5mdx

Cryo-EM structure of the PSII supercomplex from Arabidopsis thaliana

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem II protein D1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 50	Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P56777） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P56778） Photosystem II D2 protein × 2 （P56761） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P56779） Cytochrome b559 subunit beta (PsbF) × 2 （P62095） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P56780） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P62100） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P56782） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60129） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P62109） Oxygen-evolving enhancer protein 1-1, chloroplastic × 2 （P23321） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P61839） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q39194） Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q9SKI3） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P56790） Chlorophyll a-b binding protein CP29.1, chloroplastic × 2 （Q07473） Chlorophyll a-b binding protein CP26, chloroplastic × 2 （Q9XF89） Chlorophyll a-b binding protein 1, chloroplastic × 12 （P04778） Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q9LMQ2） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 212 PHEOPHYTIN A × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 CHLOROPHYLL B × 96	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBA_ARATH
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–343； UniProt 2–344 作者链 a； PDB构建体 1–343； UniProt 2–344

Photosystem II CP47 reaction center protein

物种未注明

UniProt P56777

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 50	Photosystem II protein D1 × 2 （P83755） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P56778） Photosystem II D2 protein × 2 （P56761） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P56779） Cytochrome b559 subunit beta (PsbF) × 2 （P62095） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P56780） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P62100） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P56782） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60129） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P62109） Oxygen-evolving enhancer protein 1-1, chloroplastic × 2 （P23321） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P61839） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q39194） Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q9SKI3） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P56790） Chlorophyll a-b binding protein CP29.1, chloroplastic × 2 （Q07473） Chlorophyll a-b binding protein CP26, chloroplastic × 2 （Q9XF89） Chlorophyll a-b binding protein 1, chloroplastic × 12 （P04778） Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q9LMQ2） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 212 PHEOPHYTIN A × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 CHLOROPHYLL B × 96	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBB_ARATH
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–507； UniProt 2–508 作者链 b； PDB构建体 1–507； UniProt 2–508

Photosystem II CP43 reaction center protein

物种未注明

UniProt P56778

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 50	Photosystem II protein D1 × 2 （P83755） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P56777） Photosystem II D2 protein × 2 （P56761） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P56779） Cytochrome b559 subunit beta (PsbF) × 2 （P62095） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P56780） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P62100） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P56782） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60129） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P62109） Oxygen-evolving enhancer protein 1-1, chloroplastic × 2 （P23321） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P61839） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q39194） Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q9SKI3） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P56790） Chlorophyll a-b binding protein CP29.1, chloroplastic × 2 （Q07473） Chlorophyll a-b binding protein CP26, chloroplastic × 2 （Q9XF89） Chlorophyll a-b binding protein 1, chloroplastic × 12 （P04778） Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q9LMQ2） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 212 PHEOPHYTIN A × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 CHLOROPHYLL B × 96	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBC_ARATH
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–459； UniProt 15–473 作者链 c； PDB构建体 1–459； UniProt 15–473

Photosystem II D2 protein

物种未注明

UniProt P56761

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 50	Photosystem II protein D1 × 2 （P83755） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P56777） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P56778） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P56779） Cytochrome b559 subunit beta (PsbF) × 2 （P62095） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P56780） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P62100） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P56782） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60129） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P62109） Oxygen-evolving enhancer protein 1-1, chloroplastic × 2 （P23321） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P61839） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q39194） Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q9SKI3） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P56790） Chlorophyll a-b binding protein CP29.1, chloroplastic × 2 （Q07473） Chlorophyll a-b binding protein CP26, chloroplastic × 2 （Q9XF89） Chlorophyll a-b binding protein 1, chloroplastic × 12 （P04778） Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q9LMQ2） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 212 PHEOPHYTIN A × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 CHLOROPHYLL B × 96	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBD_ARATH
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–352； UniProt 2–353 作者链 d； PDB构建体 1–352； UniProt 2–353

