6gl9

Crystal structure of JAK3 in complex with Compound 10 (FM475)

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 94.5 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Tyrosine-protein kinase JAK3

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 812–1103	未记录	F3W (~{E})-3-[3-(3-cyclohexyl-3,5,8,10-tetrazatricyclo[7.3.0.0^{2,6}]dodeca-1(9),2(6),4,7,11-pentaen-4-yl)phenyl]prop-2-enenitrile × 1 PHU 1-phenylurea × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；24-30% PEG 3350, 0.1 M MES, pH 5.5-6.0 and 0.1-0.2 M MgCl2	分辨率 1.70 Å R-free 0.244
2	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 812–1103	未记录	F3W (~{E})-3-[3-(3-cyclohexyl-3,5,8,10-tetrazatricyclo[7.3.0.0^{2,6}]dodeca-1(9),2(6),4,7,11-pentaen-4-yl)phenyl]prop-2-enenitrile × 1 PHU 1-phenylurea × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；24-30% PEG 3350, 0.1 M MES, pH 5.5-6.0 and 0.1-0.2 M MgCl2	分辨率 1.70 Å R-free 0.244

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6GL9	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1YVJ Crystal structure of the Jak3 kinase domain in complex with a staurosporine analogue 提交 2005-02-15	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 814–1103（290 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	DTV (2S,3S)-1,4-DIMERCAPTOBUTANE-2,3-DIOL × 2 4ST 1,2,3,4-TETRAHYDROGEN-STAUROSPORINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；malonate, glycerol, pipes, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.55 Å R-free 0.254
3LXK Structural and Thermodynamic Characterization of the TYK2 and JAK3 Kinase Domains in Complex with CP-690550 and CMP-6 提交 2010-02-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 806–1124（319 aa）片段：Kinase Domain	突变：C1048S	MI1 3-{(3R,4R)-4-methyl-3-[methyl(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]piperidin-1-yl}-3-oxopropanenitrile × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG-3350, 0.2 M Ammonium Sulfate, 0.02% Phenylurea, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.00 Å R-free 0.265
3LXL Structural and Thermodynamic Characterization of the TYK2 and JAK3 Kinase Domains in Complex with CP-690550 and CMP-6 提交 2010-02-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 806–1124（319 aa）片段：Kinase Domain	突变：C1048S	IZA 2-TERT-BUTYL-9-FLUORO-3,6-DIHYDRO-7H-BENZ[H]-IMIDAZ[4,5-F]ISOQUINOLINE-7-ONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；20% PEG-3350, 0.2 M Ammonium Sulfate, 0.02% phenylurea, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.74 Å R-free 0.227
3PJC Crystal structure of JAK3 complexed with a potent ATP site inhibitor showing high selectivity within the Janus kinase family 提交 2010-11-09	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 812–1124（313 aa）片段：UNP residues 812-1124	未记录	PJC 3-(1H-indol-3-yl)-4-[2-(4-oxopiperidin-1-yl)-5-(trifluoromethyl)pyrimidin-4-yl]-1H-pyrrole-2,5-dione × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；CO-CRYSTALLIZATION WITH COMPOUND NVP-BLZ295 ADDED BEFORE CONCENTRATION OF THE PROTEIN AT 3 FOLD MOLAR EXCESS. 8% PEG 4000, 0.05 M MES PH 6.5, 0.01 M MGCL2. PROTEIN AT 10.0 MG/ML. CRYOPROTECTION: 30% GLYCEROL + WELL SOLUTION, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 2.20 Å R-free 0.215
3ZC6 Crystal structure of JAK3 kinase domain in complex with an indazole substituted pyrrolopyrazine inhibitor 提交 2012-11-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 813–1100（288 aa）片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 813-1100	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	VFC N-[(2R)-1-(3-cyanoazetidin-1-yl)-1-oxidanylidene-propan-2-yl]-2-(6-fluoranyl-1-methyl-indazol-3-yl)-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 CL CHLORIDE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.42 Å R-free 0.254
3ZC6 Crystal structure of JAK3 kinase domain in complex with an indazole substituted pyrrolopyrazine inhibitor 提交 2012-11-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 813–1100（288 aa）片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 813-1100	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	VFC N-[(2R)-1-(3-cyanoazetidin-1-yl)-1-oxidanylidene-propan-2-yl]-2-(6-fluoranyl-1-methyl-indazol-3-yl)-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxamide × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.42 Å R-free 0.254
3ZC6 Crystal structure of JAK3 kinase domain in complex with an indazole substituted pyrrolopyrazine inhibitor 提交 2012-11-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 813–1100（288 aa）片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 813-1100	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	VFC N-[(2R)-1-(3-cyanoazetidin-1-yl)-1-oxidanylidene-propan-2-yl]-2-(6-fluoranyl-1-methyl-indazol-3-yl)-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxamide × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.42 Å R-free 0.254
3ZC6 Crystal structure of JAK3 kinase domain in complex with an indazole substituted pyrrolopyrazine inhibitor 提交 2012-11-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 813–1100（288 aa）片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 813-1100	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	VFC N-[(2R)-1-(3-cyanoazetidin-1-yl)-1-oxidanylidene-propan-2-yl]-2-(6-fluoranyl-1-methyl-indazol-3-yl)-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.42 Å R-free 0.254
3ZEP Crystal Structure of JAK3 Kinase Domain in Complex with a Pyrrolopyrazine-2-phenyl Ether Inhibitor 提交 2012-12-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 813–1100（288 aa）片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 813-1100	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	1NX 2-[[(3R)-3-acetamido-2,3-dihydro-1H-inden-5-yl]oxy]-N-[(1S)-1-cyclopropylethyl]-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.35 Å R-free 0.265
