6cfz

Structure of the DASH/Dam1 complex shows its role at the yeast kinetochore-microtubule interface

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ask1

Chaetomium thermophilum

UniProt G0S8F9

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 170 Dad3 × 17 (G0RY74) Dad2 × 17 (G0RZB3) Duo1 × 17 (G0SAN7) Dad4 × 17 (G0S589) Dad1,Dad1 × 17 (G0RYE9) Hsk3 × 17 Dam1 × 17 (G0S2K4) Spc19 × 17 (G0S0N0) Spc34 × 17 (G0S2A3) 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 10 Dad3 × 1 (G0RY74) Dad2 × 1 (G0RZB3) Duo1 × 1 (G0SAN7) Dad4 × 1 (G0S589) Dad1,Dad1 × 1 (G0RYE9) Hsk3 × 1 Dam1 × 1 (G0S2K4) Spc19 × 1 (G0S0N0) Spc34 × 1 (G0S2A3) 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 10 Dad3 × 1 (G0RY74) Dad2 × 1 (G0RZB3) Duo1 × 1 (G0SAN7) Dad4 × 1 (G0S589) Dad1,Dad1 × 1 (G0RYE9) Hsk3 × 1 Dam1 × 1 (G0S2K4) Spc19 × 1 (G0S0N0) Spc34 × 1 (G0S2A3) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0S8F9_CHATD
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 2–77; UniProt 13–88

Dad3

Chaetomium thermophilum

UniProt G0RY74

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 170 Ask1 × 17 (G0S8F9) Dad2 × 17 (G0RZB3) Duo1 × 17 (G0SAN7) Dad4 × 17 (G0S589) Dad1,Dad1 × 17 (G0RYE9) Hsk3 × 17 Dam1 × 17 (G0S2K4) Spc19 × 17 (G0S0N0) Spc34 × 17 (G0S2A3) 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 10 Ask1 × 1 (G0S8F9) Dad2 × 1 (G0RZB3) Duo1 × 1 (G0SAN7) Dad4 × 1 (G0S589) Dad1,Dad1 × 1 (G0RYE9) Hsk3 × 1 Dam1 × 1 (G0S2K4) Spc19 × 1 (G0S0N0) Spc34 × 1 (G0S2A3) 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 10 Ask1 × 1 (G0S8F9) Dad2 × 1 (G0RZB3) Duo1 × 1 (G0SAN7) Dad4 × 1 (G0S589) Dad1,Dad1 × 1 (G0RYE9) Hsk3 × 1 Dam1 × 1 (G0S2K4) Spc19 × 1 (G0S0N0) Spc34 × 1 (G0S2A3) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0RY74_CHATD
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 2–67; UniProt 18–83

Dad2

Chaetomium thermophilum

UniProt G0RZB3

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 170 Ask1 × 17 (G0S8F9) Dad3 × 17 (G0RY74) Duo1 × 17 (G0SAN7) Dad4 × 17 (G0S589) Dad1,Dad1 × 17 (G0RYE9) Hsk3 × 17 Dam1 × 17 (G0S2K4) Spc19 × 17 (G0S0N0) Spc34 × 17 (G0S2A3) 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 10 Ask1 × 1 (G0S8F9) Dad3 × 1 (G0RY74) Duo1 × 1 (G0SAN7) Dad4 × 1 (G0S589) Dad1,Dad1 × 1 (G0RYE9) Hsk3 × 1 Dam1 × 1 (G0S2K4) Spc19 × 1 (G0S0N0) Spc34 × 1 (G0S2A3) 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 10 Ask1 × 1 (G0S8F9) Dad3 × 1 (G0RY74) Duo1 × 1 (G0SAN7) Dad4 × 1 (G0S589) Dad1,Dad1 × 1 (G0RYE9) Hsk3 × 1 Dam1 × 1 (G0S2K4) Spc19 × 1 (G0S0N0) Spc34 × 1 (G0S2A3) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0RZB3_CHATD
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 2–94; UniProt 25–117

