6nqb

Role of Era in Assembly and Homeostasis of the Ribosomal Small Subunit

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

30S ribosomal protein S3

Escherichia coli

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 1	30S ribosomal protein S10 × 1 （D7X302） 30S ribosomal protein S14 × 1 （A0A090BZT4） 30S ribosomal protein S19 × 1 （F4SQ43） 16S RIBOSOMAL RNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （L3PZ69） 30S ribosomal protein S5 × 1 （A1AGJ2） 30S ribosomal protein S6 × 1 （A0A074QGH8） 30S ribosomal protein S8 × 1 （D8A1L7） 30S ribosomal protein S12 × 1 （V6FZ95） 30S ribosomal protein S15 × 1 （Q8X9M2） 30S RIBOSOMAL PROTEIN bS16 × 1 （S0UHH0） 30S ribosomal protein S17 × 1 （A0A0G3QJD8） 30S ribosomal protein S18 × 1 （D7ZI16） 30S ribosomal protein S20 × 1 （T6N332） 30S ribosomal protein S2 × 1 （U9ZNW8） MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A376HTV6_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–206； UniProt 2–207

30S ribosomal protein S10

Escherichia coli

UniProt D7X302

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 1	30S ribosomal protein S3 × 1 （A0A376HTV6） 30S ribosomal protein S14 × 1 （A0A090BZT4） 30S ribosomal protein S19 × 1 （F4SQ43） 16S RIBOSOMAL RNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （L3PZ69） 30S ribosomal protein S5 × 1 （A1AGJ2） 30S ribosomal protein S6 × 1 （A0A074QGH8） 30S ribosomal protein S8 × 1 （D8A1L7） 30S ribosomal protein S12 × 1 （V6FZ95） 30S ribosomal protein S15 × 1 （Q8X9M2） 30S RIBOSOMAL PROTEIN bS16 × 1 （S0UHH0） 30S ribosomal protein S17 × 1 （A0A0G3QJD8） 30S ribosomal protein S18 × 1 （D7ZI16） 30S ribosomal protein S20 × 1 （T6N332） 30S ribosomal protein S2 × 1 （U9ZNW8） MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	D7X302_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–98； UniProt 5–102

30S ribosomal protein S14

Escherichia coli

UniProt A0A090BZT4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 1	30S ribosomal protein S3 × 1 （A0A376HTV6） 30S ribosomal protein S10 × 1 （D7X302） 30S ribosomal protein S19 × 1 （F4SQ43） 16S RIBOSOMAL RNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （L3PZ69） 30S ribosomal protein S5 × 1 （A1AGJ2） 30S ribosomal protein S6 × 1 （A0A074QGH8） 30S ribosomal protein S8 × 1 （D8A1L7） 30S ribosomal protein S12 × 1 （V6FZ95） 30S ribosomal protein S15 × 1 （Q8X9M2） 30S RIBOSOMAL PROTEIN bS16 × 1 （S0UHH0） 30S ribosomal protein S17 × 1 （A0A0G3QJD8） 30S ribosomal protein S18 × 1 （D7ZI16） 30S ribosomal protein S20 × 1 （T6N332） 30S ribosomal protein S2 × 1 （U9ZNW8） MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A090BZT4_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 1–99； UniProt 2–101

30S ribosomal protein S19

Escherichia coli H736

UniProt F4SQ43

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 1	30S ribosomal protein S3 × 1 （A0A376HTV6） 30S ribosomal protein S10 × 1 （D7X302） 30S ribosomal protein S14 × 1 （A0A090BZT4） 16S RIBOSOMAL RNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （L3PZ69） 30S ribosomal protein S5 × 1 （A1AGJ2） 30S ribosomal protein S6 × 1 （A0A074QGH8） 30S ribosomal protein S8 × 1 （D8A1L7） 30S ribosomal protein S12 × 1 （V6FZ95） 30S ribosomal protein S15 × 1 （Q8X9M2） 30S RIBOSOMAL PROTEIN bS16 × 1 （S0UHH0） 30S ribosomal protein S17 × 1 （A0A0G3QJD8） 30S ribosomal protein S18 × 1 （D7ZI16） 30S ribosomal protein S20 × 1 （T6N332） 30S ribosomal protein S2 × 1 （U9ZNW8） MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	F4SQ43_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 S； PDB构建体 1–74； UniProt 8–81

