5iro

Crystal structure of a complex between the Human adenovirus type 4 E3-19K protein and MHC class molecule HLA-A2/TAX

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

HLA class I histocompatibility antigen, A-2 alpha chain

Homo sapiens

UniProt P01892

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 TAX protein × 1 (Q80817) Beta-2-microglobulin × 1 (P61769) E3 19 kDa protein × 1 (Q8BEL5) water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 TAX protein × 1 (Q80817) Beta-2-microglobulin × 1 (P61769) E3 19 kDa protein × 1 (Q8BEL5) water × 2 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 TAX protein × 1 (Q80817) Beta-2-microglobulin × 1 (P61769) E3 19 kDa protein × 1 (Q8BEL5) water × 4 与蛋白数一致
4 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 TAX protein × 1 (Q80817) Beta-2-microglobulin × 1 (P61769) E3 19 kDa protein × 1 (Q8BEL5) water × 3 与蛋白数一致
5 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 TAX protein × 1 (Q80817) Beta-2-microglobulin × 1 (P61769) E3 19 kDa protein × 1 (Q8BEL5) water × 3 与蛋白数一致
6 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 TAX protein × 1 (Q80817) Beta-2-microglobulin × 1 (P61769) E3 19 kDa protein × 1 (Q8BEL5) water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 1A02_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–275; UniProt 25–299 作者链 E; PDB构建体 1–275; UniProt 25–299 作者链 I; PDB构建体 1–275; UniProt 25–299 作者链 M; PDB构建体 1–275; UniProt 25–299 作者链 Q; PDB构建体 1–275; UniProt 25–299 作者链 U; PDB构建体 1–275; UniProt 25–299

TAX protein

物种未注明

UniProt Q80817

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 HLA class I histocompatibility antigen, A-2 alpha chain × 1 (P01892) Beta-2-microglobulin × 1 (P61769) E3 19 kDa protein × 1 (Q8BEL5) water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 HLA class I histocompatibility antigen, A-2 alpha chain × 1 (P01892) Beta-2-microglobulin × 1 (P61769) E3 19 kDa protein × 1 (Q8BEL5) water × 2 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 HLA class I histocompatibility antigen, A-2 alpha chain × 1 (P01892) Beta-2-microglobulin × 1 (P61769) E3 19 kDa protein × 1 (Q8BEL5) water × 4 与蛋白数一致
4 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 HLA class I histocompatibility antigen, A-2 alpha chain × 1 (P01892) Beta-2-microglobulin × 1 (P61769) E3 19 kDa protein × 1 (Q8BEL5) water × 3 与蛋白数一致
5 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 HLA class I histocompatibility antigen, A-2 alpha chain × 1 (P01892) Beta-2-microglobulin × 1 (P61769) E3 19 kDa protein × 1 (Q8BEL5) water × 3 与蛋白数一致
6 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 HLA class I histocompatibility antigen, A-2 alpha chain × 1 (P01892) Beta-2-microglobulin × 1 (P61769) E3 19 kDa protein × 1 (Q8BEL5) water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q80817_9DELA
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–9; UniProt 11–19 作者链 F; PDB构建体 1–9; UniProt 11–19 作者链 J; PDB构建体 1–9; UniProt 11–19 作者链 N; PDB构建体 1–9; UniProt 11–19 作者链 R; PDB构建体 1–9; UniProt 11–19 作者链 V; PDB构建体 1–9; UniProt 11–19

Beta-2-microglobulin

Homo sapiens

UniProt P61769

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 HLA class I histocompatibility antigen, A-2 alpha chain × 1 (P01892) TAX protein × 1 (Q80817) E3 19 kDa protein × 1 (Q8BEL5) water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 HLA class I histocompatibility antigen, A-2 alpha chain × 1 (P01892) TAX protein × 1 (Q80817) E3 19 kDa protein × 1 (Q8BEL5) water × 2 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 HLA class I histocompatibility antigen, A-2 alpha chain × 1 (P01892) TAX protein × 1 (Q80817) E3 19 kDa protein × 1 (Q8BEL5) water × 4 与蛋白数一致
4 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 HLA class I histocompatibility antigen, A-2 alpha chain × 1 (P01892) TAX protein × 1 (Q80817) E3 19 kDa protein × 1 (Q8BEL5) water × 3 与蛋白数一致
5 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 HLA class I histocompatibility antigen, A-2 alpha chain × 1 (P01892) TAX protein × 1 (Q80817) E3 19 kDa protein × 1 (Q8BEL5) water × 3 与蛋白数一致
6 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 HLA class I histocompatibility antigen, A-2 alpha chain × 1 (P01892) TAX protein × 1 (Q80817) E3 19 kDa protein × 1 (Q8BEL5) water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 B2MG_HUMAN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 2–100; UniProt 21–119 作者链 G; PDB构建体 2–100; UniProt 21–119 作者链 K; PDB构建体 2–100; UniProt 21–119 作者链 O; PDB构建体 2–100; UniProt 21–119 作者链 S; PDB构建体 2–100; UniProt 21–119 作者链 W; PDB构建体 2–100; UniProt 21–119

