SAXSdb — 4qj3

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha

Mus musculus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 7–359	片段：UNP residues 7-359	1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3 × 1 （Q01970） GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277.15 K；100 mM BisTris, 200 mM NaCl, 5% PEG 3350, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K	分辨率 3.00 Å R-free 0.240

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4QJ3	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2BCJ Crystal Structure of G Protein-Coupled Receptor Kinase 2 in Complex with Galpha-q and Gbetagamma Subunits 提交 2005-10-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 Q 37–359（323 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；9% PEG8000, 1M NaCl, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.06 Å R-free 0.292
3AH8 Structure of heterotrimeric G protein Galpha-q beta gamma in complex with an inhibitor YM-254890 提交 2010-04-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 37–359（323 aa）片段：UNP entry P10824 residues 2-28, UNP entry P21279 residues 37-359	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.1；293 K；7% PEG 4000, 30% (v/v) glycerol, 70 mM acetate-NaOH, pH 5.1, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.315
4EKC Structure of human regulator of G protein signaling 2 (RGS2) in complex with murine Galpha-q(R183C) 提交 2012-04-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 18–359（342 aa）片段：UNP residues 18-359	突变：E125D, N126V, Y128D, V129Y, D130A, R183C	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；17% PEG 3350, 200 mM NaCl, and 100 mM MES pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 7.40 Å R-free 0.220
4EKC Structure of human regulator of G protein signaling 2 (RGS2) in complex with murine Galpha-q(R183C) 提交 2012-04-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 18–359（342 aa）片段：UNP residues 18-359	突变：E125D, N126V, Y128D, V129Y, D130A, R183C	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；17% PEG 3350, 200 mM NaCl, and 100 mM MES pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 7.40 Å R-free 0.220
4EKD Structure of human regulator of G protein signaling 2 (RGS2) in complex with murine Galpha-q(R183C) 提交 2012-04-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 18–359（342 aa）片段：UNP residues 18-359	突变：E125D, N126V, Y128D, V129Y, D130A, R183C	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 CO COBALT (II) ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；12% PEG 8,000, 15 mM CoCl2, 200 mM NaCl, and 100 mM MES 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.71 Å R-free 0.252
4GNK Crystal structure of Galphaq in complex with full-length human PLCbeta3 提交 2012-08-17	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 7–359（353 aa）片段：UNP residues 7-359	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.75；277.15 K；100 mM MES pH 6.75, 100-200 mM NaCl, and 11-12% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K	分辨率 4.00 Å R-free 0.255
4GNK Crystal structure of Galphaq in complex with full-length human PLCbeta3 提交 2012-08-17	实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 7–359（353 aa）片段：UNP residues 7-359	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.75；277.15 K；100 mM MES pH 6.75, 100-200 mM NaCl, and 11-12% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K	分辨率 4.00 Å R-free 0.255
4QJ4 Structure of a fragment of human phospholipase C-beta3 delta472-569, bound to IP3 and in complex with Galphaq 提交 2014-06-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 7–359（353 aa）片段：UNP residues 7-359	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 I3P D-MYO-INOSITOL-1,4,5-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；100 mM BisTris, 200 mM NaCl, 8% (v/v) PEG 3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K	分辨率 3.30 Å R-free 0.267
4QJ5 Structure of a fragment of human phospholipase C-beta3 delta472-581, bound to IP3 and in complex with Galphaq 提交 2014-06-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 7–359（353 aa）片段：UNP residues 7-359	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 I3P D-MYO-INOSITOL-1,4,5-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.25；277.15 K；100 mM MES, 200 mM NaCl, 5% (v/v) PEG 3350, pH 6.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K	分辨率 3.41 Å R-free 0.277
5DO9 Structure of regulator of G protein signaling 8 (RGS8) in complex with AlF4-activated Galpha-q 提交 2015-09-10	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 37–350（314 aa）片段：Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；Ammonium acetate, BisTris pH 5.5, PEG 8000	分辨率 2.60 Å R-free 0.226
5DO9 Structure of regulator of G protein signaling 8 (RGS8) in complex with AlF4-activated Galpha-q 提交 2015-09-10	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 37–350（314 aa）片段：Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；Ammonium acetate, BisTris pH 5.5, PEG 8000	分辨率 2.60 Å R-free 0.226
5DO9 Structure of regulator of G protein signaling 8 (RGS8) in complex with AlF4-activated Galpha-q 提交 2015-09-10	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 37–350（314 aa）片段：Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；Ammonium acetate, BisTris pH 5.5, PEG 8000	分辨率 2.60 Å R-free 0.226
5DO9 Structure of regulator of G protein signaling 8 (RGS8) in complex with AlF4-activated Galpha-q 提交 2015-09-10	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 37–350（314 aa）片段：Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；Ammonium acetate, BisTris pH 5.5, PEG 8000	分辨率 2.60 Å R-free 0.226
5DO9 Structure of regulator of G protein signaling 8 (RGS8) in complex with AlF4-activated Galpha-q 提交 2015-09-10	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 37–350（314 aa）片段：Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；Ammonium acetate, BisTris pH 5.5, PEG 8000	分辨率 2.60 Å R-free 0.226
5DO9 Structure of regulator of G protein signaling 8 (RGS8) in complex with AlF4-activated Galpha-q 提交 2015-09-10	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 37–350（314 aa）片段：Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277.15 K；Ammonium acetate, BisTris pH 5.5, PEG 8000	分辨率 2.60 Å R-free 0.226
7SQ2 Reprocessed and refined structure of Phospholipase C-beta and Gq signaling complex 提交 2021-11-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 35–359（325 aa）	未记录	ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ACT ACETATE ION × 7 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；7% PEG 6000, 100 mM Hepes, 1 mM CaCl2, 100 mM magnesium acetate	分辨率 2.60 Å R-free 0.263

