5l69

Yeast 20S proteasome with mouse beta5i (1-138) and mouse beta6 (97-111; 118-133) in complex with epoxyketone inhibitor 16

Method: X-RAY DIFFRACTION

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Proteasome subunit alpha type-2

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 28	Proteasome subunit alpha type-3 × 2 （P23638） Proteasome subunit alpha type-4 × 2 （P40303） Proteasome subunit alpha type-5 × 2 （P32379） Proteasome subunit alpha type-6 × 2 （P40302） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 2 （P21242） Proteasome subunit alpha type-1 × 2 （P21243） Proteasome subunit beta type-2 × 2 （P25043） Proteasome subunit beta type-3 × 2 （P25451） Proteasome subunit beta type-4 × 2 （P22141） Proteasome subunit beta type-8,Proteasome subunit beta type-5 × 2 （P28063,P30656） ;Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6 ; × 2 （O09061,P23724） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （P30657） Proteasome subunit beta type-1 × 2 （P38624） MAGNESIUM ION × 8 CHLORIDE ION × 3 ;(2~{S})-3-(1~{H}-indol-3-yl)-~{N}-[(2~{S},3~{S},4~{R})-4-methyl-3,5-bis(oxidanyl)-1-phenyl-pentan-2-yl]-2-[[(2~{R})-2-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)propanoyl]amino]propanamide ; × 4 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 water × 28	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSA2_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–250； UniProt 1–250 作者链 O； PDB构建体 1–250； UniProt 1–250

Proteasome subunit alpha type-3

物种未注明

UniProt P23638

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 28	Proteasome subunit alpha type-2 × 2 （P23639） Proteasome subunit alpha type-4 × 2 （P40303） Proteasome subunit alpha type-5 × 2 （P32379） Proteasome subunit alpha type-6 × 2 （P40302） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 2 （P21242） Proteasome subunit alpha type-1 × 2 （P21243） Proteasome subunit beta type-2 × 2 （P25043） Proteasome subunit beta type-3 × 2 （P25451） Proteasome subunit beta type-4 × 2 （P22141） Proteasome subunit beta type-8,Proteasome subunit beta type-5 × 2 （P28063,P30656） ;Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6 ; × 2 （O09061,P23724） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （P30657） Proteasome subunit beta type-1 × 2 （P38624） MAGNESIUM ION × 8 CHLORIDE ION × 3 ;(2~{S})-3-(1~{H}-indol-3-yl)-~{N}-[(2~{S},3~{S},4~{R})-4-methyl-3,5-bis(oxidanyl)-1-phenyl-pentan-2-yl]-2-[[(2~{R})-2-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)propanoyl]amino]propanamide ; × 4 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 water × 28	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSA3_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–258； UniProt 1–258 作者链 P； PDB构建体 1–258； UniProt 1–258

Proteasome subunit alpha type-4

物种未注明

UniProt P40303

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 28	Proteasome subunit alpha type-2 × 2 （P23639） Proteasome subunit alpha type-3 × 2 （P23638） Proteasome subunit alpha type-5 × 2 （P32379） Proteasome subunit alpha type-6 × 2 （P40302） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 2 （P21242） Proteasome subunit alpha type-1 × 2 （P21243） Proteasome subunit beta type-2 × 2 （P25043） Proteasome subunit beta type-3 × 2 （P25451） Proteasome subunit beta type-4 × 2 （P22141） Proteasome subunit beta type-8,Proteasome subunit beta type-5 × 2 （P28063,P30656） ;Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6 ; × 2 （O09061,P23724） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （P30657） Proteasome subunit beta type-1 × 2 （P38624） MAGNESIUM ION × 8 CHLORIDE ION × 3 ;(2~{S})-3-(1~{H}-indol-3-yl)-~{N}-[(2~{S},3~{S},4~{R})-4-methyl-3,5-bis(oxidanyl)-1-phenyl-pentan-2-yl]-2-[[(2~{R})-2-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)propanoyl]amino]propanamide ; × 4 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 water × 28	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSA4_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–254； UniProt 1–254 作者链 Q； PDB构建体 1–254； UniProt 1–254

