SAXSdb — 5nkt

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Type-1 fimbrial protein, A chain

Escherichia coli K-12

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 24–182	未记录	SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 2.6；277 K；0.1 M Sodium Malonate, pH 2.6, 45% ammonium sulphate, 23 mg/ml of protein 1:1 mixture with reservoir	分辨率 1.50 Å R-free 0.188

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5NKT	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2JTY Self-complemented variant of FimA, the main subunit of type 1 pilus 提交 2007-08-09	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 24–182（159 aa）片段：Fusion protein of Type-1 fimbrial protein and type-1 fimbrial protein 链 A 24–42（19 aa）片段：Fusion protein of Type-1 fimbrial protein and type-1 fimbrial protein	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）18；压力 ambient NMR样品组成 1.7 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] FimA, 50 M H2O, 5 M D2O, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
2M5G Solution structure of FimA wt 提交 2013-02-24	配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 24–182（159 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.08；压力 ambient NMR样品组成 2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] FimA-1, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
3SQB Structure of the major type 1 pilus subunit FimA bound to the FimC chaperone 提交 2011-07-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 37–182（146 aa）片段：UNP residues 37-182	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.1 M sodium acetate, 0.2 M magnesium chloride, 13% PEG 4000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 3.20 Å R-free 0.300
3SQB Structure of the major type 1 pilus subunit FimA bound to the FimC chaperone 提交 2011-07-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 37–182（146 aa）片段：UNP residues 37-182	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.1 M sodium acetate, 0.2 M magnesium chloride, 13% PEG 4000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 3.20 Å R-free 0.300
3SQB Structure of the major type 1 pilus subunit FimA bound to the FimC chaperone 提交 2011-07-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 37–182（146 aa）片段：UNP residues 37-182	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.1 M sodium acetate, 0.2 M magnesium chloride, 13% PEG 4000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 3.20 Å R-free 0.300
3SQB Structure of the major type 1 pilus subunit FimA bound to the FimC chaperone 提交 2011-07-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 37–182（146 aa）片段：UNP residues 37-182	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.1 M sodium acetate, 0.2 M magnesium chloride, 13% PEG 4000, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 3.20 Å R-free 0.300
4DWH Structure of the major type 1 pilus subunit FIMA bound to the FIMC (2.5 A resolution) 提交 2012-02-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 41–182（142 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 7 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；40% (v/v) PEG 400 0.1 M phosphate/citrate pH 4.2 , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.294
4DWH Structure of the major type 1 pilus subunit FIMA bound to the FIMC (2.5 A resolution) 提交 2012-02-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 41–182（142 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；40% (v/v) PEG 400 0.1 M phosphate/citrate pH 4.2 , VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.294
5OH0 The Cryo-Electron Microscopy Structure of the Type 1 Chaperone-Usher Pilus Rod 提交 2017-07-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 24–182（159 aa）链 B 24–182（159 aa）链 C 24–182（159 aa）链 D 24–182（159 aa）链 E 24–182（159 aa）链 F 24–182（159 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
6C53 Cryo-EM structure of the Type 1 pilus rod 提交 2018-01-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 11 PDB 声明：undecameric	链 A 24–182（159 aa）链 B 24–182（159 aa）链 C 24–182（159 aa）链 D 24–182（159 aa）链 E 24–182（159 aa）链 F 24–182（159 aa）链 G 24–182（159 aa）链 H 24–182（159 aa）链 I 24–182（159 aa）链 J 24–182（159 aa）链 K 24–182（159 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
6R74 N-terminally reversed variant of FimA E. coli 提交 2019-03-28	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 42–182（141 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 3.1；298 K；45% NH4SO2 and 0.1M Sodium Malonate buffer pH 3.1	分辨率 1.81 Å R-free 0.219
6SWH Crystal structure of the ternary complex between the type 1 pilus proteins FimC, FimI and FimA from E. coli 提交 2019-09-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 37–182（146 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.8 M sodium formate, 100 mM Tris/acetic acid pH 8.5, 16% PEG 4000 (w/v)	分辨率 2.80 Å R-free 0.207
