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5fo7

Crystal Structure of Human Complement C3b at 2.8 Angstrom resolution

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 160.7 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

COMPLEMENT C3 BETA CHAIN

物种未注明

UniProt P01024

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 23–667 链 B； UniProt 749–1663 片段：RESIDUES 23-667 片段：RESIDUES 749-1663 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：8% PEG 3350 35MM BIS-TRIS PH 5.5 分辨率 2.80 Å R-free 0.268

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5FO7 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1C3D X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF C3D: A C3 FRAGMENT AND LIGAND FOR COMPLEMENT RECEPTOR 2 提交 1998-05-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 996–1287（292 aa）
突变：C17A GOL GLYCEROL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；PROTEIN WAS CRYSTALLIZED FROM 12% PEG 20K, 100 MM MES BUFFER, PH 6.5, 10 MM DTT
分辨率 1.80 Å R-free 0.230
1GHQ CR2-C3D COMPLEX STRUCTURE 提交 2001-01-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 996–1300（305 aa） 片段：FRAGMENT OF ALPHA CHAIN
突变：C17A ZN ZINC ION × 2 NDG 2-acetamido-2-deoxy-alpha-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6；pH 6.0
分辨率 2.04 Å R-free 0.239
1W2S Solution structure of CR2 SCR 1-2 in its complex with C3d by X-ray scattering 提交 2004-07-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 996–1287（292 aa）
链 A 1288–1299（12 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION SCATTERING mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
2A73 Human Complement Component C3 提交 2005-07-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–665（643 aa） 片段：residue 1-645
链 B 673–1663（991 aa） 片段：residue 650-1663
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.2；293 K；PEG 550 MME, sodium acetate, pH 6.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 3.30 Å R-free 0.289
2A74 Human Complement Component C3c 提交 2005-07-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–665（643 aa） 片段：residues 23-665
链 B 749–936（188 aa） 片段：residues 749-936
链 C 1321–1663（343 aa） 片段：esidues 1321-1663
未记录 GOL GLYCEROL × 7 NO3 NITRATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG3000, lithium nitrate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.275
2A74 Human Complement Component C3c 提交 2005-07-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 23–665（643 aa） 片段：residues 23-665
链 E 749–936（188 aa） 片段：residues 749-936
链 F 1321–1663（343 aa） 片段：esidues 1321-1663
未记录 GOL GLYCEROL × 6 NO3 NITRATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG3000, lithium nitrate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.275
2GOX Crystal structure of Efb-C / C3d Complex 提交 2006-04-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 996–1287（292 aa） 片段：Fragment of alpha chain: Residues 996-1287
突变：C1010A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；60% Tacsimate pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.20 Å R-free 0.231
2GOX Crystal structure of Efb-C / C3d Complex 提交 2006-04-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 996–1287（292 aa） 片段：Fragment of alpha chain: Residues 996-1287
突变：C1010A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；60% Tacsimate pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.20 Å R-free 0.231
2I07 Human Complement Component C3b 提交 2006-08-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–667（645 aa）
链 B 749–1663（915 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；303 K；PEG-MME 2000, sodium acetate, Bis-Tris propane, taurine, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 303K
分辨率 4.00 Å R-free 0.323
2ICE CRIg bound to C3c 提交 2006-09-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 23–664（642 aa）
链 B 749–954（206 aa）
链 C 1321–1663（343 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.10 Å R-free 0.295
2ICE CRIg bound to C3c 提交 2006-09-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 23–664（642 aa）
链 E 749–954（206 aa）
链 F 1321–1663（343 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.10 Å R-free 0.295
2ICF CRIg bound to C3b 提交 2006-09-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–664（642 aa）
链 B 749–1663（915 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；293 K；pH 6.5, EVAPORATION, temperature 293K
分辨率 4.10 Å R-free 0.330
2NOJ Crystal structure of Ehp / C3d complex 提交 2006-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 996–1287（292 aa） 片段：Residues 996-1287
突变：C1010A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.2；293 K；0.2M LiSO4, 25% PEG 3350, 0.1M Tris-HCl pH 8.2, additive: CaCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.284
2NOJ Crystal structure of Ehp / C3d complex 提交 2006-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 996–1287（292 aa） 片段：Residues 996-1287
突变：C1010A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.2；293 K；0.2M LiSO4, 25% PEG 3350, 0.1M Tris-HCl pH 8.2, additive: CaCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.284
2NOJ Crystal structure of Ehp / C3d complex 提交 2006-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 996–1287（292 aa） 片段：Residues 996-1287
突变：C1010A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.2；293 K；0.2M LiSO4, 25% PEG 3350, 0.1M Tris-HCl pH 8.2, additive: CaCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.284
2NOJ Crystal structure of Ehp / C3d complex 提交 2006-10-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 996–1287（292 aa） 片段：Residues 996-1287
突变：C1010A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.2；293 K；0.2M LiSO4, 25% PEG 3350, 0.1M Tris-HCl pH 8.2, additive: CaCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.284
2QKI Human C3c in complex with the inhibitor compstatin 提交 2007-07-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 23–665（643 aa） 片段：residues 23-665
链 B 749–936（188 aa） 片段：residues 749-936
链 C 1321–1663（343 aa） 片段：residues 1321-1663
未记录 K POTASSIUM ION × 2 BR BROMIDE ION × 12 GOL GLYCEROL × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG-MME 2000, KBr, Tris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.281
