Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白拷贝数一致 | 链 A; UniProt 376–415 | 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CU COPPER (II) ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;290 K;0.1 M imidazole, pH 6.5 1.0 M sodium acetate | 分辨率 1.75 Å R-free 0.323 |
| 2 | 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白拷贝数一致 | 链 B; UniProt 376–415 | 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | CU COPPER (II) ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;290 K;0.1 M imidazole, pH 6.5 1.0 M sodium acetate | 分辨率 1.75 Å R-free 0.323 |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 6D42 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6CNM Cryo-EM structure of the human SK4/calmodulin channel complex 提交 2018-03-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–427(427 aa)
链 B
1–427(427 aa)
链 C
1–427(427 aa)
链 D
1–427(427 aa)
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 5 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 4 LMT DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 6CNN Cryo-EM structure of the human SK4/calmodulin channel complex in the Ca2+ bound state I 提交 2018-03-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–427(427 aa)
链 B
1–427(427 aa)
链 C
1–427(427 aa)
链 D
1–427(427 aa)
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 4 POV (2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate × 4 LMT DODECYL-BETA-D-MALTOSIDE × 8 CA CALCIUM ION × 12 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 6CNO Cryo-EM structure of the human SK4/calmodulin channel complex in the Ca2+ bound state II 提交 2018-03-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–427(427 aa)
链 B
1–427(427 aa)
链 C
1–427(427 aa)
链 D
1–427(427 aa)
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 12 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.70 Å |
| 9ED1 Cryo-EM structure of the human KCa3.1/calmodulin channel in complex with Ca2+ and 1,4-dihydropyridine (DHP-103) 提交 2024-11-15 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
9–386(378 aa)
链 B
9–386(378 aa)
链 C
9–386(378 aa)
链 D
9–386(378 aa)
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 5 CA CALCIUM ION × 12 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9O48 Cryo-EM structure of the human SK2-4 chimera/calmodulin channel complex in the Ca2+ bound state 提交 2025-04-08 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–14(14 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 A
305–427(123 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 B
1–14(14 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 B
305–427(123 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 C
1–14(14 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 C
305–427(123 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 D
1–14(14 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 D
305–427(123 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 16 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8;20 mM Tris pH 8, 150 mM KCl, 2 mM CaCl2, 0.005% GDN, 0.0005% CHS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;5 uL of sample was applied to grids at 4 degree temperature with 100% humidity. After 30 seconds, grids were blotted for 5 seconds with blot force 25 and plunged into liquid ethane.
|
分辨率 3.10 Å |
| 9O51 Cryo-EM structure of the human SK2-4 chimera/calmodulin channel complex in the Ca2+ free state 提交 2025-04-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–14(14 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 A
305–427(123 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 B
1–14(14 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 B
305–427(123 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 C
1–14(14 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 C
305–427(123 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 D
1–14(14 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 D
305–427(123 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8;20 mM Tris pH 8, 150 mM KCl, 5 mM EGTA, 0.005% GDN, 0.0005% CHS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;5 uL of sample was applied to grids at 4 degree temperature with 100% humidity. After 30 seconds, grids were blotted for 5 seconds with blot force 25 and plunged into liquid ethane.
|
分辨率 3.40 Å |
| 9O52 Cryo-EM structure of the human SK2-4 chimera/calmodulin channel complex bound to the bee toxin apamin 提交 2025-04-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric |
链 A
1–14(14 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 A
305–427(123 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 B
1–14(14 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 B
305–427(123 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 C
1–14(14 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 C
305–427(123 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 D
1–14(14 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 D
305–427(123 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 16 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8;20 mM Tris pH 8, 150 mM KCl, 2 mM CaCl2, 0.005% GDN, 0.0005% CHS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;5 uL of sample was applied to grids at 4 degree temperature with 100% humidity. After 30 seconds, grids were blotted for 5 seconds with blot force 25 and plunged into liquid ethane.
|
分辨率 3.18 Å |
| 9O53 Cryo-EM structure of the human SK2-4 chimera/calmodulin channel complex bound to a small molecule inhibitor 提交 2025-04-09 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–14(14 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 A
305–427(123 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 B
1–14(14 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 B
305–427(123 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 C
1–14(14 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 C
305–427(123 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 D
1–14(14 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 D
305–427(123 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
|
未记录 | A1B8D N-(2,1,3-benzoxadiazol-4-yl)-3-(4-methoxybenzene-1-sulfonamido)benzamide × 4 K POTASSIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 16 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8;20 mM Tris pH 8, 150 mM KCl, 2 mM CaCl2, 0.005% GDN, 0.0005% CHS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;5 uL of sample was applied to grids at 4 degree temperature with 100% humidity. After 30 seconds, grids were blotted for 5 seconds with blot force 25 and plunged into liquid ethane.