3ZEP Crystal Structure of JAK3 Kinase Domain in Complex with a Pyrrolopyrazine-2-phenyl Ether Inhibitor 提交 2012-12-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 813–1100（288 aa）片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 813-1100	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	1NX 2-[[(3R)-3-acetamido-2,3-dihydro-1H-inden-5-yl]oxy]-N-[(1S)-1-cyclopropylethyl]-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.35 Å R-free 0.265
3ZEP Crystal Structure of JAK3 Kinase Domain in Complex with a Pyrrolopyrazine-2-phenyl Ether Inhibitor 提交 2012-12-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 813–1100（288 aa）片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 813-1100	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	1NX 2-[[(3R)-3-acetamido-2,3-dihydro-1H-inden-5-yl]oxy]-N-[(1S)-1-cyclopropylethyl]-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxamide × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.35 Å R-free 0.265
3ZEP Crystal Structure of JAK3 Kinase Domain in Complex with a Pyrrolopyrazine-2-phenyl Ether Inhibitor 提交 2012-12-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 813–1100（288 aa）片段：KINASE DOMAIN, RESIDUES 813-1100	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	1NX 2-[[(3R)-3-acetamido-2,3-dihydro-1H-inden-5-yl]oxy]-N-[(1S)-1-cyclopropylethyl]-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.35 Å R-free 0.265
4HVD JAK3 kinase domain in complex with 2-Cyclopropyl-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxylic acid ((S)-1,2,2-trimethyl-propyl)-amide 提交 2012-11-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 811–1124（314 aa）片段：RESIDUES 811-1124	突变：C1040S, C1048S	PHU 1-phenylurea × 1 933 2-cyclopropyl-N-[(2S)-3,3-dimethylbutan-2-yl]-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；30% PEG3350, 0.1M MES, 0.2M MgCl, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.85 Å R-free 0.259
4HVG JAK3 kinase domain in complex with 2-Cyclopropyl-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxylic acid ((S)-2-hydroxy-1,2-dimethyl-propyl)-amide 提交 2012-11-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 811–1124（314 aa）片段：RESIDUES 811-1124	突变：C1040S, C1048S	19Q 2-cyclopropyl-N-[(2S)-3-hydroxy-3-methylbutan-2-yl]-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；30% PEG3350, 0.1M MES, 0.2M MgCl, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.75 Å R-free 0.274
4HVH JAK3 kinase domain in complex with 2-Cyclopropyl-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxylic acid ((R)-2-hydroxy-1,2-dimethyl-propyl 提交 2012-11-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 811–1124（314 aa）片段：RESIDUES 811-1124	突变：C1040S, C1048S	19R 2-cyclopropyl-N-[(2R)-3-hydroxy-3-methylbutan-2-yl]-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；30% PEG3350, 0.1M MES, 0.2M MgCl, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.30 Å R-free 0.283
4HVI JAK3 kinase domain in complex with 2-Cyclopropyl-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxylic acid ((R)-1-methyl-2-oxo-2-piperidin-1-yl-ethyl)-amide 提交 2012-11-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 811–1124（314 aa）片段：RESIDUES 811-1124	突变：C1040S, C1048S	19S 2-cyclopropyl-N-[(2R)-1-oxo-1-(piperidin-1-yl)propan-2-yl]-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；30% PEG3350, 0.1M MES, 0.2M MgCl, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.40 Å R-free 0.303
4I6Q JAK3 kinase domain in complex with 2-Phenoxy-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxylic acid ((S)-1-cyclopropyl-ethyl)-amide 提交 2012-11-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 811–1124（314 aa）片段：RESIDUES 811-1124, PROTEIN KINASE DOMAIN	突变：C1040S, C1048S	PHU 1-phenylurea × 1 1DT N-[(1S)-1-cyclopropylethyl]-2-phenoxy-5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazine-7-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；30% PEG3350, 0.1M MES, 0.2M MgCl, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.85 Å R-free 0.245
4QPS Crystal structure of Jak3 complexed to N-[3-(6-Phenylamino-pyrazin-2-yl)-3H-benzoimidazol-5-yl]-acrylamide 提交 2014-06-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 811–1103（293 aa）片段：Jak3, unp residues 811-1103	突变：C1040S, C1048S, D949A	37Q N-{1-[6-(phenylamino)pyrazin-2-yl]-1H-benzimidazol-6-yl}prop-2-enamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；291 K；25% PEG-3350, 0.2 M ammonium sulfate and 0.1 M BisTRIS pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K	分辨率 1.80 Å R-free 0.251
4QPS Crystal structure of Jak3 complexed to N-[3-(6-Phenylamino-pyrazin-2-yl)-3H-benzoimidazol-5-yl]-acrylamide 提交 2014-06-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 811–1103（293 aa）片段：Jak3, unp residues 811-1103	突变：C1040S, C1048S, D949A	37Q N-{1-[6-(phenylamino)pyrazin-2-yl]-1H-benzimidazol-6-yl}prop-2-enamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；291 K；25% PEG-3350, 0.2 M ammonium sulfate and 0.1 M BisTRIS pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 291K	分辨率 1.80 Å R-free 0.251
4QT1 JAK3 kinase domain in complex with 1-[(3S)-1-isobutylsulfonyl-3-piperidyl]-3-(5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazin-2-yl)urea 提交 2014-07-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 811–1124（314 aa）片段：RESIDUES 811-1124, PROTEIN KINASE DOMAIN	突变：C1040S, C1048S	3C9 1-{(3S)-1-[(2-methylpropyl)sulfonyl]piperidin-3-yl}-3-(5H-pyrrolo[2,3-b]pyrazin-2-yl)urea × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；30% PEG 3350, 0.1M MES, 0.2M MgCl, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.40 Å R-free 0.273
