5xte

Cryo-EM structure of human respiratory complex III (cytochrome bc1 complex)

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 181.5 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cytochrome b-c1 complex subunit 8

物种未注明

UniProt O14949

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 2–82 链 N; UniProt 2–82 未记录 Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial × 2 (P47985) Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial × 2 (P47985) Cytochrome b-c1 complex subunit 9 × 2 (Q9UDW1) Cytochrome b-c1 complex subunit 6, mitochondrial × 2 (P07919) Cytochrome b-c1 complex subunit 7 × 2 (P14927) Cytochrome b-c1 complex subunit 10 × 2 (O14957) Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial × 2 (P08574) Cytochrome b × 2 (P00156) Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial × 2 (P22695) Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial × 2 (P31930) CDL CARDIOLIPIN × 9 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 6 HEC HEME C × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 PLX (9R,11S)-9-({[(1S)-1-HYDROXYHEXADECYL]OXY}METHYL)-2,2-DIMETHYL-5,7,10-TRIOXA-2LAMBDA~5~-AZA-6LAMBDA~5~-PHOSPHAOCTACOSANE-6,6,11-TRIOL × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

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UniProt名称 QCR8_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–81; UniProt 2–82 作者链 N; PDB构建体 1–81; UniProt 2–82

Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial

物种未注明

UniProt P47985

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白拷贝数一致 链 B; UniProt 1–57 链 C; UniProt 79–274 链 O; UniProt 1–57 链 P; UniProt 79–274 片段:UNP RESIDUES 1-57 Cytochrome b-c1 complex subunit 8 × 2 (O14949) Cytochrome b-c1 complex subunit 9 × 2 (Q9UDW1) Cytochrome b-c1 complex subunit 6, mitochondrial × 2 (P07919) Cytochrome b-c1 complex subunit 7 × 2 (P14927) Cytochrome b-c1 complex subunit 10 × 2 (O14957) Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial × 2 (P08574) Cytochrome b × 2 (P00156) Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial × 2 (P22695) Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial × 2 (P31930) CDL CARDIOLIPIN × 9 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 6 HEC HEME C × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 PLX (9R,11S)-9-({[(1S)-1-HYDROXYHEXADECYL]OXY}METHYL)-2,2-DIMETHYL-5,7,10-TRIOXA-2LAMBDA~5~-AZA-6LAMBDA~5~-PHOSPHAOCTACOSANE-6,6,11-TRIOL × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 UCRI_HUMAN
Isoform
PDB实体 2, 3
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–57; UniProt 1–57 作者链 O; PDB构建体 1–57; UniProt 1–57 作者链 C; PDB构建体 1–196; UniProt 79–274 作者链 P; PDB构建体 1–196; UniProt 79–274

Cytochrome b-c1 complex subunit 9

物种未注明

UniProt Q9UDW1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白拷贝数一致 链 D; UniProt 2–63 链 Q; UniProt 2–63 未记录 Cytochrome b-c1 complex subunit 8 × 2 (O14949) Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial × 2 (P47985) Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial × 2 (P47985) Cytochrome b-c1 complex subunit 6, mitochondrial × 2 (P07919) Cytochrome b-c1 complex subunit 7 × 2 (P14927) Cytochrome b-c1 complex subunit 10 × 2 (O14957) Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial × 2 (P08574) Cytochrome b × 2 (P00156) Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial × 2 (P22695) Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial × 2 (P31930) CDL CARDIOLIPIN × 9 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 6 HEC HEME C × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 PLX (9R,11S)-9-({[(1S)-1-HYDROXYHEXADECYL]OXY}METHYL)-2,2-DIMETHYL-5,7,10-TRIOXA-2LAMBDA~5~-AZA-6LAMBDA~5~-PHOSPHAOCTACOSANE-6,6,11-TRIOL × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 QCR9_HUMAN
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–62; UniProt 2–63 作者链 Q; PDB构建体 1–62; UniProt 2–63