Cytochrome b559 subunit alpha

物种未注明

UniProt P56779

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 50	Photosystem II protein D1 × 2 （P83755） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P56777） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P56778） Photosystem II D2 protein × 2 （P56761） Cytochrome b559 subunit beta (PsbF) × 2 （P62095） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P56780） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P62100） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P56782） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60129） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P62109） Oxygen-evolving enhancer protein 1-1, chloroplastic × 2 （P23321） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P61839） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q39194） Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q9SKI3） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P56790） Chlorophyll a-b binding protein CP29.1, chloroplastic × 2 （Q07473） Chlorophyll a-b binding protein CP26, chloroplastic × 2 （Q9XF89） Chlorophyll a-b binding protein 1, chloroplastic × 12 （P04778） Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q9LMQ2） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 212 PHEOPHYTIN A × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 CHLOROPHYLL B × 96	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBE_ARATH
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–83； UniProt 1–83 作者链 e； PDB构建体 1–83； UniProt 1–83

Cytochrome b559 subunit beta (PsbF)

物种未注明

UniProt P62095

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 50	Photosystem II protein D1 × 2 （P83755） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P56777） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P56778） Photosystem II D2 protein × 2 （P56761） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P56779） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P56780） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P62100） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P56782） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60129） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P62109） Oxygen-evolving enhancer protein 1-1, chloroplastic × 2 （P23321） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P61839） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q39194） Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q9SKI3） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P56790） Chlorophyll a-b binding protein CP29.1, chloroplastic × 2 （Q07473） Chlorophyll a-b binding protein CP26, chloroplastic × 2 （Q9XF89） Chlorophyll a-b binding protein 1, chloroplastic × 12 （P04778） Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q9LMQ2） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 212 PHEOPHYTIN A × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 CHLOROPHYLL B × 96	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBF_ARATH
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–39； UniProt 1–39 作者链 f； PDB构建体 1–39； UniProt 1–39

Photosystem II reaction center protein H

物种未注明

UniProt P56780

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 50	Photosystem II protein D1 × 2 （P83755） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P56777） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P56778） Photosystem II D2 protein × 2 （P56761） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P56779） Cytochrome b559 subunit beta (PsbF) × 2 （P62095） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P62100） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P56782） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60129） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P62109） Oxygen-evolving enhancer protein 1-1, chloroplastic × 2 （P23321） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P61839） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q39194） Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q9SKI3） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P56790） Chlorophyll a-b binding protein CP29.1, chloroplastic × 2 （Q07473） Chlorophyll a-b binding protein CP26, chloroplastic × 2 （Q9XF89） Chlorophyll a-b binding protein 1, chloroplastic × 12 （P04778） Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q9LMQ2） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 212 PHEOPHYTIN A × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 CHLOROPHYLL B × 96	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBH_ARATH
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–72； UniProt 2–73 作者链 h； PDB构建体 1–72； UniProt 2–73

Photosystem II reaction center protein I

物种未注明

UniProt P62100

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 50	Photosystem II protein D1 × 2 （P83755） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P56777） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P56778） Photosystem II D2 protein × 2 （P56761） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P56779） Cytochrome b559 subunit beta (PsbF) × 2 （P62095） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P56780） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P56782） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60129） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P62109） Oxygen-evolving enhancer protein 1-1, chloroplastic × 2 （P23321） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P61839） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q39194） Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q9SKI3） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P56790） Chlorophyll a-b binding protein CP29.1, chloroplastic × 2 （Q07473） Chlorophyll a-b binding protein CP26, chloroplastic × 2 （Q9XF89） Chlorophyll a-b binding protein 1, chloroplastic × 12 （P04778） Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q9LMQ2） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 212 PHEOPHYTIN A × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 CHLOROPHYLL B × 96	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBI_ARATH
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–36； UniProt 1–36 作者链 i； PDB构建体 1–36； UniProt 1–36