Proteasome subunit alpha type-5

物种未注明

UniProt P32379

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 28	Proteasome subunit alpha type-2 × 2 （P23639） Proteasome subunit alpha type-3 × 2 （P23638） Proteasome subunit alpha type-4 × 2 （P40303） Proteasome subunit alpha type-6 × 2 （P40302） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 2 （P21242） Proteasome subunit alpha type-1 × 2 （P21243） Proteasome subunit beta type-2 × 2 （P25043） Proteasome subunit beta type-3 × 2 （P25451） Proteasome subunit beta type-4 × 2 （P22141） Proteasome subunit beta type-8,Proteasome subunit beta type-5 × 2 （P28063,P30656） ;Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6 ; × 2 （O09061,P23724） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （P30657） Proteasome subunit beta type-1 × 2 （P38624） MAGNESIUM ION × 8 CHLORIDE ION × 3 ;(2~{S})-3-(1~{H}-indol-3-yl)-~{N}-[(2~{S},3~{S},4~{R})-4-methyl-3,5-bis(oxidanyl)-1-phenyl-pentan-2-yl]-2-[[(2~{R})-2-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)propanoyl]amino]propanamide ; × 4 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 water × 28	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSA5_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–260； UniProt 1–260 作者链 R； PDB构建体 1–260； UniProt 1–260

Proteasome subunit alpha type-6

物种未注明

UniProt P40302

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 28	Proteasome subunit alpha type-2 × 2 （P23639） Proteasome subunit alpha type-3 × 2 （P23638） Proteasome subunit alpha type-4 × 2 （P40303） Proteasome subunit alpha type-5 × 2 （P32379） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 2 （P21242） Proteasome subunit alpha type-1 × 2 （P21243） Proteasome subunit beta type-2 × 2 （P25043） Proteasome subunit beta type-3 × 2 （P25451） Proteasome subunit beta type-4 × 2 （P22141） Proteasome subunit beta type-8,Proteasome subunit beta type-5 × 2 （P28063,P30656） ;Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6 ; × 2 （O09061,P23724） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （P30657） Proteasome subunit beta type-1 × 2 （P38624） MAGNESIUM ION × 8 CHLORIDE ION × 3 ;(2~{S})-3-(1~{H}-indol-3-yl)-~{N}-[(2~{S},3~{S},4~{R})-4-methyl-3,5-bis(oxidanyl)-1-phenyl-pentan-2-yl]-2-[[(2~{R})-2-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)propanoyl]amino]propanamide ; × 4 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 water × 28	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSA6_YEAST
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–234； UniProt 1–234 作者链 S； PDB构建体 1–234； UniProt 1–234

Probable proteasome subunit alpha type-7

物种未注明

UniProt P21242

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 28	Proteasome subunit alpha type-2 × 2 （P23639） Proteasome subunit alpha type-3 × 2 （P23638） Proteasome subunit alpha type-4 × 2 （P40303） Proteasome subunit alpha type-5 × 2 （P32379） Proteasome subunit alpha type-6 × 2 （P40302） Proteasome subunit alpha type-1 × 2 （P21243） Proteasome subunit beta type-2 × 2 （P25043） Proteasome subunit beta type-3 × 2 （P25451） Proteasome subunit beta type-4 × 2 （P22141） Proteasome subunit beta type-8,Proteasome subunit beta type-5 × 2 （P28063,P30656） ;Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6 ; × 2 （O09061,P23724） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （P30657） Proteasome subunit beta type-1 × 2 （P38624） MAGNESIUM ION × 8 CHLORIDE ION × 3 ;(2~{S})-3-(1~{H}-indol-3-yl)-~{N}-[(2~{S},3~{S},4~{R})-4-methyl-3,5-bis(oxidanyl)-1-phenyl-pentan-2-yl]-2-[[(2~{R})-2-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)propanoyl]amino]propanamide ; × 4 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 water × 28	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSA7_YEAST
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–288； UniProt 1–288 作者链 T； PDB构建体 1–288； UniProt 1–288