6SWH Crystal structure of the ternary complex between the type 1 pilus proteins FimC, FimI and FimA from E. coli 提交 2019-09-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 F 37–182（146 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.8 M sodium formate, 100 mM Tris/acetic acid pH 8.5, 16% PEG 4000 (w/v)	分辨率 2.80 Å R-free 0.207
6Y7S 2.85 A cryo-EM structure of the in vivo assembled type 1 pilus rod 提交 2020-03-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–182（182 aa）链 B 1–182（182 aa）链 C 1–182（182 aa）链 D 1–182（182 aa）链 E 1–182（182 aa）链 F 1–182（182 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；in ddH2O. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 ul sample, 30 s wait time, 0.5 s drain time, 6 s blotting	分辨率 2.85 Å R-free 0.275
8PSV 2.7 A cryo-EM structure of in vitro assembled type 1 pilus rod 提交 2023-07-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–182（182 aa）链 B 1–182（182 aa）链 C 1–182（182 aa）链 D 1–182（182 aa）链 E 1–182（182 aa）链 F 1–182（182 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；in ddH2O. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 ul sample, 30 s wait time, 0.5 s drain time, 6 s blotting	分辨率 2.70 Å
8PTU 2.5 A cryo-EM structure of the in vitro FimD-catalyzed assembly of type 1 pilus rod 提交 2023-07-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 1–182（182 aa）链 B 1–182（182 aa）链 C 1–182（182 aa）链 D 1–182（182 aa）链 E 1–182（182 aa）链 F 1–182（182 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7；in ddH2O. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；3 ul sample, 30 s wait time, 0.5 s drain time, 6 s blotting	分辨率 2.52 Å
9FTT Cryo-EM structure of the type 1 pilus rod as part of the FimA-bound usher complex (FimDHGFAnC) 提交 2024-06-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 B 24–182（159 aa）链 C 24–182（159 aa）链 D 24–182（159 aa）链 E 24–182（159 aa）链 F 24–182（159 aa）链 G 24–182（159 aa）链 H 24–182（159 aa）链 I 24–182（159 aa）链 J 24–182（159 aa）链 K 24–182（159 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
9FW9 Cryo-EM structure of the type 1 pilus assembly platform as part of the FimA-bound chaperone-usher pilus complex (FimDHGFAnC - body 2) 提交 2024-06-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 24–182（159 aa）链 B 24–182（159 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.90 Å
9FWB Cryo-EM structure of the type 1 pilus assembly platform as part of the FimA-bound chaperone-usher pilus complex (Local refinement including FimD, FimC, FimAn and FimAn-1) 提交 2024-06-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 24–182（159 aa）链 B 24–182（159 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.50 Å
9FWZ Cryo-EM structure of the type 1 pilus assembly platform as part of the FimA-bound chaperone-usher pilus complex (Local refinement including FimD, FimC, FimAn, FimAn-1 and FimAn-2) 提交 2024-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 A 24–182（159 aa）链 B 24–182（159 aa）链 E 24–182（159 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.60 Å
9FX0 Cryo-EM structure of the type 1 pilus tip-to-rod transition 提交 2024-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 A 24–182（159 aa）链 B 24–182（159 aa）链 C 24–182（159 aa）链 D 24–182（159 aa）链 E 24–182（159 aa）链 G 24–182（159 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 3.10 Å
9FXA Cryo-EM structure of the type 1 pilus rod as part of the FimI-bound usher complex (FimDHGFAnIC - body 1) 提交 2024-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric	链 B 24–182（159 aa）链 C 24–182（159 aa）链 D 24–182（159 aa）链 E 24–182（159 aa）链 F 24–182（159 aa）链 G 24–182（159 aa）链 H 24–182（159 aa）链 I 24–182（159 aa）链 J 24–182（159 aa）链 K 24–182（159 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.00 Å
9FXB Cryo-EM structure of the type 1 pilus assembly platform as part of the FimI-bound chaperone-usher pilus complex (FimDHGFAnIC - body 2) 提交 2024-07-01	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 24–182（159 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 4.30 Å
9VKV Cryo-EM structure of the type I pilus from Escherichia Coli and the surrounding water network 提交 2025-06-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric	链 A 24–182（159 aa）链 B 24–182（159 aa）链 C 24–182（159 aa）链 D 24–182（159 aa）链 E 24–182（159 aa）链 F 24–182（159 aa）链 G 24–182（159 aa）链 H 24–182（159 aa）链 I 24–182（159 aa）链 J 24–182（159 aa）链 K 24–182（159 aa）链 L 24–182（159 aa）链 M 24–182（159 aa）链 N 24–182（159 aa）链 O 24–182（159 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 2.09 Å
9X67 Cryo-EM structure of the type I pilus from Escherichia Coli and the surrounding water network 提交 2025-10-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：15-meric	链 A 24–182（159 aa）链 B 24–182（159 aa）链 C 24–182（159 aa）链 D 24–182（159 aa）链 E 24–182（159 aa）链 F 24–182（159 aa）链 G 24–182（159 aa）链 H 24–182（159 aa）链 I 24–182（159 aa）链 J 24–182（159 aa）链 K 24–182（159 aa）链 L 24–182（159 aa）链 M 24–182（159 aa）链 N 24–182（159 aa）链 O 24–182（159 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 NITROGEN	分辨率 1.85 Å