Photosystem II reaction center protein K

物种未注明

UniProt P56782

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 50	Photosystem II protein D1 × 2 （P83755） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P56777） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P56778） Photosystem II D2 protein × 2 （P56761） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P56779） Cytochrome b559 subunit beta (PsbF) × 2 （P62095） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P56780） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P62100） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60129） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P62109） Oxygen-evolving enhancer protein 1-1, chloroplastic × 2 （P23321） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P61839） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q39194） Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q9SKI3） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P56790） Chlorophyll a-b binding protein CP29.1, chloroplastic × 2 （Q07473） Chlorophyll a-b binding protein CP26, chloroplastic × 2 （Q9XF89） Chlorophyll a-b binding protein 1, chloroplastic × 12 （P04778） Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q9LMQ2） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 212 PHEOPHYTIN A × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 CHLOROPHYLL B × 96	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBK_ARATH
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–37； UniProt 25–61 作者链 k； PDB构建体 1–37； UniProt 25–61

Photosystem II reaction center protein L

物种未注明

UniProt P60129

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 50	Photosystem II protein D1 × 2 （P83755） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P56777） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P56778） Photosystem II D2 protein × 2 （P56761） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P56779） Cytochrome b559 subunit beta (PsbF) × 2 （P62095） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P56780） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P62100） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P56782） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P62109） Oxygen-evolving enhancer protein 1-1, chloroplastic × 2 （P23321） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P61839） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q39194） Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q9SKI3） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P56790） Chlorophyll a-b binding protein CP29.1, chloroplastic × 2 （Q07473） Chlorophyll a-b binding protein CP26, chloroplastic × 2 （Q9XF89） Chlorophyll a-b binding protein 1, chloroplastic × 12 （P04778） Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q9LMQ2） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 212 PHEOPHYTIN A × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 CHLOROPHYLL B × 96	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBL_ARATH
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38 作者链 l； PDB构建体 1–38； UniProt 1–38

Photosystem II reaction center protein M

物种未注明

UniProt P62109

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 50	Photosystem II protein D1 × 2 （P83755） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P56777） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P56778） Photosystem II D2 protein × 2 （P56761） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P56779） Cytochrome b559 subunit beta (PsbF) × 2 （P62095） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P56780） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P62100） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P56782） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60129） Oxygen-evolving enhancer protein 1-1, chloroplastic × 2 （P23321） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P61839） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q39194） Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q9SKI3） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P56790） Chlorophyll a-b binding protein CP29.1, chloroplastic × 2 （Q07473） Chlorophyll a-b binding protein CP26, chloroplastic × 2 （Q9XF89） Chlorophyll a-b binding protein 1, chloroplastic × 12 （P04778） Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q9LMQ2） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 212 PHEOPHYTIN A × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 CHLOROPHYLL B × 96	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBM_ARATH
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–34； UniProt 1–34 作者链 m； PDB构建体 1–34； UniProt 1–34

Oxygen-evolving enhancer protein 1-1, chloroplastic

物种未注明

UniProt P23321

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 50	Photosystem II protein D1 × 2 （P83755） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P56777） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P56778） Photosystem II D2 protein × 2 （P56761） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P56779） Cytochrome b559 subunit beta (PsbF) × 2 （P62095） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P56780） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P62100） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P56782） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60129） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P62109） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P61839） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q39194） Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q9SKI3） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P56790） Chlorophyll a-b binding protein CP29.1, chloroplastic × 2 （Q07473） Chlorophyll a-b binding protein CP26, chloroplastic × 2 （Q9XF89） Chlorophyll a-b binding protein 1, chloroplastic × 12 （P04778） Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q9LMQ2） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 212 PHEOPHYTIN A × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 CHLOROPHYLL B × 96	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBO1_ARATH
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–247； UniProt 86–332 作者链 o； PDB构建体 1–247； UniProt 86–332

Photosystem II reaction center protein T

物种未注明

UniProt P61839

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 50	Photosystem II protein D1 × 2 （P83755） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P56777） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P56778） Photosystem II D2 protein × 2 （P56761） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P56779） Cytochrome b559 subunit beta (PsbF) × 2 （P62095） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P56780） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P62100） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P56782） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60129） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P62109） Oxygen-evolving enhancer protein 1-1, chloroplastic × 2 （P23321） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q39194） Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q9SKI3） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P56790） Chlorophyll a-b binding protein CP29.1, chloroplastic × 2 （Q07473） Chlorophyll a-b binding protein CP26, chloroplastic × 2 （Q9XF89） Chlorophyll a-b binding protein 1, chloroplastic × 12 （P04778） Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q9LMQ2） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 212 PHEOPHYTIN A × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 CHLOROPHYLL B × 96	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBT_ARATH
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 T； PDB构建体 1–33； UniProt 1–33 作者链 t； PDB构建体 1–33； UniProt 1–33

Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic

物种未注明

UniProt Q39194

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 50	Photosystem II protein D1 × 2 （P83755） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P56777） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P56778） Photosystem II D2 protein × 2 （P56761） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P56779） Cytochrome b559 subunit beta (PsbF) × 2 （P62095） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P56780） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P62100） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P56782） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60129） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P62109） Oxygen-evolving enhancer protein 1-1, chloroplastic × 2 （P23321） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P61839） Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q9SKI3） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P56790） Chlorophyll a-b binding protein CP29.1, chloroplastic × 2 （Q07473） Chlorophyll a-b binding protein CP26, chloroplastic × 2 （Q9XF89） Chlorophyll a-b binding protein 1, chloroplastic × 12 （P04778） Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q9LMQ2） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 212 PHEOPHYTIN A × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 CHLOROPHYLL B × 96	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBW_ARATH
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 W； PDB构建体 1–54； UniProt 80–133 作者链 w； PDB构建体 1–54； UniProt 80–133

Photosystem II reaction center protein X

物种未注明

UniProt Q9SKI3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 50	Photosystem II protein D1 × 2 （P83755） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P56777） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P56778） Photosystem II D2 protein × 2 （P56761） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P56779） Cytochrome b559 subunit beta (PsbF) × 2 （P62095） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P56780） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P62100） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P56782） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60129） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P62109） Oxygen-evolving enhancer protein 1-1, chloroplastic × 2 （P23321） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P61839） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q39194） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P56790） Chlorophyll a-b binding protein CP29.1, chloroplastic × 2 （Q07473） Chlorophyll a-b binding protein CP26, chloroplastic × 2 （Q9XF89） Chlorophyll a-b binding protein 1, chloroplastic × 12 （P04778） Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q9LMQ2） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 212 PHEOPHYTIN A × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 CHLOROPHYLL B × 96	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Q9SKI3_ARATH
Isoform	—
PDB实体	15
链与序列区间	作者链 X； PDB构建体 1–116； UniProt 1–116 作者链 x； PDB构建体 1–116； UniProt 1–116

Photosystem II reaction center protein Z

物种未注明

UniProt P56790

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 50	Photosystem II protein D1 × 2 （P83755） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P56777） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P56778） Photosystem II D2 protein × 2 （P56761） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P56779） Cytochrome b559 subunit beta (PsbF) × 2 （P62095） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P56780） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P62100） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P56782） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60129） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P62109） Oxygen-evolving enhancer protein 1-1, chloroplastic × 2 （P23321） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P61839） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q39194） Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q9SKI3） Chlorophyll a-b binding protein CP29.1, chloroplastic × 2 （Q07473） Chlorophyll a-b binding protein CP26, chloroplastic × 2 （Q9XF89） Chlorophyll a-b binding protein 1, chloroplastic × 12 （P04778） Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q9LMQ2） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 212 PHEOPHYTIN A × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 CHLOROPHYLL B × 96	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSBZ_ARATH
Isoform	—
PDB实体	16
链与序列区间	作者链 Z； PDB构建体 1–62； UniProt 1–62 作者链 z； PDB构建体 1–62； UniProt 1–62

Chlorophyll a-b binding protein CP29.1, chloroplastic

物种未注明

UniProt Q07473

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 50	Photosystem II protein D1 × 2 （P83755） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P56777） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P56778） Photosystem II D2 protein × 2 （P56761） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P56779） Cytochrome b559 subunit beta (PsbF) × 2 （P62095） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P56780） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P62100） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P56782） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60129） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P62109） Oxygen-evolving enhancer protein 1-1, chloroplastic × 2 （P23321） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P61839） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q39194） Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q9SKI3） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P56790） Chlorophyll a-b binding protein CP26, chloroplastic × 2 （Q9XF89） Chlorophyll a-b binding protein 1, chloroplastic × 12 （P04778） Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q9LMQ2） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 212 PHEOPHYTIN A × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 CHLOROPHYLL B × 96	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	CB4A_ARATH
Isoform	—
PDB实体	17
链与序列区间	作者链 R； PDB构建体 1–250； UniProt 41–290 作者链 r； PDB构建体 1–250； UniProt 41–290

