5n6i

Crystal structure of mouse cGAS in complex with 39 bp DNA

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 188.7 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cyclic GMP-AMP synthase

Mus musculus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白–DNA 同源多聚体蛋白 × 6 DNA 8 PDB 声明：tetradecameric（14）与全部聚合物数一致	链 A； UniProt 139–507 链 B； UniProt 139–507 链 C； UniProt 139–507 链 D； UniProt 139–507 链 E； UniProt 139–507 链 F； UniProt 139–507	未记录	DNA (37-MER) × 4 DNA (36-MER) × 4 ZN ZINC ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293.15 K；0.1M Tris pH 8, 0.2M ammonium citrate pH 7, 27,5% w/v PEG3350	分辨率 3.60 Å R-free 0.256

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5N6I	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4K8V Structure of cyclic GMP-AMP Synthase (cGAS) 提交 2013-04-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 147–507（361 aa）片段：C-TERMINAL DOMAIN, UNP residues 147-507	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；0.1 M HEPES, 0.1 M MgAc2, 20% PEG3350, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.00 Å R-free 0.208
4K8V Structure of cyclic GMP-AMP Synthase (cGAS) 提交 2013-04-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 147–507（361 aa）片段：C-TERMINAL DOMAIN, UNP residues 147-507	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；0.1 M HEPES, 0.1 M MgAc2, 20% PEG3350, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.00 Å R-free 0.208
4K8V Structure of cyclic GMP-AMP Synthase (cGAS) 提交 2013-04-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 147–507（361 aa）片段：C-TERMINAL DOMAIN, UNP residues 147-507	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；0.1 M HEPES, 0.1 M MgAc2, 20% PEG3350, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.00 Å R-free 0.208
4K8V Structure of cyclic GMP-AMP Synthase (cGAS) 提交 2013-04-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 147–507（361 aa）片段：C-TERMINAL DOMAIN, UNP residues 147-507	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；0.1 M HEPES, 0.1 M MgAc2, 20% PEG3350, pH 7.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.00 Å R-free 0.208
4K96 Structure of Binary Complex of cGAS with Bound dsDNA 提交 2013-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 147–507（361 aa）片段：C-TERMINAL DOMAIN, UNP residues 147-507	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；293 K；0.1 M MES, 8% MPD, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.08 Å R-free 0.226
4K96 Structure of Binary Complex of cGAS with Bound dsDNA 提交 2013-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 B 147–507（361 aa）片段：C-TERMINAL DOMAIN, UNP residues 147-507	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.6；293 K；0.1 M MES, 8% MPD, pH 6.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.08 Å R-free 0.226
4K97 Structure of Ternary Complex of cGAS with dsDNA and Bound ATP 提交 2013-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 147–507（361 aa）片段：C-TERMINAL DOMAIN, UNP residues 147-507	未记录	ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.7；293 K；0.1 M HEPES, 0.2 M CaAc2, 20% PEG300, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.41 Å R-free 0.236
4K98 Structure of Ternary Complex of cGAS with dsDNA and Bound 5 -pppG(2 ,5 )pG 提交 2013-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 147–507（361 aa）片段：C-TERMINAL DOMAIN, UNP residues 147-507	未记录	ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；0.1 M NaAc, 10% MPD, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.94 Å R-free 0.199
4K99 Structure of Ternary Complex of cGAS with dsDNA and Bound 5 -pppdG(2 ,5 )pdG 提交 2013-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 147–507（361 aa）片段：C-TERMINAL DOMAIN, UNP residues 147-507	未记录	ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 GH3 3'-DEOXY-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GDO 3'-deoxy-guanosine 5'-monophosphate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.2；293 K；0.1 M NaAc, 12% MPD, pH 5.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 1.95 Å R-free 0.212
4K9A Structure of Ternary Complex of cGAS with dsDNA and Bound 5 -pG(2 ,5 )pA 提交 2013-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 147–507（361 aa）片段：C-TERMINAL DOMAIN, UNP residues 147-507	未记录	ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；0.1 M MES, 40% MPD, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.26 Å R-free 0.210
4K9B Structure of Ternary Complex of cGAS with dsDNA and Bound c[G(2 ,5 )pA(3 ,5 )p] 提交 2013-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 147–507（361 aa）片段：C-TERMINAL DOMAIN, UNP residues 147-507	未记录	ZN ZINC ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES, 0.2 M MgCl2, 30% PEG300, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.26 Å R-free 0.217
