SAXSdb — 5uj7

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Origin recognition complex subunit 1

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Origin recognition complex subunit 4 × 1 （O43929） Origin recognition complex subunit 5 × 1 （O43913） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MAGNESIUM ION × 2 POTASSIUM ION × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Origin recognition complex subunit 4 × 1 （O43929） Origin recognition complex subunit 5 × 1 （O43913） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MAGNESIUM ION × 2 POTASSIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ORC1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–391； UniProt 471–861 作者链 B； PDB构建体 1–391； UniProt 471–861

Origin recognition complex subunit 4

Homo sapiens

UniProt O43929

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Origin recognition complex subunit 1 × 1 （Q13415） Origin recognition complex subunit 5 × 1 （O43913） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MAGNESIUM ION × 2 POTASSIUM ION × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Origin recognition complex subunit 1 × 1 （Q13415） Origin recognition complex subunit 5 × 1 （O43913） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MAGNESIUM ION × 2 POTASSIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ORC4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–436； UniProt 1–436 作者链 D； PDB构建体 1–436； UniProt 1–436

Origin recognition complex subunit 5

Homo sapiens

UniProt O43913

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Origin recognition complex subunit 1 × 1 （Q13415） Origin recognition complex subunit 4 × 1 （O43929） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MAGNESIUM ION × 2 POTASSIUM ION × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Origin recognition complex subunit 1 × 1 （Q13415） Origin recognition complex subunit 4 × 1 （O43929） ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MAGNESIUM ION × 2 POTASSIUM ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ORC5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–284； UniProt 1–284 作者链 F； PDB构建体 1–284； UniProt 1–284

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5uj7
沉积日期 deposition_date	2017-01-17
结构标题 title	Structure of the active form of human Origin Recognition Complex ATPase motor module, complex subunitS 1, 4, 5
关键词 keywords	Replication, DNA-binding, AAA+ ATPase, DNA BINDING PROTEIN; DNA BINDING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5uj7__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5uj7__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5uj7__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	34.58 Å
Rg（电子密度）	34.25 Å
总 Rg	34.59 Å
原子数	7981
残基数	973
排除体积	142930 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5uj7__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`5uj7__assembly_2__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Origin recognition complex subunit 1
分子量 formula_weight	44179.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	15870

APQIRSRSLAAQEPASVLEEARLRLHVSAVPESLPCREQEFQDIYNFVESKLLDHTGGCMYISGVPGTGKTATVHEVIRCLQQAAQANDVPPFQYIEVNGMKLTEPHQVYVQILQKLTGQKATANHAAELLAKQFCTRGSPQETTVLLVDELDLLWTHKQDIMYNLFDWPTHKEARLVVLAIANTMDLPERIMMNRVSSRLGLTRMCFQPYTYSQLQQILRSRLKHLKAFEDDAIQLVARKVAALSGDARRCLDICRRATEICEFSQQKPDSPGLVTIAHSMEAVDEMFSSSYITAIKNSSVLEQSFLRAILAEFRRSGLEEATFQQIYSQHVALCRMEGLPYPTMSETMAVCSHLGSCRLLLVEPSRNDLLLRVRLNVSQDDVLYALKDE

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera aff. frugiperda 2 RZ-2014

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Origin recognition complex subunit 4
分子量 formula_weight	50443.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

MSSRKSKSNSLIHTECLSQVQRILRERFCRQSPHSNLFGVQVQYKHLSELLKRTALHGESNSVLIIGPRGSGKTMLINHALKELMEIEEVSENVLQVHLNGLLQINDKIALKEITRQLNLENVVGDKVFGSFAENLSFLLEALKKGDRTSSCPVIFILDEFDLFAHHKNQTLLYNLFDISQSAQTPIAVIGLTCRLDILELLEKRVKSRFSHRQIHLMNSFGFPQYVKIFKEQLSLPAEFPDKVFAEKWNENVQYLSEDRSVQEVLQKHFNISKNLRSLHMLLMLALNRVTASHPFMTAVDLMEASQLCSMDSKANIVHGLSVLEICLIIAMKHLNDIYEEEPFNFQMVYNEFQKFVQRKAHSVYNFEKPVVMKAFEHLQQLELIKPMERTSGNSQREYQLMKLLLDNTQIMNALQKYPNCPTDVRQWATSSLSWL

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera aff. frugiperda 2 RZ-2014

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Origin recognition complex subunit 5
分子量 formula_weight	33137.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,F

MPHLENVVLCRESQVSILQSLFGERHHFSFPSIFIYGHTASGKTYVTQTLLKTLELPHVFVNCVECFTLRLLLEQILNKLNHLSSSEDGCSTEITCETFNDFVRLFKQVTTAENLKDQTVYIVLDKAEYLRDMEANLLPGFLRLQELADRNVTVLFLSEIVWEKFRPNTGCFEPFVLYFPDYSIGNLQKILSHDHPPEYSADFYAAYINILLGVFYTVCRDLKELRHLAVLNFPKYCEPVVKGEASERDTRKLWRNIEPHLKKAMQTVYLREISSSQWEKLQKD

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera aff. frugiperda 2 RZ-2014

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	507.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	POTASSIUM ION
分子量 formula_weight	39.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	5uj7C01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	5uj7D01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

▶

晶胞边长 a length_a	120.887 Å
晶胞边长 b length_b	81.141 Å
晶胞边长 c length_c	151.947 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	97.25 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.394 Å
最低分辨率 resolution_low	19.882 Å
R 因子 r_factor	0.2450
R_work r_work	0.2421
R_free r_free	0.2811

Structure of the active form of human Origin Recognition Complex ATPase motor module, complex subunitS 1, 4, 5

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Origin recognition complex subunit 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Origin recognition complex subunit 4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Origin recognition complex subunit 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5uj7__assembly_1__model_1

5uj7__assembly_1__model_1 | I(q)

5uj7__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)

Structure of the active form of human Origin Recognition Complex ATPase motor module, complex subunitS 1, 4, 5

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Origin recognition complex subunit 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Origin recognition complex subunit 4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Origin recognition complex subunit 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5uj7__assembly_1__model_1

5uj7__assembly_1__model_1 | I(q)

5uj7__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)