4ue5

Structural basis for targeting and elongation arrest of Bacillus signal recognition particle

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

SIGNAL RECOGNITION PARTICLE SUBUNIT SRP68

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 6 RNA 1	7S RNA × 1 SRP14 × 1 SIGNAL RECOGNITION PARTICLE 54 KDA PROTEIN × 1 （P61010） SRP9 × 1 （P21262） SIGNAL RECOGNITION PARTICLE 9 KDA PROTEIN × 1 （J9PAS6） SIGNAL SEQUENCE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SRP68_CANFA
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–195； UniProt 55–249

SIGNAL RECOGNITION PARTICLE 54 KDA PROTEIN

物种未注明

UniProt P61010

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 6 RNA 1	7S RNA × 1 SRP14 × 1 SIGNAL RECOGNITION PARTICLE SUBUNIT SRP68 × 1 （Q00004） SRP9 × 1 （P21262） SIGNAL RECOGNITION PARTICLE 9 KDA PROTEIN × 1 （J9PAS6） SIGNAL SEQUENCE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SRP54_CANFA
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–433； UniProt 1–433

SRP9

物种未注明

UniProt P21262

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 6 RNA 1	7S RNA × 1 SRP14 × 1 SIGNAL RECOGNITION PARTICLE SUBUNIT SRP68 × 1 （Q00004） SIGNAL RECOGNITION PARTICLE 54 KDA PROTEIN × 1 （P61010） SIGNAL RECOGNITION PARTICLE 9 KDA PROTEIN × 1 （J9PAS6） SIGNAL SEQUENCE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SRP09_CANFA
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–74； UniProt 2–75

SIGNAL RECOGNITION PARTICLE 9 KDA PROTEIN

物种未注明

UniProt J9PAS6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 6 RNA 1	7S RNA × 1 SRP14 × 1 SIGNAL RECOGNITION PARTICLE SUBUNIT SRP68 × 1 （Q00004） SIGNAL RECOGNITION PARTICLE 54 KDA PROTEIN × 1 （P61010） SRP9 × 1 （P21262） SIGNAL SEQUENCE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	J9PAS6_CANFA
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–107； UniProt 14–120

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4ue5
沉积日期 deposition_date	2014-12-15
结构标题 title	Structural basis for targeting and elongation arrest of Bacillus signal recognition particle
关键词 keywords	TRANSLATION, STALLED RIBOSOME; TRANSLATION
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4ue5__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4ue5__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4ue5__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	82.12 Å
Rg（电子密度）	83.24 Å
总 Rg	82.93 Å
原子数	9948
残基数	1185
排除体积	139320 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4ue5__assembly_1__model_1`	heptameric （7）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	7S RNA
分子量 formula_weight	96787.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	9948

GCCGGGCGCGGUGGCGCGCGCCUGUAGUCCCAGCUACUCGGGAGGCUGAGGCAGGAGGAUCGCUUGAGCCCAGGAGUUCUGGGCUGCAGUGCGCUAUGCCGAUCGGGUGUCCGCACUAAGUUCGGCAUCAAUAUGGUGACCUCCCGGGAGCGGGGGACCACCAGGUUGCCUAAGGAGGGGUGAACCGGCCCAGGUCGGAAACGGAGCAGGUCAAAACUCCCGUGCUGAUCAGUAGUGGGAUCGCGCCUGUGAAUAGCCACUGCACUCCAGCCUGUGCAACAUAGCGAGACCCCGUCUCU

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	SRP14
分子量 formula_weight	8604.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

VLLESEQFLTELTRLFQKCRLSGSVFITLKKYDNKCLLRATDGKKKISTVVSSKEVNKFQMAYSNLLRANMDGLK

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	SIGNAL RECOGNITION PARTICLE SUBUNIT SRP68
分子量 formula_weight	23220.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

LSLEILQIIKESQQQHGLRHGDFQRYRGYCSRRQRRLRKTLNFKMGNRHKFTGKKVTEDLLTDNRYLLLVLMDAERAWSYAMQLKQEANTEPRKRFHLLSRLRKAVKHAEELERLCESNRVDAKTKLEAQAYTAYLSGMLRFEHQEWKAAIEAFNKCKTIYEKLASAFTEEQAVLYNQRVEEISPNIRYCAYNIG

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	SIGNAL RECOGNITION PARTICLE 54 KDA PROTEIN
分子量 formula_weight	48056.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MVLADLGRKITSALRSLSNATIINEEVLNAMLKEVCTALLEADVNIKLVKQLRENVKSAIDLEEMASGLNKRKMIQHAVFKELVKLVDPGVKAWTPTKGKQNVIMFVGLQGSGKTTTCSKLAYYYQRKGWKTCLICADTFRAGAFDQLKQNATKARIPFYGSYTEMDPVIIASEGVEKFKNENFEIIIVDTSGRHKQEDSLFEEMLQVANAIQPDNIVYVMDASIGQACEAQAKAFKDKVDVASVIVTKLDGHAKGGGALSAVAATKSPIIFIGTGEHIDDFEPFKTQPFISKLLGMGDIEGLIDKVNELKLDDNEALIEKLKHGQFTLRDMYEQFQNIMKMGPFSQILGMIPGFGTDFMSKGNEQESMARLKKLMTIMDSMNDQELDSTDGAKVFSKQPGRIQRVARGSGVSTRDVQELLTQYTKFAQMVKK

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	SRP9
分子量 formula_weight	8694.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

AQYQTWEEFSRAAEKLYLADPMKARVVLKYRHSDGSLCIKVTDDLVCLVYRTDQAQDVKKIEKFHSQLMRLMVA

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	SIGNAL RECOGNITION PARTICLE 9 KDA PROTEIN
分子量 formula_weight	12430.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

RFICIYPAYLNNKKTIAEGRRIPISKAVENPTATEIQDVCSAVGLNVFLEKNKMYSREWNRDVQYRGRVRVQLKQEDGSLCLVQFPSRKSVMLYAAEMIPKLKTRTQ

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	SIGNAL SEQUENCE
分子量 formula_weight	2121.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S

LGFPINFLTLYVTVQHKK

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	9.000 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	9.00 Å
分辨率测定方法 resolution_method	PROJECTION MATCHING
颗粒数 num_particles	19096

Structural basis for targeting and elongation arrest of Bacillus signal recognition particle

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

SIGNAL RECOGNITION PARTICLE SUBUNIT SRP68

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SIGNAL RECOGNITION PARTICLE 54 KDA PROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SRP9

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SIGNAL RECOGNITION PARTICLE 9 KDA PROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4ue5__assembly_1__model_1

4ue5__assembly_1__model_1 | I(q)

4ue5__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

实体 7 Entity 7 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)

Structural basis for targeting and elongation arrest of Bacillus signal recognition particle

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

SIGNAL RECOGNITION PARTICLE SUBUNIT SRP68

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

SIGNAL RECOGNITION PARTICLE 54 KDA PROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

SRP9

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

SIGNAL RECOGNITION PARTICLE 9 KDA PROTEIN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4ue5__assembly_1__model_1

4ue5__assembly_1__model_1 | I(q)

4ue5__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

实体 7 Entity 7 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (1)