domain of monomeric alpha-catenin 提交 2014-04-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 13–261（249 aa）片段：UNP residues 13-261	未记录	IOD IODIDE ION × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG3350, 0.1 M Bis-Tris propane (pH 6.5), 0.2 M Sodium iodide	分辨率 2.50 Å R-free 0.234
4P9T Structure of the free form of the N-terminal VH1 domain of monomeric alpha-catenin 提交 2014-04-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 13–261（249 aa）片段：UNP residues 13-261	未记录	IOD IODIDE ION × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG3350, 0.1 M Bis-Tris propane (pH 6.5), 0.2 M Sodium iodide	分辨率 2.50 Å R-free 0.234
4P9T Structure of the free form of the N-terminal VH1 domain of monomeric alpha-catenin 提交 2014-04-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 13–261（249 aa）片段：UNP residues 13-261	未记录	IOD IODIDE ION × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG3350, 0.1 M Bis-Tris propane (pH 6.5), 0.2 M Sodium iodide	分辨率 2.50 Å R-free 0.234
4P9T Structure of the free form of the N-terminal VH1 domain of monomeric alpha-catenin 提交 2014-04-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 13–261（249 aa）片段：UNP residues 13-261	未记录	IOD IODIDE ION × 5 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；PEG3350, 0.1 M Bis-Tris propane (pH 6.5), 0.2 M Sodium iodide	分辨率 2.50 Å R-free 0.234
5XFL Crystal structure of the force-sensing device region of alpha N-catenin 提交 2017-04-10	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 260–632（373 aa）片段：UNP residues 260-632	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；277 K；100MM HEPES, 20% PEG3350, 200MM POTASSIUM FORMATE, PH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 277K	分辨率 2.45 Å R-free 0.267
5XFL Crystal structure of the force-sensing device region of alpha N-catenin 提交 2017-04-10	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 260–632（373 aa）片段：UNP residues 260-632	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；277 K；100MM HEPES, 20% PEG3350, 200MM POTASSIUM FORMATE, PH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 277K	分辨率 2.45 Å R-free 0.267
5XFL Crystal structure of the force-sensing device region of alpha N-catenin 提交 2017-04-10	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 260–632（373 aa）片段：UNP residues 260-632	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；277 K；100MM HEPES, 20% PEG3350, 200MM POTASSIUM FORMATE, PH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 277K	分辨率 2.45 Å R-free 0.267
5XFL Crystal structure of the force-sensing device region of alpha N-catenin 提交 2017-04-10	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 260–632（373 aa）片段：UNP residues 260-632	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；277 K；100MM HEPES, 20% PEG3350, 200MM POTASSIUM FORMATE, PH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 277K	分辨率 2.45 Å R-free 0.267
6DUY Crystal structure of the alpha-N-catenin actin-binding domain H1 mutant 提交 2018-06-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 664–918（255 aa）链 B 664–918（255 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；100 mM sodium acetate/acetic acid, pH 4.5, 0.8 M sodium phosphate monobasic, 1.2 M potassium phosphate dibasic	分辨率 2.81 Å R-free 0.255

共 4 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CTNA2_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–248； UniProt 18–264 作者链 C； PDB构建体 2–248； UniProt 18–264

Catenin beta-1

Mus musculus

UniProt Q02248

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 78–151	片段：alpha-catenin binding domain, UNP residues 78-151	Catenin alpha-2 × 1 （Q61301）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；283 K；100mM Tris-Cl, 22% polyethylene glycol monomethryl ether, pH 8.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 283K	分辨率 2.80 Å R-free 0.264
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 78–151	片段：alpha-catenin binding domain, UNP residues 78-151	Catenin alpha-2 × 1 （Q61301）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；283 K；100mM Tris-Cl, 22% polyethylene glycol monomethryl ether, pH 8.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 283K	分辨率 2.80 Å R-free 0.264