2QKI Human C3c in complex with the inhibitor compstatin 提交 2007-07-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 23–665（643 aa） 片段：residues 23-665
链 E 749–936（188 aa） 片段：residues 749-936
链 F 1321–1663（343 aa） 片段：residues 1321-1663
未记录 K POTASSIUM ION × 3 BR BROMIDE ION × 20 GOL GLYCEROL × 11 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG-MME 2000, KBr, Tris, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.40 Å R-free 0.281
2WII Complement C3b in complex with factor H domains 1-4 提交 2009-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–667（645 aa） 片段：RESIDUES 23-667
链 B 749–1663（915 aa） 片段：RESIDUES 749-1663
未记录 CA CALCIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 17 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.1；7.0% (W/V) PEG 3,350, 70 MM AMMONIUM ACETATE, PH 7.1
分辨率 2.70 Å R-free 0.252
2WII Complement C3b in complex with factor H domains 1-4 提交 2009-05-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 23–667（645 aa） 片段：RESIDUES 23-667
未记录 CA CALCIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.1；7.0% (W/V) PEG 3,350, 70 MM AMMONIUM ACETATE, PH 7.1
分辨率 2.70 Å R-free 0.252
2WII Complement C3b in complex with factor H domains 1-4 提交 2009-05-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 749–1663（915 aa） 片段：RESIDUES 749-1663
未记录 GOL GLYCEROL × 13 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.1；7.0% (W/V) PEG 3,350, 70 MM AMMONIUM ACETATE, PH 7.1
分辨率 2.70 Å R-free 0.252
2WIN C3 convertase (C3bBb) stabilized by SCIN 提交 2009-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 23–667（645 aa） 片段：COMPLEMENT C3B BETA CHAIN, RESIDUES 23-667
链 B 749–1663（915 aa） 片段：;COMPLEMENT C3B ALPHA' CHAIN, RESIDUES 749-1663 ;
链 G 23–667（645 aa） 片段：COMPLEMENT C3B BETA CHAIN, RESIDUES 23-667
链 H 749–1663（915 aa） 片段：;COMPLEMENT C3B ALPHA' CHAIN, RESIDUES 749-1663 ;
未记录 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 BMA beta-D-mannopyranose × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；75 MM SODIUM/POTASSIUM TARTRATE, 8.0% PEG 3350, 50 MM BIS-TRIS PROPANE, PH 6.5
分辨率 3.90 Å R-free 0.268
2WIN C3 convertase (C3bBb) stabilized by SCIN 提交 2009-05-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 23–667（645 aa） 片段：COMPLEMENT C3B BETA CHAIN, RESIDUES 23-667
链 D 749–1663（915 aa） 片段：;COMPLEMENT C3B ALPHA' CHAIN, RESIDUES 749-1663 ;
链 E 23–667（645 aa） 片段：COMPLEMENT C3B BETA CHAIN, RESIDUES 23-667
链 F 749–1663（915 aa） 片段：;COMPLEMENT C3B ALPHA' CHAIN, RESIDUES 749-1663 ;
未记录 BMA beta-D-mannopyranose × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；75 MM SODIUM/POTASSIUM TARTRATE, 8.0% PEG 3350, 50 MM BIS-TRIS PROPANE, PH 6.5
分辨率 3.90 Å R-free 0.268
2WY7 Staphylococcus aureus complement subversion protein Sbi-IV in complex with complement fragment C3d revealing an alternative binding mode 提交 2009-11-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 996–1303（308 aa） 片段：C3D, RESIDUES 996-1303
突变：YES GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；100MM TRIS PH8.0, 200MM NACL, 20%(W/V) PEG 4000
分辨率 1.70 Å R-free 0.205
2WY8 Staphylococcus aureus complement subversion protein Sbi-IV in complex with complement fragment C3d 提交 2009-11-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 996–1303（308 aa） 片段：C3D, RESIDUES 996-1303
突变：YES GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；100MM TRIS PH8.0, 200MM NACL, 20%(W/V) PEG 4000
分辨率 1.70 Å R-free 0.205
2XQW Structure of Factor H domains 19-20 in complex with complement C3d 提交 2010-09-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 996–1287（292 aa） 片段：THIOESTER DOMAIN, RESIDUES 996-1287
链 B 996–1287（292 aa） 片段：THIOESTER DOMAIN, RESIDUES 996-1287
突变：YES 突变：YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；295 K；12-18% PEG 4000, 0.1 M HEPES, PH 7.5, AT 22 DEGREES C
分辨率 2.31 Å R-free 0.242
2XQW Structure of Factor H domains 19-20 in complex with complement C3d 提交 2010-09-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 996–1287（292 aa） 片段：THIOESTER DOMAIN, RESIDUES 996-1287
突变：YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；295 K；12-18% PEG 4000, 0.1 M HEPES, PH 7.5, AT 22 DEGREES C
分辨率 2.31 Å R-free 0.242
2XQW Structure of Factor H domains 19-20 in complex with complement C3d 提交 2010-09-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 996–1287（292 aa） 片段：THIOESTER DOMAIN, RESIDUES 996-1287
突变：YES 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；295 K；12-18% PEG 4000, 0.1 M HEPES, PH 7.5, AT 22 DEGREES C
分辨率 2.31 Å R-free 0.242
2XWB Crystal Structure of Complement C3b in complex with Factors B and D 提交 2010-11-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 23–664（642 aa） 片段：RESIDUES 23-664
链 B 752–1663（912 aa） 片段：RESIDUES 752-1663
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；PH 7.7
分辨率 3.49 Å R-free 0.244
2XWB Crystal Structure of Complement C3b in complex with Factors B and D 提交 2010-11-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 23–664（642 aa） 片段：RESIDUES 23-664
链 D 752–1663（912 aa） 片段：RESIDUES 752-1663
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；PH 7.7
分辨率 3.49 Å R-free 0.244
2XWB Crystal Structure of Complement C3b in complex with Factors B and D 提交 2010-11-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 23–664（642 aa） 片段：RESIDUES 23-664
链 D 752–1663（912 aa） 片段：RESIDUES 752-1663
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；PH 7.7
分辨率 3.49 Å R-free 0.244
2XWB Crystal Structure of Complement C3b in complex with Factors B and D 提交 2010-11-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 23–664（642 aa） 片段：RESIDUES 23-664
链 B 752–1663（912 aa） 片段：RESIDUES 752-1663
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.7；PH 7.7
分辨率 3.49 Å R-free 0.244
2XWJ Crystal Structure of Complement C3b in Complex with Factor B 提交 2010-11-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–667（645 aa） 片段：RESIDUES 23-667
链 B 749–1663（915 aa） 片段：RESIDUES 749-1663
突变：YES NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 NI NICKEL (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4；pH 4.0
分辨率 4.00 Å R-free 0.281