Chlorophyll a-b binding protein CP26, chloroplastic

物种未注明

UniProt Q9XF89

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 50	Photosystem II protein D1 × 2 （P83755） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P56777） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P56778） Photosystem II D2 protein × 2 （P56761） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P56779） Cytochrome b559 subunit beta (PsbF) × 2 （P62095） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P56780） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P62100） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P56782） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60129） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P62109） Oxygen-evolving enhancer protein 1-1, chloroplastic × 2 （P23321） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P61839） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q39194） Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q9SKI3） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P56790） Chlorophyll a-b binding protein CP29.1, chloroplastic × 2 （Q07473） Chlorophyll a-b binding protein 1, chloroplastic × 12 （P04778） Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q9LMQ2） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 212 PHEOPHYTIN A × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 CHLOROPHYLL B × 96	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	CB5_ARATH
Isoform	—
PDB实体	18
链与序列区间	作者链 S； PDB构建体 1–232； UniProt 49–280 作者链 s； PDB构建体 1–232； UniProt 49–280

Chlorophyll a-b binding protein 1, chloroplastic

物种未注明

UniProt P04778

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 50	Photosystem II protein D1 × 2 （P83755） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P56777） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P56778） Photosystem II D2 protein × 2 （P56761） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P56779） Cytochrome b559 subunit beta (PsbF) × 2 （P62095） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P56780） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P62100） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P56782） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60129） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P62109） Oxygen-evolving enhancer protein 1-1, chloroplastic × 2 （P23321） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P61839） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q39194） Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q9SKI3） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P56790） Chlorophyll a-b binding protein CP29.1, chloroplastic × 2 （Q07473） Chlorophyll a-b binding protein CP26, chloroplastic × 2 （Q9XF89） Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic × 2 （Q9LMQ2） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 212 PHEOPHYTIN A × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 CHLOROPHYLL B × 96	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	CB1C_ARATH
Isoform	—
PDB实体	19
链与序列区间	作者链 1； PDB构建体 1–224； UniProt 44–267 作者链 2； PDB构建体 1–224； UniProt 44–267 作者链 3； PDB构建体 1–224； UniProt 44–267 作者链 5； PDB构建体 1–224； UniProt 44–267 作者链 6； PDB构建体 1–224； UniProt 44–267 作者链 7； PDB构建体 1–224； UniProt 44–267 作者链 G； PDB构建体 1–224； UniProt 44–267 作者链 N； PDB构建体 1–224； UniProt 44–267 作者链 Y； PDB构建体 1–224； UniProt 44–267 作者链 g； PDB构建体 1–224； UniProt 44–267 作者链 n； PDB构建体 1–224； UniProt 44–267 作者链 y； PDB构建体 1–224； UniProt 44–267

Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic

物种未注明

UniProt Q9LMQ2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 50	Photosystem II protein D1 × 2 （P83755） Photosystem II CP47 reaction center protein × 2 （P56777） Photosystem II CP43 reaction center protein × 2 （P56778） Photosystem II D2 protein × 2 （P56761） Cytochrome b559 subunit alpha × 2 （P56779） Cytochrome b559 subunit beta (PsbF) × 2 （P62095） Photosystem II reaction center protein H × 2 （P56780） Photosystem II reaction center protein I × 2 （P62100） Photosystem II reaction center protein K × 2 （P56782） Photosystem II reaction center protein L × 2 （P60129） Photosystem II reaction center protein M × 2 （P62109） Oxygen-evolving enhancer protein 1-1, chloroplastic × 2 （P23321） Photosystem II reaction center protein T × 2 （P61839） Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic × 2 （Q39194） Photosystem II reaction center protein X × 2 （Q9SKI3） Photosystem II reaction center protein Z × 2 （P56790） Chlorophyll a-b binding protein CP29.1, chloroplastic × 2 （Q07473） Chlorophyll a-b binding protein CP26, chloroplastic × 2 （Q9XF89） Chlorophyll a-b binding protein 1, chloroplastic × 12 （P04778） FE (II) ION × 2 CHLOROPHYLL A × 212 PHEOPHYTIN A × 4 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 CHLOROPHYLL B × 96	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Q9LMQ2_ARATH
Isoform	—
PDB实体	20
链与序列区间	作者链 4； PDB构建体 1–210； UniProt 48–257 作者链 8； PDB构建体 1–210； UniProt 48–257

