6f1h

C1rC1s complex

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 155.2 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Complement C1r subcomponent

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 18–308	未记录	Complement C1s subcomponent × 1 （P09871） ;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-galactopyranose-(1-4)-alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 6 NA SODIUM ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；12-18% PEG 8000, 100 mM Imidazole at pH 8.0	分辨率 4.50 Å R-free 0.340
2	其他组合异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 3 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 18–308	未记录	Complement C1s subcomponent × 1 （P09871） ;beta-D-galactopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 6 NA SODIUM ION × 3 LYS LYSINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；12-18% PEG 8000, 100 mM Imidazole at pH 8.0	分辨率 4.50 Å R-free 0.340

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6F1H	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1APQ STRUCTURE OF THE EGF-LIKE MODULE OF HUMAN C1R, NMR, 19 STRUCTURES 提交 1997-07-22	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 140–192（53 aa）片段：EGF-LIKE MODULE	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.7；288 K	分辨率未提供
1GPZ THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE ZYMOGEN CATALYTIC DOMAIN OF COMPLEMENT PROTEASE C1R 提交 2001-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 307–705（399 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN C1R, RESIDUES 307-705	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；293 K；1.5 M AMMONIUM SULFATE, 0.1M TAPS, PH 8.5, AT 20 DEG C.	分辨率 2.90 Å R-free 0.290
1GPZ THE CRYSTAL STRUCTURE OF THE ZYMOGEN CATALYTIC DOMAIN OF COMPLEMENT PROTEASE C1R 提交 2001-11-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 307–705（399 aa）片段：CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN C1R, RESIDUES 307-705	突变：YES	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 8.5；293 K；1.5 M AMMONIUM SULFATE, 0.1M TAPS, PH 8.5, AT 20 DEG C.	分辨率 2.90 Å R-free 0.290
1MD7 Monomeric structure of the zymogen of complement protease C1r 提交 2002-08-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 375–702（328 aa）片段：C-terminal CCP-SP domain	突变：S637A	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；293 K；ammonium sulfate, TAPS, pH 8.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 3.20 Å R-free 0.285
1MD8 Monomeric structure of the active catalytic domain of complement protease C1r 提交 2002-08-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 375–703（329 aa）片段：C-terminal CCP-SP domain	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；293 K；ammonium sulfate, TAPS, pH 8.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.80 Å R-free 0.269
2QY0 Active dimeric structure of the catalytic domain of C1r reveals enzyme-product like contacts 提交 2007-08-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 309–463（155 aa）片段：Sushi-1 and Sushi-2 domains, CCP1-CCP2 链 B 464–705（242 aa）片段：Peptidase S1 domain 链 C 309–463（155 aa）片段：Sushi-1 and Sushi-2 domains, CCP1-CCP2 链 D 464–705（242 aa）片段：Peptidase S1 domain	未记录	GOL GLYCEROL × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；288 K；14% (w/v) PEG 6000, 0.2 M NaCl, 10% (v/v) glycerol, 0.1 M Tris HCl, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K	分辨率 2.60 Å R-free 0.259
6F1C C1rC1s complex 提交 2017-11-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 18–308（291 aa）链 C 18–308（291 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 12 NA SODIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；12-18% PEG 8000, 100 mM Imidazole at pH 8.0	分辨率 4.20 Å R-free 0.305
6F1D CUB2 domain of C1r 提交 2017-11-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 191–307（117 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；50 mM Tris-HCl at pH 8.5 containing 25% PEG-8K, 2 mM CaCl2 and 3% 1,6-diaminohexane	分辨率 1.95 Å R-free 0.202
6F39 C1r homodimer CUB1-EGF-CUB2 提交 2017-11-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 22–306（285 aa）链 B 22–306（285 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 6 NA SODIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；12-18% PEG 8000, 100 mM Imidazole at pH 8.0	分辨率 5.80 Å R-free 0.338
7MZT Borrelia burgdorferi BBK32-C in complex with an autolytic fragment of human C1r at 4.1A 提交 2021-05-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 300–463（164 aa）链 B 464–705（242 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium formate, 27.5% Polyethylene glycol 3,350	分辨率 4.07 Å R-free 0.372
9EKD Structure of a C1r Zymogen Fragment Bound to SALO 提交 2024-12-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 308–705（398 aa）片段：residues 308-705	突变：S654A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M BIS-TRIS (pH 5.6), 0.2 M ammonium sulfate, 20% (w/v) PEG-3350	分辨率 3.28 Å R-free 0.286
9EKD Structure of a C1r Zymogen Fragment Bound to SALO 提交 2024-12-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 308–705（398 aa）片段：residues 308-705	突变：S654A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.1 M BIS-TRIS (pH 5.6), 0.2 M ammonium sulfate, 20% (w/v) PEG-3350	分辨率 3.28 Å R-free 0.286
9EKE Structure of a C1r Zymogen Fragment Bound to SALO, Y51F Mutant 提交 2024-12-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 308–705（398 aa）	突变：S654A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M ammonium citrate tribasic (pH 7.0), 20% (w/v) PEG-3350	分辨率 3.10 Å R-free 0.278
9EKE Structure of a C1r Zymogen Fragment Bound to SALO, Y51F Mutant 提交 2024-12-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 308–705（398 aa）	突变：S654A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M ammonium citrate tribasic (pH 7.0), 20% (w/v) PEG-3350	分辨率 3.10 Å R-free 0.278

