6ef1

Yeast 26S proteasome bound to ubiquitinated substrate (5D motor state)

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Proteasome subunit alpha type-1

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 14	Proteasome subunit alpha type-2 × 1 （P23639） Proteasome subunit alpha type-3 × 1 （P23638） Proteasome subunit alpha type-4 × 1 （P40303） Proteasome subunit alpha type-5 × 1 （P32379） Proteasome subunit alpha type-6 × 1 （P40302） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 1 （P21242） 26S proteasome regulatory subunit 7 homolog × 1 （P33299） 26S proteasome regulatory subunit 4 homolog × 1 （P40327） 26S proteasome regulatory subunit 8 homolog × 1 （Q01939） 26S proteasome regulatory subunit 6B homolog × 1 （P33298） 26S proteasome subunit RPT4 × 1 （P53549） 26S proteasome regulatory subunit 6A × 1 （P33297） model substrate polypeptide × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSA1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–239； UniProt 13–251

Proteasome subunit alpha type-2

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P23639

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 14	Proteasome subunit alpha type-1 × 1 （P21243） Proteasome subunit alpha type-3 × 1 （P23638） Proteasome subunit alpha type-4 × 1 （P40303） Proteasome subunit alpha type-5 × 1 （P32379） Proteasome subunit alpha type-6 × 1 （P40302） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 1 （P21242） 26S proteasome regulatory subunit 7 homolog × 1 （P33299） 26S proteasome regulatory subunit 4 homolog × 1 （P40327） 26S proteasome regulatory subunit 8 homolog × 1 （Q01939） 26S proteasome regulatory subunit 6B homolog × 1 （P33298） 26S proteasome subunit RPT4 × 1 （P53549） 26S proteasome regulatory subunit 6A × 1 （P33297） model substrate polypeptide × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSA2_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–250； UniProt 1–250

Proteasome subunit alpha type-3

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P23638

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 14	Proteasome subunit alpha type-1 × 1 （P21243） Proteasome subunit alpha type-2 × 1 （P23639） Proteasome subunit alpha type-4 × 1 （P40303） Proteasome subunit alpha type-5 × 1 （P32379） Proteasome subunit alpha type-6 × 1 （P40302） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 1 （P21242） 26S proteasome regulatory subunit 7 homolog × 1 （P33299） 26S proteasome regulatory subunit 4 homolog × 1 （P40327） 26S proteasome regulatory subunit 8 homolog × 1 （Q01939） 26S proteasome regulatory subunit 6B homolog × 1 （P33298） 26S proteasome subunit RPT4 × 1 （P53549） 26S proteasome regulatory subunit 6A × 1 （P33297） model substrate polypeptide × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSA3_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–238； UniProt 8–245

Proteasome subunit alpha type-4

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P40303

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 14	Proteasome subunit alpha type-1 × 1 （P21243） Proteasome subunit alpha type-2 × 1 （P23639） Proteasome subunit alpha type-3 × 1 （P23638） Proteasome subunit alpha type-5 × 1 （P32379） Proteasome subunit alpha type-6 × 1 （P40302） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 1 （P21242） 26S proteasome regulatory subunit 7 homolog × 1 （P33299） 26S proteasome regulatory subunit 4 homolog × 1 （P40327） 26S proteasome regulatory subunit 8 homolog × 1 （Q01939） 26S proteasome regulatory subunit 6B homolog × 1 （P33298） 26S proteasome subunit RPT4 × 1 （P53549） 26S proteasome regulatory subunit 6A × 1 （P33297） model substrate polypeptide × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSA4_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–234； UniProt 9–242

Proteasome subunit alpha type-5

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P32379

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 14	Proteasome subunit alpha type-1 × 1 （P21243） Proteasome subunit alpha type-2 × 1 （P23639） Proteasome subunit alpha type-3 × 1 （P23638） Proteasome subunit alpha type-4 × 1 （P40303） Proteasome subunit alpha type-6 × 1 （P40302） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 1 （P21242） 26S proteasome regulatory subunit 7 homolog × 1 （P33299） 26S proteasome regulatory subunit 4 homolog × 1 （P40327） 26S proteasome regulatory subunit 8 homolog × 1 （Q01939） 26S proteasome regulatory subunit 6B homolog × 1 （P33298） 26S proteasome subunit RPT4 × 1 （P53549） 26S proteasome regulatory subunit 6A × 1 （P33297） model substrate polypeptide × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSA5_YEAST
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–242； UniProt 9–250