Proteasome subunit alpha type-1

物种未注明

UniProt P21243

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 28	Proteasome subunit alpha type-2 × 2 （P23639） Proteasome subunit alpha type-3 × 2 （P23638） Proteasome subunit alpha type-4 × 2 （P40303） Proteasome subunit alpha type-5 × 2 （P32379） Proteasome subunit alpha type-6 × 2 （P40302） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 2 （P21242） Proteasome subunit beta type-2 × 2 （P25043） Proteasome subunit beta type-3 × 2 （P25451） Proteasome subunit beta type-4 × 2 （P22141） Proteasome subunit beta type-8,Proteasome subunit beta type-5 × 2 （P28063,P30656） ;Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6 ; × 2 （O09061,P23724） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （P30657） Proteasome subunit beta type-1 × 2 （P38624） MAGNESIUM ION × 8 CHLORIDE ION × 3 ;(2~{S})-3-(1~{H}-indol-3-yl)-~{N}-[(2~{S},3~{S},4~{R})-4-methyl-3,5-bis(oxidanyl)-1-phenyl-pentan-2-yl]-2-[[(2~{R})-2-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)propanoyl]amino]propanamide ; × 4 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 water × 28	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSA1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–252； UniProt 1–252 作者链 U； PDB构建体 1–252； UniProt 1–252

Proteasome subunit beta type-2

物种未注明

UniProt P25043

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 28	Proteasome subunit alpha type-2 × 2 （P23639） Proteasome subunit alpha type-3 × 2 （P23638） Proteasome subunit alpha type-4 × 2 （P40303） Proteasome subunit alpha type-5 × 2 （P32379） Proteasome subunit alpha type-6 × 2 （P40302） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 2 （P21242） Proteasome subunit alpha type-1 × 2 （P21243） Proteasome subunit beta type-3 × 2 （P25451） Proteasome subunit beta type-4 × 2 （P22141） Proteasome subunit beta type-8,Proteasome subunit beta type-5 × 2 （P28063,P30656） ;Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6 ; × 2 （O09061,P23724） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （P30657） Proteasome subunit beta type-1 × 2 （P38624） MAGNESIUM ION × 8 CHLORIDE ION × 3 ;(2~{S})-3-(1~{H}-indol-3-yl)-~{N}-[(2~{S},3~{S},4~{R})-4-methyl-3,5-bis(oxidanyl)-1-phenyl-pentan-2-yl]-2-[[(2~{R})-2-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)propanoyl]amino]propanamide ; × 4 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 water × 28	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSB2_YEAST
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–232； UniProt 30–261 作者链 V； PDB构建体 1–232； UniProt 30–261

Proteasome subunit beta type-3

物种未注明

UniProt P25451

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 28	Proteasome subunit alpha type-2 × 2 （P23639） Proteasome subunit alpha type-3 × 2 （P23638） Proteasome subunit alpha type-4 × 2 （P40303） Proteasome subunit alpha type-5 × 2 （P32379） Proteasome subunit alpha type-6 × 2 （P40302） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 2 （P21242） Proteasome subunit alpha type-1 × 2 （P21243） Proteasome subunit beta type-2 × 2 （P25043） Proteasome subunit beta type-4 × 2 （P22141） Proteasome subunit beta type-8,Proteasome subunit beta type-5 × 2 （P28063,P30656） ;Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6 ; × 2 （O09061,P23724） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （P30657） Proteasome subunit beta type-1 × 2 （P38624） MAGNESIUM ION × 8 CHLORIDE ION × 3 ;(2~{S})-3-(1~{H}-indol-3-yl)-~{N}-[(2~{S},3~{S},4~{R})-4-methyl-3,5-bis(oxidanyl)-1-phenyl-pentan-2-yl]-2-[[(2~{R})-2-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)propanoyl]amino]propanamide ; × 4 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 water × 28	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSB3_YEAST
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–205； UniProt 1–205 作者链 W； PDB构建体 1–205； UniProt 1–205

Proteasome subunit beta type-4

物种未注明

UniProt P22141

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 28	Proteasome subunit alpha type-2 × 2 （P23639） Proteasome subunit alpha type-3 × 2 （P23638） Proteasome subunit alpha type-4 × 2 （P40303） Proteasome subunit alpha type-5 × 2 （P32379） Proteasome subunit alpha type-6 × 2 （P40302） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 2 （P21242） Proteasome subunit alpha type-1 × 2 （P21243） Proteasome subunit beta type-2 × 2 （P25043） Proteasome subunit beta type-3 × 2 （P25451） Proteasome subunit beta type-8,Proteasome subunit beta type-5 × 2 （P28063,P30656） ;Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6 ; × 2 （O09061,P23724） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （P30657） Proteasome subunit beta type-1 × 2 （P38624） MAGNESIUM ION × 8 CHLORIDE ION × 3 ;(2~{S})-3-(1~{H}-indol-3-yl)-~{N}-[(2~{S},3~{S},4~{R})-4-methyl-3,5-bis(oxidanyl)-1-phenyl-pentan-2-yl]-2-[[(2~{R})-2-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)propanoyl]amino]propanamide ; × 4 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 water × 28	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSB4_YEAST
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–198； UniProt 1–198 作者链 X； PDB构建体 1–198； UniProt 1–198

