4qab

X-RAY STRUCTURE of ACETYLCHOLINE BINDING PROTEIN (ACHBP) IN COMPLEX WITH 4-(MORPHOLIN-4-YL)-6-[4-(TRIFLUOROMETHYL)PHENYL]PYRIMIDIN-2-AMINE

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Acetylcholine-binding protein

Lymnaea stagnalis

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 5	4-(morpholin-4-yl)-6-[4-(trifluoromethyl)phenyl]pyrimidin-2-amine × 5 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 PHOSPHATE ION × 5 water × 5	与蛋白数一致
2	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 5	4-(morpholin-4-yl)-6-[4-(trifluoromethyl)phenyl]pyrimidin-2-amine × 5 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 PHOSPHATE ION × 5 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ACHP_LYMST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 9–217； UniProt 20–228 作者链 B； PDB构建体 9–217； UniProt 20–228 作者链 C； PDB构建体 9–217； UniProt 20–228 作者链 D； PDB构建体 9–217； UniProt 20–228 作者链 E； PDB构建体 9–217； UniProt 20–228 作者链 F； PDB构建体 9–217； UniProt 20–228 作者链 G； PDB构建体 9–217； UniProt 20–228 作者链 H； PDB构建体 9–217； UniProt 20–228 作者链 I； PDB构建体 9–217； UniProt 20–228 作者链 J； PDB构建体 9–217； UniProt 20–228

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4qab
沉积日期 deposition_date	2014-05-03
结构标题 title	X-RAY STRUCTURE of ACETYLCHOLINE BINDING PROTEIN (ACHBP) IN COMPLEX WITH 4-(MORPHOLIN-4-YL)-6-[4-(TRIFLUOROMETHYL)PHENYL]PYRIMIDIN-2-AMINE
关键词 keywords	Acetylcholine-Binding Protein; Acetylcholine-Binding Protein
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4qab__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4qab__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4qab__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	32.33 Å
Rg（电子密度）	30.57 Å
总 Rg	31.43 Å
原子数	8536
残基数	1040
排除体积	149800 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4qab__assembly_1__model_1`	pentameric （5）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`4qab__assembly_2__model_1`	pentameric （5）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Acetylcholine-binding protein
分子量 formula_weight	24746.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	10

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H,I,J
原子数 atom_count	17236

DYKDDDDKLDRADILYNIRQTSRPDVIPTQRDRPVAVSVSLKFINILEVNEITNEVDVVFWQQTTWSDRTLAWNSSHSPDQVSVPISSLWVPDLAAYNAISKPEVLTPQLARVVSDGEVLYMPSIRQRFSCDVSGVDTESGATCRIKIGSWTHHSREISVDPTTENSDDSEYFSQYSRFEILDVTQKKNSVTYSCCPEAYEDVEVSLNFRKKGRSEI

来源 Source

来源生物 organism	Lymnaea stagnalis
通用名 common_name	Great pond snail
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	6523
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	4-(morpholin-4-yl)-6-[4-(trifluoromethyl)phenyl]pyrimidin-2-amine
分子量 formula_weight	324.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	10

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	9

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	PHOSPHATE ION
分子量 formula_weight	95.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	10

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	25

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 30 domains

SCOP 2.08 (20 domains)

结构域编号 domain_id	d4qaba1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.96 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.96.1 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like
家族 Family family	b.96.1.1 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like

结构域编号 domain_id	d4qaba2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d4qabb1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.96 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.96.1 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like
家族 Family family	b.96.1.1 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like

结构域编号 domain_id	d4qabb2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d4qabc1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.96 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.96.1 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like
家族 Family family	b.96.1.1 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like

结构域编号 domain_id	d4qabc2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d4qabd1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.96 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.96.1 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like
家族 Family family	b.96.1.1 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like

结构域编号 domain_id	d4qabd2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d4qabe1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.96 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.96.1 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like
家族 Family family	b.96.1.1 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like

结构域编号 domain_id	d4qabe2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d4qabf1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.96 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.96.1 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like
家族 Family family	b.96.1.1 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like

结构域编号 domain_id	d4qabf2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d4qabg1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.96 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.96.1 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like
家族 Family family	b.96.1.1 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like

结构域编号 domain_id	d4qabg2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d4qabh1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.96 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.96.1 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like
家族 Family family	b.96.1.1 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like

结构域编号 domain_id	d4qabh2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d4qabi1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.96 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.96.1 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like
家族 Family family	b.96.1.1 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like

结构域编号 domain_id	d4qabi2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d4qabj1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.96 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like
超家族 Superfamily superfamily	b.96.1 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like
家族 Family family	b.96.1.1 — Nicotinic receptor ligand binding domain-like

结构域编号 domain_id	d4qabj2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (10 domains)

结构域编号 domain_id	4qabA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	170 — Acetylcholine Binding Protein; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding domain

结构域编号 domain_id	4qabB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	170 — Acetylcholine Binding Protein; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding domain

结构域编号 domain_id	4qabC00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	170 — Acetylcholine Binding Protein; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding domain

结构域编号 domain_id	4qabD00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	170 — Acetylcholine Binding Protein; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding domain

结构域编号 domain_id	4qabE00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	170 — Acetylcholine Binding Protein; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding domain

结构域编号 domain_id	4qabF00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	170 — Acetylcholine Binding Protein; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding domain

结构域编号 domain_id	4qabG00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	170 — Acetylcholine Binding Protein; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding domain

结构域编号 domain_id	4qabH00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	170 — Acetylcholine Binding Protein; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding domain

结构域编号 domain_id	4qabI00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	170 — Acetylcholine Binding Protein; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding domain

结构域编号 domain_id	4qabJ00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	170 — Acetylcholine Binding Protein; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding domain

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晶胞边长 a length_a	122.639 Å
晶胞边长 b length_b	134.015 Å
晶胞边长 c length_c	147.020 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	40

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.984 Å
最低分辨率 resolution_low	49.521 Å
R 因子 r_factor	0.1529
R_work r_work	0.1496
R_free r_free	0.2333

X-RAY STRUCTURE of ACETYLCHOLINE BINDING PROTEIN (ACHBP) IN COMPLEX WITH 4-(MORPHOLIN-4-YL)-6-[4-(TRIFLUOROMETHYL)PHENYL]PYRIMIDIN-2-AMINE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Acetylcholine-binding protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4qab__assembly_1__model_1

4qab__assembly_1__model_1 | I(q)

4qab__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 30 domains

SCOP 2.08 (20 domains)

CATH v4.4 (10 domains)

7. 引用文献 (1)

X-RAY STRUCTURE of ACETYLCHOLINE BINDING PROTEIN (ACHBP) IN COMPLEX WITH 4-(MORPHOLIN-4-YL)-6-[4-(TRIFLUOROMETHYL)PHENYL]PYRIMIDIN-2-AMINE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Acetylcholine-binding protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4qab__assembly_1__model_1

4qab__assembly_1__model_1 | I(q)

4qab__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 30 domains

SCOP 2.08 (20 domains)

CATH v4.4 (10 domains)

7. 引用文献 (1)