2XWJ Crystal Structure of Complement C3b in Complex with Factor B 提交 2010-11-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 23–667（645 aa） 片段：RESIDUES 23-667
链 D 749–1663（915 aa） 片段：RESIDUES 749-1663
突变：YES NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 NI NICKEL (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4；pH 4.0
分辨率 4.00 Å R-free 0.281
2XWJ Crystal Structure of Complement C3b in Complex with Factor B 提交 2010-11-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 G 23–667（645 aa） 片段：RESIDUES 23-667
链 H 749–1663（915 aa） 片段：RESIDUES 749-1663
突变：YES NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 NI NICKEL (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4；pH 4.0
分辨率 4.00 Å R-free 0.281
2XWJ Crystal Structure of Complement C3b in Complex with Factor B 提交 2010-11-04 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 E 23–667（645 aa） 片段：RESIDUES 23-667
链 F 749–1663（915 aa） 片段：RESIDUES 749-1663
突变：YES NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 NI NICKEL (II) ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4；pH 4.0
分辨率 4.00 Å R-free 0.281
30JE Herpes simplex virus 2 delta28-73 glycoprotein C ectodomain in complex with C3b 提交 2026-04-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 23–667（645 aa）
链 C 749–1663（915 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
3D5R Crystal Structure of Efb-C (N138A) / C3d Complex 提交 2008-05-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 996–1287（292 aa） 片段：Complement C3d fragment, UNP residues 996-1287
突变：C1010A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；60% (v/v) tacsimate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.241
3D5R Crystal Structure of Efb-C (N138A) / C3d Complex 提交 2008-05-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 996–1287（292 aa） 片段：Complement C3d fragment, UNP residues 996-1287
突变：C1010A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；60% (v/v) tacsimate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.241
3D5S Crystal Structure of Efb-C (R131A) / C3d Complex 提交 2008-05-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 996–1287（292 aa） 片段：Complement C3d fragment, UNP residues 996-1287
突变：C1010A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；60% (v/v) tacsimate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.218
3D5S Crystal Structure of Efb-C (R131A) / C3d Complex 提交 2008-05-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 996–1287（292 aa） 片段：Complement C3d fragment, UNP residues 996-1287
突变：C1010A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；60% (v/v) tacsimate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.30 Å R-free 0.218
3G6J C3b in complex with a C3b specific Fab 提交 2009-02-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 23–666（644 aa）
链 B 749–1663（915 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；Crystals of the C3b:S77 complex were obtained within a week at 19\xB0 C from 4 ml hanging drops, consisting of a 1:1 ratio of protein solution (10 mg/ml protein in 50 mM NaCl, 25 mM TRIS pH 7.8) to mother liquor (10% PEG 4000, 0.2 M MgCl2, 100 mM Na-HEPES, pH 7.0), suspended over mother liquor, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.282
3G6J C3b in complex with a C3b specific Fab 提交 2009-02-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 23–666（644 aa）
链 D 749–1663（915 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；Crystals of the C3b:S77 complex were obtained within a week at 19\xB0 C from 4 ml hanging drops, consisting of a 1:1 ratio of protein solution (10 mg/ml protein in 50 mM NaCl, 25 mM TRIS pH 7.8) to mother liquor (10% PEG 4000, 0.2 M MgCl2, 100 mM Na-HEPES, pH 7.0), suspended over mother liquor, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.282
3G6J C3b in complex with a C3b specific Fab 提交 2009-02-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–666（644 aa）
链 B 749–1663（915 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；Crystals of the C3b:S77 complex were obtained within a week at 19\xB0 C from 4 ml hanging drops, consisting of a 1:1 ratio of protein solution (10 mg/ml protein in 50 mM NaCl, 25 mM TRIS pH 7.8) to mother liquor (10% PEG 4000, 0.2 M MgCl2, 100 mM Na-HEPES, pH 7.0), suspended over mother liquor, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.282
3G6J C3b in complex with a C3b specific Fab 提交 2009-02-06 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 23–666（644 aa）
链 D 749–1663（915 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；Crystals of the C3b:S77 complex were obtained within a week at 19\xB0 C from 4 ml hanging drops, consisting of a 1:1 ratio of protein solution (10 mg/ml protein in 50 mM NaCl, 25 mM TRIS pH 7.8) to mother liquor (10% PEG 4000, 0.2 M MgCl2, 100 mM Na-HEPES, pH 7.0), suspended over mother liquor, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.10 Å R-free 0.282
3L3O Staphylococcal Complement Inhibitor (SCIN) in complex with Human Complement Component C3c 提交 2009-12-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 23–667（645 aa） 片段：residues 23-667
链 B 749–954（206 aa） 片段：residues 749-954
链 C 1321–1663（343 aa） 片段：residues 1321-1663
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；Protein solution: 5mg/ml, 0.1M HEPES, 10% PEG 6000, 5% 2-Methyl-2,4-pentanediol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.40 Å R-free 0.271
3L3O Staphylococcal Complement Inhibitor (SCIN) in complex with Human Complement Component C3c 提交 2009-12-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 23–667（645 aa） 片段：residues 23-667
链 E 749–954（206 aa） 片段：residues 749-954
链 F 1321–1663（343 aa） 片段：residues 1321-1663
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；Protein solution: 5mg/ml, 0.1M HEPES, 10% PEG 6000, 5% 2-Methyl-2,4-pentanediol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.40 Å R-free 0.271
3L5N Staphylococcal Complement Inhibitor (SCIN) in complex with Human Complement Component C3b 提交 2009-12-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–667（645 aa） 片段：residues 23-667
链 B 749–1663（915 aa） 片段：residues 749-1663