Proteasome subunit beta type-8,Proteasome subunit beta type-5

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P28063

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 28	Proteasome subunit alpha type-2 × 2 （P23639） Proteasome subunit alpha type-3 × 2 （P23638） Proteasome subunit alpha type-4 × 2 （P40303） Proteasome subunit alpha type-5 × 2 （P32379） Proteasome subunit alpha type-6 × 2 （P40302） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 2 （P21242） Proteasome subunit alpha type-1 × 2 （P21243） Proteasome subunit beta type-2 × 2 （P25043） Proteasome subunit beta type-3 × 2 （P25451） Proteasome subunit beta type-4 × 2 （P22141） ;Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6 ; × 2 （O09061,P23724） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （P30657） Proteasome subunit beta type-1 × 2 （P38624） MAGNESIUM ION × 8 CHLORIDE ION × 3 ;(2~{S})-3-(1~{H}-indol-3-yl)-~{N}-[(2~{S},3~{S},4~{R})-4-methyl-3,5-bis(oxidanyl)-1-phenyl-pentan-2-yl]-2-[[(2~{R})-2-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)propanoyl]amino]propanamide ; × 4 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 water × 28	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSB8_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–138； UniProt 73–210 作者链 Y； PDB构建体 1–138； UniProt 73–210

Proteasome subunit beta type-8,Proteasome subunit beta type-5

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P30656

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 28	Proteasome subunit alpha type-2 × 2 （P23639） Proteasome subunit alpha type-3 × 2 （P23638） Proteasome subunit alpha type-4 × 2 （P40303） Proteasome subunit alpha type-5 × 2 （P32379） Proteasome subunit alpha type-6 × 2 （P40302） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 2 （P21242） Proteasome subunit alpha type-1 × 2 （P21243） Proteasome subunit beta type-2 × 2 （P25043） Proteasome subunit beta type-3 × 2 （P25451） Proteasome subunit beta type-4 × 2 （P22141） ;Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6 ; × 2 （O09061,P23724） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （P30657） Proteasome subunit beta type-1 × 2 （P38624） MAGNESIUM ION × 8 CHLORIDE ION × 3 ;(2~{S})-3-(1~{H}-indol-3-yl)-~{N}-[(2~{S},3~{S},4~{R})-4-methyl-3,5-bis(oxidanyl)-1-phenyl-pentan-2-yl]-2-[[(2~{R})-2-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)propanoyl]amino]propanamide ; × 4 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 water × 28	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSB5_YEAST
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 139–211； UniProt 215–287 作者链 Y； PDB构建体 139–211； UniProt 215–287

;Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6 ;

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt O09061

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 28	Proteasome subunit alpha type-2 × 2 （P23639） Proteasome subunit alpha type-3 × 2 （P23638） Proteasome subunit alpha type-4 × 2 （P40303） Proteasome subunit alpha type-5 × 2 （P32379） Proteasome subunit alpha type-6 × 2 （P40302） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 2 （P21242） Proteasome subunit alpha type-1 × 2 （P21243） Proteasome subunit beta type-2 × 2 （P25043） Proteasome subunit beta type-3 × 2 （P25451） Proteasome subunit beta type-4 × 2 （P22141） Proteasome subunit beta type-8,Proteasome subunit beta type-5 × 2 （P28063,P30656） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （P30657） Proteasome subunit beta type-1 × 2 （P38624） MAGNESIUM ION × 8 CHLORIDE ION × 3 ;(2~{S})-3-(1~{H}-indol-3-yl)-~{N}-[(2~{S},3~{S},4~{R})-4-methyl-3,5-bis(oxidanyl)-1-phenyl-pentan-2-yl]-2-[[(2~{R})-2-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)propanoyl]amino]propanamide ; × 4 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 water × 28	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSB1_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 97–111； UniProt 123–137 作者链 L； PDB构建体 118–133； UniProt 144–159 作者链 Z； PDB构建体 97–111； UniProt 123–137 作者链 Z； PDB构建体 118–133； UniProt 144–159

;Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6 ;

