SAXSdb — 5ftt

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NETRIN RECEPTOR UNC5D

RATTUS NORVEGICUS

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	LEUCINE-RICH REPEAT TRANSMEMBRANE PROTEIN FLRT2 × 2 （Q8BLU0） ADHESION G PROTEIN-COUPLED RECEPTOR L3 × 4 （Q80TS3） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 SODIUM ION × 4 CALCIUM ION × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	UNC5D_RAT
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–276； UniProt 32–307 作者链 E； PDB构建体 1–276； UniProt 32–307

LEUCINE-RICH REPEAT TRANSMEMBRANE PROTEIN FLRT2

MUS MUSCULUS

UniProt Q8BLU0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	NETRIN RECEPTOR UNC5D × 2 （F1LW30） ADHESION G PROTEIN-COUPLED RECEPTOR L3 × 4 （Q80TS3） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 SODIUM ION × 4 CALCIUM ION × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FLRT2_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 3–330； UniProt 35–362 作者链 F； PDB构建体 3–330； UniProt 35–362

ADHESION G PROTEIN-COUPLED RECEPTOR L3

MUS MUSCULUS

UniProt Q80TS3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	NETRIN RECEPTOR UNC5D × 2 （F1LW30） LEUCINE-RICH REPEAT TRANSMEMBRANE PROTEIN FLRT2 × 2 （Q8BLU0） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 SODIUM ION × 4 CALCIUM ION × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	AGRL3_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 3–374； UniProt 92–463 作者链 D； PDB构建体 3–374； UniProt 92–463 作者链 G； PDB构建体 3–374； UniProt 92–463 作者链 H； PDB构建体 3–374； UniProt 92–463

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5ftt
沉积日期 deposition_date	2016-01-15
结构标题 title	Octameric complex of Latrophilin 3 (Lec, Olf) , Unc5D (Ig, Ig2, TSP1) and FLRT2 (LRR)
关键词 keywords	;SIGNALING PROTEIN, SIGNALLING PROTEIN, LEUCINE-RICH REPEAT, LRR, UNC5, UNC5D, FLRT2, LPHN3, LPHN, ADGRL, ADGRL3, ADGR, GPCR, UNCOORDINATED-5, NETRIN RECEPTOR, FLRT, LATROPHILIN, ADHESION, REPULSION, GUIDANCE, BETA PROPELLER, IMMUNOGLOBULIN, THROMBOSPONDIN, OLFACTOMEDIN, LECTIN, OCTAMER ;; SIGNALING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5ftt__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5ftt__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5ftt__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	50.90 Å
Rg（电子密度）	51.01 Å
总 Rg	51.19 Å
原子数	19610
残基数	2436
排除体积	346670 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5ftt__assembly_1__model_1`	octameric （8）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	NETRIN RECEPTOR UNC5D
分子量 formula_weight	31940.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,E
原子数 atom_count	19610

RGADSGEVLPDSIPSAPGTLPHFIEEPEDAYIIKSNPIALRCKARPAMQIFFKCNGEWVHQNEHVSEESLDESSGLKVREVFINVTRQQVEDFHGPEDYWCQCVAWSHLGTSKSRKASVRIAYLRKNFEQDPQGREVPIEGMIVLHCRPPEGVPAAEVEWLKNEEPIDSEQDENIDTRADHNLIIRQARLSDSGNYTCMAANIVAKRRSLSATVVVYVNGGWSSWTEWSACNVRCGRGWQKRSRTCTNPAPLNGGAFCEGMSVQKITCTALCPVDGGTKHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	RATTUS NORVEGICUS
通用名 common_name	NORWAY RAT
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10116
宿主生物 host_organism	HOMO SAPIENS

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	LEUCINE-RICH REPEAT TRANSMEMBRANE PROTEIN FLRT2
分子量 formula_weight	38411.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,F