Proteasome subunit alpha type-6

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P40302

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 14	Proteasome subunit alpha type-1 × 1 （P21243） Proteasome subunit alpha type-2 × 1 （P23639） Proteasome subunit alpha type-3 × 1 （P23638） Proteasome subunit alpha type-4 × 1 （P40303） Proteasome subunit alpha type-5 × 1 （P32379） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 1 （P21242） 26S proteasome regulatory subunit 7 homolog × 1 （P33299） 26S proteasome regulatory subunit 4 homolog × 1 （P40327） 26S proteasome regulatory subunit 8 homolog × 1 （Q01939） 26S proteasome regulatory subunit 6B homolog × 1 （P33298） 26S proteasome subunit RPT4 × 1 （P53549） 26S proteasome regulatory subunit 6A × 1 （P33297） model substrate polypeptide × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSA6_YEAST
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–233； UniProt 2–234

Probable proteasome subunit alpha type-7

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P21242

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 14	Proteasome subunit alpha type-1 × 1 （P21243） Proteasome subunit alpha type-2 × 1 （P23639） Proteasome subunit alpha type-3 × 1 （P23638） Proteasome subunit alpha type-4 × 1 （P40303） Proteasome subunit alpha type-5 × 1 （P32379） Proteasome subunit alpha type-6 × 1 （P40302） 26S proteasome regulatory subunit 7 homolog × 1 （P33299） 26S proteasome regulatory subunit 4 homolog × 1 （P40327） 26S proteasome regulatory subunit 8 homolog × 1 （Q01939） 26S proteasome regulatory subunit 6B homolog × 1 （P33298） 26S proteasome subunit RPT4 × 1 （P53549） 26S proteasome regulatory subunit 6A × 1 （P33297） model substrate polypeptide × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PSA7_YEAST
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–243； UniProt 6–248

26S proteasome regulatory subunit 7 homolog

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P33299

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 14	Proteasome subunit alpha type-1 × 1 （P21243） Proteasome subunit alpha type-2 × 1 （P23639） Proteasome subunit alpha type-3 × 1 （P23638） Proteasome subunit alpha type-4 × 1 （P40303） Proteasome subunit alpha type-5 × 1 （P32379） Proteasome subunit alpha type-6 × 1 （P40302） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 1 （P21242） 26S proteasome regulatory subunit 4 homolog × 1 （P40327） 26S proteasome regulatory subunit 8 homolog × 1 （Q01939） 26S proteasome regulatory subunit 6B homolog × 1 （P33298） 26S proteasome subunit RPT4 × 1 （P53549） 26S proteasome regulatory subunit 6A × 1 （P33297） model substrate polypeptide × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PRS7_YEAST
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–262； UniProt 194–455

26S proteasome regulatory subunit 4 homolog

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P40327

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 14	Proteasome subunit alpha type-1 × 1 （P21243） Proteasome subunit alpha type-2 × 1 （P23639） Proteasome subunit alpha type-3 × 1 （P23638） Proteasome subunit alpha type-4 × 1 （P40303） Proteasome subunit alpha type-5 × 1 （P32379） Proteasome subunit alpha type-6 × 1 （P40302） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 1 （P21242） 26S proteasome regulatory subunit 7 homolog × 1 （P33299） 26S proteasome regulatory subunit 8 homolog × 1 （Q01939） 26S proteasome regulatory subunit 6B homolog × 1 （P33298） 26S proteasome subunit RPT4 × 1 （P53549） 26S proteasome regulatory subunit 6A × 1 （P33297） model substrate polypeptide × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PRS4_YEAST
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–271； UniProt 167–437

26S proteasome regulatory subunit 8 homolog

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt Q01939

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 14	Proteasome subunit alpha type-1 × 1 （P21243） Proteasome subunit alpha type-2 × 1 （P23639） Proteasome subunit alpha type-3 × 1 （P23638） Proteasome subunit alpha type-4 × 1 （P40303） Proteasome subunit alpha type-5 × 1 （P32379） Proteasome subunit alpha type-6 × 1 （P40302） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 1 （P21242） 26S proteasome regulatory subunit 7 homolog × 1 （P33299） 26S proteasome regulatory subunit 4 homolog × 1 （P40327） 26S proteasome regulatory subunit 6B homolog × 1 （P33298） 26S proteasome subunit RPT4 × 1 （P53549） 26S proteasome regulatory subunit 6A × 1 （P33297） model substrate polypeptide × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PRS8_YEAST
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–273； UniProt 133–405