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P23724

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 28	Proteasome subunit alpha type-2 × 2 （P23639） Proteasome subunit alpha type-3 × 2 （P23638） Proteasome subunit alpha type-4 × 2 （P40303） Proteasome subunit alpha type-5 × 2 （P32379） Proteasome subunit alpha type-6 × 2 （P40302） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 2 （P21242） Proteasome subunit alpha type-1 × 2 （P21243） Proteasome subunit beta type-2 × 2 （P25043） Proteasome subunit beta type-3 × 2 （P25451） Proteasome subunit beta type-4 × 2 （P22141） Proteasome subunit beta type-8,Proteasome subunit beta type-5 × 2 （P28063,P30656） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （P30657） Proteasome subunit beta type-1 × 2 （P38624） MAGNESIUM ION × 8 CHLORIDE ION × 3 ;(2~{S})-3-(1~{H}-indol-3-yl)-~{N}-[(2~{S},3~{S},4~{R})-4-methyl-3,5-bis(oxidanyl)-1-phenyl-pentan-2-yl]-2-[[(2~{R})-2-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)propanoyl]amino]propanamide ; × 4 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 water × 28	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSB6_YEAST
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–96； UniProt 20–115 作者链 L； PDB构建体 112–117； UniProt 131–136 作者链 L； PDB构建体 134–222； UniProt 153–241 作者链 Z； PDB构建体 1–96； UniProt 20–115 作者链 Z； PDB构建体 112–117； UniProt 131–136 作者链 Z； PDB构建体 134–222； UniProt 153–241

Proteasome subunit beta type-7

物种未注明

UniProt P30657

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 28	Proteasome subunit alpha type-2 × 2 （P23639） Proteasome subunit alpha type-3 × 2 （P23638） Proteasome subunit alpha type-4 × 2 （P40303） Proteasome subunit alpha type-5 × 2 （P32379） Proteasome subunit alpha type-6 × 2 （P40302） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 2 （P21242） Proteasome subunit alpha type-1 × 2 （P21243） Proteasome subunit beta type-2 × 2 （P25043） Proteasome subunit beta type-3 × 2 （P25451） Proteasome subunit beta type-4 × 2 （P22141） Proteasome subunit beta type-8,Proteasome subunit beta type-5 × 2 （P28063,P30656） ;Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6 ; × 2 （O09061,P23724） Proteasome subunit beta type-1 × 2 （P38624） MAGNESIUM ION × 8 CHLORIDE ION × 3 ;(2~{S})-3-(1~{H}-indol-3-yl)-~{N}-[(2~{S},3~{S},4~{R})-4-methyl-3,5-bis(oxidanyl)-1-phenyl-pentan-2-yl]-2-[[(2~{R})-2-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)propanoyl]amino]propanamide ; × 4 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 water × 28	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSB7_YEAST
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–246； UniProt 21–266 作者链 a； PDB构建体 1–246； UniProt 21–266

Proteasome subunit beta type-1

物种未注明

UniProt P38624

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 28	Proteasome subunit alpha type-2 × 2 （P23639） Proteasome subunit alpha type-3 × 2 （P23638） Proteasome subunit alpha type-4 × 2 （P40303） Proteasome subunit alpha type-5 × 2 （P32379） Proteasome subunit alpha type-6 × 2 （P40302） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 2 （P21242） Proteasome subunit alpha type-1 × 2 （P21243） Proteasome subunit beta type-2 × 2 （P25043） Proteasome subunit beta type-3 × 2 （P25451） Proteasome subunit beta type-4 × 2 （P22141） Proteasome subunit beta type-8,Proteasome subunit beta type-5 × 2 （P28063,P30656） ;Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6 ; × 2 （O09061,P23724） Proteasome subunit beta type-7 × 2 （P30657） MAGNESIUM ION × 8 CHLORIDE ION × 3 ;(2~{S})-3-(1~{H}-indol-3-yl)-~{N}-[(2~{S},3~{S},4~{R})-4-methyl-3,5-bis(oxidanyl)-1-phenyl-pentan-2-yl]-2-[[(2~{R})-2-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)propanoyl]amino]propanamide ; × 4 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 water × 28	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PSB1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 1–196； UniProt 20–215 作者链 b； PDB构建体 1–196； UniProt 20–215