Cytochrome b-c1 complex subunit 6, mitochondrial

物种未注明

UniProt P07919

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白拷贝数一致 链 E; UniProt 17–91 链 R; UniProt 17–91 未记录 Cytochrome b-c1 complex subunit 8 × 2 (O14949) Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial × 2 (P47985) Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial × 2 (P47985) Cytochrome b-c1 complex subunit 9 × 2 (Q9UDW1) Cytochrome b-c1 complex subunit 7 × 2 (P14927) Cytochrome b-c1 complex subunit 10 × 2 (O14957) Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial × 2 (P08574) Cytochrome b × 2 (P00156) Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial × 2 (P22695) Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial × 2 (P31930) CDL CARDIOLIPIN × 9 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 6 HEC HEME C × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 PLX (9R,11S)-9-({[(1S)-1-HYDROXYHEXADECYL]OXY}METHYL)-2,2-DIMETHYL-5,7,10-TRIOXA-2LAMBDA~5~-AZA-6LAMBDA~5~-PHOSPHAOCTACOSANE-6,6,11-TRIOL × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

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UniProt名称 QCR6_HUMAN
Isoform
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–75; UniProt 17–91 作者链 R; PDB构建体 1–75; UniProt 17–91

Cytochrome b-c1 complex subunit 7

物种未注明

UniProt P14927

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白拷贝数一致 链 F; UniProt 6–111 链 S; UniProt 6–111 片段:UNP RESIDUES 6-111 Cytochrome b-c1 complex subunit 8 × 2 (O14949) Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial × 2 (P47985) Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial × 2 (P47985) Cytochrome b-c1 complex subunit 9 × 2 (Q9UDW1) Cytochrome b-c1 complex subunit 6, mitochondrial × 2 (P07919) Cytochrome b-c1 complex subunit 10 × 2 (O14957) Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial × 2 (P08574) Cytochrome b × 2 (P00156) Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial × 2 (P22695) Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial × 2 (P31930) CDL CARDIOLIPIN × 9 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 6 HEC HEME C × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 PLX (9R,11S)-9-({[(1S)-1-HYDROXYHEXADECYL]OXY}METHYL)-2,2-DIMETHYL-5,7,10-TRIOXA-2LAMBDA~5~-AZA-6LAMBDA~5~-PHOSPHAOCTACOSANE-6,6,11-TRIOL × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 QCR7_HUMAN
Isoform
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 1–106; UniProt 6–111 作者链 S; PDB构建体 1–106; UniProt 6–111

Cytochrome b-c1 complex subunit 10

物种未注明

UniProt O14957

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白拷贝数一致 链 G; UniProt 2–52 链 T; UniProt 2–52 片段:UNP RESIDUES 2-52 Cytochrome b-c1 complex subunit 8 × 2 (O14949) Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial × 2 (P47985) Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial × 2 (P47985) Cytochrome b-c1 complex subunit 9 × 2 (Q9UDW1) Cytochrome b-c1 complex subunit 6, mitochondrial × 2 (P07919) Cytochrome b-c1 complex subunit 7 × 2 (P14927) Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial × 2 (P08574) Cytochrome b × 2 (P00156) Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial × 2 (P22695) Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial × 2 (P31930) CDL CARDIOLIPIN × 9 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 6 HEC HEME C × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 PLX (9R,11S)-9-({[(1S)-1-HYDROXYHEXADECYL]OXY}METHYL)-2,2-DIMETHYL-5,7,10-TRIOXA-2LAMBDA~5~-AZA-6LAMBDA~5~-PHOSPHAOCTACOSANE-6,6,11-TRIOL × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

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UniProt名称 QCR10_HUMAN
Isoform
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–51; UniProt 2–52 作者链 T; PDB构建体 1–51; UniProt 2–52

Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial

物种未注明

UniProt P08574

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白拷贝数一致 链 H; UniProt 85–325 链 U; UniProt 85–325 未记录 Cytochrome b-c1 complex subunit 8 × 2 (O14949) Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial × 2 (P47985) Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial × 2 (P47985) Cytochrome b-c1 complex subunit 9 × 2 (Q9UDW1) Cytochrome b-c1 complex subunit 6, mitochondrial × 2 (P07919) Cytochrome b-c1 complex subunit 7 × 2 (P14927) Cytochrome b-c1 complex subunit 10 × 2 (O14957) Cytochrome b × 2 (P00156) Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial × 2 (P22695) Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial × 2 (P31930) CDL CARDIOLIPIN × 9 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 6 HEC HEME C × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 PLX (9R,11S)-9-({[(1S)-1-HYDROXYHEXADECYL]OXY}METHYL)-2,2-DIMETHYL-5,7,10-TRIOXA-2LAMBDA~5~-AZA-6LAMBDA~5~-PHOSPHAOCTACOSANE-6,6,11-TRIOL × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