30S ribosomal protein S4

Escherichia coli

UniProt L3PZ69

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 1	30S ribosomal protein S3 × 1 （A0A376HTV6） 30S ribosomal protein S10 × 1 （D7X302） 30S ribosomal protein S14 × 1 （A0A090BZT4） 30S ribosomal protein S19 × 1 （F4SQ43） 16S RIBOSOMAL RNA × 1 30S ribosomal protein S5 × 1 （A1AGJ2） 30S ribosomal protein S6 × 1 （A0A074QGH8） 30S ribosomal protein S8 × 1 （D8A1L7） 30S ribosomal protein S12 × 1 （V6FZ95） 30S ribosomal protein S15 × 1 （Q8X9M2） 30S RIBOSOMAL PROTEIN bS16 × 1 （S0UHH0） 30S ribosomal protein S17 × 1 （A0A0G3QJD8） 30S ribosomal protein S18 × 1 （D7ZI16） 30S ribosomal protein S20 × 1 （T6N332） 30S ribosomal protein S2 × 1 （U9ZNW8） MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	L3PZ69_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–205； UniProt 2–206

30S ribosomal protein S5

Escherichia coli

UniProt A1AGJ2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 1	30S ribosomal protein S3 × 1 （A0A376HTV6） 30S ribosomal protein S10 × 1 （D7X302） 30S ribosomal protein S14 × 1 （A0A090BZT4） 30S ribosomal protein S19 × 1 （F4SQ43） 16S RIBOSOMAL RNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （L3PZ69） 30S ribosomal protein S6 × 1 （A0A074QGH8） 30S ribosomal protein S8 × 1 （D8A1L7） 30S ribosomal protein S12 × 1 （V6FZ95） 30S ribosomal protein S15 × 1 （Q8X9M2） 30S RIBOSOMAL PROTEIN bS16 × 1 （S0UHH0） 30S ribosomal protein S17 × 1 （A0A0G3QJD8） 30S ribosomal protein S18 × 1 （D7ZI16） 30S ribosomal protein S20 × 1 （T6N332） 30S ribosomal protein S2 × 1 （U9ZNW8） MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A1AGJ2_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–149； UniProt 10–158

30S ribosomal protein S6

Escherichia coli

UniProt A0A074QGH8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 1	30S ribosomal protein S3 × 1 （A0A376HTV6） 30S ribosomal protein S10 × 1 （D7X302） 30S ribosomal protein S14 × 1 （A0A090BZT4） 30S ribosomal protein S19 × 1 （F4SQ43） 16S RIBOSOMAL RNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （L3PZ69） 30S ribosomal protein S5 × 1 （A1AGJ2） 30S ribosomal protein S8 × 1 （D8A1L7） 30S ribosomal protein S12 × 1 （V6FZ95） 30S ribosomal protein S15 × 1 （Q8X9M2） 30S RIBOSOMAL PROTEIN bS16 × 1 （S0UHH0） 30S ribosomal protein S17 × 1 （A0A0G3QJD8） 30S ribosomal protein S18 × 1 （D7ZI16） 30S ribosomal protein S20 × 1 （T6N332） 30S ribosomal protein S2 × 1 （U9ZNW8） MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A074QGH8_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–93； UniProt 1–93