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5l69
沉积日期 deposition_date	2016-05-28
结构标题 title	Yeast 20S proteasome with mouse beta5i (1-138) and mouse beta6 (97-111; 118-133) in complex with epoxyketone inhibitor 16
关键词 keywords	HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR complex, Proteasome, Mutant, Inhibitor, Binding Analysis; HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5l69__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5l69__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5l69__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	60.20 Å
Rg（电子密度）	59.75 Å
总 Rg	59.94 Å
原子数	49589
残基数	6342
排除体积	882980 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5l69__assembly_1__model_1`	28-meric （28）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (19)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Proteasome subunit alpha type-2
分子量 formula_weight	27191.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,O
原子数 atom_count	49884

MTDRYSFSLTTFSPSGKLGQIDYALTAVKQGVTSLGIKATNGVVIATEKKSSSPLAMSETLSKVSLLTPDIGAVYSGMGPDYRVLVDKSRKVAHTSYKRIYGEYPPTKLLVSEVAKIMQEATQSGGVRPFGVSLLIAGHDEFNGFSLYQVDPSGSYFPWKATAIGKGSVAAKTFLEKRWNDELELEDAIHIALLTLKESVEGEFNGDTIELAIIGDENPDLLGYTGIPTDKGPRFRKLTSQEINDRLEAL

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Proteasome subunit alpha type-3
分子量 formula_weight	28748.2 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,P

MGSRRYDSRTTIFSPEGRLYQVEYALESISHAGTAIGIMASDGIVLAAERKVTSTLLEQDTSTEKLYKLNDKIAVAVAGLTADAEILINTARIHAQNYLKTYNEDIPVEILVRRLSDIKQGYTQHGGLRPFGVSFIYAGYDDRYGYQLYTSNPSGNYTGWKAISVGANTSAAQTLLQMDYKDDMKVDDAIELALKTLSKTTDSSALTYDRLEFATIRKGANDGEVYQKIFKPQEIKDILVKTGITKKDEDEEADEDMK

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Proteasome subunit alpha type-4
分子量 formula_weight	28478.1 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,Q

MSGYDRALSIFSPDGHIFQVEYALEAVKRGTCAVGVKGKNCVVLGCERRSTLKLQDTRITPSKVSKIDSHVVLSFSGLNADSRILIEKARVEAQSHRLTLEDPVTVEYLTRYVAGVQQRYTQSGGVRPFGVSTLIAGFDPRDDEPKLYQTEPSGIYSSWSAQTIGRNSKTVREFLEKNYDRKEPPATVEECVKLTVRSLLEVVQTGAKNIEITVVKPDSDIVALSSEEINQYVTQIEQEKQEQQEQDKKKKSNH

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Proteasome subunit alpha type-5
分子量 formula_weight	28649.1 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,R

MFLTRSEYDRGVSTFSPEGRLFQVEYSLEAIKLGSTAIGIATKEGVVLGVEKRATSPLLESDSIEKIVEIDRHIGCAMSGLTADARSMIEHARTAAVTHNLYYDEDINVESLTQSVCDLALRFGEGASGEERLMSRPFGVALLIAGHDADDGYQLFHAEPSGTFYRYNAKAIGSGSEGAQAELLNEWHSSLTLKEAELLVLKILKQVMEEKLDENNAQLSCITKQDGFKIYDNEKTAELIKELKEKEAAESPEEADVEMS

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Proteasome subunit alpha type-6
分子量 formula_weight	25634.0 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,S

MFRNNYDGDTVTFSPTGRLFQVEYALEAIKQGSVTVGLRSNTHAVLVALKRNADELSSYQKKIIKCDEHMGLSLAGLAPDARVLSNYLRQQCNYSSLVFNRKLAVERAGHLLCDKAQKNTQSYGGRPYGVGLLIIGYDKSGAHLLEFQPSGNVTELYGTAIGARSQGAKTYLERTLDTFIKIDGNPDELIKAGVEAISQSLRDESLTVDNLSIAIVGKDTPFTIYDGEAVAKYI

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Probable proteasome subunit alpha type-7
分子量 formula_weight	31575.1 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,T

MTSIGTGYDLSNSVFSPDGRNFQVEYAVKAVENGTTSIGIKCNDGVVFAVEKLITSKLLVPQKNVKIQVVDRHIGCVYSGLIPDGRHLVNRGREEAASFKKLYKTPIPIPAFADRLGQYVQAHTLYNSVRPFGVSTIFGGVDKNGAHLYMLEPSGSYWGYKGAATGKGRQSAKAELEKLVDHHPEGLSAREAVKQAAKIIYLAHEDNKEKDFELEISWCSLSETNGLHKFVKGDLLQEAIDFAQKEINGDDDEDEDDSDNVMSSDDENAPVATNANATTDQEGDIHLE