|
分辨率 3.30 Å |
| 9O5O Cryo-EM structure of the human SK2-4 chimera/calmodulin channel complex bound to a small molecule activator 提交 2025-04-10 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
1–14(14 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 A
305–427(123 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 B
1–14(14 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 B
305–427(123 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 C
1–14(14 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 C
305–427(123 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 D
1–14(14 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
链 D
305–427(123 aa)
片段:SK4 residues 1-15 + SK2 residues 124-412 + SK4 residues 306-428
|
未记录 | A1B8G N-(2,1,3-benzoxadiazol-4-yl)-4-(trifluoromethyl)benzamide × 4 K POTASSIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 16 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8;20 mM Tris pH 8, 150 mM KCl, 2 mM CaCl2, 0.005% GDN, 0.0005% CHS
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;5 uL of sample was applied to grids at 4 degree temperature with 100% humidity. After 30 seconds, grids were blotted for 5 seconds with blot force 25 and plunged into liquid ethane.
|
分辨率 3.10 Å |
| 9OA8 Cryo-EM structure of KCa3.1/calmodulin channel in complex with NS309 提交 2025-04-19 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
9–386(378 aa)
链 B
9–386(378 aa)
链 C
9–386(378 aa)
链 D
9–386(378 aa)
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 3 1KP (3E)-6,7-dichloro-3-(hydroxyimino)-1,3-dihydro-2H-indol-2-one × 4 CA CALCIUM ION × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.59 Å |
| 9Y5Q Cryo EM structure of KCa3.1_R355K_I/calmodulin channel in complex with rimtuzalcap 提交 2025-09-05 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
9–386(378 aa)
链 B
9–386(378 aa)
链 C
9–386(378 aa)
链 D
9–386(378 aa)
|
突变:R355K 突变:R355K 突变:R355K 突变:R355K | K POTASSIUM ION × 1 A1B92 Rimtuzalcap × 4 CA CALCIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.73 Å |
| 9YDZ Cryo EM structure of KCa3.1_R355K_II/calmodulin channel in complex with rimtuzalcap 提交 2025-09-23 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
9–366(358 aa)
链 B
9–366(358 aa)
链 C
9–366(358 aa)
链 D
9–366(358 aa)
|
突变:R355K 突变:R355K 突变:R355K 突变:R355K | K POTASSIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 9ZPO Cryo-EM structure of KCa3.1_I/calmodulin channel in complex with SKA31. 提交 2025-12-16 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
9–386(378 aa)
链 B
9–386(378 aa)
链 C
9–386(378 aa)
链 D
9–386(378 aa)
|
未记录 | A1C3Q naphtho[1,2-d][1,3]thiazol-2-amine × 4 CA CALCIUM ION × 8 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.67 Å |
| 9ZPT Cryo-EM structure of KCa3.1_II/calmodulin channel in complex with SKA31. 提交 2025-12-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
9–366(358 aa)
链 B
9–366(358 aa)
链 C
9–366(358 aa)
链 D
9–366(358 aa)
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.39 Å |
| 9ZRK Cryo-EM structure of KCa3.1_I/calmodulin channel in complex with SKA111. 提交 2025-12-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
9–386(378 aa)
链 B
9–386(378 aa)
链 C
9–386(378 aa)
链 D
9–386(378 aa)
|
未记录 | A1C3U 5-methylnaphtho[1,2-d][1,3]thiazol-2-amine × 4 K POTASSIUM ION × 4 CA CALCIUM ION × 16 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.99 Å |
| 9ZRL Cryo-EM structure of KCa3.1_II/calmodulin channel in complex with SKA111. 提交 2025-12-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 8 PDB 声明:octameric |
链 A
9–369(361 aa)
链 B
9–369(361 aa)
链 C
9–369(361 aa)
链 D
9–369(361 aa)
|
未记录 | K POTASSIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.38 Å |
共 16 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | KCNN4_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A; PDB构建体 3–42; UniProt 376–415 作者链 B; PDB构建体 3–42; UniProt 376–415 |