30S ribosomal protein S8

Escherichia coli

UniProt D8A1L7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 1	30S ribosomal protein S3 × 1 （A0A376HTV6） 30S ribosomal protein S10 × 1 （D7X302） 30S ribosomal protein S14 × 1 （A0A090BZT4） 30S ribosomal protein S19 × 1 （F4SQ43） 16S RIBOSOMAL RNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （L3PZ69） 30S ribosomal protein S5 × 1 （A1AGJ2） 30S ribosomal protein S6 × 1 （A0A074QGH8） 30S ribosomal protein S12 × 1 （V6FZ95） 30S ribosomal protein S15 × 1 （Q8X9M2） 30S RIBOSOMAL PROTEIN bS16 × 1 （S0UHH0） 30S ribosomal protein S17 × 1 （A0A0G3QJD8） 30S ribosomal protein S18 × 1 （D7ZI16） 30S ribosomal protein S20 × 1 （T6N332） 30S ribosomal protein S2 × 1 （U9ZNW8） MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	D8A1L7_ECOMS
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–129； UniProt 2–130

30S ribosomal protein S12

Escherichia coli

UniProt V6FZ95

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 1	30S ribosomal protein S3 × 1 （A0A376HTV6） 30S ribosomal protein S10 × 1 （D7X302） 30S ribosomal protein S14 × 1 （A0A090BZT4） 30S ribosomal protein S19 × 1 （F4SQ43） 16S RIBOSOMAL RNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （L3PZ69） 30S ribosomal protein S5 × 1 （A1AGJ2） 30S ribosomal protein S6 × 1 （A0A074QGH8） 30S ribosomal protein S8 × 1 （D8A1L7） 30S ribosomal protein S15 × 1 （Q8X9M2） 30S RIBOSOMAL PROTEIN bS16 × 1 （S0UHH0） 30S ribosomal protein S17 × 1 （A0A0G3QJD8） 30S ribosomal protein S18 × 1 （D7ZI16） 30S ribosomal protein S20 × 1 （T6N332） 30S ribosomal protein S2 × 1 （U9ZNW8） MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	V6FZ95_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–123； UniProt 2–124

30S ribosomal protein S15

Escherichia coli

UniProt Q8X9M2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 1	30S ribosomal protein S3 × 1 （A0A376HTV6） 30S ribosomal protein S10 × 1 （D7X302） 30S ribosomal protein S14 × 1 （A0A090BZT4） 30S ribosomal protein S19 × 1 （F4SQ43） 16S RIBOSOMAL RNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （L3PZ69） 30S ribosomal protein S5 × 1 （A1AGJ2） 30S ribosomal protein S6 × 1 （A0A074QGH8） 30S ribosomal protein S8 × 1 （D8A1L7） 30S ribosomal protein S12 × 1 （V6FZ95） 30S RIBOSOMAL PROTEIN bS16 × 1 （S0UHH0） 30S ribosomal protein S17 × 1 （A0A0G3QJD8） 30S ribosomal protein S18 × 1 （D7ZI16） 30S ribosomal protein S20 × 1 （T6N332） 30S ribosomal protein S2 × 1 （U9ZNW8） MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS15_ECO57
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–86； UniProt 3–88

30S RIBOSOMAL PROTEIN bS16

Escherichia coli

UniProt S0UHH0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 1	30S ribosomal protein S3 × 1 （A0A376HTV6） 30S ribosomal protein S10 × 1 （D7X302） 30S ribosomal protein S14 × 1 （A0A090BZT4） 30S ribosomal protein S19 × 1 （F4SQ43） 16S RIBOSOMAL RNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （L3PZ69） 30S ribosomal protein S5 × 1 （A1AGJ2） 30S ribosomal protein S6 × 1 （A0A074QGH8） 30S ribosomal protein S8 × 1 （D8A1L7） 30S ribosomal protein S12 × 1 （V6FZ95） 30S ribosomal protein S15 × 1 （Q8X9M2） 30S ribosomal protein S17 × 1 （A0A0G3QJD8） 30S ribosomal protein S18 × 1 （D7ZI16） 30S ribosomal protein S20 × 1 （T6N332） 30S ribosomal protein S2 × 1 （U9ZNW8） MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	S0UHH0_9ESCH
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–79； UniProt 1–79

