5oaq

TEAD4 COMPLEXED WITH YAP PEPTIDE AND MYRISTATE (COVALENTLY BOUND)

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 64.4 Å Quality: REASONABLE

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transcriptional enhancer factor TEF-3

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 217–434	片段：C-terminal domain, YAP binding domain	Transcriptional coactivator YAP1 × 1 （P46937） GOL GLYCEROL × 1 MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；15% PEG 3350,2% tacsimate, 0.1M NaCitrate	分辨率 1.95 Å R-free 0.252

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 5OAQ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5GZB Crystal Structure of Transcription Factor TEAD4 in Complex with M-CAT DNA 提交 2016-09-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric	链 A 36–139（104 aa）片段：UNP residues 36-139	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.6 M Na2HPO4, 0.6 M KH2PO4, 0.1 M HEPES	分辨率 2.70 Å R-free 0.256
5NO6 TEAD4-HOXB13 complex bound to DNA 提交 2017-04-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 N 40–112（73 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.24；298 K；PEG (4000), Ammonium sulphate, PME(550, MOPs	分辨率 2.88 Å R-free 0.317
5NO6 TEAD4-HOXB13 complex bound to DNA 提交 2017-04-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric	链 I 40–112（73 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.24；298 K；PEG (4000), Ammonium sulphate, PME(550, MOPs	分辨率 2.88 Å R-free 0.317
6GE3 X-ray structure of TEAD4 (wildtype) complexed with YAP (wildtype): The role of residual flexibility and water molecules in the adaptation of a bound intrinsically disordered protein to mutations at a binding interface 提交 2018-04-25	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 216–434（219 aa）片段：C-terminal domain, YAP binding domain	未记录	MYR MYRISTIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；16% PEG 3350,2% tacsimate, 0.1M NaCit, pH 5.6	分辨率 1.85 Å R-free 0.242
6GE4 TEAD4 (216-434);E263A COMPLEXED WITH YAP PEPTIDE (60-100) AND MYRISTOATE (COVALENTLY BOUND) AT 1.97A (P41212 CRYSTAL FORM); MYRISTOYLATION WAS DONE BY ADDING MYR-COA 提交 2018-04-25	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 216–434（219 aa）片段：C-terminal domain, YAP binding domain	未记录	MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；20% PEG 3350, 0.2M MgNitrate	分辨率 1.97 Å R-free 0.241
6GE5 TEAD4 (216-434);Y429F COMPLEXED WITH YAP PEPTIDE (60-100) AND MYRISTOATE (COVALENTLY BOUND) AT 2.05A (P41212 CRYSTAL FORM); MYRISTOYLATION WAS DONE BY ADDING MYR-COA 提交 2018-04-25	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 216–434（219 aa）片段：C-terminal domain, YAP binding domain	未记录	MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；298 K；20% PEG 3350, 8% Tacsimate	分辨率 2.05 Å R-free 0.238
6GE6 X-ray structure of TEAD4(E263A+Y429F mutant) complexed with YAP(wildtype): The role of residual flexibility and water molecules in the adaptation of a bound intrinsically disordered protein to mutations at a binding interface 提交 2018-04-25	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 173–391（219 aa）片段：C-terminal domain, YAP binding domain	未记录	MYR MYRISTIC ACID × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；2M ammonium sulfate, 0.1M Bis-TRIS	分辨率 1.80 Å R-free 0.238
6GEC TEAD4 (216-434) COMPLEXED WITH YAP PEPTIDE (60-100);S94A AND MYRISTOATE (COVALENTLY BOUND) AT 1.70A (P41212 CRYSTAL FORM); MYRISTOYLATION WAS DONE BY ADDING MYR-COA 提交 2018-04-26	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 216–434（219 aa）片段：C-terminal domain, YAP binding domain	未记录	MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；20% PEG 3350, 0.2M NaTartrate	分辨率 1.70 Å R-free 0.242
6GEE TEAD4 (216-434);E263A COMPLEXED WITH YAP PEPTIDE (60-100); S94A AND MYRISTOATE (COVALENTLY BOUND) AT 1.96A (P41212 CRYSTAL FORM); MYRISTOYLATION WAS DONE BY ADDING MYR-COA 提交 2018-04-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 216–434（219 aa）片段：C-terminal domain, YAP binding domain	突变：E263A	MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；17% PEG 10000, 0.1M ammonium acetate, 0.1M Bis-TRIS	分辨率 1.96 Å R-free 0.245
6GEG TEAD4 (216-434);Y429F COMPLEXED WITH YAP PEPTIDE (60-100); S94A AND MYRISTOATE (COVALENTLY BOUND) AT 2.23A (P41212 CRYSTAL FORM); MYRISTOYLATION WAS DONE BY ADDING MYR-COA 提交 2018-04-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 216–434（219 aa）片段：C-terminal domain, YAP binding domain	突变：Y429F	MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；20% PEG 3350, 0.2M Na tartrate	分辨率 2.23 Å R-free 0.236
6GEI TEAD4 (216-434);E263A+Y429F COMPLEXED WITH YAP PEPTIDE (60- 100);S94A AND MYRISTOATE (COVALENTLY BOUND TO LYS344, NOT CYS367!) AT 1.65A (P41212 CRYSTAL FORM); MYRISTOYLATION WAS DONE BY ADDING MYR-COA 提交 2018-04-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 216–434（219 aa）片段：C-terminal domain, YAP binding domain	突变：E263A+Y429F	MYR MYRISTIC ACID × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；20% PEG 3350, 0.2M Na acetate	分辨率 1.65 Å R-free 0.248
6GEK TEAD4 (216-434);Y429F COMPLEXED WITH YAP PEPTIDE (60-100) AND MYRISTOATE (COVALENTLY BOUND) AT 2.28A (P212121 CRYSTAL FORM); MYRISTOYLATION WAS DONE BY ADDING MYR-COA 提交 2018-04-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 216–434（219 aa）片段：C-terminal domain, YAP binding domain	突变：Y429F	MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；25% PEG 3350, 0.2M MgCl2, 0.1M Bis-TRIS	分辨率 2.28 Å R-free 0.246
6GEK TEAD4 (216-434);Y429F COMPLEXED WITH YAP PEPTIDE (60-100) AND MYRISTOATE (COVALENTLY BOUND) AT 2.28A (P212121 CRYSTAL FORM); MYRISTOYLATION WAS DONE BY ADDING MYR-COA 提交 2018-04-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 216–434（219 aa）片段：C-terminal domain, YAP binding domain	突变：Y429F	MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；25% PEG 3350, 0.2M MgCl2, 0.1M Bis-TRIS	分辨率 2.28 Å R-free 0.246
6HIK X-ray structure of TEAD4(Y429H) mutant) complexed with YAP (wildtype): Molecular and structural characterization of a TEAD mutation at the origin of Sveinsson's chorioretinal atrophy 提交 2018-08-30	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 173–391（219 aa）片段：C-terminal domain, YAP binding domain	未记录	MYR MYRISTIC ACID × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；1.4M Na/K PO4	分辨率 1.65 Å R-free 0.237
6Q2X TEAD4 (216-434) COMPLEXED WITH YAP PEPTIDE (60-100) AND MYRISTOATE (COVALENTLY BOUND) AT 2.1A (P41212 CRYSTAL FORM) 提交 2018-12-03	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 217–434（218 aa）片段：C-terminal domain, YAP binding domain	未记录	GOL GLYCEROL × 1 MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；16% PEG 3350,2% tacsimate, 0.1M NaCit	分辨率 2.10 Å R-free 0.253
6Q36 TEAD4(216-434) complexed with optimized peptide 9 and myristoate (covalently bound) at 2.01A resolution: Structure-based design of potent linear peptide inhibitors of the YAP-TEAD protein-protein interaction derived from the YAP omega-loop sequence 提交 2018-12-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 217–434（218 aa）片段：C-terminal domain, YAP binding domain 链 B 217–434（218 aa）片段：C-terminal domain, YAP binding domain	未记录	MYR MYRISTIC ACID × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；0.9 M NaK Phosphate	分辨率 2.01 Å R-free 0.244
6SEN TEAD4 bound to a FAM181A peptide 提交 2019-07-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 217–434（218 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.59；293 K；200 mM Ammonium sulfate 100 mM Sodium acetate trihydrate pH 4.59 35% Pentaerythritol ethoxylate (15/4 EO/OH)	分辨率 1.65 Å R-free 0.219
6SEN TEAD4 bound to a FAM181A peptide 提交 2019-07-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 217–434（218 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.59；293 K；200 mM Ammonium sulfate 100 mM Sodium acetate trihydrate pH 4.59 35% Pentaerythritol ethoxylate (15/4 EO/OH)	分辨率 1.65 Å R-free 0.219
6SEO TEAD4 bound to a FAM181B peptide 提交 2019-07-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 174–391（218 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；50 mM ammonium sulfate 50 mM Bis-TRIS pH 6.5 30% Pentaerythritol ethoxylate (15/4 EO/OH)	分辨率 2.55 Å R-free 0.232
8A8R Crystal structure of TEAD4 in complex with YAP peptide 提交 2022-06-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 216–434（219 aa）片段：C-terminal domain, YAP binding domain 链 B 216–434（219 aa）片段：C-terminal domain, YAP binding domain	未记录	MYR MYRISTIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；50 mM sodium acetate trihydrate pH 4.6 50 mM magnesium acetate tetrahydrate 25% PEG400	分辨率 1.70 Å R-free 0.243
8C17 Crystal structure of TEAD4 in complex with peptide 1 提交 2022-12-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 217–434（218 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 4 MYR MYRISTIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2.4 M sodium malonate	分辨率 2.25 Å R-free 0.238
8CAA Crystal structure of TEAD4 in complex with YTP-13 提交 2023-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 217–434（218 aa）片段：C-terminal domain, YAP binding domain 链 B 217–434（218 aa）片段：C-terminal domain, YAP binding domain	未记录	U3F 4-[bis(fluoranyl)methoxy]-2-[(2~{S})-5-chloranyl-6-fluoranyl-2-[[(4-oxidanylcyclohexyl)amino]methyl]-2-phenyl-3~{H}-1-benzofuran-4-yl]-3-fluoranyl-benzamide × 2 U3O (2~{R})-2-[2-chloranyl-5-[2-chloranyl-4-(trifluoromethyl)phenoxy]phenyl]sulfanylpropanoic acid × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；22% PEG 3350 (w/v) , 0.25 M ammonium citrate dibasic	分辨率 2.00 Å R-free 0.237
9QKQ Crystal structure of hTEAD4 YAP binding domain (hTEAD4-YBD) in complex with peptide 6 提交 2025-03-20	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 217–434（218 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 9 MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.9-1.2 M sodium/potassium phosphate buffer at pH 5.6	分辨率 1.74 Å R-free 0.221
9QKQ Crystal structure of hTEAD4 YAP binding domain (hTEAD4-YBD) in complex with peptide 6 提交 2025-03-20	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 217–434（218 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 MYR MYRISTIC ACID × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.9-1.2 M sodium/potassium phosphate buffer at pH 5.6	分辨率 1.74 Å R-free 0.221
9SYI Crystal structure of TEAD4 in complex with compound 9 提交 2025-10-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 217–434（218 aa）链 B 217–434（218 aa）	未记录	U3O (2~{R})-2-[2-chloranyl-5-[2-chloranyl-4-(trifluoromethyl)phenoxy]phenyl]sulfanylpropanoic acid × 2 A1ICN 2-[(2~{S})-5-chloranyl-2-phenyl-2-[(2~{S})-pyrrolidin-2-yl]-3~{H}-1-benzofuran-4-yl]-3-fluoranyl-4-methoxy-benzamide × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；sodium/potassium phosphate	分辨率 2.10 Å R-free 0.245
9SYN Crystal structure of TEAD4 in complex with Vgll1-peptide and IAG933 提交 2025-10-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 217–434（218 aa）	未记录	MYR MYRISTIC ACID × 1 WCF 4-[(2~{S})-5-chloranyl-6-fluoranyl-2-phenyl-2-[(2~{S})-pyrrolidin-2-yl]-3~{H}-1-benzofuran-4-yl]-5-fluoranyl-6-(2-hydroxyethyloxy)-~{N}-methyl-pyridine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Ammonium sulfate, HEPES, PEG3350	分辨率 1.30 Å R-free 0.233

共 22 个其他 PDB 条目、26 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TEAD4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–220； UniProt 217–434

Transcriptional coactivator YAP1

物种未注明

UniProt P46937

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 L； UniProt 60–100	未记录	Transcriptional enhancer factor TEF-3 × 1 （Q15561） GOL GLYCEROL × 1 MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；15% PEG 3350,2% tacsimate, 0.1M NaCitrate	分辨率 1.95 Å R-free 0.252

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 5OAQ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1JMQ YAP65 (L30K mutant) WW domain in Complex with GTPPPPYTVG peptide 提交 2001-07-19	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 165–210（46 aa）	突变：L30K	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；288 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM NaCl；压力 1 NMR测量条件 pH 6；288 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM NaCl；压力 1 NMR样品组成 1.2 mM WW domain; 2.4 mM peptide GTPPPPYTVG; 10mM potassium phosphate buffer pH6; 100mM NaCl; 0.1 mM DTT; 0.1 mM EDTA, \| 90% H20, 10% D20 NMR样品组成 1.2 mM WW domain; 2.4 mM peptide GTPPPPYTVG; 10mM potassium phosphate buffer pH6; 100mM NaCl; 0.1 mM DTT; 0.1 mM EDTA, \| 100%D20	分辨率未提供
1K5R YAP65 WW domain S24-Amino-Ethylsulfanyl-Acetic Acid mutant 提交 2001-10-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 165–204（40 aa）片段：WW domain, residues 5-44	突变：S24/Amino-ethyl-sulfanyl-acetic acid 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；288 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM NaCl；压力 1 NMR测量条件 pH 6；288 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM NaCl；压力 1 NMR样品组成 phosphate buffer 10 mM, Nacl 100mM, DTT 0.1mM, EDTA 0.1 mM, pH 6, WW domain 1.2 mM Ligand 2.4 mM \| H20 (10% D20) NMR样品组成 phosphate buffer 10 mM, Nacl 100mM, DTT 0.1mM, EDTA 0.1 mM, pH 6 WW domain, 1.2 mM Ligand 2.4 mM \| D2O	分辨率未提供
1K9Q YAP65 WW domain complexed to N-(n-octyl)-GPPPY-NH2 提交 2001-10-30	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 165–204（40 aa）片段：Wild type WW domain	未记录	OCT N-OCTANE × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；288 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM NaCl；压力 1 NMR测量条件 pH 6；288 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM NaCl；压力 1 NMR样品组成 phosphate buffer 10mM, NaCl 100mM, DTT 0.1mM, EDTA 0.1mM, pH 6, WW domain 1.2mM, ligand 2.4mM \| H2O (10% D2O) NMR样品组成 phosphate buffer 10mM, NaCl 100mM, DTT 0.1mM, EDTA 0.1mM, pH 6, WW domain 1.2mM, ligand 2.4mM \| D2O	分辨率未提供
1K9R YAP65 WW domain complexed to Acetyl-PLPPY 提交 2001-10-30	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 165–204（40 aa）片段：Wild type WW domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；288 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM NaCl；压力 1 NMR测量条件 pH 6；288 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM NaCl；压力 1 NMR样品组成 phosphate buffer 10mM, NaCl 100mM, DTT 0.1mM, EDTA 0.1mM, pH 6, WW domain 1.2mM, ligand 2.4mM \| H2O (10% D2O) NMR样品组成 phosphate buffer 10mM, NaCl 100mM, DTT 0.1mM, EDTA 0.1mM, pH 6, WW domain 1.2mM, ligand 2.4mM \| D2O	分辨率未提供
2LAW Structure of the second WW domain from human YAP in complex with a human Smad1 derived peptide 提交 2011-03-22	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 230–263（34 aa）片段：second WW domain, residues 230-263	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；285 K；离子强度（mmCIF原始值）0.420；压力 ambient NMR样品组成 1 mM NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 15N] NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2LAX Structure of first WW domain of human YAP in complex with a human Smad1 doubly-phosphorilated derived peptide. 