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 MAN alpha-D-mannopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；Protein solution 5mg/ml, 0.1M HEPES-NaOH, 30%(v/v) Jeffamine ED-2001-HCl, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 7.54 Å R-free 0.268
3NMS Staphylococcal Complement Inhibitor (SCIN) in complex with Human Complement C3c 提交 2010-06-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 23–667（645 aa）
链 B 749–954（206 aa）
链 C 1321–1663（343 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；Protein solution: 5mg/ml, 0.1M HEPES, 10% PEG 6000, 5% 2-Methyl-2,4-pentanediol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 4.10 Å R-free 0.289
3OED The structure of the complex between complement receptor CR2 and its ligand complement fragment C3d 提交 2010-08-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 996–1303（308 aa） 片段：C3 (unp residues 996-1303)
突变：C1010A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；100 mM HEPES, 20% Poly Ethylene Glycol 6000, 200 mM CaCl2, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.16 Å R-free 0.259
3OED The structure of the complex between complement receptor CR2 and its ligand complement fragment C3d 提交 2010-08-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 996–1303（308 aa） 片段：C3 (unp residues 996-1303)
突变：C1010A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；100 mM HEPES, 20% Poly Ethylene Glycol 6000, 200 mM CaCl2, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 3.16 Å R-free 0.259
3OHX Molecular Basis for Complement Recognition and Inhibition Determined by Crystallographic Studies of the Staphylococcal Complement Inhibitor (SCIN) Bound to C3c and C3b 提交 2010-08-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 23–667（645 aa） 片段：Complement C3 beta chain
链 B 749–954（206 aa） 片段：;Complement C3 alpha' chain fragment 1 ;
链 C 1321–1663（343 aa） 片段：;Complement C3 alpha' chain fragment 2 ;
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；2.5mg/ml protein, 0.1M HEPES, 10% PEG6000, 5% 2-Methyl-2,4-pentanediol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.50 Å R-free 0.294
3OHX Molecular Basis for Complement Recognition and Inhibition Determined by Crystallographic Studies of the Staphylococcal Complement Inhibitor (SCIN) Bound to C3c and C3b 提交 2010-08-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 23–667（645 aa） 片段：Complement C3 beta chain
链 E 749–954（206 aa） 片段：;Complement C3 alpha' chain fragment 1 ;
链 F 1321–1663（343 aa） 片段：;Complement C3 alpha' chain fragment 2 ;
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；2.5mg/ml protein, 0.1M HEPES, 10% PEG6000, 5% 2-Methyl-2,4-pentanediol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.50 Å R-free 0.294
3OXU Complement components factor H CCP19-20 and C3d in complex 提交 2010-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 996–1303（308 aa） 片段：UNP residues 996-1303
突变：C1010A GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；290 K；4% w/v PEG 8000, 0.1 M Tris HCl, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.10 Å R-free 0.206
3OXU Complement components factor H CCP19-20 and C3d in complex 提交 2010-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 996–1303（308 aa） 片段：UNP residues 996-1303
突变：C1010A GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；290 K；4% w/v PEG 8000, 0.1 M Tris HCl, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.10 Å R-free 0.206
3OXU Complement components factor H CCP19-20 and C3d in complex 提交 2010-09-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 996–1303（308 aa） 片段：UNP residues 996-1303
突变：C1010A GOL GLYCEROL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.8；290 K；4% w/v PEG 8000, 0.1 M Tris HCl, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.10 Å R-free 0.206
3RJ3 Complement components factor H CCP19-20 (S1191L mutant) and C3D in complex 提交 2011-04-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 996–1303（308 aa） 片段：UNP residues 996-1303
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；290 K；4% w/v PEG 8000, 0.1 M Tris HCl, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.35 Å R-free 0.232
3RJ3 Complement components factor H CCP19-20 (S1191L mutant) and C3D in complex 提交 2011-04-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 996–1303（308 aa） 片段：UNP residues 996-1303
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；290 K；4% w/v PEG 8000, 0.1 M Tris HCl, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.35 Å R-free 0.232
3RJ3 Complement components factor H CCP19-20 (S1191L mutant) and C3D in complex 提交 2011-04-15 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 996–1303（308 aa） 片段：UNP residues 996-1303
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；290 K；4% w/v PEG 8000, 0.1 M Tris HCl, pH 8.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.35 Å R-free 0.232
3T4A Structure of a truncated form of Staphylococcal Complement Inhibitor B bound to human C3c at 3.4 Angstrom resolution 提交 2011-07-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 23–667（645 aa） 片段：C3c beta chain, UNP residues 23-667
链 B 749–954（206 aa） 片段：;C3c alpha' chain fragment 1, UNP residues 749-954 ;
链 C 1321–1663（343 aa） 片段：;C3c alpha' chain fragment 2, UNP residues 1321-1663 ;
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；293 K；5mg/ml protein, 0.1M bis-Tris, 15% w/v PEG 3350, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 3.40 Å R-free 0.270
3T4A Structure of a truncated form of Staphylococcal Complement Inhibitor B bound to human C3c at 3.4 Angstrom resolution 提交 2011-07-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 23–667（645 aa） 片段：C3c beta chain, UNP residues 23-667
链 E 749–954（206 aa） 片段：;C3c alpha' chain fragment 1, UNP residues 749-954 ;
链 F 1321–1663（343 aa） 片段：;C3c alpha' chain fragment 2, UNP residues 1321-1663 ;
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；293 K；5mg/ml protein, 0.1M bis-Tris, 15% w/v PEG 3350, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
分辨率 3.40 Å R-free 0.270
4HW5 Crystal Structure of the Human C3a anaphylatoxin 提交 2012-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 672–748（77 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；292 K；2-2.2 M ammonium sulfate with the pH ranging from 6 to 9 , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 2.25 Å R-free 0.243