30S ribosomal protein S17

Escherichia coli

UniProt A0A0G3QJD8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 1	30S ribosomal protein S3 × 1 （A0A376HTV6） 30S ribosomal protein S10 × 1 （D7X302） 30S ribosomal protein S14 × 1 （A0A090BZT4） 30S ribosomal protein S19 × 1 （F4SQ43） 16S RIBOSOMAL RNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （L3PZ69） 30S ribosomal protein S5 × 1 （A1AGJ2） 30S ribosomal protein S6 × 1 （A0A074QGH8） 30S ribosomal protein S8 × 1 （D8A1L7） 30S ribosomal protein S12 × 1 （V6FZ95） 30S ribosomal protein S15 × 1 （Q8X9M2） 30S RIBOSOMAL PROTEIN bS16 × 1 （S0UHH0） 30S ribosomal protein S18 × 1 （D7ZI16） 30S ribosomal protein S20 × 1 （T6N332） 30S ribosomal protein S2 × 1 （U9ZNW8） MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A0G3QJD8_9GAMM
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 Q； PDB构建体 1–79； UniProt 4–82

30S ribosomal protein S18

Escherichia coli

UniProt D7ZI16

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 1	30S ribosomal protein S3 × 1 （A0A376HTV6） 30S ribosomal protein S10 × 1 （D7X302） 30S ribosomal protein S14 × 1 （A0A090BZT4） 30S ribosomal protein S19 × 1 （F4SQ43） 16S RIBOSOMAL RNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （L3PZ69） 30S ribosomal protein S5 × 1 （A1AGJ2） 30S ribosomal protein S6 × 1 （A0A074QGH8） 30S ribosomal protein S8 × 1 （D8A1L7） 30S ribosomal protein S12 × 1 （V6FZ95） 30S ribosomal protein S15 × 1 （Q8X9M2） 30S RIBOSOMAL PROTEIN bS16 × 1 （S0UHH0） 30S ribosomal protein S17 × 1 （A0A0G3QJD8） 30S ribosomal protein S20 × 1 （T6N332） 30S ribosomal protein S2 × 1 （U9ZNW8） MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	D7ZI16_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 R； PDB构建体 1–52； UniProt 23–74

30S ribosomal protein S20

Escherichia coli

UniProt T6N332

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 1	30S ribosomal protein S3 × 1 （A0A376HTV6） 30S ribosomal protein S10 × 1 （D7X302） 30S ribosomal protein S14 × 1 （A0A090BZT4） 30S ribosomal protein S19 × 1 （F4SQ43） 16S RIBOSOMAL RNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （L3PZ69） 30S ribosomal protein S5 × 1 （A1AGJ2） 30S ribosomal protein S6 × 1 （A0A074QGH8） 30S ribosomal protein S8 × 1 （D8A1L7） 30S ribosomal protein S12 × 1 （V6FZ95） 30S ribosomal protein S15 × 1 （Q8X9M2） 30S RIBOSOMAL PROTEIN bS16 × 1 （S0UHH0） 30S ribosomal protein S17 × 1 （A0A0G3QJD8） 30S ribosomal protein S18 × 1 （D7ZI16） 30S ribosomal protein S2 × 1 （U9ZNW8） MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	T6N332_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	15
链与序列区间	作者链 T； PDB构建体 1–85； UniProt 3–87