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Proteasome subunit alpha type-1
分子量 formula_weight	28033.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,U

MSGAAAASAAGYDRHITIFSPEGRLYQVEYAFKATNQTNINSLAVRGKDCTVVISQKKVPDKLLDPTTVSYIFCISRTIGMVVNGPIPDARNAALRAKAEAAEFRYKYGYDMPCDVLAKRMANLSQIYTQRAYMRPLGVILTFVSVDEELGPSIYKTDPAGYYVGYKATATGPKQQEITTNLENHFKKSKIDHINEESWEKVVEFAITHMIDALGTEFSKNDLEVGVATKDKFFTLSAENIEERLVAIAEQD

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Proteasome subunit beta type-2
分子量 formula_weight	25114.5 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,V

TTIVGVKFNNGVVIAADTRSTQGPIVADKNCAKLHRISPKIWCAGAGTAADTEAVTQLIGSNIELHSLYTSREPRVVSALQMLKQHLFKYQGHIGAYLIVAGVDPTGSHLFSIHAHGSTDVGYYLSLGSGSLAAMAVLESHWKQDLTKEEAIKLASDAIQAGIWNDLGSGSNVDVCVMEIGKDAEYLRNYLTPNVREEKQKSYKFPRGTTAVLKESIVNICDIQEEQVDITA

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Proteasome subunit beta type-3
分子量 formula_weight	22627.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,W

MSDPSSINGGIVVAMTGKDCVAIACDLRLGSQSLGVSNKFEKIFHYGHVFLGITGLATDVTTLNEMFRYKTNLYKLKEERAIEPETFTQLVSSSLYERRFGPYFVGPVVAGINSKSGKPFIAGFDLIGCIDEAKDFIVSGTASDQLFGMCESLYEPNLEPEDLFETISQALLNAADRDALSGWGAVVYIIKKDEVVKRYLKMRQD

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Proteasome subunit beta type-4
分子量 formula_weight	22545.7 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J,X

MDIILGIRVQDSVILASSKAVTRGISVLKDSDDKTRQLSPHTLMSFAGEAGDTVQFAEYIQANIQLYSIREDYELSPQAVSSFVRQELAKSIRSRRPYQVNVLIGGYDKKKNKPELYQIDYLGTKVELPYGAHGYSGFYTFSLLDHHYRPDMTTEEGLDLLKLCVQELEKRMPMDFKGVIVKIVDKDGIRQVDDFQAQ

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Proteasome subunit beta type-8,Proteasome subunit beta type-5
分子量 formula_weight	23438.5 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1,3.4.25.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K,Y

TTTLAFKFQHGVIVAVDSRATAGSYISSLRMNKVIEINPYLLGTMSGCAADCQYWERLLAKECRLYYLRNGERISVSAASKLLSNMMLQYRGMGLSMGSMICGWDKKGPGLYYVDDNGTRLSGQMFSTGSGNTYAYGVLDSNYKWDLSVEDALYLGKRSILAAAHRDAYSGGSVNLYHVTEDGWIYHGNHDVGELFWKVKEEEGSFNNVIG

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae S288c

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	;Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6,Proteasome subunit beta type-1,Proteasome subunit beta type-6 ;
分子量 formula_weight	24979.0 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1,3.4.25.1,3.4.25.1,3.4.25.1,3.4.25.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,Z

QFNPYGDNGGTILGIAGEDFAVLAGDTRNITDYSINSRYEPKVFDCGDNIVMSANGFAADGDALVKRFKNSVKWYHFDHNDKKLSINSAARNIQHLLYSRRFFPYYVYNIIAGLDEDGKGAVYSFDPVGSYQREQCRAGGAAASLIMPFLDNQVNFKNQYEPGTNGKVKKPLKYLSVEEVIKLVRDSFTSATERHIQVGDGLEILIVTKDGVRKEFYELKRD

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae S288c

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Proteasome subunit beta type-7
分子量 formula_weight	27200.9 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M,a