4HW5 Crystal Structure of the Human C3a anaphylatoxin 提交 2012-11-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 672–748（77 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；292 K；2-2.2 M ammonium sulfate with the pH ranging from 6 to 9 , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 2.25 Å R-free 0.243
4HW5 Crystal Structure of the Human C3a anaphylatoxin 提交 2012-11-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 672–748（77 aa）
链 B 672–748（77 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；292 K；2-2.2 M ammonium sulfate with the pH ranging from 6 to 9 , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 2.25 Å R-free 0.243
4HWJ Crystal Structure of the Human C3a desArg anaphylatoxin 提交 2012-11-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 672–747（76 aa）
未记录 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；292 K；0.1 M Tris pH 7.5-8.5, 25 % w/v PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 2.60 Å R-free 0.270
4I6O Crystal structure of chemically synthesized human anaphylatoxin C3a 提交 2012-11-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 672–748（77 aa） 片段：C3a anaphylatoxin (UNP residues 672-748)
未记录 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, 1 uL 5 mg/mL lyophilized C3a in 2 mM hydrochloric acid + 1 uL reservoir (0.1 M Tris-HCl, 0.2 M ammonium phosphate monobasic, 49-51% v/v MPD, pH 8.5) against 500 uL reservoir, prepared at 277K, incubated at 281K for 96 hours, stored at 277K, rhomboid-shaped crystals appeared after 6 days and grew to a final size of 0.5 x 0.2 x 0.2 mm
分辨率 2.14 Å R-free 0.268
4M76 Integrin I domain of complement receptor 3 in complex with C3d 提交 2013-08-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 994–1288（295 aa） 片段：unp residues 994-1288
突变：C1010A, C144A, I332G NI NICKEL (II) ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；PEG 3350, pH 7, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.242
4ONT Ternary host recognition complex of complement factor H, C3d, and sialic acid 提交 2014-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 996–1303（308 aa） 片段：UNP residues 996-1303
突变：C17A GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；0.1 M Tris-HCl, pH 9.0, 8% w/v PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.15 Å R-free 0.223
4ONT Ternary host recognition complex of complement factor H, C3d, and sialic acid 提交 2014-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 996–1303（308 aa） 片段：UNP residues 996-1303
突变：C17A GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；0.1 M Tris-HCl, pH 9.0, 8% w/v PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.15 Å R-free 0.223
4ONT Ternary host recognition complex of complement factor H, C3d, and sialic acid 提交 2014-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 996–1303（308 aa） 片段：UNP residues 996-1303
突变：C17A GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；0.1 M Tris-HCl, pH 9.0, 8% w/v PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.15 Å R-free 0.223
4ZH1 Complement factor H in complex with the GM1 glycan 提交 2015-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 996–1303（308 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M TRIS-HCL, PH 9.0, 8% W/V PRG 8000
分辨率 2.24 Å R-free 0.228
4ZH1 Complement factor H in complex with the GM1 glycan 提交 2015-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 996–1303（308 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M TRIS-HCL, PH 9.0, 8% W/V PRG 8000
分辨率 2.24 Å R-free 0.228
4ZH1 Complement factor H in complex with the GM1 glycan 提交 2015-04-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 996–1303（308 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.1 M TRIS-HCL, PH 9.0, 8% W/V PRG 8000
分辨率 2.24 Å R-free 0.228
5FO8 Crystal Structure of Human Complement C3b in Complex with MCP (CCP1-4) 提交 2015-11-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–667（645 aa） 片段：UNP RESIDUES 23-667
链 B 749–1663（915 aa） 片段：UNP RESIDUES 749-1663
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 32 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 100MM AMMONIUM CITRATE 7% PEG 3350 5MM GLUTATHIONE 50MM BIS-TRIS PROPANE, PH 6.5
分辨率 2.40 Å R-free 0.219
5FO9 Crystal Structure of Human Complement C3b in Complex with CR1 (CCP15- 17) 提交 2015-11-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 23–667（645 aa） 片段：RESIDUES 23-667
链 E 749–1663（915 aa） 片段：CCP DOMAINS, RESIDUES 749-1663
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 8% PEG 3350 35MM BIS-TRIS PH 5.5
分辨率 3.30 Å R-free 0.291
5FO9 Crystal Structure of Human Complement C3b in Complex with CR1 (CCP15- 17) 提交 2015-11-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–667（645 aa） 片段：RESIDUES 23-667
链 B 749–1663（915 aa） 片段：CCP DOMAINS, RESIDUES 749-1663
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 8% PEG 3350 35MM BIS-TRIS PH 5.5
分辨率 3.30 Å R-free 0.291
5FOA Crystal Structure of Human Complement C3b in complex with DAF (CCP2-4) 提交 2015-11-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–667（645 aa） 片段：UNP RESIDUES 23-667
链 B 749–1663（915 aa） 片段：UNP RESIDUES 749-1663
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 60MM MGCL2 30MM BIS-TRIS PH 5.5 6.5% PEG 3350 3% MESO-ERHYTROL
分辨率 4.19 Å R-free 0.307
5FOA Crystal Structure of Human Complement C3b in complex with DAF (CCP2-4) 提交 2015-11-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 23–667（645 aa） 片段：UNP RESIDUES 23-667
链 D 749–1663（915 aa） 片段：UNP RESIDUES 749-1663
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 60MM MGCL2 30MM BIS-TRIS PH 5.5 6.5% PEG 3350 3% MESO-ERHYTROL
分辨率 4.19 Å R-free 0.307
5FOB Crystal Structure of Human Complement C3b in complex with Smallpox Inhibitor of Complement (SPICE) 提交 2015-11-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–667（645 aa） 片段：RESIDUES 23-667
链 B 749–1663（915 aa） 片段：CCP DOMAINS, RESIDUES 749-1663
未记录 CL CHLORIDE ION × 5 GOL GLYCEROL × 24 NA SODIUM ION × 2 IOD IODIDE ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 75MM AMMONIUM IODIDE, 3.5% PEG 3350
分辨率 2.60 Å R-free 0.230