共 9 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GNAQ_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 27–379； UniProt 7–359

1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3

Homo sapiens

UniProt Q01970

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 10–470 链 B； UniProt 570–891	片段：UNP residues 10-891	Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha × 1 （P21279） GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277.15 K；100 mM BisTris, 200 mM NaCl, 5% PEG 3350, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K	分辨率 3.00 Å R-free 0.240

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 4QJ3	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4GNK Crystal structure of Galphaq in complex with full-length human PLCbeta3 提交 2012-08-17	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 10–1234（1225 aa）片段：UNP residues 10-1234	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.75；277.15 K；100 mM MES pH 6.75, 100-200 mM NaCl, and 11-12% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K	分辨率 4.00 Å R-free 0.255
4GNK Crystal structure of Galphaq in complex with full-length human PLCbeta3 提交 2012-08-17	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 10–1234（1225 aa）片段：UNP residues 10-1234	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.75；277.15 K；100 mM MES pH 6.75, 100-200 mM NaCl, and 11-12% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K	分辨率 4.00 Å R-free 0.255
4GNK Crystal structure of Galphaq in complex with full-length human PLCbeta3 提交 2012-08-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 934–1192（259 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.75；277.15 K；100 mM MES pH 6.75, 100-200 mM NaCl, and 11-12% PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K	分辨率 4.00 Å R-free 0.255
4QJ4 Structure of a fragment of human phospholipase C-beta3 delta472-569, bound to IP3 and in complex with Galphaq 提交 2014-06-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 10–470（461 aa）片段：UNP residues 10-891 链 B 570–891（322 aa）片段：UNP residues 10-891	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 I3P D-MYO-INOSITOL-1,4,5-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；100 mM BisTris, 200 mM NaCl, 8% (v/v) PEG 3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K	分辨率 3.30 Å R-free 0.267
4QJ5 Structure of a fragment of human phospholipase C-beta3 delta472-581, bound to IP3 and in complex with Galphaq 提交 2014-06-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 10–470（461 aa）片段：UNP residues 10-891 链 B 570–891（322 aa）片段：UNP residues 10-891	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1 I3P D-MYO-INOSITOL-1,4,5-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.25；277.15 K；100 mM MES, 200 mM NaCl, 5% (v/v) PEG 3350, pH 6.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.15K	分辨率 3.41 Å R-free 0.277
7SQ2 Reprocessed and refined structure of Phospholipase C-beta and Gq signaling complex 提交 2021-11-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 10–886（877 aa）	未记录	ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ACT ACETATE ION × 7 CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；7% PEG 6000, 100 mM Hepes, 1 mM CaCl2, 100 mM magnesium acetate	分辨率 2.60 Å R-free 0.263