26S proteasome regulatory subunit 6B homolog

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P33298

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 14	Proteasome subunit alpha type-1 × 1 （P21243） Proteasome subunit alpha type-2 × 1 （P23639） Proteasome subunit alpha type-3 × 1 （P23638） Proteasome subunit alpha type-4 × 1 （P40303） Proteasome subunit alpha type-5 × 1 （P32379） Proteasome subunit alpha type-6 × 1 （P40302） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 1 （P21242） 26S proteasome regulatory subunit 7 homolog × 1 （P33299） 26S proteasome regulatory subunit 4 homolog × 1 （P40327） 26S proteasome regulatory subunit 8 homolog × 1 （Q01939） 26S proteasome subunit RPT4 × 1 （P53549） 26S proteasome regulatory subunit 6A × 1 （P33297） model substrate polypeptide × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PRS6B_YEAST
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–276； UniProt 153–428

26S proteasome subunit RPT4

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P53549

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 14	Proteasome subunit alpha type-1 × 1 （P21243） Proteasome subunit alpha type-2 × 1 （P23639） Proteasome subunit alpha type-3 × 1 （P23638） Proteasome subunit alpha type-4 × 1 （P40303） Proteasome subunit alpha type-5 × 1 （P32379） Proteasome subunit alpha type-6 × 1 （P40302） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 1 （P21242） 26S proteasome regulatory subunit 7 homolog × 1 （P33299） 26S proteasome regulatory subunit 4 homolog × 1 （P40327） 26S proteasome regulatory subunit 8 homolog × 1 （Q01939） 26S proteasome regulatory subunit 6B homolog × 1 （P33298） 26S proteasome regulatory subunit 6A × 1 （P33297） model substrate polypeptide × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PRS10_YEAST
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–271； UniProt 166–436

26S proteasome regulatory subunit 6A

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P33297

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 14	Proteasome subunit alpha type-1 × 1 （P21243） Proteasome subunit alpha type-2 × 1 （P23639） Proteasome subunit alpha type-3 × 1 （P23638） Proteasome subunit alpha type-4 × 1 （P40303） Proteasome subunit alpha type-5 × 1 （P32379） Proteasome subunit alpha type-6 × 1 （P40302） Probable proteasome subunit alpha type-7 × 1 （P21242） 26S proteasome regulatory subunit 7 homolog × 1 （P33299） 26S proteasome regulatory subunit 4 homolog × 1 （P40327） 26S proteasome regulatory subunit 8 homolog × 1 （Q01939） 26S proteasome regulatory subunit 6B homolog × 1 （P33298） 26S proteasome subunit RPT4 × 1 （P53549） model substrate polypeptide × 1 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 4 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	PRS6A_YEAST
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–262； UniProt 173–434

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6ef1
沉积日期 deposition_date	2018-08-15
结构标题 title	Yeast 26S proteasome bound to ubiquitinated substrate (5D motor state)
关键词 keywords	26S Proteasome, ATPase, AAA+, Protease, Motor protein, Ubiquitin; MOTOR PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6ef1__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6ef1__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6ef1__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	47.46 Å
Rg（电子密度）	46.58 Å
总 Rg	46.96 Å
原子数	23658
残基数	3294
排除体积	418250 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6ef1__assembly_1__model_1`	tetradecameric （14）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (16)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Proteasome subunit alpha type-1
分子量 formula_weight	26909.6 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	23658

DRHITIFSPEGRLYQVEYAFKATNQTNINSLAVRGKDCTVVISQKKVPDKLLDPTTVSYIFCISRTIGMVVNGPIPDARNAALRAKAEAAEFRYKYGYDMPCDVLAKRMANLSQIYTQRAYMRPLGVILTFVSVDEELGPSIYKTDPAGYYVGYKATATGPKQQEITTNLENHFKKSKIDHINEESWEKVVEFAITHMIDALGTEFSKNDLEVGVATKDKFFTLSAENIEERLVAIAEQ