5NBQ The structure of the tripartite complex between OspE, the C-terminal domains of factor H and C3dg 提交 2017-03-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 994–1287（294 aa）
突变：A1153E, C1010A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG3350, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M MgCl2 or 24% PEG3350, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M MgCl2 or 16% PEG3350, Tris pH 8.5, 0.2 M ammonium acetate
分辨率 3.18 Å R-free 0.261
5NBQ The structure of the tripartite complex between OspE, the C-terminal domains of factor H and C3dg 提交 2017-03-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 994–1287（294 aa）
突变：A1153E, C1010A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG3350, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M MgCl2 or 24% PEG3350, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M MgCl2 or 16% PEG3350, Tris pH 8.5, 0.2 M ammonium acetate
分辨率 3.18 Å R-free 0.261
5NBQ The structure of the tripartite complex between OspE, the C-terminal domains of factor H and C3dg 提交 2017-03-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 994–1287（294 aa）
突变：A1153E, C1010A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG3350, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M MgCl2 or 24% PEG3350, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M MgCl2 or 16% PEG3350, Tris pH 8.5, 0.2 M ammonium acetate
分辨率 3.18 Å R-free 0.261
5O32 The structure of complement complex 提交 2017-05-23 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 A 23–667（645 aa） 片段：beta chain, UNP residues 23-667
链 B 749–1663（915 aa） 片段：alpha chain, UNP residues 749-1663
链 E 23–667（645 aa） 片段：beta chain, UNP residues 23-667
链 F 749–1663（915 aa） 片段：alpha chain, UNP residues 749-1663
未记录 CA CALCIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 MLI MALONATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；60mM sodium malonate PH5.0 6% w/v PEG3350
分辨率 4.21 Å R-free 0.254
5O35 Structure of complement proteins complex 提交 2017-05-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–667（645 aa）
链 B 749–1663（915 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291.15 K；60mM Ammonium sulfate, 6% w/v PEG3350
分辨率 4.20 Å R-free 0.246
6EHG complement component C3b in complex with a nanobody 提交 2017-09-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–665（643 aa）
链 B 749–1663（915 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；12 mM Sodium Citrate pH 8, 28 mM Sodium Citrate pH 6.0, 12.25 % (w/v) PEG 2000 MME, 70 mM Imidazole pH 7, 60 mM Ammonium acetate, 70 mM Tris pH 8.5, 13.5 % (v/v) and (+/-)-2-Methyl-2,4-pentanediol
分辨率 2.65 Å
6RMT Crystal structure of disulphide-linked human C3d dimer 提交 2019-05-07 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 996–1303（308 aa）
链 B 996–1303（308 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；100 mM Tris pH 8, 200 mM NaCl, 24% PEG 4000
分辨率 2.00 Å R-free 0.200
6RMU Crystal structure of disulphide-linked human C3d dimer in complex with Staphylococcus aureus complement subversion protein Sbi-IV 提交 2019-05-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 996–1303（308 aa）
链 B 996–1303（308 aa）
未记录 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.07；291 K；0.2 M sodium citrate tribasic dihydrate, 20% PEG 3350.
分辨率 2.40 Å R-free 0.211
6RU5 human complement C3 in complex with the hC3Nb1 nanobody 提交 2019-05-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–667（645 aa）
链 B 672–1663（992 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；100 mM HEPES pH 7.2, 1.75 % (w/v) PEG8000
分辨率 3.90 Å
6RUR Structure of the SCIN stabilized C3bBb convertase bound to properdin 提交 2019-05-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 23–667（645 aa）
链 B 749–1663（915 aa）
链 G 23–667（645 aa）
链 H 749–1663（915 aa）
未记录 MAN alpha-D-mannopyranose × 18 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；50 mM MgAcetate 50 mM Mes 6.5 5 % w/v PEG 10K
分辨率 6.00 Å R-free 0.272
6RUV Structure of the SCIN stabilized C3bBb convertase bound to Properdin and a the non-inhibitory nanobody hFPNb1 提交 2019-05-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 A 23–667（645 aa）
链 B 749–1663（915 aa）
链 G 23–667（645 aa）
链 H 749–1663（915 aa）
未记录 MAN alpha-D-mannopyranose × 21 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.8；277 K；100 mM NaCl, 5 % (w/v) PEG4000, 10 mM MgCl2, 100 mM Sodium Cacodylate trihydrate pH 5.8.
分辨率 6.15 Å R-free 0.271
6S0B Crystal Structure of Properdin in complex with the CTC domain of C3/C3b 提交 2019-06-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 1517–1663（147 aa）
未记录 MAN alpha-D-mannopyranose × 8 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；291 K；Tacsimate, PEG 3350
分辨率 2.31 Å R-free 0.277
7AKK Structure of a complement factor-receptor complex 提交 2020-10-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 749–1663（915 aa）
链 B 23–667（645 aa）
链 C 23–667（645 aa）
链 E 749–1663（915 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 K POTASSIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；100 mM Tris-HCl (pH 8.0), 8% (w/v) polyethylene glycol (PEG) 8000
分辨率 3.40 Å R-free 0.229
7BAG C3b in complex with CP40 提交 2020-12-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–667（645 aa）
链 B 749–1663（915 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 5 ACM ACETAMIDE × 1 NH2 AMINO GROUP × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；291 K；6.66% w/v polyethylene glycol 8000, 66.6 mM sodium chloride and 33.3 mM disodium phosphate/citric acid pH 4.0
分辨率 2.00 Å R-free 0.225
7NOZ Structure of the nanobody stablized properdin bound alternative pathway proconvertase C3b:FB:FP 提交 2021-02-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 23–667（645 aa）
链 B 752–1663（912 aa）
未记录 MAN alpha-D-mannopyranose × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.05 M Na-acetate pH 5.3, 0.1 M Mg-formate,7% PEG5000 MME
分辨率 3.90 Å R-free 0.265
7PI6 Trypanosoma brucei ISG65 bound to human complement C3d 提交 2021-08-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 996–1287（292 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M MES pH 6, 0.2 M MgCl2, 20% PEG 6000 with sliver bullet HR2-996-55
