6ew1

Crystal structure of the Filamin A Ig-like domains 3-5 mutant P637Q

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 70.8 Å Quality: EXCELLENT

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Filamin-A

Homo sapiens

UniProt P21333

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白单体 单体 蛋白 × 1 PDB 声明:monomeric(1) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 478–766 突变:P637Q 无其他共同聚合物 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件:VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.05 M ammonium citrate, 18 % PEG 3350 分辨率 2.31 Å R-free 0.273

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 25 个其他 PDB 条目、41 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 FLNA_HUMAN
Isoform P21333-2
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 3–291; UniProt 478–766

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 6ew1

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 6ew1
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6ew1
沉积日期 deposition_date2017-11-03
结构标题 titleCrystal structure of the Filamin A Ig-like domains 3-5 mutant P637Q
关键词 keywordsActin binding protein, CELL ADHESION; CELL ADHESION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier21.79
回转半径 Rg (电子) rg_electron20.87
零角强度 I(0) i017662900.00
分子量 molecular_weight30808.0 kDa
排除体积 excluded_volume38176 ų
包络体积 envelope_volume48113 ų
水化壳体积 shell_volume19563 ų
包络直径 envelope_diameter72.2
壳层 Rg shell_rg27.00
包络 Rg envelope_rg20.80
形状 Rg shape_rg20.82
总 Rg total_rg21.83
总原子数 total_atoms2165
残基数 n_residues288
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax70.8
Rg (实空间) rg_real21.73
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.44
I(0) (实空间) i0_real1.7660e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.4480e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal21.74
I(0) (倒空间) i0_reciprocal17660000.0000
解质量估计 total_estimate0.9020
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary26.4
偏度 Skewness skewness0.226
峰度 Kurtosis kurtosis-0.499
角度范围 angular_range— – 0.3650 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha4924000.0000
实空间数据点数 n_real_points68
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.917; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.980; Smooth: 0.992

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd6ew1a1
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.18 — E set domains
家族 Family familyb.1.18.10 — Filamin repeat (rod domain)
结构域编号 domain_idd6ew1a2
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.18 — E set domains
家族 Family familyb.1.18.10 — Filamin repeat (rod domain)
结构域编号 domain_idd6ew1a3
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.18 — E set domains
家族 Family familyb.1.18.10 — Filamin repeat (rod domain)
结构域编号 domain_idd6ew1a4
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id6ew1A01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id6ew1A02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins
结构域编号 domain_id6ew1A03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Immunoglobulins

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)