Metabotropic glutamate receptor 3
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 2–508 | 片段:UNP RESIDUES 2-508 | 40F (1S,2S,5R,6S)-2-aminobicyclo[3.1.0]hexane-2,6-dicarboxylic acid × 2 IOD IODIDE ION × 16 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION;295 K;20% PEG 3350, 200mM Ammonium Iodide | 分辨率 2.26 Å R-free 0.224 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 4XAR | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3SM9 Crystal Structure of Metabotropic glutamate receptor 3 precursor in presence of LY341495 antagonist 提交 2011-06-27 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
26–504(479 aa)
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 10 Z99 2-[(1S,2S)-2-carboxycyclopropyl]-3-(9H-xanthen-9-yl)-D-alanine × 2 CL CHLORIDE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;1.5 M Ammonium Sulfate
0.1 M BisTris Propane pH 7.0
, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.26 Å R-free 0.227 |
| 5CNK mglur3 with glutamate 提交 2015-07-17 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
2–507(506 aa)
片段:UNP residues 2-507
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 IOD IODIDE ION × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;295 K;16% PEG 3350 + 200mM Ammonium Iodide, 50mM Tris pH 8.0 / 150mM NaCl
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.258 |
| 5CNK mglur3 with glutamate 提交 2015-07-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
2–507(506 aa)
片段:UNP residues 2-507
链 C
2–507(506 aa)
片段:UNP residues 2-507
|
未记录 | IOD IODIDE ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;295 K;16% PEG 3350 + 200mM Ammonium Iodide, 50mM Tris pH 8.0 / 150mM NaCl
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.258 |
| 5CNK mglur3 with glutamate 提交 2015-07-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 B
2–507(506 aa)
片段:UNP residues 2-507
链 C
2–507(506 aa)
片段:UNP residues 2-507
|
未记录 | IOD IODIDE ION × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;295 K;16% PEG 3350 + 200mM Ammonium Iodide, 50mM Tris pH 8.0 / 150mM NaCl
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.258 |
| 5CNK mglur3 with glutamate 提交 2015-07-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 4 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
2–507(506 aa)
片段:UNP residues 2-507
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 1 IOD IODIDE ION × 4 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;295 K;16% PEG 3350 + 200mM Ammonium Iodide, 50mM Tris pH 8.0 / 150mM NaCl
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.258 |
| 5CNK mglur3 with glutamate 提交 2015-07-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 5 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 B
2–507(506 aa)
片段:UNP residues 2-507
|
未记录 | IOD IODIDE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;295 K;16% PEG 3350 + 200mM Ammonium Iodide, 50mM Tris pH 8.0 / 150mM NaCl
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.258 |
| 5CNK mglur3 with glutamate 提交 2015-07-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 6 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 C
2–507(506 aa)
片段:UNP residues 2-507
|
未记录 | IOD IODIDE ION × 3 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;295 K;16% PEG 3350 + 200mM Ammonium Iodide, 50mM Tris pH 8.0 / 150mM NaCl
|
分辨率 3.15 Å R-free 0.258 |
| 5CNM mGluR3 complexed with glutamate analog 提交 2015-07-17 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
2–507(506 aa)
片段:UNP residues 2-507
|
未记录 | 52Q (1R,2S,4R,5R,6R)-2-amino-4-(1H-1,2,4-triazol-3-ylsulfanyl)bicyclo[3.1.0]hexane-2,6-dicarboxylic acid × 2 CL CHLORIDE ION × 4 SO4 SULFATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;295 K;100mM Hepes pH 7.7 + 19% PEG 8K + 50mM Magnesium Sulfate
|
分辨率 2.84 Å R-free 0.226 |
| 5CNM mGluR3 complexed with glutamate analog 提交 2015-07-17 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白单体 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
2–507(506 aa)
片段:UNP residues 2-507
|
未记录 | 52Q (1R,2S,4R,5R,6R)-2-amino-4-(1H-1,2,4-triazol-3-ylsulfanyl)bicyclo[3.1.0]hexane-2,6-dicarboxylic acid × 1 CL CHLORIDE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;295 K;100mM Hepes pH 7.7 + 19% PEG 8K + 50mM Magnesium Sulfate
|
分辨率 2.84 Å R-free 0.226 |
| 6B7H Structure of mGluR3 with an agonist 提交 2017-10-04 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 单体;蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric |
链 A
2–507(506 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CWY (1S,2S,4S,5R,6S)-2-amino-4-[(3-methoxybenzene-1-carbonyl)amino]bicyclo[3.1.0]hexane-2,6-dicarboxylic acid × 1 CA CALCIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 5.5;298 K;100 mM Bis-Tris, pH 5.5, 17% PEG10000, 100 mM ammonium acetate
|
分辨率 2.82 Å R-free 0.223 |
| 7WI6 Cryo-EM structure of LY341495/NAM-bound mGlu3 提交 2022-01-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
23–879(857 aa)
链 B
23–879(857 aa)
|
未记录 | Z99 2-[(1S,2S)-2-carboxycyclopropyl]-3-(9H-xanthen-9-yl)-D-alanine × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.71 Å |
