6ct0

Atomic Structure of the E2 Inner Core of Human Pyruvate Dehydrogenase Complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Dihydrolipoyllysine-residue acetyltransferase component of pyruvate dehydrogenase complex, mitochondrial

Homo sapiens

UniProt P10515

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 60 无其他共同聚合物 与蛋白数一致
2 蛋白单体 单体 蛋白 1 无其他共同聚合物 与蛋白数一致
3 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 5 无其他共同聚合物 与蛋白数一致
4 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 6 无其他共同聚合物 与蛋白数一致
5 蛋白单体 单体 蛋白 1 无其他共同聚合物 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ODP2_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 0; PDB构建体 1–647; UniProt 1–647

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6ct0
沉积日期 deposition_date2018-03-21
结构标题 titleAtomic Structure of the E2 Inner Core of Human Pyruvate Dehydrogenase Complex
关键词 keywordsPyruvate Dehydrogenase Complex, E2, Inner Core, OXIDOREDUCTASE; OXIDOREDUCTASE
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6ct0__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6ct0__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

6ct0__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)99.63 Å
Rg(电子密度)97.79 Å
总 Rg97.78 Å
原子数105600
残基数13740
排除体积1906100 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 6ct0__assembly_1__model_1 60-meric (60) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 6ct0__assembly_2__model_1 monomeric (1) 排除
排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。
3 1 6ct0__assembly_3__model_1 pentameric (5) 排除
排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。
4 1 6ct0__assembly_4__model_1 hexameric (6) 排除
排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。
5 1 6ct0__assembly_5__model_1 monomeric (1) 排除
排除原因: 辅助对称表示,不是完整或代表性的 biological assembly。

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (1)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd6ct00_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.43 — CoA-dependent acyltransferases
超家族 Superfamily superfamilyc.43.1 — CoA-dependent acyltransferases
家族 Family familyc.43.1.0 — automated matches

7. 引用文献 (1)