30S ribosomal protein S2

Escherichia coli

UniProt U9ZNW8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 15 RNA 1	30S ribosomal protein S3 × 1 （A0A376HTV6） 30S ribosomal protein S10 × 1 （D7X302） 30S ribosomal protein S14 × 1 （A0A090BZT4） 30S ribosomal protein S19 × 1 （F4SQ43） 16S RIBOSOMAL RNA × 1 30S ribosomal protein S4 × 1 （L3PZ69） 30S ribosomal protein S5 × 1 （A1AGJ2） 30S ribosomal protein S6 × 1 （A0A074QGH8） 30S ribosomal protein S8 × 1 （D8A1L7） 30S ribosomal protein S12 × 1 （V6FZ95） 30S ribosomal protein S15 × 1 （Q8X9M2） 30S RIBOSOMAL PROTEIN bS16 × 1 （S0UHH0） 30S ribosomal protein S17 × 1 （A0A0G3QJD8） 30S ribosomal protein S18 × 1 （D7ZI16） 30S ribosomal protein S20 × 1 （T6N332） MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	U9ZNW8_ECOLX
Isoform	—
PDB实体	16
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–217； UniProt 10–226

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6nqb
沉积日期 deposition_date	2019-01-20
结构标题 title	Role of Era in Assembly and Homeostasis of the Ribosomal Small Subunit
关键词 keywords	Ribosome assembly, 30S subunit, YjeQ protein, Era protein; cryo-electron microscopy, RIBOSOME; RIBOSOME
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6nqb__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6nqb__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6nqb__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	67.66 Å
Rg（电子密度）	67.29 Å
总 Rg	67.38 Å
原子数	42570
残基数	3093
排除体积	652480 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6nqb__assembly_1__model_1`	hexadecameric （16）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (17)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S3
分子量 formula_weight	23078.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C
原子数 atom_count	42570

GQKVHPNGIRLGIVKPWNSTWFANTKEFADNLDSDFKVRQYLTKELAKASVSRIVIERPAKSIRVTIHTARPGIVIGKKGEDVEKLRKVVADIAGVPAQINIAEVRKPELDAKLVADSITSQLERRVMFRRAMKRAVQNAMRLGAKGIKVEVSGRLGGAEIARTEWYREGRVPLHTLRADIDYNTSEAHTTYGVIGVKVWIFKGEI

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S10
分子量 formula_weight	11197.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

RIRIRLKAFDHRLIDQATAEIVETAKRTGAQVRGPIPLPTRKERFTVLISPHVNKDARDQYEIRTHLRLVDIVEPTEKTVDALMRLDLAAGVDVQISL

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S14
分子量 formula_weight	11360.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N

AKQSMKAREVKRVALADKYFAKRAELKAIISDVNASDERWNAVLKLQTLPRDSSPSRQRNRCRQTGRPHGFLRKFGLSRIKVREAAMRGEIPGLKKASW

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S19
分子量 formula_weight	8441.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S

GPFIDLHLLKKVEKAVESGDKKPLRTWSRRSTIFPNMIGLTIAVHNGRQHVPVFVTDEMVGHKLGEFAPTRTYR

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli H736
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	656414
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	16S RIBOSOMAL RNA
分子量 formula_weight	499690.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	A