| 7WI8 Cryo-EM structure of inactive mGlu3 bound to LY341495 提交 2022-01-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
23–879(857 aa)
链 B
23–879(857 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 Z99 2-[(1S,2S)-2-carboxycyclopropyl]-3-(9H-xanthen-9-yl)-D-alanine × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.17 Å |
| 7WIH Cryo-EM structure of LY2794193-bound mGlu3 提交 2022-01-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 A
23–879(857 aa)
链 B
23–879(857 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CWY (1S,2S,4S,5R,6S)-2-amino-4-[(3-methoxybenzene-1-carbonyl)amino]bicyclo[3.1.0]hexane-2,6-dicarboxylic acid × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.68 Å |
| 8JCU Cryo-EM structure of mGlu2-mGlu3 heterodimer in presence of LY341495 (dimerization mode I) 提交 2023-05-12 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 3
23–879(857 aa)
|
未记录 | Z99 2-[(1S,2S)-2-carboxycyclopropyl]-3-(9H-xanthen-9-yl)-D-alanine × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 8JCV Cryo-EM structure of mGlu2-mGlu3 heterodimer in presence of LY341495 (dimerization mode II) 提交 2023-05-12 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 3
23–879(857 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 Z99 2-[(1S,2S)-2-carboxycyclopropyl]-3-(9H-xanthen-9-yl)-D-alanine × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8JCW Cryo-EM structure of mGlu2-mGlu3 heterodimer in presence of LY341495 and NAM563 (dimerization mode I) 提交 2023-05-12 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 3
23–879(857 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 Z99 2-[(1S,2S)-2-carboxycyclopropyl]-3-(9H-xanthen-9-yl)-D-alanine × 2 CLR CHOLESTEROL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8JCX Cryo-EM structure of mGlu2-mGlu3 heterodimer in presence of LY341495 and NAM563 (dimerization mode II) 提交 2023-05-12 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 3
23–879(857 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 Z99 2-[(1S,2S)-2-carboxycyclopropyl]-3-(9H-xanthen-9-yl)-D-alanine × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8JCY Cryo-EM structure of mGlu2-mGlu3 heterodimer in presence of LY341495, NAM563, and LY2389575 (dimerization mode I) 提交 2023-05-12 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 3
23–879(857 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 Z99 2-[(1S,2S)-2-carboxycyclopropyl]-3-(9H-xanthen-9-yl)-D-alanine × 2 CLR CHOLESTEROL × 7 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8JCZ Cryo-EM structure of mGlu2-mGlu3 heterodimer in presence of LY341495, NAM563, and LY2389575 (dimerization mode III) 提交 2023-05-12 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 3
23–879(857 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 Z99 2-[(1S,2S)-2-carboxycyclopropyl]-3-(9H-xanthen-9-yl)-D-alanine × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8JD0 Cryo-EM structure of mGlu2-mGlu3 heterodimer in presence of NAM563 提交 2023-05-12 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 3
23–879(857 aa)
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 J9R 4-(1-methylpyrazol-4-yl)-7-[[(2~{S})-2-(trifluoromethyl)morpholin-4-yl]methyl]quinoline-2-carboxamide × 1 CLR CHOLESTEROL × 9 GLU GLUTAMIC ACID × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8JD1 Cryo-EM structure of mGlu2-mGlu3 heterodimer in Rco state 提交 2023-05-12 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 3
23–879(857 aa)
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 CLR CHOLESTEROL × 7 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 8JD2 Cryo-EM structure of G protein-free mGlu2-mGlu3 heterodimer in Acc state 提交 2023-05-12 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 3
23–879(857 aa)
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 8JD3 Cryo-EM structure of Gi1-bound mGlu2-mGlu3 heterodimer 提交 2023-05-12 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 5 PDB 声明:pentameric |
链 3
23–879(857 aa)
|
未记录 | HZR 1-butyl-3-chloranyl-4-(4-phenylpiperidin-1-yl)pyridin-2-one × 1 GLU GLUTAMIC ACID × 2 CLR CHOLESTEROL × 3 PEF DI-PALMITOYL-3-SN-PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9II2 Cryo-EM Structure of the 2:2 Complex of mGlu3 and beta-arrestin1 提交 2024-06-18 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric |
链 B
1–879(879 aa)
链 R
1–879(879 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | GLU GLUTAMIC ACID × 2 CLR CHOLESTEROL × 6 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 9II3 Cryo-EM Structure of the 2:1 Complex of mGlu3 and beta-arrestin1 提交 2024-06-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 B
1–879(879 aa)
链 R
1–879(879 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | GLU GLUTAMIC ACID × 2 CLR CHOLESTEROL × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
共 19 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
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| UniProt名称 | GRM3_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 4–510; UniProt 2–508 |