E3 19 kDa protein

Human adenovirus E serotype 4

UniProt Q8BEL5

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 HLA class I histocompatibility antigen, A-2 alpha chain × 1 (P01892) TAX protein × 1 (Q80817) Beta-2-microglobulin × 1 (P61769) water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 HLA class I histocompatibility antigen, A-2 alpha chain × 1 (P01892) TAX protein × 1 (Q80817) Beta-2-microglobulin × 1 (P61769) water × 2 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 HLA class I histocompatibility antigen, A-2 alpha chain × 1 (P01892) TAX protein × 1 (Q80817) Beta-2-microglobulin × 1 (P61769) water × 4 与蛋白数一致
4 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 HLA class I histocompatibility antigen, A-2 alpha chain × 1 (P01892) TAX protein × 1 (Q80817) Beta-2-microglobulin × 1 (P61769) water × 3 与蛋白数一致
5 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 HLA class I histocompatibility antigen, A-2 alpha chain × 1 (P01892) TAX protein × 1 (Q80817) Beta-2-microglobulin × 1 (P61769) water × 3 与蛋白数一致
6 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 HLA class I histocompatibility antigen, A-2 alpha chain × 1 (P01892) TAX protein × 1 (Q80817) Beta-2-microglobulin × 1 (P61769) water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q8BEL5_ADE04
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–108; UniProt 24–131 作者链 H; PDB构建体 1–108; UniProt 24–131 作者链 L; PDB构建体 1–108; UniProt 24–131 作者链 P; PDB构建体 1–108; UniProt 24–131 作者链 T; PDB构建体 1–108; UniProt 24–131 作者链 X; PDB构建体 1–108; UniProt 24–131

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5iro
沉积日期 deposition_date2016-03-14
结构标题 titleCrystal structure of a complex between the Human adenovirus type 4 E3-19K protein and MHC class molecule HLA-A2/TAX
关键词 keywordsAd4 E3-19K-HLA-A2 COMPLEX, IMMUNE EVASION FUNCTION, MHC CLASS I MOLECULE, Immune system-transcription complex; Immune system/transcription
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5iro__assembly_6__model_1

Assembly 6 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5iro__assembly_6__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

5iro__assembly_6__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)25.69 Å
Rg(电子密度)24.69 Å
总 Rg25.60 Å
原子数3735
残基数456
排除体积65610 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 5iro__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 5iro__assembly_2__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 5iro__assembly_3__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
4 1 5iro__assembly_4__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
5 1 5iro__assembly_5__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
6 1 5iro__assembly_6__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 24 domains

CATH v4.4 (24 domains)

结构域编号 domain_id5iroA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology500 — Murine Class I Major Histocompatibility Complex, H2-DB; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — MHC class I-like antigen recognition-like
结构域编号 domain_id5iroA02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5iroC00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5iroD00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily3530 —
结构域编号 domain_id5iroE01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology500 — Murine Class I Major Histocompatibility Complex, H2-DB; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — MHC class I-like antigen recognition-like
结构域编号 domain_id5iroE02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5iroG00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5iroH00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily3530 —
结构域编号 domain_id5iroI01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology500 — Murine Class I Major Histocompatibility Complex, H2-DB; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — MHC class I-like antigen recognition-like
结构域编号 domain_id5iroI02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5iroK00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5iroL00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily3530 —
结构域编号 domain_id5iroM01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology500 — Murine Class I Major Histocompatibility Complex, H2-DB; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — MHC class I-like antigen recognition-like
结构域编号 domain_id5iroM02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5iroO00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5iroP00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily3530 —
结构域编号 domain_id5iroQ01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology500 — Murine Class I Major Histocompatibility Complex, H2-DB; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — MHC class I-like antigen recognition-like
结构域编号 domain_id5iroQ02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5iroS00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5iroT00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily3530 —
结构域编号 domain_id5iroU01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology500 — Murine Class I Major Histocompatibility Complex, H2-DB; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — MHC class I-like antigen recognition-like
结构域编号 domain_id5iroU02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5iroW00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id5iroX00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily3530 —
▶

7. 引用文献 (1)