6ahu

Cryo-EM structure of human Ribonuclease P with mature tRNA

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 11 RNA 2	H1 RNA × 1 Ribonuclease P protein subunit p38 × 1 （P78345） Ribonuclease P protein subunit p29 × 1 （O95707） Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5 × 1 （Q969H6） Ribonuclease P protein subunit p25 × 1 （Q9BUL9） Ribonuclease P protein subunit p20 × 1 （O75817） Ribonuclease P protein subunit p14 × 1 （O95059） Ribonuclease P protein subunit p30 × 2 （P78346） Ribonuclease P protein subunit p21 × 1 （Q9H633） Ribonuclease P protein subunit p40 × 1 （O75818） tRNA × 1 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	POP1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–1024； UniProt 1–1024

Ribonuclease P protein subunit p38

物种未注明

UniProt P78345

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 11 RNA 2	H1 RNA × 1 Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1 × 1 （Q99575） Ribonuclease P protein subunit p29 × 1 （O95707） Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5 × 1 （Q969H6） Ribonuclease P protein subunit p25 × 1 （Q9BUL9） Ribonuclease P protein subunit p20 × 1 （O75817） Ribonuclease P protein subunit p14 × 1 （O95059） Ribonuclease P protein subunit p30 × 2 （P78346） Ribonuclease P protein subunit p21 × 1 （Q9H633） Ribonuclease P protein subunit p40 × 1 （O75818） tRNA × 1 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPP38_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–283； UniProt 1–283

Ribonuclease P protein subunit p29

物种未注明

UniProt O95707

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 11 RNA 2	H1 RNA × 1 Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1 × 1 （Q99575） Ribonuclease P protein subunit p38 × 1 （P78345） Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5 × 1 （Q969H6） Ribonuclease P protein subunit p25 × 1 （Q9BUL9） Ribonuclease P protein subunit p20 × 1 （O75817） Ribonuclease P protein subunit p14 × 1 （O95059） Ribonuclease P protein subunit p30 × 2 （P78346） Ribonuclease P protein subunit p21 × 1 （Q9H633） Ribonuclease P protein subunit p40 × 1 （O75818） tRNA × 1 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPP29_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–220； UniProt 1–220

Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5

物种未注明

UniProt Q969H6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 11 RNA 2	H1 RNA × 1 Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1 × 1 （Q99575） Ribonuclease P protein subunit p38 × 1 （P78345） Ribonuclease P protein subunit p29 × 1 （O95707） Ribonuclease P protein subunit p25 × 1 （Q9BUL9） Ribonuclease P protein subunit p20 × 1 （O75817） Ribonuclease P protein subunit p14 × 1 （O95059） Ribonuclease P protein subunit p30 × 2 （P78346） Ribonuclease P protein subunit p21 × 1 （Q9H633） Ribonuclease P protein subunit p40 × 1 （O75818） tRNA × 1 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	POP5_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–163； UniProt 1–163

Ribonuclease P protein subunit p25

物种未注明

UniProt Q9BUL9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 11 RNA 2	H1 RNA × 1 Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1 × 1 （Q99575） Ribonuclease P protein subunit p38 × 1 （P78345） Ribonuclease P protein subunit p29 × 1 （O95707） Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5 × 1 （Q969H6） Ribonuclease P protein subunit p20 × 1 （O75817） Ribonuclease P protein subunit p14 × 1 （O95059） Ribonuclease P protein subunit p30 × 2 （P78346） Ribonuclease P protein subunit p21 × 1 （Q9H633） Ribonuclease P protein subunit p40 × 1 （O75818） tRNA × 1 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPP25_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–199； UniProt 1–199

Ribonuclease P protein subunit p20

物种未注明

UniProt O75817

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 11 RNA 2	H1 RNA × 1 Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1 × 1 （Q99575） Ribonuclease P protein subunit p38 × 1 （P78345） Ribonuclease P protein subunit p29 × 1 （O95707） Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5 × 1 （Q969H6） Ribonuclease P protein subunit p25 × 1 （Q9BUL9） Ribonuclease P protein subunit p14 × 1 （O95059） Ribonuclease P protein subunit p30 × 2 （P78346） Ribonuclease P protein subunit p21 × 1 （Q9H633） Ribonuclease P protein subunit p40 × 1 （O75818） tRNA × 1 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	POP7_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140