4RIO Crystal structure of JAK3 kinase domain in complex with a pyrrolopyridazine carboxamide inhibitor 提交 2014-10-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 810–1100（291 aa）片段：KINASE DOMAIN (UNP residues 810-1100)	突变：C811S, C1040S, C1048S	3QX 4-{[(1R,2S)-2-fluoro-2-methylcyclopentyl]amino}pyrrolo[1,2-b]pyridazine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；293 K；30% PEG-3350, 200MM MAGNESIUM CHLORIDE 100MM BIS-TRIS PH 5.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.69 Å R-free 0.281
4V0G JAK3 in complex with a covalent EGFR inhibitor 提交 2014-09-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 816–1098（283 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 816-1098	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	G9B N-[3-(2-{3-amino-6-[1-(1-methylpiperidin-4-yl)-1H-pyrazol-4-yl]pyrazin-2-yl}-1H-benzimidazol-1-yl)phenyl]propanamide × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å R-free 0.295
4V0G JAK3 in complex with a covalent EGFR inhibitor 提交 2014-09-16	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 816–1098（283 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP RESIDUES 816-1098	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	G9B N-[3-(2-{3-amino-6-[1-(1-methylpiperidin-4-yl)-1H-pyrazol-4-yl]pyrazin-2-yl}-1H-benzimidazol-1-yl)phenyl]propanamide × 1	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 3.00 Å R-free 0.295
4Z16 Crystal Structure of the Jak3 Kinase Domain Covalently Bound to N-(3-(((5-chloro-2-((2-methoxy-4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl)amino)pyrimidin-4-yl)amino)methyl)phenyl)acrylamide 提交 2015-03-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 811–1124（314 aa）片段：UNP residues 811-1124	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	4LH N-(3-{[(5-chloro-2-{[2-methoxy-4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrimidin-4-yl)amino]methyl}phenyl)prop-2-enamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M Bis-tris pH 6.5, 16% PEG 3350, 0.2 M ammonium sulfate, 5 mM TCEP	分辨率 2.90 Å R-free 0.240
4Z16 Crystal Structure of the Jak3 Kinase Domain Covalently Bound to N-(3-(((5-chloro-2-((2-methoxy-4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl)amino)pyrimidin-4-yl)amino)methyl)phenyl)acrylamide 提交 2015-03-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 811–1124（314 aa）片段：UNP residues 811-1124	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	4LH N-(3-{[(5-chloro-2-{[2-methoxy-4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrimidin-4-yl)amino]methyl}phenyl)prop-2-enamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M Bis-tris pH 6.5, 16% PEG 3350, 0.2 M ammonium sulfate, 5 mM TCEP	分辨率 2.90 Å R-free 0.240
4Z16 Crystal Structure of the Jak3 Kinase Domain Covalently Bound to N-(3-(((5-chloro-2-((2-methoxy-4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl)amino)pyrimidin-4-yl)amino)methyl)phenyl)acrylamide 提交 2015-03-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 811–1124（314 aa）片段：UNP residues 811-1124	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	4LH N-(3-{[(5-chloro-2-{[2-methoxy-4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrimidin-4-yl)amino]methyl}phenyl)prop-2-enamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M Bis-tris pH 6.5, 16% PEG 3350, 0.2 M ammonium sulfate, 5 mM TCEP	分辨率 2.90 Å R-free 0.240
4Z16 Crystal Structure of the Jak3 Kinase Domain Covalently Bound to N-(3-(((5-chloro-2-((2-methoxy-4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl)amino)pyrimidin-4-yl)amino)methyl)phenyl)acrylamide 提交 2015-03-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 811–1124（314 aa）片段：UNP residues 811-1124	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	4LH N-(3-{[(5-chloro-2-{[2-methoxy-4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}pyrimidin-4-yl)amino]methyl}phenyl)prop-2-enamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；0.1 M Bis-tris pH 6.5, 16% PEG 3350, 0.2 M ammonium sulfate, 5 mM TCEP	分辨率 2.90 Å R-free 0.240
5LWM Crystal structure of JAK3 in complex with Compound 4 (FM381) 提交 2016-09-18	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 812–1103（292 aa）	未记录	79T 2-cyano-3-[5-(3-cyclohexyl-3,5,8,10-tetrazatricyclo[7.3.0.0^{2,6}]dodeca-1,4,6,8,11-pentaen-4-yl)furan-2-yl]-~{N},~{N}-dimethyl-prop-2-enamide × 1 PHU 1-phenylurea × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；18-25% PEG 3350, 0.1-0.2 M MgCl2 and 0.1 M MES, pH 5.5-6.1	分辨率 1.55 Å R-free 0.204
5LWN Crystal structure of JAK3 in complex with Compound 5 (FM409) 提交 2016-09-18	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 812–1103（292 aa）	未记录	PHU 1-phenylurea × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 79R (~{Z})-2-cyano-~{N},~{N}-dimethyl-3-[5-[3-[(1~{S},2~{R})-2-methylcyclohexyl]-3,5,8,10-tetrazatricyclo[7.3.0.0^{2,6}]dodeca-1,4,6,8,11-pentaen-4-yl]furan-2-yl]prop-2-enamide × 1 79S (2~{S})-2-cyano-~{N},~{N}-dimethyl-3-[5-[3-[(1~{S},2~{R})-2-methylcyclohexyl]-3,5,8,10-tetrazatricyclo[7.3.0.0^{2,6}]dodeca-1,4,6,8,11-pentaen-4-yl]furan-2-yl]propanamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；18-25% PEG 3350, 0.1-0.2 M MgCl2 and 0.1 M MES, pH 5.5-6.1	分辨率 1.60 Å R-free 0.209
5TOZ JAK3 with covalent inhibitor PF-06651600 提交 2016-10-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 812–1124（313 aa）片段：UNP residues 812-1124	未记录	7H4 1-{(2S,5R)-2-methyl-5-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]piperidin-1-yl}propan-1-one × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；20% PEG-3350, 0.2 M ammonium sulfate	分辨率 1.98 Å R-free 0.215