提交 2011-03-22	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 170–205（36 aa）片段：first WW domain, residues 170-205	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；285 K；离子强度（mmCIF原始值）0.420；压力 ambient NMR样品组成 1 mM NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 15N] NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2LAY Structure of the first WW domain of human YAP in complex with a phosphorylated human Smad1 derived peptide 提交 2011-03-22	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 170–205（36 aa）片段：residues 170-205	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；285 K；离子强度（mmCIF原始值）0.420；压力 ambient NMR样品组成 1 mM NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 15N] NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] NEDD4LWW3, 3 mM SMAD3, 20 mM sodium phosphate, 100 mM sodium chloride, 2 mM sodium azide, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2LTV YAP WW2 in complex with a Smad7 derived peptide 提交 2012-06-04	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 230–265（36 aa）片段：WW2 domain (UNP residues 230-265)	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.2；285 K；压力 ambient NMR样品组成 1 mM YAPWW2, 2 mM SMAD7, 20 mM [U-100% 2H] TRIS, 100 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] YAPWW2, 3 mM SMAD7, 20 mM [U-100% 2H] TRIS, 100 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2LTW YAP WW1 in complex with a Smad7 derived peptide 提交 2012-06-04	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 170–205（36 aa）片段：WW1 domain (UNP residues 170-205)	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7.2；285 K；压力 ambient NMR样品组成 1 mM YAPWW1, 2 mM SMAD7, 20 mM [U-100% 2H] TRIS, 100 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] YAPWW1, 3 mM SMAD7, 20 mM [U-100% 2H] TRIS, 100 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
3KYS Crystal structure of human YAP and TEAD complex 提交 2009-12-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 50–171（122 aa）片段：TEAD binding domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；277 K；0.1M sodium acetate, 2M sodium formate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.80 Å R-free 0.266
3KYS Crystal structure of human YAP and TEAD complex 提交 2009-12-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 50–171（122 aa）片段：TEAD binding domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；277 K；0.1M sodium acetate, 2M sodium formate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.80 Å R-free 0.266
4RE1 Crystal structure of human TEAD1 and disulfide-engineered YAP 提交 2014-09-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 50–171（122 aa）片段：TEAD BINDING DOMAIN (UNP RESIDUES 50-171)	突变：R87C, D93A, F96C, E100R	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；277 K；0.1M sodium acetate, 1.8M sodium formate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.20 Å R-free 0.248
4RE1 Crystal structure of human TEAD1 and disulfide-engineered YAP 提交 2014-09-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 50–171（122 aa）片段：TEAD BINDING DOMAIN (UNP RESIDUES 50-171)	突变：R87C, D93A, F96C, E100R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；277 K；0.1M sodium acetate, 1.8M sodium formate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.20 Å R-free 0.248
4REX Crystal structure of the first WW domain of human YAP2 isoform 提交 2014-09-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 165–209（45 aa）片段：WW domain (UNP residues 165-209)	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 5；293 K；1.5 M ammonium sulphate, 0.1 M sodium acetate, 100 mM proline, 5 mM NDSB-201 and 5mM MBCD, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.60 Å R-free 0.194
6G6X 14-3-3sigma in complex with a P129beta3P mutated YAP pS127 phosphopeptide 提交 2018-04-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 P 124–133（10 aa）	突变：Proline 129 to beta3-proline 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CL CHLORIDE ION × 8 NA SODIUM ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.095 M HEPES, pH 7.1, 29% PEG 400, 0.19 M CaCl2, 5% glycerol	分辨率 1.13 Å R-free 0.168
6G8P 14-3-3sigma in complex with a P129beta3P and L132beta3L mutated YAP pS127 phosphopeptide 提交 2018-04-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 P 124–133（10 aa）片段：UNP residues 124-133	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.095 M HEPES, pH 7.1, 29% PEG 400, 0.19 M CaCl2, 5% glycerol	分辨率 1.90 Å R-free 0.159
6G8Q 14-3-3sigma in complex with a A130beta3A and Q133beta3Q mutated YAP pS127 phosphopeptide 提交 2018-04-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 P 124–133（10 aa）片段：UNP residues 124-133	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CA CALCIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 4 NA SODIUM ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.095 M HEPES, pH 7.1, 29% PEG 400, 0.19 M CaCl2, 5% glycerol	分辨率 1.85 Å R-free 0.175
6GE3 X-ray structure of TEAD4 (wildtype) complexed with YAP (wildtype): The role of residual flexibility and water molecules in the adaptation of a bound intrinsically disordered protein to mutations at a binding interface 提交 2018-04-25	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 60–100（41 aa）	未记录	MYR MYRISTIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；16% PEG 3350,2% tacsimate, 0.1M NaCit, pH 5.6	分辨率 1.85 Å R-free 0.242
6GE4 TEAD4 (216-434);E263A COMPLEXED WITH YAP PEPTIDE (60-100) AND MYRISTOATE (COVALENTLY BOUND) AT 1.97A (P41212 CRYSTAL FORM); MYRISTOYLATION WAS DONE BY ADDING MYR-COA 提交 2018-04-25	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 60–100（41 aa）	未记录	MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；20% PEG 3350, 0.2M MgNitrate	分辨率 1.97 Å R-free 0.241
6GE5 TEAD4 (216-434);Y429F COMPLEXED WITH YAP PEPTIDE (60-100) AND MYRISTOATE (COVALENTLY BOUND) AT 2.05A (P41212 CRYSTAL FORM); MYRISTOYLATION WAS DONE BY ADDING MYR-COA 提交 2018-04-25	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 60–100（41 aa）	未记录	MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；298 K；20% PEG 3350, 8% Tacsimate	分辨率 2.05 Å R-free 0.238
6GE6 X-ray structure of TEAD4(E263A+Y429F mutant) complexed with YAP(wildtype): The role of residual flexibility and water molecules in the adaptation of a bound intrinsically disordered protein to mutations at a binding interface 提交 2018-04-25	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 60–100（41 aa）	未记录	MYR MYRISTIC ACID × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；2M ammonium sulfate, 0.1M Bis-TRIS	分辨率 1.80 Å R-free 0.238
6GEC TEAD4 (216-434) COMPLEXED WITH YAP PEPTIDE (60-100);S94A AND MYRISTOATE (COVALENTLY BOUND) AT 1.70A (P41212 CRYSTAL FORM); MYRISTOYLATION WAS DONE BY ADDING MYR-COA 提交 2018-04-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 60–99（40 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；20% PEG 3350, 0.2M NaTartrate	分辨率 1.70 Å R-free 0.242
6GEE TEAD4 (216-434);E263A COMPLEXED WITH YAP PEPTIDE (60-100); S94A AND MYRISTOATE (COVALENTLY BOUND) AT 1.96A (P41212 CRYSTAL FORM); MYRISTOYLATION WAS DONE BY ADDING MYR-COA 提交 2018-04-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 60–99（40 aa）	突变：S94A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；17% PEG 10000, 0.1M ammonium acetate, 0.1M Bis-TRIS	分辨率 1.96 Å R-free 0.245
6GEG TEAD4 (216-434);Y429F COMPLEXED WITH YAP PEPTIDE (60-100); S94A AND MYRISTOATE (COVALENTLY BOUND) AT 2.23A (P41212 CRYSTAL FORM); MYRISTOYLATION WAS DONE BY ADDING MYR-COA 提交 2018-04-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 60–99（40 aa）	突变：S94A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；20% PEG 3350, 0.2M Na tartrate	分辨率 2.23 Å R-free 0.236
6GEI TEAD4 (216-434);E263A+Y429F COMPLEXED WITH YAP PEPTIDE (60- 100);S94A AND MYRISTOATE (COVALENTLY BOUND TO LYS344, NOT CYS367!) AT 1.65A (P41212 CRYSTAL FORM); MYRISTOYLATION WAS DONE BY ADDING MYR-COA 提交 2018-04-26	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 60–100（41 aa）	突变：S94A 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MYR MYRISTIC ACID × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；20% PEG 3350, 0.2M Na acetate	分辨率 1.65 Å R-free 0.248
6GEK TEAD4 (216-434);Y429F COMPLEXED WITH YAP PEPTIDE (60-100) AND MYRISTOATE (COVALENTLY BOUND) AT 2.28A (P212121 CRYSTAL FORM); MYRISTOYLATION WAS DONE BY ADDING MYR-COA 提交 2018-04-26	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 60–100（41 aa）	未记录	MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；25% PEG 3350, 0.2M MgCl2, 0.1M Bis-TRIS	分辨率 2.28 Å R-free 0.246
6GEK TEAD4 (216-434);Y429F COMPLEXED WITH YAP PEPTIDE (60-100) AND MYRISTOATE (COVALENTLY BOUND) AT 2.28A (P212121 CRYSTAL FORM); MYRISTOYLATION WAS DONE BY ADDING MYR-COA 提交 2018-04-26	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 M 60–100（41 aa）	未记录	MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；298 K；25% PEG 3350, 0.2M MgCl2, 0.1M Bis-TRIS	分辨率 2.28 Å R-free 0.246
