SAXSdb — 5tby

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Myosin-7

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Myosin light chain 3 × 2 （P08590） Myosin regulatory light chain 2, ventricular/cardiac muscle isoform × 2 （P10916）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MYH7_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–1935； UniProt 1–1935 作者链 B； PDB构建体 1–1935； UniProt 1–1935

Myosin light chain 3

物种未注明

UniProt P08590

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Myosin-7 × 2 （P12883） Myosin regulatory light chain 2, ventricular/cardiac muscle isoform × 2 （P10916）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MYL3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–195； UniProt 1–195 作者链 D； PDB构建体 1–195； UniProt 1–195

Myosin regulatory light chain 2, ventricular/cardiac muscle isoform

物种未注明

UniProt P10916

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Myosin-7 × 2 （P12883） Myosin light chain 3 × 2 （P08590）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MLRV_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–166； UniProt 1–166 作者链 F； PDB构建体 1–166； UniProt 1–166

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5tby
沉积日期 deposition_date	2016-09-13
结构标题 title	HUMAN BETA CARDIAC HEAVY MEROMYOSIN INTERACTING-HEADS MOTIF OBTAINED BY HOMOLOGY MODELING (USING SWISS-MODEL) OF HUMAN SEQUENCE FROM APHONOPELMA HOMOLOGY MODEL (PDB-3JBH), RIGIDLY FITTED TO HUMAN BETA-CARDIAC NEGATIVELY STAINED THICK FILAMENT 3D-RECONSTRUCTION (EMD-2240)
关键词 keywords	;CONTRACTILE PROTEIN Hypertrophic or dilated cardiomyopathy beta-cardiac myosin II Myosin interacting-heads motif, CONTRACTILE PROTEIN ;; CONTRACTILE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5tby__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5tby__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5tby__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	55.07 Å
Rg（电子密度）	55.08 Å
总 Rg	55.18 Å
原子数	20357
残基数	2528
排除体积	363250 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5tby__assembly_1__model_1`	hexameric （6）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Myosin-7
分子量 formula_weight	223446.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	20357

MGDSEMAVFGAAAPYLRKSEKERLEAQTRPFDLKKDVFVPDDKQEFVKAKIVSREGGKVTAETEYGKTVTVKEDQVMQQNPPKFDKIEDMAMLTFLHEPAVLYNLKDRYGSWMIYTYSGLFCVTVNPYKWLPVYTPEVVAAYRGKKRSEAPPHIFSISDNAYQYMLTDRENQSILITGESGAGKTVNTKRVIQYFAVIAAIGDRSKKDQSPGKGTLEDQIIQANPALEAFGNAKTVRNDNSSRFGKFIRIHFGATGKLASADIETYLLEKSRVIFQLKAERDYHIFYQILSNKKPELLDMLLITNNPYDYAFISQGETTVASIDDAEELMATDNAFDVLGFTSEEKNSMYKLTGAIMHFGNMKFKLKQREEQAEPDGTEEADKSAYLMGLNSADLLKGLCHPRVKVGNEYVTKGQNVQQVIYATGALAKAVYERMFNWMVTRINATLETKQPRQYFIGVLDIAGFEIFDFNSFEQLCINFTNEKLQQFFNHHMFVLEQEEYKKEGIEWTFIDFGMDLQACIDLIEKPMGIMSILEEECMFPKATDMTFKAKLFDNHLGKSANFQKPRNIKGKPEAHFSLIHYAGIVDYNIIGWLQKNKDPLNETVVGLYQKSSLKLLSTLFANYAGADAPIEKGKGKAKKGSSFQTVSALHRENLNKLMTNLRSTHPHFVRCIIPNETKSPGVMDNPLVMHQLRCNGVLEGIRICRKGFPNRILYGDFRQRYRILNPAAIPEGQFIDSRKGAEKLLSSLDIDHNQYKFGHTKVFFKAGLLGLLEEMRDERLSRIITRIQAQSRGVLARMEYKKLLERRDSLLVIQWNIRAFMGVKNWPWMKLYFKIKPLLKSAEREKEMASMKEEFTRLKEALEKSEARRKELEEKMVSLLQEKNDLQLQVQAEQDNLADAEERCDQLIKNKIQLEAKVKEMNERLEDEEEMNAELTAKKRKLEDECSELKRDIDDLELTLAKVEKEKHATENKVKNLTEEMAGLDEIIAKLTKEKKALQEAHQQALDDLQAEEDKVNTLTKAKVKLEQQVDDLEGSLEQEKKVRMDLERAKRKLEGDLKLTQESIMDLENDKQQLDERLKKKDFELNALNARIEDEQALGSQLQKKLKELQARIEELEEELEAERTARAKVEKLRSDLSRELEEISERLEEAGGATSVQIEMNKKREAEFQKMRRDLEEATLQHEATAAALRKKHADSVAELGEQIDNLQRVKQKLEKEKSEFKLELDDVTSNMEQIIKAKANLEKMCRTLEDQMNEHRSKAEETQRSVNDLTSQRAKLQTENGELSRQLDEKEALISQLTRGKLTYTQQLEDLKRQLEEEVKAKNALAHALQSARHDCDLLREQYEEETEAKAELQRVLSKANSEVAQWRTKYETDAIQRTEELEEAKKKLAQRLQEAEEAVEAVNAKCSSLEKTKHRLQNEIEDLMVDVERSNAAAAALDKKQRNFDKILAEWKQKYEESQSELESSQKEARSLSTELFKLKNAYEESLEHLETFKRENKNLQEEISDLTEQLGSSGKTIHELEKVRKQLEAEKMELQSALEEAEASLEHEEGKILRAQLEFNQIKAEIERKLAEKDEEMEQAKRNHLRVVDSLQTSLDAETRSRNEALRVKKKMEGDLNEMEIQLSHANRMAAEAQKQVKSLQSLLKDTQIQLDDAVRANDDLKENIAIVERRNNLLQAELEELRAVVEQTERSRKLAEQELIETSERVQLLHSQNTSLINQKKKMDADLSQLQTEVEEAVQECRNAEEKAKKAITDAAMMAEELKKEQDTSAHLERMKKNMEQTIKDLQHRLDEAEQIALKGGKKQLQKLEARVRELENELEAEQKRNAESVKGMRKSERRIKELTYQTEEDRKNLLRLQDLVDKLQLKVKAYKRQAEEAEEQANTNLSKFRKVQHELDEAEERADIAESQVNKLRAKSRDIGTKGLNEE