Ribonuclease P protein subunit p14

物种未注明

UniProt O95059

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 11 RNA 2	H1 RNA × 1 Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1 × 1 （Q99575） Ribonuclease P protein subunit p38 × 1 （P78345） Ribonuclease P protein subunit p29 × 1 （O95707） Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5 × 1 （Q969H6） Ribonuclease P protein subunit p25 × 1 （Q9BUL9） Ribonuclease P protein subunit p20 × 1 （O75817） Ribonuclease P protein subunit p30 × 2 （P78346） Ribonuclease P protein subunit p21 × 1 （Q9H633） Ribonuclease P protein subunit p40 × 1 （O75818） tRNA × 1 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPP14_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–124； UniProt 1–124

Ribonuclease P protein subunit p30

物种未注明

UniProt P78346

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 11 RNA 2	H1 RNA × 1 Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1 × 1 （Q99575） Ribonuclease P protein subunit p38 × 1 （P78345） Ribonuclease P protein subunit p29 × 1 （O95707） Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5 × 1 （Q969H6） Ribonuclease P protein subunit p25 × 1 （Q9BUL9） Ribonuclease P protein subunit p20 × 1 （O75817） Ribonuclease P protein subunit p14 × 1 （O95059） Ribonuclease P protein subunit p21 × 1 （Q9H633） Ribonuclease P protein subunit p40 × 1 （O75818） tRNA × 1 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPP30_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–268； UniProt 1–268 作者链 J； PDB构建体 1–268； UniProt 1–268

Ribonuclease P protein subunit p21

物种未注明

UniProt Q9H633

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 11 RNA 2	H1 RNA × 1 Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1 × 1 （Q99575） Ribonuclease P protein subunit p38 × 1 （P78345） Ribonuclease P protein subunit p29 × 1 （O95707） Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5 × 1 （Q969H6） Ribonuclease P protein subunit p25 × 1 （Q9BUL9） Ribonuclease P protein subunit p20 × 1 （O75817） Ribonuclease P protein subunit p14 × 1 （O95059） Ribonuclease P protein subunit p30 × 2 （P78346） Ribonuclease P protein subunit p40 × 1 （O75818） tRNA × 1 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPP21_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–154； UniProt 1–154

Ribonuclease P protein subunit p40

物种未注明

UniProt O75818

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 11 RNA 2	H1 RNA × 1 Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1 × 1 （Q99575） Ribonuclease P protein subunit p38 × 1 （P78345） Ribonuclease P protein subunit p29 × 1 （O95707） Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5 × 1 （Q969H6） Ribonuclease P protein subunit p25 × 1 （Q9BUL9） Ribonuclease P protein subunit p20 × 1 （O75817） Ribonuclease P protein subunit p14 × 1 （O95059） Ribonuclease P protein subunit p30 × 2 （P78346） Ribonuclease P protein subunit p21 × 1 （Q9H633） tRNA × 1 ZINC ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPP40_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–363； UniProt 1–363

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6ahu
沉积日期 deposition_date	2018-08-20
结构标题 title	Cryo-EM structure of human Ribonuclease P with mature tRNA
关键词 keywords	Ribonuclease P, RNA-protein complex, HYDROLASE-RNA complex; HYDROLASE/RNA
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6ahu__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6ahu__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6ahu__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	52.86 Å
Rg（电子密度）	53.11 Å
总 Rg	53.27 Å
原子数	29386
残基数	3008
排除体积	493630 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6ahu__assembly_1__model_1`	tridecameric （13）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (13)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	H1 RNA
分子量 formula_weight	110244.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	29386

AUAGGGCGGAGGGAAGCUCAUCAGUGGGGCCACGAGCUGAGUGCGUCCUGUCACUCCACUCCCAUGUCCCUUGGGAAGGUCUGAGACUAGGGCCAGAGGCGGCCCUAACAGGGCUCUCCCUGAGCUUCGGGGAGGUGAGUUCCCAGAGAACGGGGCUCCGCGCGAGGUCAGACUGGGCAGGAGAUGCCGUGGACCCCGCCCUUCGGGGAGGGGCCCGGCGGAUGCCUCCUUUGCCGGAGCUUGGAACAGACUCACGGCCAGCGAAGUGAGUUCAAUGGCUGAGGUGAGGUACCCCGCAGGGGACCUCAUAACCCAAUUCAGACUACUCUCCUCCGCCCAUU