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UniProt名称 CY1_HUMAN
Isoform
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–241; UniProt 85–325 作者链 U; PDB构建体 1–241; UniProt 85–325

Cytochrome b

物种未注明

UniProt P00156

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白拷贝数一致 链 J; UniProt 2–379 链 V; UniProt 2–379 未记录 Cytochrome b-c1 complex subunit 8 × 2 (O14949) Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial × 2 (P47985) Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial × 2 (P47985) Cytochrome b-c1 complex subunit 9 × 2 (Q9UDW1) Cytochrome b-c1 complex subunit 6, mitochondrial × 2 (P07919) Cytochrome b-c1 complex subunit 7 × 2 (P14927) Cytochrome b-c1 complex subunit 10 × 2 (O14957) Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial × 2 (P08574) Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial × 2 (P22695) Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial × 2 (P31930) CDL CARDIOLIPIN × 9 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 6 HEC HEME C × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 PLX (9R,11S)-9-({[(1S)-1-HYDROXYHEXADECYL]OXY}METHYL)-2,2-DIMETHYL-5,7,10-TRIOXA-2LAMBDA~5~-AZA-6LAMBDA~5~-PHOSPHAOCTACOSANE-6,6,11-TRIOL × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

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UniProt名称 CYB_HUMAN
Isoform
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 J; PDB构建体 1–378; UniProt 2–379 作者链 V; PDB构建体 1–378; UniProt 2–379

Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial

物种未注明

UniProt P22695

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白拷贝数一致 链 K; UniProt 35–453 链 W; UniProt 35–453 片段:UNP RESIDUES 35-453 Cytochrome b-c1 complex subunit 8 × 2 (O14949) Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial × 2 (P47985) Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial × 2 (P47985) Cytochrome b-c1 complex subunit 9 × 2 (Q9UDW1) Cytochrome b-c1 complex subunit 6, mitochondrial × 2 (P07919) Cytochrome b-c1 complex subunit 7 × 2 (P14927) Cytochrome b-c1 complex subunit 10 × 2 (O14957) Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial × 2 (P08574) Cytochrome b × 2 (P00156) Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial × 2 (P31930) CDL CARDIOLIPIN × 9 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 6 HEC HEME C × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 PLX (9R,11S)-9-({[(1S)-1-HYDROXYHEXADECYL]OXY}METHYL)-2,2-DIMETHYL-5,7,10-TRIOXA-2LAMBDA~5~-AZA-6LAMBDA~5~-PHOSPHAOCTACOSANE-6,6,11-TRIOL × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

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UniProt名称 QCR2_HUMAN
Isoform
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 K; PDB构建体 1–419; UniProt 35–453 作者链 W; PDB构建体 1–419; UniProt 35–453

Cytochrome b-c1 complex subunit 1, mitochondrial

物种未注明

UniProt P31930

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 22 PDB 声明:22-meric(22) 与蛋白拷贝数一致 链 L; UniProt 35–480 链 Y; UniProt 35–480 未记录 Cytochrome b-c1 complex subunit 8 × 2 (O14949) Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial × 2 (P47985) Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial × 2 (P47985) Cytochrome b-c1 complex subunit 9 × 2 (Q9UDW1) Cytochrome b-c1 complex subunit 6, mitochondrial × 2 (P07919) Cytochrome b-c1 complex subunit 7 × 2 (P14927) Cytochrome b-c1 complex subunit 10 × 2 (O14957) Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial × 2 (P08574) Cytochrome b × 2 (P00156) Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial × 2 (P22695) CDL CARDIOLIPIN × 9 FES FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER × 2 PEE 1,2-dioleoyl-sn-glycero-3-phosphoethanolamine × 6 HEC HEME C × 2 HEM PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 PLX (9R,11S)-9-({[(1S)-1-HYDROXYHEXADECYL]OXY}METHYL)-2,2-DIMETHYL-5,7,10-TRIOXA-2LAMBDA~5~-AZA-6LAMBDA~5~-PHOSPHAOCTACOSANE-6,6,11-TRIOL × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 QCR1_HUMAN
Isoform
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 L; PDB构建体 1–446; UniProt 35–480 作者链 Y; PDB构建体 1–446; UniProt 35–480

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 5xte

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 5xte
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5xte
沉积日期 deposition_date2017-06-19
结构标题 titleCryo-EM structure of human respiratory complex III (cytochrome bc1 complex)
关键词 keywordsRespiratory, OXIDOREDUCTASE-ELECTRON TRANSPORT complex; OXIDOREDUCTASE/ELECTRON TRANSPORT
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier55.44
回转半径 Rg (电子) rg_electron54.28
零角强度 I(0) i03180370000.00
分子量 molecular_weight490030.0 kDa
排除体积 excluded_volume619660 ų
包络体积 envelope_volume869780 ų
水化壳体积 shell_volume128780 ų
包络直径 envelope_diameter179.2
壳层 Rg shell_rg60.27
包络 Rg envelope_rg53.48
形状 Rg shape_rg54.29
总 Rg total_rg54.38
总原子数 total_atoms34492
残基数 n_residues4222
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax181.5
Rg (实空间) rg_real55.32
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.95
I(0) (实空间) i0_real3.1800e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error6.4380e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal55.53
I(0) (倒空间) i0_reciprocal3181000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8832
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary64.8
偏度 Skewness skewness0.239
峰度 Kurtosis kurtosis-0.545
角度范围 angular_range— – 0.1400 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha383300000.0000
实空间数据点数 n_real_points29
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.890; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.988; Smooth: 0.818

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (17)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 30 domains

CATH v4.4 (30 domains)

结构域编号 domain_id5xteA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily210 — Cytochrome b-c1 complex subunit 8
结构域编号 domain_id5xteB00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology210 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain I
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain I
结构域编号 domain_id5xteC01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily270 — Ubiquinol cytochrome reductase, transmembrane domain
结构域编号 domain_id5xteC02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture102 — 3-layer Sandwich
拓扑 Topology topology10 — Rieske Iron-sulfur Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Rieske [2Fe-2S] iron-sulphur domain
结构域编号 domain_id5xteD00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily260 — Cytochrome b-c1 complex subunit 9
结构域编号 domain_id5xteE00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge domain
结构域编号 domain_id5xteF00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology1090 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain F
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cytochrome b-c1 complex subunit 7
结构域编号 domain_id5xteG00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily220
结构域编号 domain_id5xteH01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology760 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain D, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cytochrome c-like domain
结构域编号 domain_id5xteH02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100 — Cytochrome c1, transmembrane anchor, C-terminal
结构域编号 domain_id5xteJ00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology810 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain C
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain C
结构域编号 domain_id5xteK01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology830 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like
结构域编号 domain_id5xteK02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology830 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like
结构域编号 domain_id5xteL01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology830 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like
结构域编号 domain_id5xteL02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology830 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like
结构域编号 domain_id5xteN00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily210 — Cytochrome b-c1 complex subunit 8
结构域编号 domain_id5xteO00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology210 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain I
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain I
结构域编号 domain_id5xteP01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily270 — Ubiquinol cytochrome reductase, transmembrane domain
结构域编号 domain_id5xteP02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture102 — 3-layer Sandwich
拓扑 Topology topology10 — Rieske Iron-sulfur Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Rieske [2Fe-2S] iron-sulphur domain
结构域编号 domain_id5xteQ00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily260 — Cytochrome b-c1 complex subunit 9
结构域编号 domain_id5xteR00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Ubiquinol-cytochrome C reductase hinge domain
结构域编号 domain_id5xteS00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology1090 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain F
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cytochrome b-c1 complex subunit 7
结构域编号 domain_id5xteT00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily220
结构域编号 domain_id5xteU01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology760 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain D, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cytochrome c-like domain
结构域编号 domain_id5xteU02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100 — Cytochrome c1, transmembrane anchor, C-terminal
结构域编号 domain_id5xteV00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology810 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain C
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain C
结构域编号 domain_id5xteW01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology830 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like
结构域编号 domain_id5xteW02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology830 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like
结构域编号 domain_id5xteY01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology830 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like
结构域编号 domain_id5xteY02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology830 — Cytochrome Bc1 Complex; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Metalloenzyme, LuxS/M16 peptidase-like

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)