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Myosin light chain 3
分子量 formula_weight	21962.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

MAPKKPEPKKDDAKAAPKAAPAPAPPPEPERPKEVEFDASKIKIEFTPEQIEEFKEAFMLFDRTPKCEMKITYGQCGDVLRALGQNPTQAEVLRVLGKPRQEELNTKMMDFETFLPMLQHISKNKDTGTYEDFVEGLRVFDKEGNGTVMGAELRHVLATLGERLTEDEVEKLMAGQEDSNGCINYEAFVKHIMSS

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Myosin regulatory light chain 2, ventricular/cardiac muscle isoform
分子量 formula_weight	18813.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F

MAPKKAKKRAGGANSNVFSMFEQTQIQEFKEAFTIMDQNRDGFIDKNDLRDTFAALGRVNVKNEEIDEMIKEAPGPINFTVFLTMFGEKLKGADPEETILNAFKVFDPEGKGVLKADYVREMLTTQAERFSKEEVDQMFAAFPPDVTGNLDYKNLVHIITHGEEKD

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7. 引用文献 (8)

Effects of myosin variants on interacting-heads motif explain distinct hypertrophic and dilated cardiomyopathy phenotypes.

Elife (2017)

PMID: 28606303 · DOI: 10.7554/eLife.24634 PRIMARY

;Conserved Intramolecular Interactions Maintain Myosin Interacting-Heads Motifs Explaining Tarantula Muscle Super-Relaxed State Structural Basis. ;

J. Mol. Biol. (2016)

PMID: 26851071 · DOI: 10.1016/j.jmb.2016.01.027

;Conserved Intramolecular Interactions Maintain Myosin Interacting-Heads Motifs Explaining Tarantula Muscle Super-Relaxed State Structural Basis. ;

J. Mol. Biol. (2016)

PMID: 26851071 · DOI: 10.1016/j.jmb.2016.01.027

Atomic model of the human cardiac muscle myosin filament.

Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. (2013)

PMID: 23251030 · DOI: 10.1073/pnas.1212708110

Three-dimensional reconstruction of tarantula myosin filaments suggests how phosphorylation may regulate myosin activity.

J. Mol. Biol. (2008)

PMID: 18951904 · DOI: 10.1016/j.jmb.2008.10.013

The SWISS-MODEL workspace: a web-based environment for protein structure homology modelling.

Bioinformatics (2006)

PMID: 16301204

SWISS-MODEL: An automated protein homology-modeling server.

Nucleic Acids Res. (2003)

PMID: 12824332

SWISS-MODEL and the Swiss-PdbViewer: an environment for comparative protein modeling.

Electrophoresis (1997)

PMID: 9504803

分辨率 resolution	20.000 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	20.00 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	10700

HUMAN BETA CARDIAC HEAVY MEROMYOSIN INTERACTING-HEADS MOTIF OBTAINED BY HOMOLOGY MODELING (USING SWISS-MODEL) OF HUMAN SEQUENCE FROM APHONOPELMA HOMOLOGY MODEL (PDB-3JBH), RIGIDLY FITTED TO HUMAN BETA-CARDIAC NEGATIVELY STAINED THICK FILAMENT 3D-RECONSTRUCTION (EMD-2240)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Myosin-7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Myosin light chain 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Myosin regulatory light chain 2, ventricular/cardiac muscle isoform

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5tby__assembly_1__model_1

5tby__assembly_1__model_1 | I(q)

5tby__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (8)

HUMAN BETA CARDIAC HEAVY MEROMYOSIN INTERACTING-HEADS MOTIF OBTAINED BY HOMOLOGY MODELING (USING SWISS-MODEL) OF HUMAN SEQUENCE FROM APHONOPELMA HOMOLOGY MODEL (PDB-3JBH), RIGIDLY FITTED TO HUMAN BETA-CARDIAC NEGATIVELY STAINED THICK FILAMENT 3D-RECONSTRUCTION (EMD-2240)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Myosin-7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Myosin light chain 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Myosin regulatory light chain 2, ventricular/cardiac muscle isoform

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5tby__assembly_1__model_1

5tby__assembly_1__model_1 | I(q)

5tby__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

7. 引用文献 (8)