TGACPSVCRCDRNFVYCNERSLTSVPLGIPEGVTVLYLHNNQINNAGFPAELHNVQSVHTVYLYGNQLDEFPMNLPKNVRVLHLQENNIQTISRAALAQLLKLEELHLDDNSISTVGVEDGAFREAISLKLLFLSKNHLSSVPVGLPVDLQELRVDENRIAVISDMAFQNLTSLERLIVDGNLLTNKGIAEGTFSHLTKLKEFSIVRNSLSHPPPDLPGTHLIRLYLQDNQINHIPLTAFANLRKLERLDISNNQLRMLTQGVFDHLSNLKQLTARNNPWFCDCSIKWVTEWLKYIPSSLNVRGFMCQGPEQVRGMAVRELNMNLLSCPTRTKHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	MUS MUSCULUS
通用名 common_name	HOUSE MOUSE
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	HOMO SAPIENS

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	ADHESION G PROTEIN-COUPLED RECEPTOR L3
分子量 formula_weight	43908.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D,G,H

TGPIPMAVVRRELSCESYPIELRCPGTDVIMIESANYGRTDDKICDSDPAQMENIRCYLPDAYKIMSQRCNNRTQCAVVAGPDVFPDPCPGTYKYLEVQYECVPYKVEQKVFLCPGLLKGVYQSEHLFESDHQSGAWCKDPLQASDKIYYMPWTPYRTDTLTEYSSKDDFIAGRPTTTYKLPHRVDGTGFVVYDGALFFNKERTRNIVKFDLRTRIKSGEAIIANANYHDTSPYRWGGKSDIDLAVDENGLWVIYATEQNNGKIVISQLNPYTLRIEGTWDTAYDKRSASNAFMICGILYVVKSVYEDDDNEATGNKIDYIYNTDQSKDSLVDVPFPNSYQYIAAVDYNPRDNLLYVWNNYHVVKYSLDFGPLDGTKHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	MUS MUSCULUS
通用名 common_name	HOUSE MOUSE
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	HOMO SAPIENS

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	8

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	SODIUM ION
分子量 formula_weight	23.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	5fttB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	80 — Alpha-Beta Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribonuclease Inhibitor

结构域编号 domain_id	5fttC01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	740 — Rhamnose-binding lectin domain (RBL)

结构域编号 domain_id	5fttF00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	80 — Alpha-Beta Horseshoe
拓扑 Topology topology	10 — Leucine-rich repeat, LRR (right-handed beta-alpha superhelix)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribonuclease Inhibitor

结构域编号 domain_id	5fttG01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	120 — Jelly Rolls
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	740 — Rhamnose-binding lectin domain (RBL)

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晶胞边长 a length_a	231.961 Å
晶胞边长 b length_b	141.486 Å
晶胞边长 c length_c	151.491 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	117.94 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.400 Å
最低分辨率 resolution_low	133.830 Å
R 因子 r_factor	0.2261
R_work r_work	0.2252
R_free r_free	0.2446

Octameric complex of Latrophilin 3 (Lec, Olf) , Unc5D (Ig, Ig2, TSP1) and FLRT2 (LRR)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NETRIN RECEPTOR UNC5D

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

LEUCINE-RICH REPEAT TRANSMEMBRANE PROTEIN FLRT2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

ADHESION G PROTEIN-COUPLED RECEPTOR L3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5ftt__assembly_1__model_1

5ftt__assembly_1__model_1 | I(q)

5ftt__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

Octameric complex of Latrophilin 3 (Lec, Olf) , Unc5D (Ig, Ig2, TSP1) and FLRT2 (LRR)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

NETRIN RECEPTOR UNC5D

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

LEUCINE-RICH REPEAT TRANSMEMBRANE PROTEIN FLRT2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ADHESION G PROTEIN-COUPLED RECEPTOR L3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5ftt__assembly_1__model_1

5ftt__assembly_1__model_1 | I(q)

5ftt__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)