AAAUUGAAGAGUUUGAUCAUGGCUCAGAUUGAACGCUGGCGGCAGGCCUAACACAUGCAAGUCGAACGGUAACAGGAAGAAGCUUGCUUCUUUGCUGACGAGUGGCGGACGGGUGAGUAAUGUCUGGGAAACUGCCUGAUGGAGGGGGAUAACUACUGGAAACGGUAGCUAAUACCGCAUAACGUCGCAAGACCAAAGAGGGGGACCUUCGGGCCUCUUGCCAUCGGAUGUGCCCAGAUGGGAUUAGCUAGUAGGUGGGGUAACGGCUCACCUAGGCGACGAUCCCUAGCUGGUCUGAGAGGAUGACCAGCCACACUGGAACUGAGACACGGUCCAGACUCCUACGGGAGGCAGCAGUGGGGAAUAUUGCACAAUGGGCGCAAGCCUGAUGCAGCCAUGCCGCGUGUAUGAAGAAGGCCUUCGGGUUGUAAAGUACUUUCAGCGGGGAGGAAGGGAGUAAAGUUAAUACCUUUGCUCAUUGACGUUACCCGCAGAAGAAGCACCGGCUAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGGUGCAAGCGUUAAUCGGAAUUACUGGGCGUAAAGCGCACGCAGGCGGUUUGUUAAGUCAGAUGUGAAAUCCCCGGGCUCAACCUGGGAACUGCAUCUGAUACUGGCAAGCUUGAGUCUCGUAGAGGGGGGUAGAAUUCCAGGUGUAGCGGUGAAAUGCGUAGAGAUCUGGAGGAAUACCGGUGGCGAAGGCGGCCCCCUGGACGAAGACUGACGCUCAGGUGCGAAAGCGUGGGGAGCAAACAGGAUUAGAUACCCUGGUAGUCCACGCCGUAAACGAUGUCGACUUGGAGGUUGUGCCCUUGAGGCGUGGCUUCCGGAGCUAACGCGUUAAGUCGACCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGUUAAAACUCAAAUGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAUGCAACGCGAAGAACCUUACCUGGUCUUGACAUCCACGGAAGUUUUCAGAGAUGAGAAUGUGCCUUCGGGAACCGUGAGACAGGUGCUGCAUGGCUGUCGUCAGCUCGUGUUGUGAAAUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCUUAUCCUUUGUUGCCAGCGGUCCGGCCGGGAACUCAAAGGAGACUGCCAGUGAUAAACUGGAGGAAGGUGGGGAUGACGUCAAGUCAUCAUGGCCCUUACGACCAGGGCUACACACGUGCUACAAUGGCGCAUACAAAGAGAAGCGACCUCGCGAGAGCAAGCGGACCUCAUAAAGUGCGUCGUAGUCCGGAUUGGAGUCUGCAACUCGACUCCAUGAAGUCGGAAUCGCUAGUAAUCGUGGAUCAGAAUGCCACGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACACCAUGGGAGUGGGUUGCAAAAGAAGUAGGUAGCUUAACCUUCGGGAGGGCGCUUACCACUUUGUGAUUCAUGACUGGGGUGAAGUCGUAACAAGGUAACCGUAGGGGAACCUGCGGUUGGAUCACCUCCUUA

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S4
分子量 formula_weight	23383.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

ARYLGPKLKLSRREGTDLFLKSGVRAIDTKCKIEQAPGQHGARKPRLSDYGVQLREKQKVRRIYGVLERQFRNYYKEAARLKGNTGENLLALLEGRLDNVVYRMGFGATRAEARQLVSHKAIMVNGRVVNIASYQVSPNDVVSIREKAKKQSRVKAALELAEQREKPTWLEVDAGKMEGTFKRKPERSDLSADINEHLIVELYSK

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S5
分子量 formula_weight	15675.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

ELQEKLIAVNRVSKTVKGGRIFSFTALTVVGDGNGRVGFGYGKAREVPAAIQKAMEKARRNMINVALNNGTLQHPVKGVHTGSRVFMQPASEGTGIIAGGAMRAVLEVAGVHNVLAKAYGSTNPINVVRATIDGLENMNSPEMVAAKRG

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S6
分子量 formula_weight	10972.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MRHYEIVFMVHPDQSEQVPGMIERYTAAITGAEGKIHRLEDWGRRQLAYPINKLHKAHYVLMNVEAPQEVIDELETTFRFNDAVIRSMVMRTK

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S8
分子量 formula_weight	14015.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

SMQDPIADMLTRIRNGQAANKAAVTMPSSKLKVAIANVLKEEGFIEDFKVEGDTKPELELTLKYFQGKAVVESIQRVSRPGLRIYKRKDELPKVMAGLGIAVVSTSKGVMTDRAARQAGLGGEIICYVA