共 11 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	C1R_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–291； UniProt 18–308 作者链 C； PDB构建体 1–291； UniProt 18–308

Complement C1s subcomponent

Homo sapiens

UniProt P09871

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	其他组合异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 17–292	未记录	Complement C1r subcomponent × 1 （P00736） ;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-galactopyranose-(1-4)-alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 CA CALCIUM ION × 6 NA SODIUM ION × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；12-18% PEG 8000, 100 mM Imidazole at pH 8.0	分辨率 4.50 Å R-free 0.340
2	其他组合异源复合物蛋白 × 2 其他聚合物 3 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 17–292	未记录	Complement C1r subcomponent × 1 （P00736） ;beta-D-galactopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; × 1 beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 CA CALCIUM ION × 6 NA SODIUM ION × 3 LYS LYSINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；12-18% PEG 8000, 100 mM Imidazole at pH 8.0	分辨率 4.50 Å R-free 0.340

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6F1H	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1ELV CRYSTAL STRUCTURE OF THE CATALYTIC DOMAIN OF HUMAN COMPLEMENT C1S PROTEASE 提交 2000-03-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 358–688（331 aa）片段：CCP2-SP CATALYTIC FRAGMENT: ASP363-ASP-673 SEGMENT PRECEDED BY AN ASP-LEU SEQUENCE ADDED AT THE N-TERMINAL END	突变：YES	SO4 SULFATE ION × 2 NES 2-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；277 K；PEG 4K 34%, AMMONIUM SULFATE 100mM, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.70 Å R-free 0.219
1NZI Crystal Structure of the CUB1-EGF Interaction Domain of Complement Protease C1s 提交 2003-02-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 16–174（159 aa）片段：CALCIUM-DEPENDENT INTERACTION DOMAIN 链 B 16–174（159 aa）片段：CALCIUM-DEPENDENT INTERACTION DOMAIN	未记录	CA CALCIUM ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG 4000, magnesium chloride, glycerol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.50 Å R-free 0.234
4J1Y The X-ray crystal structure of human complement protease C1s zymogen 提交 2013-02-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 292–688（397 aa）片段：CCP1-CCP2-SPz (UNP Residues 292-698)	突变：Q436A, I438A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；18% PEG 3350, 0.2M potassium nitrate., pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.66 Å R-free 0.259
4J1Y The X-ray crystal structure of human complement protease C1s zymogen 提交 2013-02-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 292–688（397 aa）片段：CCP1-CCP2-SPz (UNP Residues 292-698)	突变：Q436A, I438A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；18% PEG 3350, 0.2M potassium nitrate., pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.66 Å R-free 0.259
4J1Y The X-ray crystal structure of human complement protease C1s zymogen 提交 2013-02-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 292–688（397 aa）片段：CCP1-CCP2-SPz (UNP Residues 292-698) 链 B 292–688（397 aa）片段：CCP1-CCP2-SPz (UNP Residues 292-698)	突变：Q436A, I438A 突变：Q436A, I438A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293 K；18% PEG 3350, 0.2M potassium nitrate., pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.66 Å R-free 0.259
4LMF C1s CUB1-EGF-CUB2 提交 2013-07-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 17–292（276 aa）片段：CUB1-EGF-CUB2 fragment (unp residues 17-292)	未记录	NA SODIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.92 Å R-free 0.252
4LMF C1s CUB1-EGF-CUB2 提交 2013-07-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 17–292（276 aa）片段：CUB1-EGF-CUB2 fragment (unp residues 17-292)	未记录	NA SODIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.92 Å R-free 0.252
4LMF C1s CUB1-EGF-CUB2 提交 2013-07-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 17–292（276 aa）片段：CUB1-EGF-CUB2 fragment (unp residues 17-292)	未记录	NA SODIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.92 Å R-free 0.252
4LMF C1s CUB1-EGF-CUB2 提交 2013-07-10	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 17–292（276 aa）片段：CUB1-EGF-CUB2 fragment (unp residues 17-292)	未记录	NA SODIUM ION × 1 CA CALCIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.92 Å R-free 0.252
4LMF C1s CUB1-EGF-CUB2 提交 2013-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 17–292（276 aa）片段：CUB1-EGF-CUB2 fragment (unp residues 17-292) 链 D 17–292（276 aa）片段：CUB1-EGF-CUB2 fragment (unp residues 17-292)	未记录	NA SODIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.92 Å R-free 0.252