TQIANAGASPMVNTQQPIVTGTSVISMKYDNGVIIAADNLGSYGSLLRFNGVERLIPVGDNTVVGISGDISDMQHIERLLKDLVTENAYDNPLADAEEALEPSYIFEYLATVMYQRRSKMNPLWNAIIVAGVQSNGDQFLRYVNLLGVTYSSPTLATGFGAHMANPLLRKVVDRESDIPKTTVQVAEEAIVNAMRVLYYRDARSSRNFSLAIIDKNTGLTFKKNLQVENMKWDFAKDIKGYGTQKI

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	Proteasome subunit beta type-1
分子量 formula_weight	21517.2 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N,b

TSIMAVTFKDGVILGADSRTTTGAYIANRVTDKLTRVHDKIWCCRSGSAADTQAIADIVQYHLELYTSQYGTPSTETAASVFKELCYENKDNLTAGIIVAGYDDKNKGEVYTIPLGGSVHKLPYAIAGSGSTFIYGYCDKNFRENMSKEETVDFIKHSLSQAIKWDGSSGGVIRMVVLTAAGVERLIFYPDEYEQL

实体 15 Entity 15 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	8

实体 16 Entity 16 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 17 Entity 17 non-polymer

描述 description	;(2~{S})-3-(1~{H}-indol-3-yl)-~{N}-[(2~{S},3~{S},4~{R})-4-methyl-3,5-bis(oxidanyl)-1-phenyl-pentan-2-yl]-2-[[(2~{R})-2-(2-morpholin-4-ylethanoylamino)propanoyl]amino]propanamide ;
分子量 formula_weight	593.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 18 Entity 18 non-polymer

描述 description	2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID
分子量 formula_weight	195.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 19 Entity 19 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	287

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 56 domains

SCOP 2.08 (28 domains)

结构域编号 domain_id	d5l69a_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d5l69b_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d5l69c1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d5l69c2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d5l69d_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d5l69e_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d5l69f_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d5l69g_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d5l69h_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d5l69i_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d5l69j_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d5l69k_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d5l69l_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d5l69m_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d5l69n_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d5l69o_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d5l69p_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d5l69q1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d5l69q2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d5l69r_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d5l69s_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d5l69t_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d5l69u_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
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类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
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结构域编号 domain_id	d5l69w_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
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类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
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超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

结构域编号 domain_id	d5l69y_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
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类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.153 — Ntn hydrolase-like
超家族 Superfamily superfamily	d.153.1 — N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases)
家族 Family family	d.153.1.4 — Proteasome subunits

CATH v4.4 (28 domains)

结构域编号 domain_id	5l69A00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	5l69B00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	5l69C00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	5l69D00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
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同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	5l69E00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	5l69F00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	5l69G00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	5l69H00
类 Class class	3 — Alpha Beta
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拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	5l69I00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	5l69J00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	5l69K00
类 Class class	3 — Alpha Beta
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拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	5l69L00
类 Class class	3 — Alpha Beta
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同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	5l69M00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
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同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	5l69N00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	5l69O00
类 Class class	3 — Alpha Beta
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拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	5l69P00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
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同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	5l69Q00
类 Class class	3 — Alpha Beta
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结构域编号 domain_id	5l69R00
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结构域编号 domain_id	5l69S00
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拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	5l69U00
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架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	5l69V00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

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类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	5l69X00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	5l69Y00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	5l69Z00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	5l69a00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

结构域编号 domain_id	5l69b00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	60 — 4-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	20 — Glutamine Phosphoribosylpyrophosphate, subunit 1, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Aminohydrolase, N-terminal nucleophile (Ntn) domain

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晶胞边长 a length_a	135.400 Å
晶胞边长 b length_b	298.560 Å
晶胞边长 c length_c	146.170 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	112.41 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.700 Å
最低分辨率 resolution_low	15.000 Å
R 因子 r_factor	0.1933
R_work r_work	0.1921
R_free r_free	0.2174

Yeast 20S proteasome with mouse beta5i (1-138) and mouse beta6 (97-111; 118-133) in complex with epoxyketone inhibitor 16

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Proteasome subunit alpha type-2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome subunit alpha type-3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome subunit alpha type-4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome subunit alpha type-5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome subunit alpha type-6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Probable proteasome subunit alpha type-7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome subunit alpha type-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome subunit beta type-2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome subunit beta type-3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome subunit beta type-4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体