4LEY Structure of mouse cGAS bound to 18 bp DNA 提交 2013-06-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 142–507（366 aa）片段：Catalytic domain, UNP residues 142-507 链 C 142–507（366 aa）片段：Catalytic domain, UNP residues 142-507	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；24-36% MPD, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.50 Å R-free 0.191
4LEY Structure of mouse cGAS bound to 18 bp DNA 提交 2013-06-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 B 142–507（366 aa）片段：Catalytic domain, UNP residues 142-507 链 D 142–507（366 aa）片段：Catalytic domain, UNP residues 142-507	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；24-36% MPD, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.50 Å R-free 0.191
4LEZ Structure of mouse cGAS bound to an 18bp DNA and cGAS product 提交 2013-06-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 142–507（366 aa）片段：mouse cGAS catalytic domain, UNP residues 142-507 链 C 142–507（366 aa）片段：mouse cGAS catalytic domain, UNP residues 142-507	未记录	ZN ZINC ION × 2 1SY cGAMP × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；24-36% MPD, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.36 Å R-free 0.247
4O6A Mouse cyclic GMP-AMP synthase (cGAS) in complex with DNA 提交 2013-12-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 147–507（361 aa）片段：UNP residues 147-507 链 B 147–507（361 aa）片段：UNP residues 147-507	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；25% Methanol, 0.1M Tris-HCl, pH 8.0, 0.01M MgCl2., VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.86 Å R-free 0.218
5XZB Mouse cGAS bound to the inhibitor RU365 提交 2017-07-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 149–505（357 aa）片段：UNP residues 149-505	未记录	ZN ZINC ION × 1 A9Y (3R)-3-[1-(1H-benzimidazol-2-yl)-5-hydroxy-3-methyl-1H-pyrazol-4-yl]-2-benzofuran-1(3H)-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES, pH 6.3, 26% PEG400, 0.1 M magnesium chloride	分辨率 2.13 Å R-free 0.247
5XZE Mouse cGAS bound to the inhibitor RU332 提交 2017-07-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 147–507（361 aa）片段：UNP residues 147-505	未记录	ZN ZINC ION × 1 AE7 (3R)-3-[1-(3H-1lambda~4~,3-benzothiazol-2-yl)-5-hydroxy-3-methyl-1H-pyrazol-4-yl]-2-benzofuran-1(3H)-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES, pH 6.3, 25% PEG400, 0.1 M magnesium chloride	分辨率 2.18 Å R-free 0.281
5XZG Mouse cGAS bound to the inhibitor RU521 提交 2017-07-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 147–507（361 aa）片段：UNP residues 147-505	未记录	ZN ZINC ION × 1 AEV 2-(4,5-dichloro-1H-benzimidazol-2-yl)-5-methyl-4-[(1R)-3-oxo-1,3-dihydro-2-benzofuran-1-yl]-1,2-dihydro-3H-pyrazol-3-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES, pH 6.9, 22.5% PEG400, 0.08 M magnesium chloride	分辨率 1.83 Å R-free 0.232
6X59 The mouse cGAS catalytic domain binding to human assembled nucleosome 提交 2020-05-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 K 142–507（366 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.98 Å
6X5A The mouse cGAS catalytic domain binding to human nucleosome that purified from HEK293T cells 提交 2020-05-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 K 142–507（366 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.36 Å
6XJD Two mouse cGAS catalytic domain binding to human assembled nucleosome 提交 2020-06-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric	链 K 142–507（366 aa）链 L 142–507（366 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 6.80 Å
7A08 CryoEM Structure of cGAS Nucleosome complex 提交 2020-08-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 a 139–507（369 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.11 Å
7BUJ mcGAS bound with pppGpG 提交 2020-04-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 61–507（447 aa）链 B 61–507（447 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MN MANGANESE (II) ION × 4 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.15 M Ammonium sulfate, 0.1 M Sodium HEPES, 20 % w/v PEG-4000, pH 6.8	分辨率 2.13 Å R-free 0.278
7BUM mcGAS bound with pGpA 提交 2020-04-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–507（507 aa）链 B 1–507（507 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 2 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M MES, 30 % w/v PEG-5000 MME, pH 6.5	分辨率 3.05 Å R-free 0.280
7BUQ mcGAS bound with 23-cGAMP 提交 2020-04-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1–507（507 aa）链 B 1–507（507 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2 1SY cGAMP × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M BIS-Tris, 25 % w/v PEG-3350, pH 6.5	分辨率 3.09 Å R-free 0.296