4LMF C1s CUB1-EGF-CUB2 提交 2013-07-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 17–292（276 aa）片段：CUB1-EGF-CUB2 fragment (unp residues 17-292) 链 C 17–292（276 aa）片段：CUB1-EGF-CUB2 fragment (unp residues 17-292)	未记录	NA SODIUM ION × 2 CA CALCIUM ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.92 Å R-free 0.252
4LOR C1s CUB1-EGF-CUB2 in complex with a collagen-like peptide from C1q 提交 2013-07-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 17–292（276 aa）片段：CUB1-EGF-CUB2 fragment (unp residues 17-292)	未记录	CA CALCIUM ION × 3 NA SODIUM ION × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；100 mM Tris, 100 mM NaBr, 24% PEG 3350 , pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.252
4LOS C1s CUB2-CCP1 提交 2013-07-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 172–358（187 aa）片段：CUB2-CCP1 fragment (unp residues 172-358)	未记录	CA CALCIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；100 mM Tris/acetate, 200 mM KH2PO4 + 20% PEG 10K , pH 8, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.212
4LOT C1s CUB2-CCP1-CCP2 提交 2013-07-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 175–423（249 aa）片段：CUB2-CCP1-CCP2 fragment (unp residues 175-423)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.3；293 K；24% PEG 8K in Bis-tris propane-HCL, containing 200 mM potassium citrate, pH 6.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.92 Å R-free 0.292
5UBM Crystal structure of human C1s in complex with inhibitor gigastasin 提交 2016-12-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 437–688（252 aa）链 B 285–436（152 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 25 % PEG 3350	分辨率 2.50 Å R-free 0.222
6F1C C1rC1s complex 提交 2017-11-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 16–292（277 aa）链 D 16–292（277 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 12 NA SODIUM ION × 6 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；12-18% PEG 8000, 100 mM Imidazole at pH 8.0	分辨率 4.20 Å R-free 0.305
8GMN Crystal structure of human C1s in complex with inhibitor 提交 2023-03-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 358–688（331 aa）	未记录	ZWK [4-(1-aminophthalazin-6-yl)piperazin-1-yl](2-methylphenyl)methanone × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；22% PEG 3350, 50-100 mM Ammonium Sulphate and 100 mM TRIS pH 7.5-8.0	分辨率 2.60 Å R-free 0.281
8GMN Crystal structure of human C1s in complex with inhibitor 提交 2023-03-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 358–688（331 aa）	未记录	ZWK [4-(1-aminophthalazin-6-yl)piperazin-1-yl](2-methylphenyl)methanone × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；22% PEG 3350, 50-100 mM Ammonium Sulphate and 100 mM TRIS pH 7.5-8.0	分辨率 2.60 Å R-free 0.281
8GMN Crystal structure of human C1s in complex with inhibitor 提交 2023-03-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 358–688（331 aa）	未记录	ZWK [4-(1-aminophthalazin-6-yl)piperazin-1-yl](2-methylphenyl)methanone × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；22% PEG 3350, 50-100 mM Ammonium Sulphate and 100 mM TRIS pH 7.5-8.0	分辨率 2.60 Å R-free 0.281
8GMN Crystal structure of human C1s in complex with inhibitor 提交 2023-03-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 358–688（331 aa）	未记录	ZWK [4-(1-aminophthalazin-6-yl)piperazin-1-yl](2-methylphenyl)methanone × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；22% PEG 3350, 50-100 mM Ammonium Sulphate and 100 mM TRIS pH 7.5-8.0	分辨率 2.60 Å R-free 0.281
8TYP Complement Protease C1s Inhibited by 6-(4-phenylpiperazin-1-yl)pyridine-3-carboximidamide 提交 2023-08-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 358–688（331 aa）	未记录	SQT 6-(4-phenylpiperazin-1-yl)pyridine-3-carboximidamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；0.2 M sodium acetate 0.1 M Tris-HCl (pH 8.1) PEG-4000 24% (w/v)	分辨率 1.80 Å R-free 0.196
8W18 The crystal structure of the Michaelis-Menten complex of a C1s/C1-INH at 3.94 Angstroms 提交 2024-02-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 292–437（146 aa）片段：Sushi domains 链 B 438–688（251 aa）	突变：S632A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.1 M L-Proline, 0.1M HEPES (pH 6.5), and 12% PEG 3,350	分辨率 3.94 Å R-free 0.281
9X1H Cryo-EM Structure of human complement C1s CUB domain in complex with RAY121 提交 2025-10-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 16–292（277 aa）链 B 16–292（277 aa）	未记录	CA CALCIUM ION × 4	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20mM HEPES(7.5), 150mM NaCl, 3mM CaCl2, 0.03% DDM cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å