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1
分子量 formula_weight	114896.1 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.26.5
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MSNAKERKHAKKMRNQPTNVTLSSGFVADRGVKHHSGGEKPFQAQKQEPHPGTSRQRQTRVNPHSLPDPEVNEQSSSKGMFRKKGGWKAGPEGTSQEIPKYITASTFAQARAAEISAMLKAVTQKSSNSLVFQTLPRHMRRRAMSHNVKRLPRRLQEIAQKEAEKAVHQKKEHSKNKCHKARRCHMNRTLEFNRRQKKNIWLETHIWHAKRFHMVKKWGYCLGERPTVKSHRACYRAMTNRCLLQDLSYYCCLELKGKEEEILKALSGMCNIDTGLTFAAVHCLSGKRQGSLVLYRVNKYPREMLGPVTFIWKSQRTPGDPSESRQLWIWLHPTLKQDILEEIKAACQCVEPIKSAVCIADPLPTPSQEKSQTELPDEKIGKKRKRKDDGENAKPIKKIIGDGTRDPCLPYSWISPTTGIIISDLTMEMNRFRLIGPLSHSILTEAIKAASVHTVGEDTEETPHRWWIETCKKPDSVSLHCRQEAIFELLGGITSPAEIPAGTILGLTVGDPRINLPQKKSKALPNPEKCQDNEKVRQLLLEGVPVECTHSFIWNQDICKSVTENKISDQDLNRMRSELLVPGSQLILGPHESKIPILLIQQPGKVTGEDRLGWGSGWDVLLPKGWGMAFWIPFIYRGVRVGGLKESAVHSQYKRSPNVPGDFPDCPAGMLFAEEQAKNLLEKYKRRPPAKRPNYVKLGTLAPFCCPWEQLTQDWESRVQAYEEPSVASSPNGKESDLRRSEVPCAPMPKKTHQPSDEVGTSIEHPREAEEVMDAGCQESAGPERITDQEASENHVAATGSHLCVLRSRKLLKQLSAWCGPSSEDSRGGRRAPGRGQQGLTREACLSILGHFPRALVWVSLSLLSKGSPEPHTMICVPAKEDFLQLHEDWHYCGPQESKHSDPFRSKILKQKEKKKREKRQKPGRASSDGPAGEEPVAGQEALTLGLWSGPLPRVTLHCSRTLLGFVTQGDFSMAVGCGEALGFVSLTGLLDMLSSQPAAQRGLVLLRPPASLQYRFARIAIEV

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Ribonuclease P protein subunit p38
分子量 formula_weight	31891.4 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.26.5
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MAAAPQAPGRGSLRKTRPLVVKTSLNNPYIIRWSALESEDMHFILQTLEDRLKAIGLQKIEDKKKKNKTPFLKKESREKCSIAVDISENLKEKKTDAKQQVSGWTPAHVRKQLAIGVNEVTRALERRELLLVLVCKSVKPAMITSHLIQLSLSRSVPACQVPRLSERIAPVIGLKCVLALAFKKNTTDFVDEVRAIIPRVPSLSVPWLQDRIEDSGENLETEPLESQDRELLDTSFEDLSKPKRKLADGRQASVTLQPLKIKKLIPNPNKIRKPPKSKKATPK

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Ribonuclease P protein subunit p29
分子量 formula_weight	25474.9 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.26.5
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MKSVIYHALSQKEANDSDVQPSGAQRAEAFVRAFLKRSTPRMSPQAREDQLQRKAVVLEYFTRHKRKEKKKKAKGLSARQRRELRLFDIKPEQQRYSLFLPLHELWKQYIRDLCSGLKPDTQPQMIQAKLLKADLHGAIISVTKSKCPSYVGITGILLQETKHIFKIITKEDRLKVIPKLNCVFTVETDGFISYIYGSKFQLRSSERSAKKFKAKGTIDL

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5
分子量 formula_weight	18844.7 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.26.5
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MVRFKHRYLLCELVSDDPRCRLSLDDRVLSSLVRDTIARVHGTFGAAACSIGFAVRYLNAYTGIVLLRCRKEFYQLVWSALPFITYLENKGHRYPCFFNTLHVGGTIRTCQKFLIQYNRRQLLILLQNCTDEGEREAIQKSVTRSCLLEEEEESGEEAAEAME