7JO9 1:1 cGAS-nucleosome complex 提交 2020-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 K 142–507（366 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7JOA 2:1 cGAS-nucleosome complex 提交 2020-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 K 142–507（366 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7KXS Computational design of constitutively active cGAS 提交 2020-12-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 147–507（361 aa）链 B 147–507（361 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；20 % w/v Polyethylene glycol 3,350 200 mM Potassium thiocyanate	分辨率 2.60 Å R-free 0.261
7UTT Structure of Non-hydrolyzable ATP (ApCpp) binds to Cyclic GMP AMP synthase (cGAS) through Mn coordination 提交 2022-04-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 147–507（361 aa）链 C 147–507（361 aa）	未记录	APC DIPHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID ADENOSYL ESTER × 2 ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5	分辨率 2.04 Å R-free 0.210
7UUX ATP binds to Cyclic GMP AMP synthase (cGAS) through Mg coordination 提交 2022-04-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 147–507（361 aa）链 C 147–507（361 aa）	突变：E211Q, D213N 突变：E211Q, D213N	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5	分辨率 2.26 Å R-free 0.234
7UXW Structure of ATP and GTP bind to Cyclic GMP AMP synthase (cGAS) through Mg coordination 提交 2022-05-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 147–507（361 aa）链 C 147–507（361 aa）	突变：E211Q, D213N 突变：E211Q, D213N	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5	分辨率 2.57 Å R-free 0.248
7UYQ Structure of GTP binds to Cyclic GMP AMP synthase (cGAS) through Mg coordination 提交 2022-05-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 147–507（361 aa）链 C 147–507（361 aa）	突变：E211Q, D213N 突变：E211Q, D213N	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5	分辨率 2.57 Å R-free 0.241
7UYZ Structure of Ternary Complex of cGAS with dsDNA and Bound 5 -pppG(2 ,5 )pG 提交 2022-05-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 147–507（361 aa）链 C 147–507（361 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5	分辨率 2.49 Å R-free 0.251
7UZR Structure of Ternary Complex of cGAS with dsDNA and Bound 5 -pppG(2 ,5 )pG 提交 2022-05-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 147–507（361 aa）片段：catalytic domain, residues 147-507 链 C 147–507（361 aa）片段：catalytic domain, residues 147-507	未记录	OKR [[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 2 ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5	分辨率 2.70 Å R-free 0.245
7V0C Structure of Ternary Complex of cGAS with dsDNA and Bound 5 -pppG(2 ,5 )pG 提交 2022-05-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 147–507（361 aa）片段：catalytic domain 链 C 147–507（361 aa）片段：catalytic domain	未记录	OKR [[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 2 ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5	分辨率 2.57 Å R-free 0.240
7V0R Structure of Ternary Complex of cGAS with dsDNA and Bound 5 -ppcpG(2 ,5 )pA 提交 2022-05-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 147–507（361 aa）片段：catalytic domain 链 C 147–507（361 aa）片段：catalytic domain	未记录	OKX [(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-[[oxidanyl(phosphonooxy)phosphoryl]methyl]phosphinic acid × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5	分辨率 2.51 Å R-free 0.250
7V0W Structure of Ternary Complex of cGAS with dsDNA and Bound 5 -pppG(2,5 )pA 提交 2022-05-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 147–507（361 aa）链 C 147–507（361 aa）	突变：E211Q, D213N 突变：E211Q, D213N	ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5	分辨率 2.66 Å R-free 0.238
8EAE Structure of Ternary Complex of cGAS with dsDNA and Bound 5-pppG(2,5)pI 提交 2022-08-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 147–507（361 aa）链 C 147–507（361 aa）	未记录	VLO [[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-3,4-bis(oxidanyl)-5-(6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-3-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 2 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5	分辨率 2.56 Å R-free 0.233
8ECC Structure of Ternary Complex of cGAS with dsDNA and Bound 5-pppI(2,5)pA 提交 2022-09-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 147–507（361 aa）链 C 147–507（361 aa）	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 VWX [[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-3-oxidanyl-5-(6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5	分辨率 2.44 Å R-free 0.259