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5mdx
沉积日期 deposition_date	2016-11-13
结构标题 title	Cryo-EM structure of the PSII supercomplex from Arabidopsis thaliana
关键词 keywords	photosynthesis, photosystem II supercomplex, single particle analysis; PHOTOSYNTHESIS
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5mdx__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5mdx__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5mdx__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	87.67 Å
Rg（电子密度）	88.35 Å
总 Rg	87.80 Å
原子数	78322
残基数	8270
排除体积	1407100 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5mdx__assembly_1__model_1`	50-meric （50）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (25)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Photosystem II protein D1
分子量 formula_weight	38003.2 kDa
EC 编号 ec_number	1.10.3.9
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,a
原子数 atom_count	78324

TAILERRESESLWGRFCNWITSTENRLYIGWFGVLMIPTLLTATSVFIIAFIAAPPVDIDGIREPVSGSLLYGNNIISGAIIPTSAAIGLHFYPIWEAASVDEWLYNGGPYELIVLHFLLGVACYMGREWELSFRLGMRPWIAVAYSAPVAAATAVFLIYPIGQGSFSDGMPLGISGTFNFMIVFQAEHNILMHPFHMLGVAGVFGGSLFSAMHGSLVTSSLIRETTENESANEGYRFGQEEETYNIVAAHGYFGRLIFQYASFNNSRSLHFFLAAWPVVGIWFTALGISTMAFNLNGFNFNQSVVDSQGRVINTWADIINRANLGMEVMHERNAHNFPLDLA

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Photosystem II CP47 reaction center protein
分子量 formula_weight	55960.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,b

GLPWYRVHTVVLNDPGRLLAVHIMHTALVAGWAGSMALYELAVFDPSDPVLDPMWRQGMFVIPFMTRLGITNSWGGWNITGGTITNPGLWSYEGVAGAHIVFSGLCFLAAIWHWVYWDLEIFCDERTGKPSLDLPKIFGIHLFLSGVACFGFGAFHVTGLYGPGIWVSDPYGLTGKVQPVNPAWGVEGFDPFVPGGIASHHIAAGTLGILAGLFHLSVRPPQRLYKGLRMGNIETVLSSSIAAVFFAAFVVAGTMWYGSATTPIELFGPTRYQWDQGYFQQEIYRRVSAGLAENQSLSEAWAKIPEKLAFYDYIGNNPAKGGLFRAGSMDNGDGIAVGWLGHPVFRNKEGRELFVRRMPTFFETFPVVLVDGDGIVRADVPFRRAESKYSVEQVGVTVEFYGGELNGVSYSDPATVKKYARRAQLGEIFELDRATLKSDGVFRSSPRGWFTFGHASFALLFFFGHIWHGARTLFRDVFAGIDPDLDAQVEFGAFQKLGDPTTKRQAV

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Photosystem II CP43 reaction center protein
分子量 formula_weight	50086.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,c

TLFNGTLALAGRDQETTGFAWWAGNARLINLSGKLLGAHVAHAGLIVFWAGAMNLFEVAHFVPEKPMYEQGLILLPHLATLGWGVGPGGEVIDTFPYFVSGVLHLISSAVLGFGGIYHALLGPETLEESFPFFGYVWKDRNKMTTILGIHLILLGVGAFLLVFKALYFGGVYDTWAPGGGDVRKITNLTLSPSVIFGYLLKSPFGGEGWIVSVDDLEDIIGGHVWLGSICIFGGIWHILTKPFAWARRALVWSGEAYLSYSLAALSVCGFIACCFVWFNNTAYPSEFYGPTGPEASQAQAFTFLVRDQRLGANVGSAQGPTGLGKYLMRSPTGEVIFGGETMRFWDLRAPWLEPLRGPNGLDLSRLKKDIQPWQERRSAEYMTHAPLGSLNSVGGVATEINAVNYVSPRSWLSTSHFVLGFFLFVGHLWHAGRARAAAAGFEKGIDRDFEPVLSMTPLN

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Photosystem II D2 protein
分子量 formula_weight	39444.1 kDa
EC 编号 ec_number	1.10.3.9
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,d

TIALGKFTKDEKDLFDIMDDWLRRDRFVFVGWSGLLLFPCAYFALGGWFTGTTFVTSWYTHGLASSYLEGCNFLTAAVSTPANSLAHSLLLLWGPEAQGDFTRWCQLGGLWAFVALHGAFALIGFMLRQFELARSVQLRPYNAIAFSGPIAVFVSVFLIYPLGQSGWFFAPSFGVAAIFRFILFFQGFHNWTLNPFHMMGVAGVLGAALLCAIHGATVENTLFEDGDGANTFRAFNPTQAEETYSMVTANRFWSQIFGVAFSNKRWLHFFMLFVPVTGLWMSALGVVGLALNLRAYDFVSQEIRAAEDPEFETFYTKNILLNEGIRAWMAAQDQPHENLIFPEEVLPRGNAL

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Cytochrome b559 subunit alpha
分子量 formula_weight	9393.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,e

MSGSTGERSFADIITSIRYWVIHSITIPSLFIAGWLFVSTGLAYDVFGSPRPNEYFTESRQGIPLITGRFDSLEQLDEFSRSF

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Cytochrome b559 subunit beta (PsbF)
分子量 formula_weight	4428.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,f

MTIDRTYPIFTVRWLAVHGLAVPTVSFLGSISAMQFIQR

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein H
分子量 formula_weight	7575.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,h

ATQTVEDSSRSGPRSTTVGKLLKPLNSEYGKVAPGWGTTPLMGVAMALFAVFLSIILEIYNSSVLLDGISVN

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein I
分子量 formula_weight	4170.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,i

MLTLKLFVYTVVIFFVSLFIFGFLSNDPGRNPGREE

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein K
分子量 formula_weight	4239.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K,k

KLPEAYAFLNPIVDVMPVIPLFFLLLAFVWQAAVSFR

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein L
分子量 formula_weight	4471.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,l

MTQSNPNEQSVELNRTSLYWGLLLIFVLAVLFSNYFFN

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein M
分子量 formula_weight	3783.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M,m

MEVNILAFIATALFILVPTAFLLIIYVKTVSQND

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Oxygen-evolving enhancer protein 1-1, chloroplastic
分子量 formula_weight	26594.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O,o

EGAPKRLTYDEIQSKTYMEVKGTGTANQCPTIDGGSETFSFKPGKYAGKKFCFEPTSFTVKADSVSKNAPPEFQNTKLMTRLTYTLDEIEGPFEVASDGSVNFKEEDGIDYAAVTVQLPGGERVPFLFTVKQLDASGKPDSFTGKFLVPSYRGSSFLDPKGRGGSTGYDNAVALPAGGRGDEEELVKENVKNTAASVGEITLKVTKSKPETGEVIGVFESLQPSDTDLGAKVPKDVKIQGVWYGQLE

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein T
分子量 formula_weight	3825.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	T,t

MEALVYTFLLVSTLGIIFFAIFFREPPKISTKK

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic
分子量 formula_weight	6036.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	W,w

LVDERMSTEGTGLPFGLSNNLLGWILFGVFGLIWTFFFVYTSSLEEDEESGLSL

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein X
分子量 formula_weight	11826.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X,x