Duo1

Chaetomium thermophilum

UniProt G0SAN7

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 170 Ask1 × 17 (G0S8F9) Dad3 × 17 (G0RY74) Dad2 × 17 (G0RZB3) Dad4 × 17 (G0S589) Dad1,Dad1 × 17 (G0RYE9) Hsk3 × 17 Dam1 × 17 (G0S2K4) Spc19 × 17 (G0S0N0) Spc34 × 17 (G0S2A3) 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 10 Ask1 × 1 (G0S8F9) Dad3 × 1 (G0RY74) Dad2 × 1 (G0RZB3) Dad4 × 1 (G0S589) Dad1,Dad1 × 1 (G0RYE9) Hsk3 × 1 Dam1 × 1 (G0S2K4) Spc19 × 1 (G0S0N0) Spc34 × 1 (G0S2A3) 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 10 Ask1 × 1 (G0S8F9) Dad3 × 1 (G0RY74) Dad2 × 1 (G0RZB3) Dad4 × 1 (G0S589) Dad1,Dad1 × 1 (G0RYE9) Hsk3 × 1 Dam1 × 1 (G0S2K4) Spc19 × 1 (G0S0N0) Spc34 × 1 (G0S2A3) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0SAN7_CHATD
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 2–111; UniProt 49–158

Dad4

Chaetomium thermophilum

UniProt G0S589

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 170 Ask1 × 17 (G0S8F9) Dad3 × 17 (G0RY74) Dad2 × 17 (G0RZB3) Duo1 × 17 (G0SAN7) Dad1,Dad1 × 17 (G0RYE9) Hsk3 × 17 Dam1 × 17 (G0S2K4) Spc19 × 17 (G0S0N0) Spc34 × 17 (G0S2A3) 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 10 Ask1 × 1 (G0S8F9) Dad3 × 1 (G0RY74) Dad2 × 1 (G0RZB3) Duo1 × 1 (G0SAN7) Dad1,Dad1 × 1 (G0RYE9) Hsk3 × 1 Dam1 × 1 (G0S2K4) Spc19 × 1 (G0S0N0) Spc34 × 1 (G0S2A3) 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 10 Ask1 × 1 (G0S8F9) Dad3 × 1 (G0RY74) Dad2 × 1 (G0RZB3) Duo1 × 1 (G0SAN7) Dad1,Dad1 × 1 (G0RYE9) Hsk3 × 1 Dam1 × 1 (G0S2K4) Spc19 × 1 (G0S0N0) Spc34 × 1 (G0S2A3) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0S589_CHATD
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–63; UniProt 1–63

Dad1,Dad1

Chaetomium thermophilum

UniProt G0RYE9

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 170 Ask1 × 17 (G0S8F9) Dad3 × 17 (G0RY74) Dad2 × 17 (G0RZB3) Duo1 × 17 (G0SAN7) Dad4 × 17 (G0S589) Hsk3 × 17 Dam1 × 17 (G0S2K4) Spc19 × 17 (G0S0N0) Spc34 × 17 (G0S2A3) 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 10 Ask1 × 1 (G0S8F9) Dad3 × 1 (G0RY74) Dad2 × 1 (G0RZB3) Duo1 × 1 (G0SAN7) Dad4 × 1 (G0S589) Hsk3 × 1 Dam1 × 1 (G0S2K4) Spc19 × 1 (G0S0N0) Spc34 × 1 (G0S2A3) 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 10 Ask1 × 1 (G0S8F9) Dad3 × 1 (G0RY74) Dad2 × 1 (G0RZB3) Duo1 × 1 (G0SAN7) Dad4 × 1 (G0S589) Hsk3 × 1 Dam1 × 1 (G0S2K4) Spc19 × 1 (G0S0N0) Spc34 × 1 (G0S2A3) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0RYE9_CHATD
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 1–57; UniProt 17–73

Dam1

Chaetomium thermophilum

UniProt G0S2K4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 170 Ask1 × 17 (G0S8F9) Dad3 × 17 (G0RY74) Dad2 × 17 (G0RZB3) Duo1 × 17 (G0SAN7) Dad4 × 17 (G0S589) Dad1,Dad1 × 17 (G0RYE9) Hsk3 × 17 Spc19 × 17 (G0S0N0) Spc34 × 17 (G0S2A3) 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 10 Ask1 × 1 (G0S8F9) Dad3 × 1 (G0RY74) Dad2 × 1 (G0RZB3) Duo1 × 1 (G0SAN7) Dad4 × 1 (G0S589) Dad1,Dad1 × 1 (G0RYE9) Hsk3 × 1 Spc19 × 1 (G0S0N0) Spc34 × 1 (G0S2A3) 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 10 Ask1 × 1 (G0S8F9) Dad3 × 1 (G0RY74) Dad2 × 1 (G0RZB3) Duo1 × 1 (G0SAN7) Dad4 × 1 (G0S589) Dad1,Dad1 × 1 (G0RYE9) Hsk3 × 1 Spc19 × 1 (G0S0N0) Spc34 × 1 (G0S2A3) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0S2K4_CHATD
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 2–56; UniProt 53–107