8G10 Structure of Ternary Complex of cGAS with dsDNA and Bound ITP and GTP 提交 2023-02-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 147–507（361 aa）片段：catalytic domain, residues 147-507 链 C 147–507（361 aa）片段：catalytic domain, residues 147-507	突变：E211Q, D213N 突变：E211Q, D213N	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate,32%MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5	分辨率 2.47 Å R-free 0.227
8G1J Structure of Ternary Complex of cGAS with dsDNA and Bound ATP and ITP 提交 2023-02-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 147–507（361 aa）片段：catalytic domain, residues 147-507 链 C 147–507（361 aa）片段：catalytic domain, residues 147-507	突变：E211Q, D213N 突变：E211Q, D213N	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5	分辨率 2.30 Å R-free 0.234
8G23 Structure of Ternary Complex of cGAS with dsDNA and Bound pppIpA 提交 2023-02-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 147–507（361 aa）片段：catalytic domain, residues 147-507 链 C 147–507（361 aa）片段：catalytic domain, residues 147-507	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 VWX [[(2~{R},3~{R},4~{R},5~{R})-4-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]oxy-3-oxidanyl-5-(6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5	分辨率 2.71 Å R-free 0.248
8G2P Structure of Ternary Complex of cGAS with dsDNA and Bound ATP and GTP 提交 2023-02-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 147–507（361 aa）链 C 147–507（361 aa）	突变：D307N 突变：D307N	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5	分辨率 2.52 Å R-free 0.242
8G2Q Structure of Ternary Complex of mouse cGAS with dsDNA and Bound GTP 提交 2023-02-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 147–507（361 aa）链 C 147–507（361 aa）	突变：D307N 突变：D307N	GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5	分辨率 2.37 Å R-free 0.244
8GIM Structure of Ternary Complex of mouse cGAS with dsDNA and Bound ATP: with 10mM Mg2+ 提交 2023-03-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 147–507（361 aa）片段：catalytic domain, residues 147-507 链 C 147–507（361 aa）片段：catalytic domain, residues 147-507	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5	分辨率 2.63 Å R-free 0.230
8GIN Structure of Ternary Complex of mouse cGAS with dsDNA and Bound ATP: with 10mM Mg2+ and 0.015mM Mn2+ 提交 2023-03-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 147–507（361 aa）片段：catalytic domain, residues 147-507 链 C 147–507（361 aa）片段：catalytic domain, residues 147-507	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5	分辨率 2.75 Å R-free 0.225
8GIO Structure of Ternary Complex of mouse cGAS with dsDNA and Bound ATP: with 10mM Mg2+ and 0.1mM Mn2+ 提交 2023-03-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 147–507（361 aa）片段：catalytic domain, residues 147-507 链 C 147–507（361 aa）片段：catalytic domain, residues 147-507	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5	分辨率 2.67 Å R-free 0.241
8GIP Structure of Ternary Complex of mouse cGAS with dsDNA and Bound ATP: with 10mM Mg2+ and 0.040mM Mn2+ 提交 2023-03-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 147–507（361 aa）片段：catalytic domain, residues 147-507 链 C 147–507（361 aa）片段：catalytic domain, residues 147-507	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5	分辨率 2.70 Å R-free 0.242
8GIR Structure of Ternary Complex of mouse cGAS with dsDNA and Bound ATP: with 10mM Mg2+ and 0.2mM Mn2+ 提交 2023-03-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 147–507（361 aa）片段：catalytic domain, residues 147-507 链 C 147–507（361 aa）片段：catalytic domain, residues 147-507	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.229
8GIS Structure of Ternary Complex of mouse cGAS with dsDNA and Bound ATP: with 10mM Mg2+ and 0.5mM Mn2+ 提交 2023-03-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 147–507（361 aa）片段：catalytic domain, residues 147-507 链 C 147–507（361 aa）片段：catalytic domain, residues 147-507	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5	分辨率 2.46 Å R-free 0.230
8GIT Structure of Ternary Complex of mouse cGAS with dsDNA and Bound ATP: with 10mM Mg2+ and 1mM Mn2+ 提交 2023-03-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 147–507（361 aa）片段：catalytic domain, residues 147-507 链 C 147–507（361 aa）片段：catalytic domain, residues 147-507	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, with 0.1 M Bis-Tris pH 6.5	分辨率 2.72 Å R-free 0.230
8SHK Structure of binary complex of mouse cGAS and bound ATP 提交 2023-04-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 147–507（361 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 147-507)	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M magnesium acetate tetrahydrate, 0.1 M sodium cacodylate trihydrate, pH 6.5, 20% w/v PEG8000	分辨率 1.71 Å R-free 0.228
