6cxj

Cardiac thin filament decorated with C0C1 fragment of cardiac myosin binding protein C mode 2

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 190.2 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Actin, cytoplasmic 2

Homo sapiens

UniProt P63261

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric(20) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–375 链 B; UniProt 1–375 链 C; UniProt 1–375 链 D; UniProt 1–375 链 E; UniProt 1–375 未记录 Myosin-binding protein C, cardiac-type × 6 (Q14896) Myosin-binding protein C, cardiac-type × 5 (Q14896) Tropomyosin × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 11.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 8 个其他 PDB 条目、12 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACTG_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–375; UniProt 1–375 作者链 B; PDB构建体 1–375; UniProt 1–375 作者链 C; PDB构建体 1–375; UniProt 1–375 作者链 D; PDB构建体 1–375; UniProt 1–375 作者链 E; PDB构建体 1–375; UniProt 1–375

Myosin-binding protein C, cardiac-type

Homo sapiens

UniProt Q14896

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 20 PDB 声明:eicosameric(20) 与蛋白拷贝数一致 链 G; UniProt 151–258 链 H; UniProt 151–258 链 I; UniProt 151–258 链 J; UniProt 151–258 链 K; UniProt 151–258 链 L; UniProt 151–258 链 M; UniProt 1–101 链 N; UniProt 1–101 链 O; UniProt 1–101 链 P; UniProt 1–101 链 Q; UniProt 1–101 片段:C1 Ig-domain (UNP residues 151-258) 片段:C0 Ig-domain (UNP residues 1-101) Actin, cytoplasmic 2 × 5 (P63261) Tropomyosin × 4 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 11.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 16 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MYPC3_HUMAN
Isoform Q14896-2
PDB实体 2, 3
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 2–109; UniProt 151–258 作者链 H; PDB构建体 2–109; UniProt 151–258 作者链 I; PDB构建体 2–109; UniProt 151–258 作者链 J; PDB构建体 2–109; UniProt 151–258 作者链 K; PDB构建体 2–109; UniProt 151–258 作者链 L; PDB构建体 2–109; UniProt 151–258 作者链 M; PDB构建体 1–101; UniProt 1–101 作者链 N; PDB构建体 1–101; UniProt 1–101 作者链 O; PDB构建体 1–101; UniProt 1–101 作者链 P; PDB构建体 1–101; UniProt 1–101 作者链 Q; PDB构建体 1–101; UniProt 1–101

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 6cxj

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 6cxj
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6cxj
沉积日期 deposition_date2018-04-03
结构标题 titleCardiac thin filament decorated with C0C1 fragment of cardiac myosin binding protein C mode 2
关键词 keywordsmyosin binding protein C, MOTOR PROTEIN; MOTOR PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier56.11
回转半径 Rg (电子) rg_electron55.93
零角强度 I(0) i01920560000.00
分子量 molecular_weight359400.0 kDa
排除体积 excluded_volume446780 ų
包络体积 envelope_volume756000 ų
水化壳体积 shell_volume112180 ų
包络直径 envelope_diameter206.3
壳层 Rg shell_rg58.54
包络 Rg envelope_rg55.66
形状 Rg shape_rg55.97
总 Rg total_rg55.88
总原子数 total_atoms25305
残基数 n_residues3429
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax190.2
Rg (实空间) rg_real56.20
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.49
I(0) (实空间) i0_real1.9210e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error3.7890e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal56.02
I(0) (倒空间) i0_reciprocal1920000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8447
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary61.1
偏度 Skewness skewness0.454
峰度 Kurtosis kurtosis-0.157
角度范围 angular_range— – 0.1400 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0001
最高正则化参数 α highest_alpha279600000.0000
实空间数据点数 n_real_points29
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.785; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.996; Smooth: 0.627

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)