分辨率 2.60 Å R-free 0.310
7PI6 Trypanosoma brucei ISG65 bound to human complement C3d 提交 2021-08-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 996–1287（292 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 PG0 2-(2-METHOXYETHOXY)ETHANOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M MES pH 6, 0.2 M MgCl2, 20% PEG 6000 with sliver bullet HR2-996-55
分辨率 2.60 Å R-free 0.310
7QIV Structure of human C3b in complex with the EWE nanobody 提交 2021-12-16 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–667（645 aa）
链 B 749–1663（915 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；292 K；112 mM Sodium Citrate pH 8, 28 mM Sodium Citrate pH 6.0, 12.25 % (w/v) PEG 2000 MME, 70 mM Imidazole pH 7, 60 mM Ammonium acetate, 70 mM TRIS pH 8.5, and 13.5 % (v/v) 2-Methyl-2,4-pentanediol
分辨率 2.80 Å R-free 0.275
7TV9 HUMAN COMPLEMENT COMPONENT C3B IN COMPLEX WITH APL-1030 提交 2022-02-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–667（645 aa）
链 B 749–1663（915 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；293 K；100 mM HEPES, pH 7.8, 25% Poly(acrylic acid sodium salt) 5100
分辨率 3.40 Å R-free 0.328
7UE9 Structure of anti-C3d Fab(3d8b) in complex with C3d 提交 2022-03-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 994–1303（310 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 10 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；293 K；15% PEG 10,000, 0.1 M bicine pH 7.6
分辨率 1.75 Å R-free 0.201
7ZGJ Trypanosoma brucei gambiense ISG65 in complex with human complement component C3 提交 2022-04-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–667（645 aa）
链 B 672–1663（992 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.58 Å
7ZGK Trypanosoma brucei gambiense ISG65 in complex with human complement component C3b 提交 2022-04-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–667（645 aa）
链 B 749–1663（915 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
8ENU Structure of the C3bB proconvertase in complex with lufaxin 提交 2022-09-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 23–667（645 aa）
链 H 749–1663（915 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.22 Å
8EOK Structure of the C3bB proconvertase in complex with lufaxin and factor Xa 提交 2022-10-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 G 23–667（645 aa）
链 H 749–1663（915 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.53 Å
8HK2 C3aR-Gi-C3a protein complex 提交 2022-11-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 672–748（77 aa）
未记录 CLR CHOLESTEROL × 5 PLM PALMITIC ACID × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8I9L Structure of C3a-C3aR-Go complex (Composite map) 提交 2023-02-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 672–748（77 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.18 Å
8OQ3 Structure of methylamine treated human complement C3 提交 2023-04-11 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 23–1663（1641 aa）
链 D 23–1663（1641 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8OVB Human Complement C3b in complex with Trypanosoma brucei ISG65. 提交 2023-04-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 23–664（642 aa）
链 B 749–1663（915 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8UH2 Complex of C3b with the inhibitor albicin 提交 2023-10-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 23–664（642 aa）
链 B 749–1663（915 aa）
链 G 23–664（642 aa）
链 H 749–1663（915 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.59 Å
8UIN Structure of the C3bBb-albicin complex 提交 2023-10-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 23–664（642 aa）
链 B 749–1663（915 aa）
链 G 23–664（642 aa）
链 H 749–1663（915 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM Hepes pH 7.4, 150 mM NaCl, 5 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.86 Å
9N1Z Structure of C3d Bound to a Fragment of FHR-2 提交 2025-01-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 996–1287（292 aa）
突变：C1010A SO4 SULFATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.075 M HEPES [PH 7.5] 1.2 M Ammonium Sulfate
分辨率 2.31 Å R-free 0.227
9N1Z Structure of C3d Bound to a Fragment of FHR-2 提交 2025-01-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 996–1287（292 aa）
突变：C1010A SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.075 M HEPES [PH 7.5] 1.2 M Ammonium Sulfate
分辨率 2.31 Å R-free 0.227
9N20 Structure of C3d Bound to a Fragment of FHR-2 and S. aureus Efb-C 提交 2025-01-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 996–1287（292 aa） 片段：residues 996-1287
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M imidazole [pH 6.7] 12% (w/v) peg-20k
分辨率 3.30 Å R-free 0.214
9QK2 Structure of the Complement classical and lectin pathway C3 convertase in complex with substrate C3 提交 2025-03-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 F 1–1663（1663 aa）
链 G 1–1663（1663 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9RBO A cryo-EM structure of native C3 protein in a compact conformation. 提交 2025-05-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 32–227（196 aa）
链 B 350–665（316 aa）
链 C 686–734（49 aa）
链 D 762–1663（902 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.00 Å
9T3Y Cryo-EM structure of alphaM/beta2:C3d-anti-CR3-Nb headpiece complex (HPO2 3D class reconstruction) 提交 2025-10-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 995–1289（295 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 5 MN MANGANESE (II) ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；0.02 % w/v CHAPS added to sample just before vitrification
分辨率 3.44 Å
9U61 CP/MBL pathways C3 convertase C4b2a and C3 complex 提交 2025-03-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–1663（1663 aa）
链 D 1–1663（1663 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 NI NICKEL (II) ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9U62 AP pathways C3 convertase C3bBbP and C3 complex 提交 2025-03-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 1–1663（1663 aa）
链 D 1–1663（1663 aa）
链 E 1–1663（1663 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 NI NICKEL (II) ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å