8SHU Structure of mouse cGAS 提交 2023-04-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 147–507（361 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 147-507)	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M magnesium acetate tetrahydrate, 0.1 M sodium cacodylate trihydrate, pH 6.5, 20% w/v PEG8000	分辨率 1.71 Å R-free 0.211
8SHY Structure of binary complex of mouse cGAS QN and bound ATP 提交 2023-04-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 147–507（361 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 147-507)	突变：E211Q, D213N	ZN ZINC ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M magnesium acetate tetrahydrate, 0.1 M sodium cacodylate trihydrate, pH 6.5, 20% w/v PEG8000	分辨率 1.77 Å R-free 0.214
8SJ0 Structure of ternary complex of cGAS with dsDNA and bound 2'-dATP 提交 2023-04-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 147–507（361 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 147-507) 链 C 147–507（361 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 147-507)	未记录	DTP 2'-DEOXYADENOSINE 5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, 0.1 M Bis-Tris pH 6.5	分辨率 2.55 Å R-free 0.237
8SJ1 Structure of ternary complex of cGAS with dsDNA and bound 3'-dATP 提交 2023-04-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 147–507（361 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 147-507) 链 C 147–507（361 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 147-507)	未记录	3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5	分辨率 2.81 Å R-free 0.240
8SJ2 Structure of ternary complex of cGAS with dsDNA and bound ATP and 2'-dGTP 提交 2023-04-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 147–507（361 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 147-507) 链 C 147–507（361 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 147-507)	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 DGT 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5	分辨率 2.23 Å R-free 0.234
8SKT Structure of ternary complex of mouse cGAS with dsDNA and bound ATP with 5 mM Mn2+ 提交 2023-04-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：hexameric	链 A 147–507（361 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 147-507) 链 C 147–507（361 aa）片段：catalytic domain (UNP residues 147-507)	未记录	ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 2 MN MANGANESE (II) ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277.15 K；0.2 M ammonium acetate, 32% MPD, 0.1 M Bis-Tris, pH 6.5	分辨率 2.69 Å R-free 0.247
9J2Z mouse cGAS catalytic domain bound with RU.521 提交 2024-08-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 146–507（362 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；0.1 M HEPES, 0.1 M MgAc2, 20% PEG3350	分辨率 2.39 Å R-free 0.263
9J2Z mouse cGAS catalytic domain bound with RU.521 提交 2024-08-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 146–507（362 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1EAM (4~{S},5~{R})-2-[4,5-bis(chloranyl)-1~{H}-benzimidazol-2-yl]-5-methyl-4-[(1~{S})-3-oxidanylidene-1~{H}-2-benzofuran-1-yl]pyrazolidin-3-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；0.1 M HEPES, 0.1 M MgAc2, 20% PEG3350	分辨率 2.39 Å R-free 0.263
9J2Z mouse cGAS catalytic domain bound with RU.521 提交 2024-08-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 146–507（362 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1EAM (4~{S},5~{R})-2-[4,5-bis(chloranyl)-1~{H}-benzimidazol-2-yl]-5-methyl-4-[(1~{S})-3-oxidanylidene-1~{H}-2-benzofuran-1-yl]pyrazolidin-3-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；0.1 M HEPES, 0.1 M MgAc2, 20% PEG3350	分辨率 2.39 Å R-free 0.263
9J2Z mouse cGAS catalytic domain bound with RU.521 提交 2024-08-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 146–507（362 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 1 A1EAM (4~{S},5~{R})-2-[4,5-bis(chloranyl)-1~{H}-benzimidazol-2-yl]-5-methyl-4-[(1~{S})-3-oxidanylidene-1~{H}-2-benzofuran-1-yl]pyrazolidin-3-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.6；277 K；0.1 M HEPES, 0.1 M MgAc2, 20% PEG3350	分辨率 2.39 Å R-free 0.263
9OH4 Cryo-EM structure of cGAS tetramer in complex with BuDNA (bubble DNA) 提交 2025-05-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric	链 A 149–505（357 aa）片段：UNP residues 149-505 链 B 149–505（357 aa）片段：UNP residues 149-505 链 C 149–505（357 aa）片段：UNP residues 149-505 链 D 149–505（357 aa）片段：UNP residues 149-505	未记录	ZN ZINC ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM Tris pH 7.5, 150mM NaCl, and 0.5mM TCEP cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Filter paper blotted with blot force 2 and blot time 2s, and plunge-frozen in liquid ethane using a Vitrobot Mark IV at 4 degree Celsius and 100% humidity.	分辨率 3.48 Å

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	CGAS_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–370； UniProt 139–507 作者链 B； PDB构建体 2–370； UniProt 139–507 作者链 C； PDB构建体 2–370； UniProt 139–507 作者链 D； PDB构建体 2–370； UniProt 139–507 作者链 E； PDB构建体 2–370； UniProt 139–507 作者链 F； PDB构建体 2–370； UniProt 139–507

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5n6i
沉积日期 deposition_date	2017-02-15
结构标题 title	Crystal structure of mouse cGAS in complex with 39 bp DNA
关键词 keywords	;nucleotidyltransferase, cyclic GMP-AMP synthase, cGAS, DNA-binding, activator DNA, pattern recognition receptor, innate immune response, viral DNA recognition, TRANSFERASE ;; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	56.96 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	57.78 Å
零角强度 I(0) i0	1796210000.00
分子量 molecular_weight	317740.0 kDa
排除体积 excluded_volume	382680 Å³
包络体积 envelope_volume	580850 Å³
水化壳体积 shell_volume	89708 Å³
包络直径 envelope_diameter	196.1 Å
壳层 Rg shell_rg	53.13 Å
包络 Rg envelope_rg	56.82 Å
形状 Rg shape_rg	57.78 Å
总 Rg total_rg	57.66 Å
总原子数 total_atoms	22083
残基数 n_residues	2354
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	188.7 Å
Rg (实空间) rg_real	57.55 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.99 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.7960e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	3.5940e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal	56.43 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	1793000000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7748
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	47.2 Å
偏度 Skewness skewness	0.588
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.395
角度范围 angular_range	— – 0.1400 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	640300000.0000
实空间数据点数 n_real_points	29
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.705; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.899; Smooth: 0.054