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4ONS	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1DOW CRYSTAL STRUCTURE OF A CHIMERA OF BETA-CATENIN AND ALPHA-CATENIN 提交 1999-12-21	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 118–149（32 aa）片段：ALPHA-CATENIN BINDING REGION	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；PEG 2000 monomethylether, HEPES, urea, ethanol, Dithiothreitol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K	分辨率 1.80 Å R-free 0.233
1I7W BETA-CATENIN/PHOSPHORYLATED E-CADHERIN COMPLEX 提交 2001-03-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 134–671（538 aa）片段：ARMADILLO DOMAIN 链 C 134–671（538 aa）片段：ARMADILLO DOMAIN	未记录	ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；polyethylene glycol monomethylether 5000, Tris-HCl, NaCl, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.245
1I7X BETA-CATENIN/E-CADHERIN COMPLEX 提交 2001-03-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 134–671（538 aa）片段：ARMADILLO DOMAIN 链 C 134–671（538 aa）片段：ARMADILLO DOMAIN	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；POLYETHYLENEIMINE TRIS-HCL ISOPROPANOL, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.00 Å R-free 0.242
1JPP The Structure of a beta-Catenin Binding Repeat from Adenomatous Polyposis Coli (APC) in Complex with beta-Catenin 提交 2001-08-02	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 134–671（538 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；293 K；PEG 8000, sodium potassium phosphate, sodium chloride, DTT, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1JPP The Structure of a beta-Catenin Binding Repeat from Adenomatous Polyposis Coli (APC) in Complex with beta-Catenin 提交 2001-08-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 134–671（538 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；293 K；PEG 8000, sodium potassium phosphate, sodium chloride, DTT, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.10 Å R-free 0.274
1M1E Beta-catenin armadillo repeat domain bound to ICAT 提交 2002-06-18	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 134–671（538 aa）片段：Armadillo Repeat Region (RESIDUES 134-671)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；MES, MPD, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.10 Å R-free 0.228
1V18 The crystal structure of beta-catenin armadillo repeat complexed with a phosphorylated APC 20mer repeat. 提交 2004-04-09	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 134–671（538 aa）片段：ARMADILLO REPEAT, REPEAT 3 OF APC, RESIDUES 134-671	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；pH 6.50	分辨率 2.10 Å R-free 0.253
2BCT THE ARMADILLO REPEAT REGION FROM MURINE BETA-CATENIN 提交 1997-07-30	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 150–665（516 aa）片段：ARMADILLO REPEAT REGION	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；10% (W/V) PEG 8000, 875 MM NACL, 200 MM TRIS-HCL, PH 8.5	分辨率 2.90 Å R-free 0.288
3BCT THE ARMADILLO REPEAT REGION FROM MURINE BETA-CATENIN 提交 1997-07-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 193–662（470 aa）片段：ARMADILLO REPEAT REGION	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CL CHLORIDE ION × 1 URE UREA × 8	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；0.5% (W/V) PEG 8000, 2.4 M UREA, 200 MM TRIS-HCL, PH 8.5	分辨率 2.10 Å R-free 0.260
3BCT THE ARMADILLO REPEAT REGION FROM MURINE BETA-CATENIN 提交 1997-07-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 193–662（470 aa）片段：ARMADILLO REPEAT REGION	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CL CHLORIDE ION × 2 URE UREA × 16	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；0.5% (W/V) PEG 8000, 2.4 M UREA, 200 MM TRIS-HCL, PH 8.5	分辨率 2.10 Å R-free 0.260
3OUW Structure of beta-catenin with Lef-1 提交 2010-09-15	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 134–671（538 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；296 K；well solution: 4.2% PEG 4000, 100 mM sodium citrate. protein solution: 100 uM beta-cat-arm, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K	分辨率 2.91 Å R-free 0.256
3OUX Structure of beta-catenin with phosphorylated Lef-1 提交 2010-09-15	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 134–671（538 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；296 K；well solution: 7% PEG 3000, 100 mM sodium citrate. protein solution: 100 micro-M beta-cat-arm, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K	分辨率 2.40 Å R-free 0.264
4EV8 Crystal structure of mouse catenin beta-59 in 2.4M urea. 提交 2012-04-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 134–671（538 aa）	未记录	URE UREA × 18	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 1.90 Å R-free 0.220
4EV9 Crystal Structure of Mouse Catenin beta-59 in 4.0M urea 提交 2012-04-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 134–671（538 aa）片段：unp residues 134-671	未记录	URE UREA × 42	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；1.6~3.2 M Urea, 200mM Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.10 Å R-free 0.232
4EVA Crystal Structure of Mouse Catenin beta-59 in 5.6M urea 提交 2012-04-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 134–671（538 aa）片段：unp residues 134-671	未记录	URE UREA × 38	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；1.6~3.2 M Urea, 200mM Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.00 Å R-free 0.228
4EVA Crystal Structure of Mouse Catenin beta-59 in 5.6M urea 提交 2012-04-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 134–671（538 aa）片段：unp residues 134-671	未记录	URE UREA × 34	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；1.6~3.2 M Urea, 200mM Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.00 Å R-free 0.228
4EVP Crystal Structure of Mouse Catenin beta-59 in 7.2M urea 提交 2012-04-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 134–671（538 aa）片段：unp residues 134-671	未记录	URE UREA × 43	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.25 Å R-free 0.225
4EVT Crystal Structure of Mouse Catenin beta-59 in 8.3M urea 提交 2012-04-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 134–671（538 aa）片段：unp residues 134-671	未记录	URE UREA × 56	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；1.6~3.2 M Urea, 200mM Tris-HCl, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.34 Å R-free 0.225