5TTS Jak3 with covalent inhibitor 4 提交 2016-11-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 812–1124（313 aa）片段：Kinase domain (UNP residues 812-1124)	突变：C1048S	7KU 1-{(3R)-3-[(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)amino]piperidin-1-yl}propan-1-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；20% PEG 3350, 0.2M (NH4)2SO4, 2% phenylurea	分辨率 2.34 Å R-free 0.263
5TTU Jak3 with covalent inhibitor 7 提交 2016-11-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 812–1124（313 aa）片段：Kinase domain (UNP residues 812-1124)	突变：C1048S	7KV 1-[(3aR,7aR)-1-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)octahydro-6H-pyrrolo[2,3-c]pyridin-6-yl]propan-1-one × 1 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；20% PEG 3350, 0.2M (NH4)2SO4, 2% phenylurea	分辨率 1.72 Å R-free 0.212
5TTV Jak3 with covalent inhibitor 6 提交 2016-11-04	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 812–1124（313 aa）片段：Kinase domain (UNP residues 812-1124)	突变：C1048S	7KX N-[3-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)phenyl]propanamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；298 K；20% PEG 3350, 0.2M (NH4)2SO4, 2% phenylurea	分辨率 1.93 Å R-free 0.250
5VO6 CRYSTAL STRUCTURE OF JAK3 KINASE DOMAIN IN COMPLEX WITH A PYRROLOPYRIDAZINE INHIBITOR 提交 2017-05-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 812–1100（289 aa）片段：KINASE DOMAIN (UNP RESIDUES 810-1100)	突变：YES	9J4 4-{[(1R,3S)-3-amino-2,2,3-trimethylcyclopentyl]amino}-6-phenylpyrrolo[1,2-b]pyridazine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；NULL	分辨率 2.65 Å R-free 0.284
5W86 CRYSTAL STRUCTURE OF JAK3 KINASE DOMAIN WITH A 4,6-DIAMINONICOTINAMIDE INHIBITOR (COMPOUND NUMBER 7) 提交 2017-06-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 814–1100（287 aa）片段：KINASE DOMAIN (UNP RESIDUES 810-1100)	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	9YV 4-(benzylamino)-6-({4-[(1-methylpiperidin-4-yl)carbamoyl]phenyl}amino)pyridine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K	分辨率 2.61 Å R-free 0.264
5W86 CRYSTAL STRUCTURE OF JAK3 KINASE DOMAIN WITH A 4,6-DIAMINONICOTINAMIDE INHIBITOR (COMPOUND NUMBER 7) 提交 2017-06-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 814–1100（287 aa）片段：KINASE DOMAIN (UNP RESIDUES 810-1100)	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	9YV 4-(benzylamino)-6-({4-[(1-methylpiperidin-4-yl)carbamoyl]phenyl}amino)pyridine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K	分辨率 2.61 Å R-free 0.264
5W86 CRYSTAL STRUCTURE OF JAK3 KINASE DOMAIN WITH A 4,6-DIAMINONICOTINAMIDE INHIBITOR (COMPOUND NUMBER 7) 提交 2017-06-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 814–1100（287 aa）片段：KINASE DOMAIN (UNP RESIDUES 810-1100)	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	9YV 4-(benzylamino)-6-({4-[(1-methylpiperidin-4-yl)carbamoyl]phenyl}amino)pyridine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K	分辨率 2.61 Å R-free 0.264
5W86 CRYSTAL STRUCTURE OF JAK3 KINASE DOMAIN WITH A 4,6-DIAMINONICOTINAMIDE INHIBITOR (COMPOUND NUMBER 7) 提交 2017-06-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 814–1100（287 aa）片段：KINASE DOMAIN (UNP RESIDUES 810-1100)	突变：YES 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	9YV 4-(benzylamino)-6-({4-[(1-methylpiperidin-4-yl)carbamoyl]phenyl}amino)pyridine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K	分辨率 2.61 Å R-free 0.264
5WFJ THE JAK3 KINASE DOMAIN IN COMPLEX WITH A COVALENT INHIBITOR 提交 2017-07-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 810–1100（291 aa）片段：KINASE DOMAIN (UNP RESIDUES 810-1100)	突变：C4S, C233S, C241S	9Z4 4-({[3-(propanoylamino)phenyl]methyl}amino)pyrrolo[1,2-b]pyridazine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K	分辨率 2.48 Å R-free 0.255
6AAK Crystal structure of JAK3 in complex with peficitinib 提交 2018-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 814–1100（287 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP residues 814-1100 链 B 814–1100（287 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP residues 814-1100	突变：C1040S, C1048S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C1040S, C1048S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	9T6 4-[[(1S,3R)-5-oxidanyl-2-adamantyl]amino]-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-5-carboxamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；buffer, salt, precipitant	分辨率 2.67 Å R-free 0.326
6AAK Crystal structure of JAK3 in complex with peficitinib 提交 2018-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 814–1100（287 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP residues 814-1100 链 D 814–1100（287 aa）片段：KINASE DOMAIN, UNP residues 814-1100	突变：C1040S, C1048S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）突变：C1040S, C1048S 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	9T6 4-[[(1S,3R)-5-oxidanyl-2-adamantyl]amino]-1H-pyrrolo[2,3-b]pyridine-5-carboxamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；buffer, salt, precipitant	分辨率 2.67 Å R-free 0.326
6DA4 JAK3 with Cyanamide CP10 提交 2018-05-01	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 812–1124（313 aa）片段：kinase domain	突变：C1048S	G4V (Z)-1-{2,2-difluoro-6-[5-(2-methoxyethyl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl]-2,3-dihydro-4H-1,4-benzoxazin-4-yl}methanimine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；20% PEG 3350, 0.2M (NH4)2SO4, 2% phenylurea	分辨率 2.90 Å R-free 0.263
6DB3 JAK3 with Cyanamide CP23 提交 2018-05-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 812–1124（313 aa）片段：kinase domain	突变：C1048S	G54 [(1S)-1-methyl-6-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl]cyanamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；20% PEG 3350, 0.2M (NH4)2SO4, 2% phenylurea	分辨率 1.97 Å R-free 0.224
6DB4 JAK3 with Cyanamide CP34 提交 2018-05-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 812–1124（313 aa）片段：kinase domain	突变：C1048S	G4Y N-[(1S)-6-(5-phenyl-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl]imidoformamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；20% PEG 3350, 0.2M (NH4)2SO4, 2% phenylurea	分辨率 1.66 Å R-free 0.216
6DUD JAK3 with cyanamide CP12 提交 2018-06-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 812–1124（313 aa）片段：kinase domain	突变：C1048S	HB4 N-[(1S)-6-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-2,3-dihydro-1H-inden-1-yl]imidoformamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；20% PEG 3350, 0.2M (NH4)2SO4, 2% phenylurea	分辨率 1.66 Å R-free 0.215
6GLA Crystal structure of JAK3 in complex with Compound 11 (FM481) 提交 2018-05-23	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 812–1103（292 aa）	未记录	F4B (~{E})-3-[5-(3-cyclohexyl-3,5,8,10-tetrazatricyclo[7.3.0.0^{2,6}]dodeca-1(9),2(6),4,7,11-pentaen-4-yl)furan-2-yl]prop-2-enenitrile × 1 PHU 1-phenylurea × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；24-30% PEG 3350, 0.1 M MES, pH 5.5-6.0 and 0.1-0.2 M MgCl2	分辨率 1.92 Å R-free 0.273
6GLA Crystal structure of JAK3 in complex with Compound 11 (FM481) 提交 2018-05-23	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 812–1103（292 aa）	未记录	F4B (~{E})-3-[5-(3-cyclohexyl-3,5,8,10-tetrazatricyclo[7.3.0.0^{2,6}]dodeca-1(9),2(6),4,7,11-pentaen-4-yl)furan-2-yl]prop-2-enenitrile × 1 PHU 1-phenylurea × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；24-30% PEG 3350, 0.1 M MES, pH 5.5-6.0 and 0.1-0.2 M MgCl2	分辨率 1.92 Å R-free 0.273
6GLB Crystal structure of JAK3 in complex with Compound 20 (FM484) 提交 2018-05-23	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 812–1103（292 aa）	未记录	F48 3-[5-(3-cyclohexyl-3,5,8,10-tetrazatricyclo[7.3.0.0^{2,6}]dodeca-1(9),2(6),4,7,11-pentaen-4-yl)furan-2-yl]propanenitrile × 1 PHU 1-phenylurea × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；24-30% PEG 3350, 0.1 M MES, pH 5.5-6.0 and 0.1-0.2 M MgCl2	分辨率 2.00 Å R-free 0.290
6GLB Crystal structure of JAK3 in complex with Compound 20 (FM484) 提交 2018-05-23	配体/离子不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 812–1103（292 aa）	未记录	F48 3-[5-(3-cyclohexyl-3,5,8,10-tetrazatricyclo[7.3.0.0^{2,6}]dodeca-1(9),2(6),4,7,11-pentaen-4-yl)furan-2-yl]propanenitrile × 1 PHU 1-phenylurea × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；24-30% PEG 3350, 0.1 M MES, pH 5.5-6.0 and 0.1-0.2 M MgCl2	分辨率 2.00 Å R-free 0.290
6HZV HUMAN JAK3 IN COMPLEX WITH LASW959 PROTEIN IN COMPLEX WITH LIGAND 提交 2018-10-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 815–1099（285 aa）片段：KINASE DOMAIN	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GYW 3-[7-(2-hydroxyethyl)-9-(oxan-4-yl)-8-oxidanylidene-purin-2-yl]imidazo[1,2-a]pyridine-6-carbonitrile × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；30% PEG3350, 0.1M BIS-TRIS, 0.2M MgCl, pH 6.0	分辨率 2.46 Å R-free 0.275
6HZV HUMAN JAK3 IN COMPLEX WITH LASW959 PROTEIN IN COMPLEX WITH LIGAND 提交 2018-10-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 815–1099（285 aa）片段：KINASE DOMAIN	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GYW 3-[7-(2-hydroxyethyl)-9-(oxan-4-yl)-8-oxidanylidene-purin-2-yl]imidazo[1,2-a]pyridine-6-carbonitrile × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；30% PEG3350, 0.1M BIS-TRIS, 0.2M MgCl, pH 6.0	分辨率 2.46 Å R-free 0.275
6HZV HUMAN JAK3 IN COMPLEX WITH LASW959 PROTEIN IN COMPLEX WITH LIGAND 提交 2018-10-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 815–1099（285 aa）片段：KINASE DOMAIN	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GYW 3-[7-(2-hydroxyethyl)-9-(oxan-4-yl)-8-oxidanylidene-purin-2-yl]imidazo[1,2-a]pyridine-6-carbonitrile × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；30% PEG3350, 0.1M BIS-TRIS, 0.2M MgCl, pH 6.0	分辨率 2.46 Å R-free 0.275
6HZV HUMAN JAK3 IN COMPLEX WITH LASW959 PROTEIN IN COMPLEX WITH LIGAND 提交 2018-10-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 815–1099（285 aa）片段：KINASE DOMAIN	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GYW 3-[7-(2-hydroxyethyl)-9-(oxan-4-yl)-8-oxidanylidene-purin-2-yl]imidazo[1,2-a]pyridine-6-carbonitrile × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；30% PEG3350, 0.1M BIS-TRIS, 0.2M MgCl, pH 6.0	分辨率 2.46 Å R-free 0.275
6NY4 Crystal structure of JAK3 kinase domain in complex with a pyrrolopyridazine carboxamide inhibitor 提交 2019-02-11	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 810–1100（291 aa）片段：kinase domain (UNP residues 810-1100)	突变：C811S,C1040S,C1048S	Z3A 4-{[(2R,3R)-1,3-dihydroxybutan-2-yl]amino}-6-phenylpyrrolo[1,2-b]pyridazine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；293 K；30% PEG3350, 200 mM magnesium chloride, 100 mM Bis-Tris, pH 5.8	分辨率 2.33 Å R-free 0.241
7APF Crystal structure of JAK3 in complex with FM601 (compound 10a) 提交 2020-10-16	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 812–1103（292 aa）	未记录	RQZ 3-[3-(propanoylamino)phenyl]-1~{H}-pyrrolo[2,3-b]pyridine-5-carboxamide × 1 PHU 1-phenylurea × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277.15 K；25% PEG 3350, 0.1-0.2 M MgCl2, 0.1 M MES, pH 5.5	分辨率 1.95 Å R-free 0.255
7APF Crystal structure of JAK3 in complex with FM601 (compound 10a) 提交 2020-10-16	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 812–1103（292 aa）	未记录	RQZ 3-[3-(propanoylamino)phenyl]-1~{H}-pyrrolo[2,3-b]pyridine-5-carboxamide × 1 PHU 1-phenylurea × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277.15 K；25% PEG 3350, 0.1-0.2 M MgCl2, 0.1 M MES, pH 5.5	分辨率 1.95 Å R-free 0.255