6HIK X-ray structure of TEAD4(Y429H) mutant) complexed with YAP (wildtype): Molecular and structural characterization of a TEAD mutation at the origin of Sveinsson's chorioretinal atrophy 提交 2018-08-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 60–99（40 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MYR MYRISTIC ACID × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；1.4M Na/K PO4	分辨率 1.65 Å R-free 0.237
6HIL X-ray structure of TEAD1(Y421H mutant) complexed with YAP(wildtype): Molecular and structural characterization of a TEAD mutation at the origin of Sveinsson's chorioretinal atrophy 提交 2018-08-30	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 60–100（41 aa）	未记录	MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；22% (w/v) PEG3350, 0.2M Na Malonate	分辨率 2.30 Å R-free 0.267
6HIL X-ray structure of TEAD1(Y421H mutant) complexed with YAP(wildtype): Molecular and structural characterization of a TEAD mutation at the origin of Sveinsson's chorioretinal atrophy 提交 2018-08-30	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 O 60–100（41 aa）	未记录	MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；22% (w/v) PEG3350, 0.2M Na Malonate	分辨率 2.30 Å R-free 0.267
6HIL X-ray structure of TEAD1(Y421H mutant) complexed with YAP(wildtype): Molecular and structural characterization of a TEAD mutation at the origin of Sveinsson's chorioretinal atrophy 提交 2018-08-30	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 M 60–100（41 aa）	未记录	MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；22% (w/v) PEG3350, 0.2M Na Malonate	分辨率 2.30 Å R-free 0.267
6HIL X-ray structure of TEAD1(Y421H mutant) complexed with YAP(wildtype): Molecular and structural characterization of a TEAD mutation at the origin of Sveinsson's chorioretinal atrophy 提交 2018-08-30	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 N 60–100（41 aa）	未记录	MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；22% (w/v) PEG3350, 0.2M Na Malonate	分辨率 2.30 Å R-free 0.267
6Q2X TEAD4 (216-434) COMPLEXED WITH YAP PEPTIDE (60-100) AND MYRISTOATE (COVALENTLY BOUND) AT 2.1A (P41212 CRYSTAL FORM) 提交 2018-12-03	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 L 60–100（41 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1 MYR MYRISTIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；16% PEG 3350,2% tacsimate, 0.1M NaCit	分辨率 2.10 Å R-free 0.253
8A8Q Crystal structure of Protein Scalloped in complex with YAP peptide 提交 2022-06-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 51–99（49 aa）链 D 51–99（49 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	ACT ACETATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M MES pH 6 20 % PEG8000 0.2 M sodium acetate trihydrate	分辨率 1.47 Å R-free 0.234
8A8R Crystal structure of TEAD4 in complex with YAP peptide 提交 2022-06-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 L 50–100（51 aa）链 M 50–100（51 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MYR MYRISTIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；50 mM sodium acetate trihydrate pH 4.6 50 mM magnesium acetate tetrahydrate 25% PEG400	分辨率 1.70 Å R-free 0.243
8WRG Solution structure of the TAD domain (450-504) of human transcriptional coactivator YAP1 提交 2023-10-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 450–504（55 aa）	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120；压力 1 NMR样品组成 0.95 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] YAP-TAD, 20 mM HEPES, 100 mM sodium chloride, 5 % v/v [U-99% 2H] D2O, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
9FZA TEAD1/YAP in complex with a reversible inhibitor N-[(4-phenoxyphenyl)methyl]imidazo[1,2-a]pyridine-3-carboxamide 提交 2024-07-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 51–110（60 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1 A1IHH ~{N}-[(4-phenoxyphenyl)methyl]imidazo[1,2-a]pyridine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；2M Sodium Formate, 0.1M Sodium Acetate pH 4.6	分辨率 2.21 Å R-free 0.262
9FZA TEAD1/YAP in complex with a reversible inhibitor N-[(4-phenoxyphenyl)methyl]imidazo[1,2-a]pyridine-3-carboxamide 提交 2024-07-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 51–110（60 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1 A1IHH ~{N}-[(4-phenoxyphenyl)methyl]imidazo[1,2-a]pyridine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；293 K；2M Sodium Formate, 0.1M Sodium Acetate pH 4.6	分辨率 2.21 Å R-free 0.262

