Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 单体 | 蛋白 1 DNA 2 | ;DNA (5'-D(CP*AP*AP*AP*AP*TP*GP*TP*AP*AP*AP*CP*AP*AP*GP*A)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(TP*CP*TP*TP*GP*TP*TP*TP*AP*CP*AP*TP*TP*TP*TP*G)-3') ; × 1 MAGNESIUM ION × 1 water × 2 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | FOXC2_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 3 |
| 链与序列区间 | 作者链 C； PDB构建体 3–103； UniProt 72–172 |
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| 条目编号 entry_id | 6ako |
| 沉积日期 deposition_date | 2018-09-03 |
| 结构标题 title | Crystal Structure of FOXC2 DBD Bound to DBE2 DNA |
| 关键词 keywords | FOXC; DNA binding domain; DNA recognition; Crystal Structure; Lymphoedema distichiasis syndrome, DNA BINDING PROTEIN-DNA complex; DNA BINDING PROTEIN/DNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 17.79 Å |
| Rg（电子密度） | 16.63 Å |
| 总 Rg | 17.57 Å |
| 原子数 | 1463 |
| 残基数 | 129 |
| 排除体积 | 24026 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d6akoc1 |
| 类 Class class | a — All alpha proteins |
| 折叠类型 Fold fold | a.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle |
| 超家族 Superfamily superfamily | a.4.5 — 'Winged helix' DNA-binding domain |
| 家族 Family family | a.4.5.14 — Forkhead DNA-binding domain |
| 结构域编号 domain_id | d6akoc2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | 6akoC00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 10 — Arc Repressor Mutant, subunit A |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain |