SAXSdb — 5ewx

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Endolysin,Immunoglobulin G-binding protein A,Endolysin

Enterobacteria phage T4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	单体	蛋白 1	;2,2'-ethyne-1,2-diylbis{5-[(chloroacetyl)amino]benzenesulfonic acid} ; × 1 water × 1	与蛋白数一致
2	信息不足	单体	蛋白 1	;2,2'-ethyne-1,2-diylbis{5-[(chloroacetyl)amino]benzenesulfonic acid} ; × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ENLYS_BPT4
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–35； UniProt 1–35 作者链 A； PDB构建体 101–227； UniProt 38–164 作者链 B； PDB构建体 1–35； UniProt 1–35 作者链 B； PDB构建体 101–227； UniProt 38–164

Endolysin,Immunoglobulin G-binding protein A,Endolysin

Enterobacteria phage T4

UniProt P38507

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	单体	蛋白 1	;2,2'-ethyne-1,2-diylbis{5-[(chloroacetyl)amino]benzenesulfonic acid} ; × 1 water × 1	与蛋白数一致
2	信息不足	单体	蛋白 1	;2,2'-ethyne-1,2-diylbis{5-[(chloroacetyl)amino]benzenesulfonic acid} ; × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SPA_STAAU
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 46–100； UniProt 212–266 作者链 B； PDB构建体 46–100； UniProt 212–266

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5ewx
沉积日期 deposition_date	2015-11-22
结构标题 title	Fusion protein of T4 lysozyme and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus with chemical cross-linker EY-CBS
关键词 keywords	Fusion, EY-CBS, alpha helix, cross-linker, PROTEIN BINDING; PROTEIN BINDING
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5ewx__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5ewx__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5ewx__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	23.41 Å
Rg（电子密度）	22.77 Å
总 Rg	23.42 Å
原子数	1696
残基数	210
排除体积	30016 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5ewx__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`5ewx__assembly_2__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Endolysin,Immunoglobulin G-binding protein A,Endolysin
分子量 formula_weight	25212.5 kDa
EC 编号 ec_number	3.2.1.17
突变 mutation	A1212V, G1240A, E1258C, K1261A, L1262A, N40C, C54T, C97A, K162A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	3472

MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKGGGGSGGGGSVDNKFNKEQQNAFYEILHLPNLNEEQRNAFIQSLKDDPSQSANLLACAKAANDAQSLCAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYANL

来源 Source

来源生物 organism	Enterobacteria phage T4
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10665
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	;2,2'-ethyne-1,2-diylbis{5-[(chloroacetyl)amino]benzenesulfonic acid} ;
分子量 formula_weight	521.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	64

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晶胞边长 a length_a	89.522 Å
晶胞边长 b length_b	149.850 Å
晶胞边长 c length_c	55.836 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	122.69 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.600 Å
最低分辨率 resolution_low	42.745 Å
R 因子 r_factor	0.2076
R_work r_work	0.2025
R_free r_free	0.2532

Fusion protein of T4 lysozyme and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus with chemical cross-linker EY-CBS

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Endolysin,Immunoglobulin G-binding protein A,Endolysin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Endolysin,Immunoglobulin G-binding protein A,Endolysin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5ewx__assembly_1__model_1

5ewx__assembly_1__model_1 | I(q)

5ewx__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 water

7. 引用文献 (1)

Fusion protein of T4 lysozyme and B4 domain of protein A from staphylococcal aureus with chemical cross-linker EY-CBS

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Endolysin,Immunoglobulin G-binding protein A,Endolysin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Endolysin,Immunoglobulin G-binding protein A,Endolysin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5ewx__assembly_1__model_1

5ewx__assembly_1__model_1 | I(q)

5ewx__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 water

7. 引用文献 (1)