共 31 个其他 PDB 条目、38 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	YAP1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–41； UniProt 60–100

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5oaq
沉积日期 deposition_date	2017-06-23
结构标题 title	TEAD4 COMPLEXED WITH YAP PEPTIDE AND MYRISTATE (COVALENTLY BOUND)
关键词 keywords	OTHER, TRANSCRIPTION; TRANSCRIPTION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	19.95 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	18.36 Å
零角强度 I(0) i0	13956600.00
分子量 molecular_weight	28597.0 kDa
排除体积 excluded_volume	36047 Å³
包络体积 envelope_volume	41970 Å³
水化壳体积 shell_volume	19120 Å³
包络直径 envelope_diameter	68.6 Å
壳层 Rg shell_rg	24.77 Å
包络 Rg envelope_rg	18.75 Å
形状 Rg shape_rg	18.36 Å
总 Rg total_rg	19.34 Å
总原子数 total_atoms	2016
残基数 n_residues	244
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	64.4 Å
Rg (实空间) rg_real	19.83 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.39 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.3960e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.8090e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	19.85 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	13960000.0000
解质量估计 total_estimate	0.6293
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	3
主峰位置 r_peak_primary	25.4 Å
偏度 Skewness skewness	0.168
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.372
角度范围 angular_range	— – 0.4000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	2632000.0000
实空间数据点数 n_real_points	72
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.851; Stabil: 0.999; Sysdev: 0.210; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Transcriptional enhancer factor TEF-3
分子量 formula_weight	25597.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	2172