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Cyclic GMP-AMP synthase
分子量 formula_weight	43401.2 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.86
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F
原子数 atom_count	22083

GAMRGSRKEPDKLKKVLDKLRLKRKDISEAAETVNKVVERLLRRMQKRESEFKGVEQLNTGSYYEHVKISAPNEFDVMFKLEVPRIELQEYYETGAFYLVKFKRIPRGNPLSHFLEGEVLSATKMLSKFRKIIKEEVKEIKDIDVSVEKEKPGSPAVTLLIRNPEEISVDIILALESKGSWPISTKEGLPIQGWLGTKVRTNLRREPFYLVPKNAKDGNSFQGETWRLSFSHTEKYILNNHGIEKTCCESSGAKCCRKECLKLMKYLLEQLKKEFQELDAFCSYHVKTAIFHMWTQDPQDSQWDPRNLSSCFDKLLAFFLECLRTEKLDHYFIPKFNLFSQELIDRKSKEFLSKKIEYERNNGFPIFDKL

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	Mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	DNA (37-MER)
分子量 formula_weight	11987.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	G,I,K,M

AGATCTACTAGTGATCTATGACTGATCTGTACATGATCT

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	DNA (36-MER)
分子量 formula_weight	12014.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	H,J,L,N

AGATCATGTACAGATCAGTCATAGATCACTAGTAGATCT

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

CATH v4.4 (12 domains)

结构域编号 domain_id	5n6iA01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1410 — Poly(a)-polymerase, middle domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 —

结构域编号 domain_id	5n6iA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	460 — Beta Polymerase; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 —

结构域编号 domain_id	5n6iB01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1410 — Poly(a)-polymerase, middle domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 —

结构域编号 domain_id	5n6iB02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	460 — Beta Polymerase; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 —

结构域编号 domain_id	5n6iC01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1410 — Poly(a)-polymerase, middle domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 —

结构域编号 domain_id	5n6iC02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	460 — Beta Polymerase; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 —

结构域编号 domain_id	5n6iD01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1410 — Poly(a)-polymerase, middle domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 —

结构域编号 domain_id	5n6iD02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	460 — Beta Polymerase; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 —

结构域编号 domain_id	5n6iE01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1410 — Poly(a)-polymerase, middle domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 —

结构域编号 domain_id	5n6iE02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	460 — Beta Polymerase; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 —

结构域编号 domain_id	5n6iF01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1410 — Poly(a)-polymerase, middle domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 —

结构域编号 domain_id	5n6iF02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	460 — Beta Polymerase; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	90 —

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	168.530 Å
晶胞边长 b length_b	122.940 Å
晶胞边长 c length_c	179.980 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	96.37 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	24

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.600 Å
最低分辨率 resolution_low	47.000 Å
R 因子 r_factor	0.2065
R_work r_work	0.2039
R_free r_free	0.2563

fit	/app/data/saxs_computation/n6/5n6i/5n6i.fit
pddf	/app/data/pr_computation/n6/5n6i/5n6i.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/n6/5n6i/5n6i.dat

Crystal structure of mouse cGAS in complex with 39 bp DNA

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cyclic GMP-AMP synthase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

CATH v4.4 (12 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)