共 15 个其他 PDB 条目、18 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CTNB1_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 15–88； UniProt 78–151 作者链 D； PDB构建体 15–88； UniProt 78–151

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4ons
沉积日期 deposition_date	2014-01-29
结构标题 title	Structural and thermodynamic characterization of cadherin-beta-catenin-alpha-catenin complex formation
关键词 keywords	four helix bundles, cell adhesion; CELL ADHESION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	28.75 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	28.04 Å
零角强度 I(0) i0	64337600.00
分子量 molecular_weight	61323.0 kDa
排除体积 excluded_volume	76468 Å³
包络体积 envelope_volume	99395 Å³
水化壳体积 shell_volume	30713 Å³
包络直径 envelope_diameter	100.2 Å
壳层 Rg shell_rg	34.07 Å
包络 Rg envelope_rg	27.91 Å
形状 Rg shape_rg	28.03 Å
总 Rg total_rg	28.67 Å
总原子数 total_atoms	4296
残基数 n_residues	552
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	94.1 Å
Rg (实空间) rg_real	28.78 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.71 Å
I(0) (实空间) i0_real	6.4340e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	9.0190e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	28.77 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	64340000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8878
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	35.9 Å
偏度 Skewness skewness	0.393
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.233
角度范围 angular_range	— – 0.2750 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	12340000.0000
实空间数据点数 n_real_points	56
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.881; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.970; Smooth: 0.925

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Catenin alpha-2
分子量 formula_weight	27351.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C
原子数 atom_count	4318

MEIRTLTVERLLEPLVTQVTTLVNTSNKGPSGKKKGRSKKAHVLAASVEQATQNFLEKGEQIAKESQDLKEELVAAVEDVRKQGETMRIASSEFADDPCSSVKRGTMVRAARALLSAVTRLLILADMADVMRLLSHLKIVEEALEAVKNATNEQDLANRFKEFGKEMVKLNYVAARRQQELKDPHCRDEMAAARGALKKNATMLYTASQAFLRHPDVAATRANRDYVFKQVQEAIAGISSAAQATSPT

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Catenin beta-1
分子量 formula_weight	9913.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,D

MGSSHHHHHHSQDPQVADIDGQYAMTRAQRVRAAMFPETLDEGMQIPSTQFDAAHPTNVQRLAEPSQMLKHAVVNLINYQDDAELATR

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	22

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	4onsA01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	230 — Alpha-catenin/vinculin-like

结构域编号 domain_id	4onsA02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	230 — Alpha-catenin/vinculin-like

结构域编号 domain_id	4onsB00
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	250 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2780 —

结构域编号 domain_id	4onsC01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	230 — Alpha-catenin/vinculin-like

结构域编号 domain_id	4onsC02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	230 — Alpha-catenin/vinculin-like

结构域编号 domain_id	4onsD00
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	250 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2780 —

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	96.125 Å
晶胞边长 b length_b	96.125 Å
晶胞边长 c length_c	65.517 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 31
空间群编号 int_tables_number	144
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.800 Å
最低分辨率 resolution_low	38.753 Å
R 因子 r_factor	0.2075
R_work r_work	0.2033
R_free r_free	0.2637

fit	/app/data/saxs_computation/on/4ons/4ons.fit
pddf	/app/data/pr_computation/on/4ons/4ons.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/on/4ons/4ons.dat

Structural and thermodynamic characterization of cadherin-beta-catenin-alpha-catenin complex formation

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Catenin alpha-2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Catenin beta-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)