共 13 个其他 PDB 条目、23 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	C1S_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–276； UniProt 17–292 作者链 D； PDB构建体 1–276； UniProt 17–292

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6f1h
沉积日期 deposition_date	2017-11-22
结构标题 title	C1rC1s complex
关键词 keywords	CUB domain, EGF-like domain, complement, C1r-C1s, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	44.64 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	44.68 Å
零角强度 I(0) i0	270978000.00
分子量 molecular_weight	132770.0 kDa
排除体积 excluded_volume	164650 Å³
包络体积 envelope_volume	243920 Å³
水化壳体积 shell_volume	46967 Å³
包络直径 envelope_diameter	163.9 Å
壳层 Rg shell_rg	46.77 Å
包络 Rg envelope_rg	44.22 Å
形状 Rg shape_rg	44.67 Å
总 Rg total_rg	44.84 Å
总原子数 total_atoms	9318
残基数 n_residues	1128
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	155.2 Å
Rg (实空间) rg_real	44.80 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.65 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.7100e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.3220e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	44.64 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	270900000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8552
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	57.6 Å
偏度 Skewness skewness	0.351
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.355
角度范围 angular_range	— – 0.1750 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	17940000.0000
实空间数据点数 n_real_points	36
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.856; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.859; Smooth: 0.686

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Complement C1r subcomponent
分子量 formula_weight	33121.0 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.21.41
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,C
原子数 atom_count	9318

SIPIPQKLFGEVTSPLFPKPYPNNFETTTVITVPTGYRVKLVFQQFDLEPSEGCFYDYVKISADKKSLGRFCGQLGSPLGNPPGKKEFMSQGNKMLLTFHTDFSNEENGTIMFYKGFLAYYQAVDLDECASRSKSGEEDPQPQCQHLCHNYVGGYFCSCRPGYELQEDTHSCQAECSSELYTEASGYISSLEYPRSYPPDLRCNYSIRVERGLTLHLKFLEPFDIDDHQQVHCPYDQLQIYANGKNIGEFCGKQRPPDLDTSSNAVDLLFFTDESGDSRGWKLRYTTEIIK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Cricetulus griseus

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Complement C1s subcomponent
分子量 formula_weight	31115.5 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.21.42
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,B

PTMYGEILSPNYPQAYPSEVEKSWDIEVPEGYGIHLYFTHLDIELSENCAYDSVQIISGDTEEGRLCGQRSSNNPHSPIVEEFQVPYNKLQVIFKSDFSNEERFTGFAAYYVATDINECTDFVDVPCSHFCNNFIGGYFCSCPPEYFLHDDMKNCGVNCSGDVFTALIGEIASPNYPKPYPENSRCEYQIRLEKGFQVVVTLRREDFDVEAADSAGNCLDSLVFVAGDRQFGPYCGHGFPGPLNIETKSNALDIIFQTDLTGQKKGWKLRYHGDPM

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Cricetulus griseus

实体 3 Entity 3 branched

描述 description	;2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-beta-D-galactopyranose-(1-4)-alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;
分子量 formula_weight	1276.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 branched

描述 description	;beta-D-galactopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;
分子量 formula_weight	1276.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 branched

描述 description	beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	586.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	12

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	SODIUM ION
分子量 formula_weight	23.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 8 Entity 8 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

实体 9 Entity 9 non-polymer

描述 description	LYSINE
分子量 formula_weight	147.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	88.209 Å
晶胞边长 b length_b	88.340 Å
晶胞边长 c length_c	197.559 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.500 Å
最低分辨率 resolution_low	80.645 Å
R 因子 r_factor	0.3052
R_work r_work	0.3035
R_free r_free	0.3398

fit	/app/data/saxs_computation/f1/6f1h/6f1h.fit
pddf	/app/data/pr_computation/f1/6f1h/6f1h.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/f1/6f1h/6f1h.dat

C1rC1s complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Complement C1r subcomponent

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Complement C1s subcomponent

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 branched

实体 4 Entity 4 branched

实体 5 Entity 5 branched

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 non-polymer

实体 9 Entity 9 non-polymer

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)