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae W303

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Proteasome subunit alpha type-2
分子量 formula_weight	27191.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MTDRYSFSLTTFSPSGKLGQIDYALTAVKQGVTSLGIKATNGVVIATEKKSSSPLAMSETLSKVSLLTPDIGAVYSGMGPDYRVLVDKSRKVAHTSYKRIYGEYPPTKLLVSEVAKIMQEATQSGGVRPFGVSLLIAGHDEFNGFSLYQVDPSGSYFPWKATAIGKGSVAAKTFLEKRWNDELELEDAIHIALLTLKESVEGEFNGDTIELAIIGDENPDLLGYTGIPTDKGPRFRKLTSQEINDRLEAL

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae W303

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Proteasome subunit alpha type-3
分子量 formula_weight	26313.6 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

SRTTIFSPEGRLYQVEYALESISHAGTAIGIMASDGIVLAAERKVTSTLLEQDTSTEKLYKLNDKIAVAVAGLTADAEILINTARIHAQNYLKTYNEDIPVEILVRRLSDIKQGYTQHGGLRPFGVSFIYAGYDDRYGYQLYTSNPSGNYTGWKAISVGANTSAAQTLLQMDYKDDMKVDDAIELALKTLSKTTDSSALTYDRLEFATIRKGANDGEVYQKIFKPQEIKDILVKTGIT

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae W303

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Proteasome subunit alpha type-4
分子量 formula_weight	26098.5 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

SIFSPDGHIFQVEYALEAVKRGTCAVGVKGKNCVVLGCERRSTLKLQDTRITPSKVSKIDSHVVLSFSGLNADSRILIEKARVEAQSHRLTLEDPVTVEYLTRYVAGVQQRYTQSGGVRPFGVSTLIAGFDPRDDEPKLYQTEPSGIYSSWSAQTIGRNSKTVREFLEKNYDRKEPPATVEECVKLTVRSLLEVVQTGAKNIEITVVKPDSDIVALSSEEINQYVTQIEQEKQE

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae W303

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Proteasome subunit alpha type-5
分子量 formula_weight	26544.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

DRGVSTFSPEGRLFQVEYSLEAIKLGSTAIGIATKEGVVLGVEKRATSPLLESDSIEKIVEIDRHIGCAMSGLTADARSMIEHARTAAVTHNLYYDEDINVESLTQSVCDLALRFGEGASGEERLMSRPFGVALLIAGHDADDGYQLFHAEPSGTFYRYNAKAIGSGSEGAQAELLNEWHSSLTLKEAELLVLKILKQVMEEKLDENNAQLSCITKQDGFKIYDNEKTAELIKELKEKEAAE

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae W303

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Proteasome subunit alpha type-6
分子量 formula_weight	25502.8 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

FRNNYDGDTVTFSPTGRLFQVEYALEAIKQGSVTVGLRSNTHAVLVALKRNADELSSYQKKIIKCDEHMGLSLAGLAPDARVLSNYLRQQCNYSSLVFNRKLAVERAGHLLCDKAQKNTQSYGGRPYGVGLLIIGYDKSGAHLLEFQPSGNVTELYGTAIGARSQGAKTYLERTLDTFIKIDGNPDELIKAGVEAISQSLRDESLTVDNLSIAIVGKDTPFTIYDGEAVAKYI

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae W303

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Probable proteasome subunit alpha type-7
分子量 formula_weight	26835.4 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.25.1
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

TGYDLSNSVFSPDGRNFQVEYAVKAVENGTTSIGIKCNDGVVFAVEKLITSKLLVPQKNVKIQVVDRHIGCVYSGLIPDGRHLVNRGREEAASFKKLYKTPIPIPAFADRLGQYVQAHTLYNSVRPFGVSTIFGGVDKNGAHLYMLEPSGSYWGYKGAATGKGRQSAKAELEKLVDHHPEGLSAREAVKQAAKIIYLAHEDNKEKDFELEISWCSLSETNGLHKFVKGDLLQEAIDFAQKEIN

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae W303

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	26S proteasome regulatory subunit 7 homolog
分子量 formula_weight	29070.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

SVTMMTVEEKPDVTYSDVGGCKDQIEKLREVVELPLLSPERFATLGIDPPKGILLYGPPGTGKTLCARAVANRTDATFIRVIGSELVQKYVGEGARMVRELFEMARTKKACIIFFDEIDAVGGARFDDGAGGDNEVQRTMLELITQLDGFDPRGNIKVMFATNRPNTLDPALLRPGRIDRKVEFSLPDLEGRANIFRIHSKSMSVERGIRWELISRLCPNSTGAELRSVCTEAGMFAIRARRKVATEKDFLKAVDKVISGYK