7APG Crystal structure of JAK3 in complex with FM587 (compound 9a) 提交 2020-10-16	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 812–1103（292 aa）	未记录	RQT ~{N}-[3-(1~{H}-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)phenyl]propanamide × 1 PHU 1-phenylurea × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277.15 K；25% PEG 3350, 0.1-0.2 M MgCl2 and 0.1 M MES, pH 5.5	分辨率 2.40 Å R-free 0.256
7APG Crystal structure of JAK3 in complex with FM587 (compound 9a) 提交 2020-10-16	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 812–1103（292 aa）	未记录	RQT ~{N}-[3-(1~{H}-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)phenyl]propanamide × 1 PHU 1-phenylurea × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277.15 K；25% PEG 3350, 0.1-0.2 M MgCl2 and 0.1 M MES, pH 5.5	分辨率 2.40 Å R-free 0.256
7APG Crystal structure of JAK3 in complex with FM587 (compound 9a) 提交 2020-10-16	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 812–1103（292 aa）	未记录	RQT ~{N}-[3-(1~{H}-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)phenyl]propanamide × 1 PHU 1-phenylurea × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277.15 K；25% PEG 3350, 0.1-0.2 M MgCl2 and 0.1 M MES, pH 5.5	分辨率 2.40 Å R-free 0.256
7APG Crystal structure of JAK3 in complex with FM587 (compound 9a) 提交 2020-10-16	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 812–1103（292 aa）	未记录	RQT ~{N}-[3-(1~{H}-pyrrolo[2,3-b]pyridin-3-yl)phenyl]propanamide × 1 PHU 1-phenylurea × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277.15 K；25% PEG 3350, 0.1-0.2 M MgCl2 and 0.1 M MES, pH 5.5	分辨率 2.40 Å R-free 0.256
7C3N Crystal structure of JAK3 in complex with Delgocitinib 提交 2020-05-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 812–1124（313 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	FHX 3-[(3S,4R)-3-methyl-7-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-1,7-diazaspiro[3.4]octan-1-yl]-3-oxidanylidene-propanenitrile × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277.15 K；50mM Pipes pH6.0, 1.1M sodium malonate, 1.6% glycerol, 10mM DTT	分辨率 1.98 Å R-free 0.194
7Q6H HUMAN JAK3 KINASE DOMAIN WITH 1-(4-((2-((1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)amino)quinazolin-8-yl)amino)piperidin-1-yl)ethan-1-one 提交 2021-11-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 AAA 806–1124（319 aa）	未记录	934 1-[4-[[2-[(1-methylpyrazol-4-yl)amino]quinazolin-8-yl]amino]piperidin-1-yl]ethanone × 1 SO4 SULFATE ION × 1 PHU 1-phenylurea × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；8-20% PEG3350 and 0.2-0.3M ammonium sulphate (AS). 2% phenylurea	分辨率 1.75 Å R-free 0.220
7UYV Crystal structure of JAK3 kinase domain in complex with compound 25 提交 2022-05-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 810–1100（291 aa）片段：KINASE DOMAIN	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	OV5 6-{[(2M)-2-(2-chloro-6-fluorophenyl)-5-oxo-5H-pyrrolo[3,4-b]pyridin-4-yl]amino}-N-ethylpyridine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；Crystals of human JAK3 in complex with the ligand were prepared according to established protocols	分辨率 2.15 Å R-free 0.263
7UYV Crystal structure of JAK3 kinase domain in complex with compound 25 提交 2022-05-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 810–1100（291 aa）片段：KINASE DOMAIN	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	OV5 6-{[(2M)-2-(2-chloro-6-fluorophenyl)-5-oxo-5H-pyrrolo[3,4-b]pyridin-4-yl]amino}-N-ethylpyridine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；Crystals of human JAK3 in complex with the ligand were prepared according to established protocols	分辨率 2.15 Å R-free 0.263
7UYV Crystal structure of JAK3 kinase domain in complex with compound 25 提交 2022-05-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 810–1100（291 aa）片段：KINASE DOMAIN	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	OV5 6-{[(2M)-2-(2-chloro-6-fluorophenyl)-5-oxo-5H-pyrrolo[3,4-b]pyridin-4-yl]amino}-N-ethylpyridine-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；Crystals of human JAK3 in complex with the ligand were prepared according to established protocols	分辨率 2.15 Å R-free 0.263
7UYV Crystal structure of JAK3 kinase domain in complex with compound 25 提交 2022-05-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 810–1100（291 aa）片段：KINASE DOMAIN	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	OV5 6-{[(2M)-2-(2-chloro-6-fluorophenyl)-5-oxo-5H-pyrrolo[3,4-b]pyridin-4-yl]amino}-N-ethylpyridine-3-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；298 K；Crystals of human JAK3 in complex with the ligand were prepared according to established protocols	分辨率 2.15 Å R-free 0.263
8EXM Crystal structure of PTP1B D181A/Q262A phosphatase domain with a JAK3 activation loop phosphopeptide 提交 2022-10-25	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 973–988（16 aa）片段：residues 973-988 of JAK3	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 1 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；281.15 K；12% Peg 4K, 0.15 M Calcium acetate, 0.05 M MES (pH 6.5)	分辨率 2.35 Å R-free 0.247
9R5Z Crystal structure of JAK3 with GCL258 提交 2025-05-11	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 812–1103（292 aa）	未记录	A1JJU 3-(3-cyclohexyl-3,8,10-triazatricyclo[7.3.0.0^{2,6}]dodeca-1,4,6,8,11-pentaen-5-yl)benzenesulfonyl fluoride × 1 PHU 1-phenylurea × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；31% PEG 3350, 0.2M MgCl2, 0.1M MES pH5.5.	分辨率 1.80 Å R-free 0.289
9R5Z Crystal structure of JAK3 with GCL258 提交 2025-05-11	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 812–1103（292 aa）	未记录	A1JJU 3-(3-cyclohexyl-3,8,10-triazatricyclo[7.3.0.0^{2,6}]dodeca-1,4,6,8,11-pentaen-5-yl)benzenesulfonyl fluoride × 1 PHU 1-phenylurea × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；31% PEG 3350, 0.2M MgCl2, 0.1M MES pH5.5.	分辨率 1.80 Å R-free 0.289