8EMV Phospholipase C beta 3 (PLCb3) in solution 提交 2022-09-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 10–1234（1225 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8EMW Phospholipase C beta 3 (PLCb3) in complex with Gbg on liposomes 提交 2022-09-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 10–1234（1225 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8EMX Phospholipase C beta 3 (PLCb3) in complex with Gbg on lipid nanodiscs 提交 2022-09-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 9–1234（1226 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8UQN PLCb3-Gaq complex on membranes 提交 2023-10-24	构建体不同突变/修饰不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 10–1234（1225 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8UQO PLCb3-Gbg-Gaq complex on membranes 提交 2023-10-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 Q 10–1234（1225 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.37 Å
9Y7H Gb1g2 crosslinked to PLCb3 提交 2025-09-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 10–882（873 aa）	突变：E60C, C193S, C221S, C358S, C516S, C824S, C834S	ME7 1,1'-ethane-1,2-diylbis(1H-pyrrole-2,5-dione) × 1 CA CALCIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 100 mM NaCl, 0.1 mM EDTA and 0.1 mM EGTA cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
9YAO Gbg crosslinked to PLCb3 - second conformation 提交 2025-09-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 10–882（873 aa）	突变：E60C, S193C, S221C, S358C, S824C, S834C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 100 mM NaCl, 0.1 mM EDTA and 0.1 mM EGTA cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.00 Å
9YAP Gbg crosslinked to PLCb3 - second conformation 提交 2025-09-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 10–882（873 aa）	突变：E60C, S193C, S221C, S358C, S824C, S834C	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 100 mM NaCl, 0.1 mM EDTA and 0.1 mM EGTA cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å

共 12 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PLCB3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 11–471； UniProt 10–470 作者链 B； PDB构建体 472–793； UniProt 570–891

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4qj3
沉积日期 deposition_date	2014-06-03
结构标题 title	Structure of a fragment of human phospholipase C-beta3 delta472-559, in complex with Galphaq
关键词 keywords	;GTP-BINDING PROTEIN ALPHA SUBUNITS, PHOSPHOLIPASE C BETA, PH DOMAIN, EF HAND, C2 DOMAIN, TIM BARREL DOMAIN, GTP HYDROLYSIS, G-PROTEIN SIGNALING, LIPASE, CALCIUM BINDING, GTP BINDING, PHOSPHOLIPIDS, membrane, SIGNALING PROTEIN-HYDROLASE complex ;; SIGNALING PROTEIN/HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	33.56 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	32.71 Å
零角强度 I(0) i0	234078000.00
分子量 molecular_weight	123940.0 kDa
排除体积 excluded_volume	155670 Å³
包络体积 envelope_volume	198860 Å³
水化壳体积 shell_volume	49361 Å³
包络直径 envelope_diameter	119.8 Å
壳层 Rg shell_rg	40.58 Å
包络 Rg envelope_rg	32.70 Å
形状 Rg shape_rg	32.70 Å
总 Rg total_rg	33.34 Å
总原子数 total_atoms	8719
残基数 n_residues	1072
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	110.9 Å
Rg (实空间) rg_real	33.45 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.85 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.3410e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	4.0860e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	33.52 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	234100000.0000
解质量估计 total_estimate	0.6792
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	40.1 Å
偏度 Skewness skewness	0.204
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.439
角度范围 angular_range	— – 0.2350 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	49160000.0000
实空间数据点数 n_real_points	48
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.871; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.078; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.979

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha
分子量 formula_weight	44711.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	8747