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae W303

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	26S proteasome regulatory subunit 4 homolog
分子量 formula_weight	30125.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MVSVMKMDKSPTESYSDIGGLESQIQEIKESVELPLTHPELYEEMGIKPPKGVILYGAPGTGKTLLAKAVANQTSATFLRIVGSELIQKYLGDGPRLCRQIFKVAGENAPSIVFIDEIDAIGTKRYDSNSGGEREIQRTMLELLNQLDGFDDRGDVKVIMATNKIETLDPALIRPGRIDRKILFENPDLSTKKKILGIHTSKMNLSEDVNLETLVTTKDDLSGADIQAMCTEAGLLALRERRMQVTAEDFKQAKERVMKNKVEENLEGLYL

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae W303

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	26S proteasome regulatory subunit 8 homolog
分子量 formula_weight	30239.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

LVSLMMVEKVPDSTYDMVGGLTKQIKEIKEVIELPVKHPELFESLGIAQPKGVILYGPPGTGKTLLARAVAHHTDCKFIRVSGAELVQKYIGEGSRMVRELFVMAREHAPSIIFMDEIDSIGSTRVEGSGGGDSEVQRTMLELLNQLDGFETSKNIKIIMATNRLDILDPALLRPGRIDRKIEFPPPSVAARAEILRIHSRKMNLTRGINLRKVAEKMNGCSGADVKGVCTEAGMYALRERRIHVTQEDFELAVGKVMNKNQETAISVAKLFK

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae W303

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	26S proteasome regulatory subunit 6B homolog
分子量 formula_weight	30792.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

DSDSSISVMGENEKPDVTYADVGGLDMQKQEIREAVELPLVQADLYEQIGIDPPRGVLLYGPPGTGKTMLVKAVANSTKAAFIRVNGSEFVHKYLGEGPRMVRDVFRLARENAPSIIFIDEVDSIATKRFDAQTGSDREVQRILIELLTQMDGFDQSTNVKVIMATNRADTLDPALLRPGRLDRKIEFPSLRDRRERRLIFGTIASKMSLAPEADLDSLIIRNDSLSGAVIAAIMQEAGLRAVRKNRYVILQSDLEEAYATQVKTDNTVDKFDFYK

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae W303

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	26S proteasome subunit RPT4
分子量 formula_weight	30174.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

LVYNMTSFEQGEITFDGIGGLTEQIRELREVIELPLKNPEIFQRVGIKPPKGVLLYGPPGTGKTLLAKAVAATIGANFIFSPASGIVDKYIGESARIIREMFAYAKEHEPCIIFMDEVDAIGGRRFSEGTSADREIQRTLMELLTQMDGFDNLGQTKIIMATNRPDTLDPALLRPGRLDRKVEIPLPNEAGRLEIFKIHTAKVKKTGEFDFEAAVKMSDGFNGADIRNCATEAGFFAIRDDRDHINPDDLMKAVRKVAEVKKLEGTIEYQK

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae W303

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	26S proteasome regulatory subunit 6A
分子量 formula_weight	28942.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

DEKPTETYSDVGGLDKQIEELVEAIVLPMKRADKFKDMGIRAPKGALMYGPPGTGKTLLARACAAQTNATFLKLAAPQLVQMYIGEGAKLVRDAFALAKEKAPTIIFIDELDAIGTKRFDSEKSGDREVQRTMLELLNQLDGFSSDDRVKVLAATNRVDVLDPALLRSGRLDRKIEFPLPSEDSRAQILQIHSRKMTTDDDINWQELARSTDEFNGAQLKAVTVEAGMIALRNGQSSVKHEDFVEGISEVQARKSKSVSFYA

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Saccharomyces cerevisiae W303

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	model substrate polypeptide
分子量 formula_weight	1458.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	s

NENVSARLGGASIAV

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21

实体 15 Entity 15 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	507.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 16 Entity 16 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.73 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	31019

Yeast 26S proteasome bound to ubiquitinated substrate (5D motor state)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Proteasome subunit alpha type-1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome subunit alpha type-2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome subunit alpha type-3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome subunit alpha type-4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome subunit alpha type-5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Proteasome subunit alpha type-6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Probable proteasome subunit alpha type-7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

26S proteasome regulatory subunit 7 homolog

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

26S proteasome regulatory subunit 4 homolog

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

26S proteasome regulatory subunit 8 homolog

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体