共 41 个其他 PDB 条目、69 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	JAK3_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–294； UniProt 812–1103 作者链 B； PDB构建体 3–294； UniProt 812–1103

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6gl9
沉积日期 deposition_date	2018-05-23
结构标题 title	Crystal structure of JAK3 in complex with Compound 10 (FM475)
关键词 keywords	;KINASE, JAK3, COVALENT INHIBITOR, REVERSIBLE COVALENT INHIBITOR, INDUCED POCKET, ARGININE POCKET, STRUCTURAL GENOMICS CONSORTIUM, SGC, TRANSFERASE ;; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	28.19 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	27.22 Å
零角强度 I(0) i0	74788400.00
分子量 molecular_weight	67850.0 kDa
排除体积 excluded_volume	85034 Å³
包络体积 envelope_volume	103980 Å³
水化壳体积 shell_volume	32105 Å³
包络直径 envelope_diameter	96.4 Å
壳层 Rg shell_rg	34.23 Å
包络 Rg envelope_rg	27.19 Å
形状 Rg shape_rg	27.21 Å
总 Rg total_rg	27.98 Å
总原子数 total_atoms	4774
残基数 n_residues	583
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	94.5 Å
Rg (实空间) rg_real	28.14 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.54 Å
I(0) (实空间) i0_real	7.4790e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.0320e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	28.16 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	74790000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8910
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	32.0 Å
偏度 Skewness skewness	0.283
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.458
角度范围 angular_range	— – 0.2800 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0001
最高正则化参数 α highest_alpha	17390000.0000
实空间数据点数 n_real_points	57
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.870; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.980; Smooth: 0.989