共 20 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FIMA1_ECOLI
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–159； UniProt 24–182

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5nkt
沉积日期 deposition_date	2017-04-03
结构标题 title	FimA wt from E. coli
关键词 keywords	FimA, pilus, monomer, subunit, pili, Escherichia, coli, pathogenic, main structural subunit, high resolution, STRUCTURAL PROTEIN; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	17.29 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	15.98 Å
零角强度 I(0) i0	5373260.00
分子量 molecular_weight	15432.0 kDa
排除体积 excluded_volume	18723 Å³
包络体积 envelope_volume	22140 Å³
水化壳体积 shell_volume	12453 Å³
包络直径 envelope_diameter	57.0 Å
壳层 Rg shell_rg	20.88 Å
包络 Rg envelope_rg	16.34 Å
形状 Rg shape_rg	15.90 Å
总 Rg total_rg	17.00 Å
总原子数 total_atoms	2097
残基数 n_residues	151
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	58.6 Å
Rg (实空间) rg_real	17.36 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.40 Å
I(0) (实空间) i0_real	5.3730e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.9340e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal	17.35 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	5373000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7004
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	19.3 Å
偏度 Skewness skewness	0.467
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.205
角度范围 angular_range	— – 0.4600 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	978800.0000
实空间数据点数 n_real_points	77
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.776; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.307; Positv: 1.000; Valcen: 0.931; Smooth: 0.922

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Type-1 fimbrial protein, A chain
分子量 formula_weight	15835.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	2258

AATTVNGGTVHFKGEVVNAACAVDAGSVDQTVQLGQVRTASLAQEGATSSAVGFNIQLNDCDTNVASKAAVAFLGTAIDAGHTNVLALQSSAAGSATNVGVQILDRTGAALTLDGATFSSETTLNNGTNTIPFQARYFATGAATPGAANADATFKVQYQ

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli K-12
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	83333
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	153

▼

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d5nkta_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.2 — Common fold of diphtheria toxin/transcription factors/cytochrome f
超家族 Superfamily superfamily	b.2.3 — Bacterial adhesins
家族 Family family	b.2.3.0 — automated matches

▶

8. 引用文献 (1)

▶

晶胞边长 a length_a	86.990 Å
晶胞边长 b length_b	86.990 Å
晶胞边长 c length_c	162.710 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	18

空间群 space_group	H 3 2
空间群编号 int_tables_number	155
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.500 Å
最低分辨率 resolution_low	29.874 Å
R 因子 r_factor	0.1588
R_work r_work	0.1579
R_free r_free	0.1881

fit	/app/data/saxs_computation/nk/5nkt/5nkt.fit
pddf	/app/data/pr_computation/nk/5nkt/5nkt.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/nk/5nkt/5nkt.dat

FimA wt from E. coli

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Type-1 fimbrial protein, A chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction