SAXSdb — 4yxb

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Flagellar motor switch protein FliM,Flagellar motor switch protein FliN

Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720)

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 3	FliM::FliN fragment × 1 IMIDAZOLE × 1 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FLIM_SALTY
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 5–94； UniProt 245–334 作者链 B； PDB构建体 5–94； UniProt 245–334

Flagellar motor switch protein FliM,Flagellar motor switch protein FliN

Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720)

UniProt P26419

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 3	FliM::FliN fragment × 1 IMIDAZOLE × 1 water × 2	与蛋白数一致
2	信息不足	单体	蛋白 1	无其他共同聚合物	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FLIN_SALTY
Isoform	—
PDB实体	1, 3
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 95–227； UniProt 5–137 作者链 B； PDB构建体 95–227； UniProt 5–137 作者链 D； PDB构建体 10–80； UniProt 67–137

FliM::FliN fragment

Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720)

UniProt A0A0B4JZM9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
2	信息不足	单体	蛋白 1	无其他共同聚合物	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A0B4JZM9_SALTM
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–9； UniProt 10–18

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	4yxb
沉积日期 deposition_date	2015-03-22
结构标题 title	FliM(SPOA)::FliN fusion protein
关键词 keywords	Type III Secretion System, PROTEIN TRANSPORT; PROTEIN TRANSPORT
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

4yxb__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

4yxb__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

4yxb__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	22.70 Å
Rg（电子密度）	21.55 Å
总 Rg	22.52 Å
原子数	2510
残基数	332
排除体积	45734 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`4yxb__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`4yxb__assembly_2__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`4yxb__assembly_3__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Flagellar motor switch protein FliM,Flagellar motor switch protein FliN
分子量 formula_weight	25085.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	2628

GPVDNWRDNLVRQVQHSELELVANFADIPLRLSQILKLKPGDVLPIEKPDRIIAHVDGVPVLTSQYGTVNGQYALRVEHLINPILNSLNEEQPKNNPSDENTGALDDLWADALNEQKATTTKSAADAVFQQLGGGDVSGAMQDIDLIMDIPVKLTVELGRTRMTIKELLRLTQGSVVALDGLAGEPLDILINGYLIAQGEVVVVADKYGVRITDIITPSERMRRLSR

来源 Source

来源生物 organism	Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	99287
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	FliM::FliN fragment
分子量 formula_weight	690.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

VFQQLG

来源 Source

来源生物 organism	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	90371
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	FliM::FliN fragment
分子量 formula_weight	8912.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

GALDDLWADELGRTRMTIKELLRLTQGSVVALDGLAGEPLDILINGYLIAQGEVVVVADKYGVRITDIITPSERMRRLSR

来源 Source

来源生物 organism	Salmonella typhimurium (strain LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720)
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	99287
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Ambiguous peptide density
分子量 formula_weight	528.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

XXXXXX

来源 Source

来源生物 organism	Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	90371
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	IMIDAZOLE
分子量 formula_weight	69.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	23

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晶胞边长 a length_a	75.150 Å
晶胞边长 b length_b	81.500 Å
晶胞边长 c length_c	89.960 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.560 Å
最低分辨率 resolution_low	47.078 Å
R 因子 r_factor	0.2218
R_work r_work	0.2175
R_free r_free	0.2593

FliM(SPOA)::FliN fusion protein

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Flagellar motor switch protein FliM,Flagellar motor switch protein FliN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Flagellar motor switch protein FliM,Flagellar motor switch protein FliN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

FliM::FliN fragment

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4yxb__assembly_1__model_1

4yxb__assembly_1__model_1 | I(q)

4yxb__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

7. 引用文献 (1)

FliM(SPOA)::FliN fusion protein

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Flagellar motor switch protein FliM,Flagellar motor switch protein FliN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Flagellar motor switch protein FliM,Flagellar motor switch protein FliN

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

FliM::FliN fragment

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

4yxb__assembly_1__model_1

4yxb__assembly_1__model_1 | I(q)

4yxb__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

7. 引用文献 (1)