MSYYHHHHHHDYDIPTTENLYFQGAAMACCLSEEAKEARRINDEIERQLRRDKRDARRELKLLLLGTGESGKSTFIKQMRIIHGSGYSDEDKRGFTKLVYQNIFTAMQAMIRAMDTLKIPYKYEHNKAHAQLVREVDVEKVSAFENPYVDAIKSLWNDPGIQECYDRRREYQLSDSTKYYLNDLDRVADPSYLPTQQDVLRVRVPTTGIIEYPFDLQSVIFRMVDVGGQRSERRKWIHCFENVTSIMFLVALSEYDQVLVESDNENRMEESKALFRTIITYPWFQNSSVILFLNKKDLLEEKIMYSHLVDYFPEYDGPQRDAQAAREFILKMFVDLNPDSDKIIYSHFTCATDTENIRFVFAAVKDTILQLNLKEYNLV

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	TRICHOPLUSIA NI

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3
分子量 formula_weight	90294.2 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.4.11
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MAHHHHHHGTALQLEPPTVVETLRRGSKFIKWDEETSSRNLVTLRVDPNGFFLYWTGPNMEVDTLDISSIRDTRTGRYARLPKDPKIREVLGFGGPDARLEEKLMTVVSGPDPVNTVFLNFMAVQDDTAKVWSEELFKLAMNILAQNASRNTFLRKAYTKLKLQVNQDGRIPVKNILKMFSADKKRVETALESCGLKFNRSESIRPDEFSLEIFERFLNKLCLRPDIDKILLEIGAKGKPYLTLEQLMDFINQKQRDPRLNEVLYPPLRPSQARLLIEKYEPNQQFLERDQMSMEGFSRYLGGEENGILPLEALDLSTDMTQPLSAYFINSSHNTYLTAGQLAGTSSVEMYRQALLWGCRCVELDVWKGRPPEEEPFITHGFTMTTEVPLRDVLEAIAETAFKTSPYPVILSFENHVDSAKQQAKMAEYCRSIFGDALLIEPLDKYPLAPGVPLPSPQDLMGRILVKNKKRPKKPTTDEGTASSEVNATEEMSTLVNYIEPVKFKSFEAARKRNKCFEMSSFVETKAMEQLTKSPMEFVEYNKQQLSRIYPKGTRVDSSNYMPQLFWNVGCQLVALNFQTLDVAMQLNAGVFEYNGRSGYLLKPEFMRRPDKSFDPFTEVIVDGIVANALRVKVISGQFLSDRKVGIYVEVDMFGLPVDTRRKYRTRTSQGNSFNPVWDEEPFDFPKVVLPTLASLRIAAFEEGGKFVGHRILPVSAIRSGYHYVCLRNEANQPLCLPALLIYTEASDYIPDDHQDYAEALINPIKHVSLMDQRARQLAALIGESEAQAGQET

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	TRICHOPLUSIA NI

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	443.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	TETRAFLUOROALUMINATE ION
分子量 formula_weight	103.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 7 Entity 7 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	28

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	4qj3A01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	4qj3A02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	400 — GI Alpha 1, domain 2-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — GI Alpha 1, domain 2-like

结构域编号 domain_id	4qj3B01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	30 — Roll
拓扑 Topology topology	29 — PH-domain like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	240 —

结构域编号 domain_id	4qj3B02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

结构域编号 domain_id	4qj3B03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	190 — Phosphatidylinositol (PI) phosphodiesterase

结构域编号 domain_id	4qj3B04
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — C2 domain

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	200.623 Å
晶胞边长 b length_b	88.761 Å
晶胞边长 c length_c	92.232 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	101.39 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.000 Å
最低分辨率 resolution_low	29.710 Å
R 因子 r_factor	0.1974
R_work r_work	0.1951
R_free r_free	0.2403

fit	/app/data/saxs_computation/qj/4qj3/4qj3.fit
pddf	/app/data/pr_computation/qj/4qj3/4qj3.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/qj/4qj3/4qj3.dat

Structure of a fragment of human phospholipase C-beta3 delta472-559, in complex with Galphaq

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Guanine nucleotide-binding protein G(q) subunit alpha

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)