共 74 个其他 PDB 条目、117 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CO3_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1, 2
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–645； UniProt 23–667 作者链 B； PDB构建体 1–915； UniProt 749–1663

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 5fo7

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 5fo7
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5fo7
沉积日期 deposition_date2015-11-18
结构标题 titleCrystal Structure of Human Complement C3b at 2.8 Angstrom resolution
关键词 keywordsLIPID BINDING, COMPLEMENT SYSTEM, IMMUNE SYSTEM, PLASMA PROTEIN; LIPID BINDING
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier46.29 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron46.16 Å
零角强度 I(0) i0432060000.00
分子量 molecular_weight172650.0 kDa
排除体积 excluded_volume217050 ų
包络体积 envelope_volume313610 ų
水化壳体积 shell_volume59571 ų
包络直径 envelope_diameter171.0 Å
壳层 Rg shell_rg47.51 Å
包络 Rg envelope_rg45.23 Å
形状 Rg shape_rg46.15 Å
总 Rg total_rg46.24 Å
总原子数 total_atoms12150
残基数 n_residues1537
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax160.7 Å
Rg (实空间) rg_real46.54 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.69 Å
I(0) (实空间) i0_real4.3210e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error8.6200e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal46.29 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal431900000.0000
解质量估计 total_estimate0.8673
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary52.0 Å
偏度 Skewness skewness0.438
峰度 Kurtosis kurtosis-0.338
角度范围 angular_range— – 0.1700 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0001
最高正则化参数 α highest_alpha29680000.0000
实空间数据点数 n_real_points35
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.831; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.972; Smooth: 0.805
▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

CATH v4.4 (12 domains)

结构域编号 domain_id5fo7A01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1930 — Macroglobulin (MG2) domain
结构域编号 domain_id5fo7A02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1930 — Macroglobulin (MG2) domain
结构域编号 domain_id5fo7A03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1940 —
结构域编号 domain_id5fo7A04
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5fo7A05
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1930 — Macroglobulin (MG2) domain
结构域编号 domain_id5fo7A06
类 Class class6 — Special
架构 Architecture architecture20 — Other non-globular
拓扑 Topology topology50 — N-terminal domain of TfIIb
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily160 —
结构域编号 domain_id5fo7B01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology130 — S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 —
结构域编号 domain_id5fo7B02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5fo7B03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1540 —
结构域编号 domain_id5fo7B04
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture50 — Alpha/alpha barrel
拓扑 Topology topology10 — Glycosyltransferase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 —
结构域编号 domain_id5fo7B05
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily690 — Alpha-macroglobulin, receptor-binding domain
结构域编号 domain_id5fo7B06
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily120 —
▶

8. 引用文献 (1)

▶

9. 文件与曲线 (10)