Actin, cytoplasmic 2
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric(20) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 1–375 链 B; UniProt 1–375 链 C; UniProt 1–375 链 D; UniProt 1–375 链 E; UniProt 1–375 | 未记录 | Myosin-binding protein C, cardiac-type × 6 (Q14896) Myosin-binding protein C, cardiac-type × 5 (Q14896) Tropomyosin × 4 | ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE | 分辨率 11.00 Å |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 6CXJ | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5JLH Cryo-EM structure of a human cytoplasmic actomyosin complex at near-atomic resolution 提交 2016-04-27 | 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:undecameric |
链 A
2–375(374 aa)
链 B
2–375(374 aa)
链 C
2–375(374 aa)
链 D
2–375(374 aa)
链 E
2–375(374 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5;5 mM Tris-HCl pH 7.5, 1 mM DTT, 100 mM KCl, and 2 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;Sample (2 uL of F-actin-tropomyosin solution) was applied to a glow-discharged holey carbon grid, incubated for 20 s and manually blotted from the backside for less than a second with filter paper. Afterwards 1.5 uL of myosin solution (3 uM without nucleotide) were added directly on the grid, incubated for 10 s and then manually blotted for 5 s from the backside with filter paper.
|
分辨率 3.90 Å |
| 6CXI Cardiac thin filament decorated with C0C1 fragment of cardiac myosin binding protein C mode 1 提交 2018-04-03 | 当前字段一致 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric |
链 A
1–375(375 aa)
链 B
1–375(375 aa)
链 C
1–375(375 aa)
链 D
1–375(375 aa)
链 E
1–375(375 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 11.00 Å |
| 6G2T human cardiac myosin binding protein C C1 Ig-domain bound to native cardiac thin filament 提交 2018-03-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric |
链 A
1–375(375 aa)
链 B
1–375(375 aa)
链 C
1–375(375 aa)
链 D
1–375(375 aa)
链 E
1–375(375 aa)
链 F
1–375(375 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.00 Å |
| 6WK1 SETD3 in Complex with an Actin Peptide with His73 Replaced with Methionine 提交 2020-04-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 Y
66–88(23 aa)
链 Z
66–88(23 aa)
|
突变:H73M 突变:H73M | GOL GLYCEROL × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 46 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 2 ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;292 K;0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.228 |
| 6WK1 SETD3 in Complex with an Actin Peptide with His73 Replaced with Methionine 提交 2020-04-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 Y
66–88(23 aa)
|
突变:H73M | GOL GLYCEROL × 6 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 27 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ACT ACETATE ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;292 K;0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.228 |
| 6WK1 SETD3 in Complex with an Actin Peptide with His73 Replaced with Methionine 提交 2020-04-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 Z
66–88(23 aa)
|
突变:H73M | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 19 SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;292 K;0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000
|
分辨率 1.89 Å R-free 0.228 |
| 6WK2 SETD3 mutant (N255V) in Complex with an Actin Peptide with His73 Replaced with Methionine 提交 2020-04-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 C
66–88(23 aa)
链 Y
66–88(23 aa)
|
突变:H73M 突变:H73M | SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 8 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;292 K;0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.206 |
| 6WK2 SETD3 mutant (N255V) in Complex with an Actin Peptide with His73 Replaced with Methionine 提交 2020-04-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 Y
66–88(23 aa)
|
突变:H73M | SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;292 K;0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.206 |
| 6WK2 SETD3 mutant (N255V) in Complex with an Actin Peptide with His73 Replaced with Methionine 提交 2020-04-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric |
链 C
66–88(23 aa)
|
突变:H73M | SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NA SODIUM ION × 1 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.6;292 K;0.2 M ammonium acetate, 0.1 M sodium citrate tribasic dihydrate pH 5.6 and 30% (w/v) polyethylene glycol 4000
|
分辨率 1.76 Å R-free 0.206 |
| 7NVM Human TRiC complex in closed state with nanobody Nb18, actin and PhLP2A bound 提交 2021-03-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric |
链 K
1–375(375 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 MG MAGNESIUM ION × 16 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 16 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 8DNF Cryo-EM structure of nonmuscle gamma-actin 提交 2022-07-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric |
链 A
2–375(374 aa)
链 B
2–375(374 aa)
链 C
2–375(374 aa)
链 D
2–375(374 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.38 Å |
| 9SMX CM1-activated gTuRC in complex with nascent alpha-E254D mutant microtubules 提交 2025-09-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 73 PDB 声明:73-meric |
链 7
2–375(374 aa)
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 11 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6.9
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.67 Å |
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查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | ACTG_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 1–375; UniProt 1–375 作者链 B; PDB构建体 1–375; UniProt 1–375 作者链 C; PDB构建体 1–375; UniProt 1–375 作者链 D; PDB构建体 1–375; UniProt 1–375 作者链 E; PDB构建体 1–375; UniProt 1–375 |