Spc19

Chaetomium thermophilum

UniProt G0S0N0

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 170 Ask1 × 17 (G0S8F9) Dad3 × 17 (G0RY74) Dad2 × 17 (G0RZB3) Duo1 × 17 (G0SAN7) Dad4 × 17 (G0S589) Dad1,Dad1 × 17 (G0RYE9) Hsk3 × 17 Dam1 × 17 (G0S2K4) Spc34 × 17 (G0S2A3) 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 10 Ask1 × 1 (G0S8F9) Dad3 × 1 (G0RY74) Dad2 × 1 (G0RZB3) Duo1 × 1 (G0SAN7) Dad4 × 1 (G0S589) Dad1,Dad1 × 1 (G0RYE9) Hsk3 × 1 Dam1 × 1 (G0S2K4) Spc34 × 1 (G0S2A3) 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 10 Ask1 × 1 (G0S8F9) Dad3 × 1 (G0RY74) Dad2 × 1 (G0RZB3) Duo1 × 1 (G0SAN7) Dad4 × 1 (G0S589) Dad1,Dad1 × 1 (G0RYE9) Hsk3 × 1 Dam1 × 1 (G0S2K4) Spc34 × 1 (G0S2A3) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0S0N0_CHATD
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 2–151; UniProt 7–156

Spc34

Chaetomium thermophilum

UniProt G0S2A3

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 170 Ask1 × 17 (G0S8F9) Dad3 × 17 (G0RY74) Dad2 × 17 (G0RZB3) Duo1 × 17 (G0SAN7) Dad4 × 17 (G0S589) Dad1,Dad1 × 17 (G0RYE9) Hsk3 × 17 Dam1 × 17 (G0S2K4) Spc19 × 17 (G0S0N0) 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 10 Ask1 × 1 (G0S8F9) Dad3 × 1 (G0RY74) Dad2 × 1 (G0RZB3) Duo1 × 1 (G0SAN7) Dad4 × 1 (G0S589) Dad1,Dad1 × 1 (G0RYE9) Hsk3 × 1 Dam1 × 1 (G0S2K4) Spc19 × 1 (G0S0N0) 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 10 Ask1 × 1 (G0S8F9) Dad3 × 1 (G0RY74) Dad2 × 1 (G0RZB3) Duo1 × 1 (G0SAN7) Dad4 × 1 (G0S589) Dad1,Dad1 × 1 (G0RYE9) Hsk3 × 1 Dam1 × 1 (G0S2K4) Spc19 × 1 (G0S0N0) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G0S2A3_CHATD
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 J; PDB构建体 1–239; UniProt 1–239

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6cfz
沉积日期 deposition_date2018-02-19
结构标题 titleStructure of the DASH/Dam1 complex shows its role at the yeast kinetochore-microtubule interface
关键词 keywords;DASH, Dam1 complex, Ask1, Dad1, Dad2, Dad3, Dad4, Dam1, Duo1, Hsk3, Spc19, Spc34, kinetochore, kinetochore-microtubule interface, chromosome segregation, cell-division, point-centromere yeast, NUCLEAR PROTEIN ;; NUCLEAR PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6cfz__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6cfz__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 108 109 1010 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

6cfz__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)0.00 Å
Rg(电子密度)238.90 Å
总 Rg239.00 Å
原子数204102
残基数12937
排除体积1815200 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 6cfz__assembly_1__model_1 170-meric (170) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 6cfz__assembly_2__model_1 decameric (10) 排除 — —
排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。
3 1 6cfz__assembly_3__model_1 decameric (10) 排除 — —
排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (10)

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7. 引用文献 (1)