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Ribonuclease P protein subunit p25
分子量 formula_weight	20659.4 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.26.5
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MENFRKVRSEEAPAGCGAEGGGPGSGPFADLAPGAVHMRVKEGSKIRNLMAFATASMAQPATRAIVFSGCGRATTKTVTCAEILKRRLAGLHQVTRLRYRSVREVWQSLPPGPTQGQTPGEPAASLSVLKNVPGLAILLSKDALDPRQPGYQPPNPHPGPSSPPAAPASKRSLGEPAAGEGSAKRSQPEPGVADEDQTA

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Ribonuclease P protein subunit p20
分子量 formula_weight	15672.9 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.26.5
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MAENREPRGAVEAELDPVEYTLRKRLPSRLPRRPNDIYVNMKTDFKAQLARCQKLLDGGARGQNACSEIYIHGLGLAINRAINIALQLQAGSFGSLQVAANTSTVELVDELEPETDTREPLTRIRNNSAIHIRVFRVTPK

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Ribonuclease P protein subunit p14
分子量 formula_weight	13707.0 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.26.5
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MPAPAATYERVVYKNPSEYHYMKVCLEFQDCGVGLNAAQFKQLLISAVKDLFGEVDAALPLDILTYEEKTLSAILRICSSGLVKLWSSLTLLGSYKGKKCAFRVIQVSPFLLALSGNSRELVLD

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Ribonuclease P protein subunit p30
分子量 formula_weight	29364.3 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.26.5
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,J

MAVFADLDLRAGSDLKALRGLVETAAHLGYSVVAINHIVDFKEKKQEIEKPVAVSELFTTLPIVQGKSRPIKILTRLTIIVSDPSHCNVLRATSSRARLYDVVAVFPKTEKLFHIACTHLDVDLVCITVTEKLPFYFKRPPINVAIDRGLAFELVYSPAIKDSTMRRYTISSALNLMQICKGKNVIISSAAERPLEIRGPYDVANLGLLFGLSESDAKAAVSTNCRAALLHGETRKTAFGIISTVKKPRPSEGDEDCLPASKKAKCEG

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Ribonuclease P protein subunit p21
分子量 formula_weight	17596.1 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.26.5
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MAGPVKDREAFQRLNFLYQAAHCVLAQDPENQALARFYCYTERTIAKRLVLRRDPSVKRTLCRGCSSLLVPGLTCTQRQRRCRGQRWTVQTCLTCQRSQRFLNDPGHLLWGDRPEAQLGSQADSKPLQPLPNTAHSISDRLPEEKMQTQGSSNQ

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Ribonuclease P protein subunit p40
分子量 formula_weight	41884.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.1.26.5
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MATLRRLREAPRHLLVCEKSNFGNHKSRHRHLVQTHYYNYRVSFLIPECGILSEELKNLVMNTGPYYFVKNLPLHELITPEFISTFIKKGSCYALTYNTHIDEDNTVALLPNGKLILSLDKDTYEETGLQGHPSQFSGRKIMKFIVSIDLMELSLNLDSKKYERISWSFKEKKPLKFDFLLAWHKTGSEESTMMSYFSKYQIQEHQPKVALSTLRDLQCPVLQSSELEGTPEVSCRALELFDWLGAVFSNVDLNNEPNNFISTYCCPEPSTVVAKAYLCTITGFILPEKICLLLEHLCHYFDEPKLAPWVTLSVQGFADSPVSWEKNEHGFRKGGEHLYNFVIFNNQDYWLQMAVGANDHCPP

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	tRNA
分子量 formula_weight	23168.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	T

GUUUCCGUAGUGUAGUGGUUAUCACGUUCGCCUAACACGCGAAAGGUCCCCGGUUCGAAACCGGGCGGAAAC

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 13 Entity 13 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	6ahuH01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	3250 — Ribonuclease P, Pop5 subunit

结构域编号 domain_id	6ahuI01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology	20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Metal-dependent hydrolases

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.66 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	287700

Cryo-EM structure of human Ribonuclease P with mature tRNA

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Ribonuclease P protein subunit p38

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Ribonuclease P protein subunit p29

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Ribonuclease P protein subunit p25

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Ribonuclease P protein subunit p20

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Ribonuclease P protein subunit p14

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Ribonuclease P protein subunit p30

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Ribonuclease P protein subunit p21

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Ribonuclease P protein subunit p40

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体