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S12
分子量 formula_weight	13637.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

ATVNQLVRKPRARKVAKSNVPALEACPQKRGVCTRVYTTTPKKPNSALRKVCRVRLTNGFEVTSYIGGEGHNLQEHSVILIRGGRVKDLPGVRYHTVRGALDCSGVKDRKQARSKYGVKRPKA

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S15
分子量 formula_weight	9944.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O

LSTEATAKIVSEFGRDANDTGSTEVQVALLTAQINHLQGHFAEHKKDHHSRRGLLRMVSQRRKLLDYLKRKDVARYTRLIERLGLR

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN bS16
分子量 formula_weight	8936.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P

MVTIRLARHGAKKRPFYQVVVADSRNARNGRFIERVGFFNPIASEKEEGTRLDLDRIAHWVGQGATISDRVAALIKEVN

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S17
分子量 formula_weight	9164.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q

KIRTLQGRVVSDKMEKSIVVAIERFVKHPIYGKFIKRTTKLHVHDENNECGIGDVVEIRECRPLSKTKSWTLVRVVEKA

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S18
分子量 formula_weight	6109.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R

YKDIATLKNYITESGKIVPSRITGTRAKYQRQLARAIKRARYLSLLPYTDRH

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S20
分子量 formula_weight	9506.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	T

NIKSAKKRAIQSEKARKHNASRRSMMRTFIKKVYAAIEAGDKAAAQKAFNEMQPIVDRQAAKGLIHKNKAARHKANLTAQINKLA

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	30S ribosomal protein S2
分子量 formula_weight	24122.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

LKAGVHFGHQTRYWNPKMKPFIFGARNKVHIINLEKTVPMFNEALAELNKIASRKGKILFVGTKRAASEAVKDAALSCDQFFVNHRWLGGMLTNWKTVRQSIKRLKDLETQSQDGTFDKLTKKEALMRTRELEKLENSLGGIKDMGGLPDALFVIDADHEHIAIKEANNLGIPVFAIVDTNSDPDGVDFVIPGNDDAIRAVTLYLGAVAATVREGRS

来源 Source

来源生物 organism	Escherichia coli
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	562
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 17 Entity 17 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 17 domains

CATH v4.4 (17 domains)

结构域编号 domain_id	6nqbB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10490 — Glucose-6-phosphate isomerase like protein; domain 1

结构域编号 domain_id	6nqbB02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	610 — Helix hairpin bin

结构域编号 domain_id	6nqbC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — K homology (KH) domain

结构域编号 domain_id	6nqbC02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1140 — Ribosomal protein S3 C-terminal domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	32 — Ribosomal protein S3, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	6nqbE01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	160 — Double Stranded RNA Binding Domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	6nqbE02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	6nqbF00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — Ribosomal protein S6/Translation elongation factor EF1B

结构域编号 domain_id	6nqbH01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1370 — Ribosomal Protein S8; Chain: A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 —

结构域编号 domain_id	6nqbH02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1490 — Dna Ligase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	6nqbJ00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	600 — Ribosomal protein S10

结构域编号 domain_id	6nqbL00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	6nqbN01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1480 —

结构域编号 domain_id	6nqbP00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1320 — S16 Ribosomal Protein; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribosomal protein S16

结构域编号 domain_id	6nqbQ00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	6nqbR00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	640 — 30s Ribosomal Protein S18
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribosomal protein S18

结构域编号 domain_id	6nqbS00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	860 — 30s Ribosomal Protein S19; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribosomal protein S19/S15

结构域编号 domain_id	6nqbT00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	58 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	110 — Ribosomal protein S20

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.80 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	423567

Role of Era in Assembly and Homeostasis of the Ribosomal Small Subunit

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

30S ribosomal protein S3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S10

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S14

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S19

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S12

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S ribosomal protein S15

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体