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Tyrosine-protein kinase JAK3
分子量 formula_weight	33417.3 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.10.2
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	5182

SMQDPTIFEERHLKYISQLGKGNFGSVELCRYDPLGDNTGALVAVKQLQHSGPDQQRDFQREIQILKALHSDFIVKYRGVSYGPGRQSLRLVMEYLPSGCLRDFLQRHRARLDASRLLLYSSQICKGMEYLGSRRCVHRALAARNILVESEAHVKIADFGLAKLLPLDKDYYVVREPGQSPIFWYAPESLSDNIFSRQSDVWSFGVVLYELFTYCDKSCSPSAEFLRMMGSERDVPALSRLLELLEEGQRLPAPPACPAEVHELMKLCWAPSPQDRPSFSALGPQLDMLWSGSR

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Spodoptera frugiperda

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	(~{E})-3-[3-(3-cyclohexyl-3,5,8,10-tetrazatricyclo[7.3.0.0^{2,6}]dodeca-1(9),2(6),4,7,11-pentaen-4-yl)phenyl]prop-2-enenitrile
分子量 formula_weight	367.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	1-phenylurea
分子量 formula_weight	136.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	13

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	321

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d6gl9a_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.144 — Protein kinase-like (PK-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.144.1 — Protein kinase-like (PK-like)
家族 Family family	d.144.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d6gl9b_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.144 — Protein kinase-like (PK-like)
超家族 Superfamily superfamily	d.144.1 — Protein kinase-like (PK-like)
家族 Family family	d.144.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	6gl9A01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	6gl9A02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

结构域编号 domain_id	6gl9B01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	6gl9B02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	42.020 Å
晶胞边长 b length_b	50.424 Å
晶胞边长 c length_c	61.588 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	91.93 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.03 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	92.80 °
晶胞分子数 Z z_pdb	2

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.700 Å
最低分辨率 resolution_low	19.810 Å
R 因子 r_factor	0.2086
R_work r_work	0.2069
R_free r_free	0.2438

fit	/app/data/saxs_computation/gl/6gl9/6gl9.fit
pddf	/app/data/pr_computation/gl/6gl9/6gl9.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/gl/6gl9/6gl9.dat