SAXSdb — 6bnv

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Unconventional myosin-VI

Sus scrofa

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 20	Actin, alpha skeletal muscle × 8 （P68135） Calmodulin × 6 （P62149）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	F1RQI7_PIG
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–816； UniProt 2–817 作者链 J； PDB构建体 1–816； UniProt 2–817 作者链 K； PDB构建体 1–816； UniProt 2–817 作者链 L； PDB构建体 1–816； UniProt 2–817 作者链 M； PDB构建体 1–816； UniProt 2–817 作者链 N； PDB构建体 1–816； UniProt 2–817

Actin, alpha skeletal muscle

物种未注明

UniProt P68135

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 20	Unconventional myosin-VI × 6 （F1RQI7） Calmodulin × 6 （P62149）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ACTS_RABIT
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–373； UniProt 1–373 作者链 B； PDB构建体 1–373； UniProt 1–373 作者链 C； PDB构建体 1–373； UniProt 1–373 作者链 D； PDB构建体 1–373； UniProt 1–373 作者链 E； PDB构建体 1–373； UniProt 1–373 作者链 F； PDB构建体 1–373； UniProt 1–373 作者链 G； PDB构建体 1–373； UniProt 1–373 作者链 H； PDB构建体 1–373； UniProt 1–373

Calmodulin

Gallus gallus

UniProt P62149

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 20	Unconventional myosin-VI × 6 （F1RQI7） Actin, alpha skeletal muscle × 8 （P68135）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CALM_CHICK
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–145； UniProt 4–148 作者链 P； PDB构建体 1–145； UniProt 4–148 作者链 Q； PDB构建体 1–145； UniProt 4–148 作者链 R； PDB构建体 1–145； UniProt 4–148 作者链 S； PDB构建体 1–145； UniProt 4–148 作者链 T； PDB构建体 1–145； UniProt 4–148

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6bnv
沉积日期 deposition_date	2017-11-17
结构标题 title	CryoEM structure of MyosinVI-actin complex in the rigor (nucleotide-free) state, backbone-averaged with side chains truncated to alanine
关键词 keywords	Cytoskeleton, Filament, complex, CONTRACTILE PROTEIN; CONTRACTILE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6bnv__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6bnv__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6bnv__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	86.70 Å
Rg（电子密度）	86.75 Å
总 Rg	86.67 Å
原子数	42360
残基数	8588
排除体积	681980 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6bnv__assembly_1__model_1`	eicosameric （20）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Unconventional myosin-VI
分子量 formula_weight	93207.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,J,K,L,M,N
原子数 atom_count	42360

EDGKPVWAPHPTDGFQVGNIVDIGPDSLTIEPLNQKGKTFLALINQVFPAEEDSKKDVEDNCSLMYLNEATLLHNIKVRYSKDRIYTYVANILIAVNPYFDIPKIYSSETIKSYQGKSLGTMPPHVFAIADKAFRDMKVLKLSQSIIVSGESGAGKTENTKFVLRYLTESYGTGQDIDDRIVEANPLLEAFGNAKTVRNNNSSRFGKFVEIHFNEKSSVVGGFVSHYLLEKSRICVQGKEERNYHIFYRLCAGASEDIRERLHLSSPDNFRYLNRGCTRYFANKETDKQILQNRKSPEYLKAGSLKDPLLDDHGDFIRMCTAMKKIGLDDEEKLDLFRVVAGVLHLGNIDFEEAGSTSGGCNLKNKSTQALEYCAELLGLDQDDLRVSLTTRVMLTTAGGAKGTVIKVPLKVEQANNARDALAKTVYSHLFDHVVNRVNQCFPFETSSYFIGVLDIAGFEYFEHNSFEQFCINYCNEKLQQFFNERILKEEQELYQKEGLGVNEVHYVDNQDCIDLIEARLVGILDILDEENRLPQPSDQHFTSAVHQKHKDHFRLSIPRKSKLAIHRNIRDDEGFIIRHFAGAVCYETTQFVEKNNDALHMSLESLICESRDKFIRELFESSTNNNKDTKQKAGKLSFISVGNKFKTQLNLLLDKLRSTGASFIRCIKPNLKMTSHHFEGAQILSQLQCSGMVSVLDLMQGGFPSRASFHELYNMYKKYMPDKLARLDPRLFCKALFKALGLNEIDYKFGLTKVFFRPGKFAEFDQIMKSDPDHLAELVKRVNHWLICSRWKKVQWCSLSVIKLKNKIKYRAEAC

来源 Source

来源生物 organism	Sus scrofa
通用名 common_name	Pig
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9823
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Actin, alpha skeletal muscle
分子量 formula_weight	41560.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H

MCDEDETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVH

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Calmodulin
分子量 formula_weight	16406.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O,P,Q,R,S,T

QLTEEQIAEFKEAFSLFDKDGDGTITTKELGTVMRSLGQNPTEAELQDMINEVDADGNGTIDFPEFLTMMARKMKDTDSEEEIREAFRVFDKDGNGYISAAELRHVMTNLGEKLTDEEVDEMIREADIDGDGQVNYEEFVQMMTA

来源 Source

来源生物 organism	Gallus gallus
通用名 common_name	Chicken
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9031
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

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分辨率 resolution	4.60 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	56116

CryoEM structure of MyosinVI-actin complex in the rigor (nucleotide-free) state, backbone-averaged with side chains truncated to alanine

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Unconventional myosin-VI

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Actin, alpha skeletal muscle

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Calmodulin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6bnv__assembly_1__model_1

6bnv__assembly_1__model_1 | I(q)

6bnv__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (2)

CryoEM structure of MyosinVI-actin complex in the rigor (nucleotide-free) state, backbone-averaged with side chains truncated to alanine

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Unconventional myosin-VI

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Actin, alpha skeletal muscle

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Calmodulin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6bnv__assembly_1__model_1

6bnv__assembly_1__model_1 | I(q)

6bnv__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (2)