Rattus norvegicus
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 同源多聚体 | 蛋白 2 DNA 4 | ;DNA (5'-D(*AP*TP*AP*TP*CP*GP*AP*TP*AP*T)-3') ; × 4 MAGNESIUM ION × 1 water × 6 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | HMGB1_RAT |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 3–76； UniProt 8–81 作者链 B； PDB构建体 3–76； UniProt 8–81 |
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| 条目编号 entry_id | 4qr9 |
| 沉积日期 deposition_date | 2014-06-30 |
| 结构标题 title | Crystal structure of two HMGB1 Box A domains cooperating to underwind and kink a DNA |
| 关键词 keywords | ;HMG-box, HMGB1, Box A domain, High mobility group, DNA-binding, bend DNA, kink DNA, architectural factor, minor groove, chromatin, Nucleus, DNA BINDING PROTEIN ;; DNA BINDING PROTEIN |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 21.61 Å |
| Rg（电子密度） | 21.20 Å |
| 总 Rg | 21.92 Å |
| 原子数 | 2043 |
| 残基数 | 190 |
| 排除体积 | 33857 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 4qr9A00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 30 — DNA Binding (I), subunit A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — High mobility group box domain |
| 结构域编号 domain_id | 4qr9B00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 30 — DNA Binding (I), subunit A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — High mobility group box domain |