GPRSVASSKLWMLEFSAFLEQQQDPDTYNKHLFVHIGQSSPSYSDPYLEAVDIRQIYDKFPEKKGGLKDLFERGPSNAFFLVKFWADLNTNIEDEGSSFYGVSSQYESPENMIITCSTKVCSFGKQVVEKVETEYARYENGHYSYRIHRSPLCEYMINFIHKLKHLPEKYMMNSVLENFTILQVVTNRDTQETLLCIAYVFEVSASEHGAQHHIYRLVKE

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Transcriptional coactivator YAP1
分子量 formula_weight	4650.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

DSETDLEALFNAVMNPKTANVPQTVPMRLRKLPDSFFKPPE

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	MYRISTIC ACID
分子量 formula_weight	228.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	115

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	5oaqA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	70 — Distorted Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Coagulation Factor XIII; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	80 —

结构域编号 domain_id	5oaqL01
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	20 — Other non-globular
拓扑 Topology topology	430 — Virus Scaffolding Protein; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	59.012 Å
晶胞边长 b length_b	59.012 Å
晶胞边长 c length_c	159.559 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 41 21 2
空间群编号 int_tables_number	92
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.950 Å
最低分辨率 resolution_low	19.750 Å
R 因子 r_factor	0.2304
R_work r_work	0.2293
R_free r_free	0.2521

fit	/app/data/saxs_computation/oa/5oaq/5oaq.fit
pddf	/app/data/pr_computation/oa/5oaq/5oaq.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/oa/5oaq/5oaq.dat

TEAD4 COMPLEXED WITH YAP PEPTIDE AND MYRISTATE (COVALENTLY BOUND)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transcriptional enhancer factor TEF-3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Transcriptional coactivator YAP1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)