MASTSAMSLVTPLNQTRSSPFLKPLPLKPSKALVATGGRAQRLQVKALKMDKALTGISAAALTASMVIPEIAEAAGSGISPSLKNFLLSIASGGLVLTVIIGVVVGVSNFDPVKRT

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	Photosystem II reaction center protein Z
分子量 formula_weight	6569.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Z,z

MTIAFQLAVFALIITSSILLISVPVVFASPDGWSSNKNVVFSGTSLWIGLVFLVGILNSLIS

实体 17 Entity 17 polymer

描述 description	Chlorophyll a-b binding protein CP29.1, chloroplastic
分子量 formula_weight	27302.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R,r

AAPKKSAKKTVTTDRPLWYPGAISPDWLDGSLVGDYGFDPFGLGKPAEYLQFDIDSLDQNLAKNLAGDVIGTRTEAADAKSTPFQPYSEVFGIQRFRECELIHGRWAMLATLGALSVEWLTGVTWQDAGKVELVDGSSYLGQPLPFSISTLIWIEVLVIGYIEFQRNAELDSEKRLYPGGKFFDPLGLAADPEKTAQLQLAEIKHARLAMVAFLGFAVQAAATGKGPLNNWATHLSDPLHTTIIDTFSSS

实体 18 Entity 18 polymer

描述 description	Chlorophyll a-b binding protein CP26, chloroplastic
分子量 formula_weight	25232.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S,s

SKAVSETSDELAKWYGPDRRIFLPDGLLDRSEIPEYLNGEVAGDYGYDPFGLGKKPENFAKYQAFELIHARWAMLGAAGFIIPEALNKYGANCGPEAVWFKTGALLLDGNTLNYFGKNIPINLVLAVVAEVVLLGGAEYYRITNGLDFEDKLHPGGPFDPLGLAKDPEQGALLKVKEIKNGRLAMFAMLGFFIQAYVTGEGPVENLAKHLSDPFGNNLLTVIAGTAERAPTL

实体 19 Entity 19 polymer

描述 description	Chlorophyll a-b binding protein 1, chloroplastic
分子量 formula_weight	23971.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,N,Y,g,n,y,1,2,3,5,6,7

GPSGSPWYGSDRVKYLGPFSGESPSYLTGEFPGDYGWDTAGLSADPETFARNRELEVIHSRWAMLGALGCVFPELLARNGVKFGEAVWFKAGSQIFSDGGLDYLGNPSLVHAQSILAIWATQVILMGAVEGYRVAGNGPLGEAEDLLYPGGSFDPLGLATDPEAFAELKVKELKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPIENLADHLADPVNNNAWAFATNFVPGK

实体 20 Entity 20 polymer

描述 description	Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic
分子量 formula_weight	23014.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	4,8

AAAAQPKKSWIPAVKGGGNFLDPEWLDGSLPGDFGFDPLGLGKDPAFLKWYREAELIHGRWAMAAVLGIFVGQAWSGVAWFEAGAQPDAIAPFSFGSLLGTQLLLMGWVESKRWVDFFNPDSQSVEWATPWSKTAENFANYTGDQGYPGGRFFDPLGLAGKNRDGVYEPDFEKLERLKLAEIKHSRLAMVAMLIFYFEAGQGKTPLGALG

实体 21 Entity 21 non-polymer

描述 description	FE (II) ION
分子量 formula_weight	55.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 22 Entity 22 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL A
分子量 formula_weight	893.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	212

实体 23 Entity 23 non-polymer

描述 description	PHEOPHYTIN A
分子量 formula_weight	871.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 24 Entity 24 non-polymer

描述 description	PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
分子量 formula_weight	616.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 25 Entity 25 non-polymer

描述 description	CHLOROPHYLL B
分子量 formula_weight	907.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	96

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	5.30 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	23434

Cryo-EM structure of the PSII supercomplex from Arabidopsis thaliana

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem II protein D1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II CP47 reaction center protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II CP43 reaction center protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II D2 protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome b559 subunit alpha

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome b559 subunit beta (PsbF)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II reaction center protein H

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II reaction center protein I

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II reaction center protein K

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Photosystem II reaction center protein L

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体