6o85

Electron cryo-microscopy of the eukaryotic translation initiation factor 2B bound to eukaryotic translation initiation factor 2 from Homo sapiens

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Translation initiation factor eIF-2B subunit epsilon

Homo sapiens

UniProt Q13144

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 13 Translation initiation factor eIF-2B subunit beta × 2 (P49770) Translation initiation factor eIF-2B subunit delta × 2 (Q9UI10) Translation initiation factor eIF-2B subunit alpha × 2 (Q14232) Translation initiation factor eIF-2B subunit gamma × 2 (Q9NR50) Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 1 × 1 (P05198) Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3 × 1 (P41091) Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit beta × 1 2-(4-chloranylphenoxy)-~{N}-[4-[2-(4-chloranylphenoxy)ethanoylamino]cyclohexyl]ethanamide × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 EI2BE_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–721; UniProt 1–721 作者链 B; PDB构建体 1–721; UniProt 1–721

Translation initiation factor eIF-2B subunit beta

Homo sapiens

UniProt P49770

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 13 Translation initiation factor eIF-2B subunit epsilon × 2 (Q13144) Translation initiation factor eIF-2B subunit delta × 2 (Q9UI10) Translation initiation factor eIF-2B subunit alpha × 2 (Q14232) Translation initiation factor eIF-2B subunit gamma × 2 (Q9NR50) Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 1 × 1 (P05198) Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3 × 1 (P41091) Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit beta × 1 2-(4-chloranylphenoxy)-~{N}-[4-[2-(4-chloranylphenoxy)ethanoylamino]cyclohexyl]ethanamide × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 EI2BB_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 19–368; UniProt 2–351 作者链 D; PDB构建体 19–368; UniProt 2–351

Translation initiation factor eIF-2B subunit delta

Homo sapiens

UniProt Q9UI10

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 13 Translation initiation factor eIF-2B subunit epsilon × 2 (Q13144) Translation initiation factor eIF-2B subunit beta × 2 (P49770) Translation initiation factor eIF-2B subunit alpha × 2 (Q14232) Translation initiation factor eIF-2B subunit gamma × 2 (Q9NR50) Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 1 × 1 (P05198) Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3 × 1 (P41091) Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit beta × 1 2-(4-chloranylphenoxy)-~{N}-[4-[2-(4-chloranylphenoxy)ethanoylamino]cyclohexyl]ethanamide × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 EI2BD_HUMAN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–523; UniProt 1–523 作者链 F; PDB构建体 1–523; UniProt 1–523

Translation initiation factor eIF-2B subunit alpha

Homo sapiens

UniProt Q14232

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 13 Translation initiation factor eIF-2B subunit epsilon × 2 (Q13144) Translation initiation factor eIF-2B subunit beta × 2 (P49770) Translation initiation factor eIF-2B subunit delta × 2 (Q9UI10) Translation initiation factor eIF-2B subunit gamma × 2 (Q9NR50) Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 1 × 1 (P05198) Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3 × 1 (P41091) Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit beta × 1 2-(4-chloranylphenoxy)-~{N}-[4-[2-(4-chloranylphenoxy)ethanoylamino]cyclohexyl]ethanamide × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 EI2BA_HUMAN
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–305; UniProt 1–305 作者链 H; PDB构建体 1–305; UniProt 1–305

Translation initiation factor eIF-2B subunit gamma

Homo sapiens

UniProt Q9NR50

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 13 Translation initiation factor eIF-2B subunit epsilon × 2 (Q13144) Translation initiation factor eIF-2B subunit beta × 2 (P49770) Translation initiation factor eIF-2B subunit delta × 2 (Q9UI10) Translation initiation factor eIF-2B subunit alpha × 2 (Q14232) Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 1 × 1 (P05198) Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3 × 1 (P41091) Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit beta × 1 2-(4-chloranylphenoxy)-~{N}-[4-[2-(4-chloranylphenoxy)ethanoylamino]cyclohexyl]ethanamide × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 EI2BG_HUMAN
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 1–452; UniProt 1–452 作者链 J; PDB构建体 1–452; UniProt 1–452

Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 1

Homo sapiens

UniProt P05198

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 13 Translation initiation factor eIF-2B subunit epsilon × 2 (Q13144) Translation initiation factor eIF-2B subunit beta × 2 (P49770) Translation initiation factor eIF-2B subunit delta × 2 (Q9UI10) Translation initiation factor eIF-2B subunit alpha × 2 (Q14232) Translation initiation factor eIF-2B subunit gamma × 2 (Q9NR50) Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3 × 1 (P41091) Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit beta × 1 2-(4-chloranylphenoxy)-~{N}-[4-[2-(4-chloranylphenoxy)ethanoylamino]cyclohexyl]ethanamide × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 IF2A_HUMAN
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 L; PDB构建体 1–314; UniProt 2–315

Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 3

Homo sapiens

UniProt P41091

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 13 Translation initiation factor eIF-2B subunit epsilon × 2 (Q13144) Translation initiation factor eIF-2B subunit beta × 2 (P49770) Translation initiation factor eIF-2B subunit delta × 2 (Q9UI10) Translation initiation factor eIF-2B subunit alpha × 2 (Q14232) Translation initiation factor eIF-2B subunit gamma × 2 (Q9NR50) Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit 1 × 1 (P05198) Eukaryotic translation initiation factor 2 subunit beta × 1 2-(4-chloranylphenoxy)-~{N}-[4-[2-(4-chloranylphenoxy)ethanoylamino]cyclohexyl]ethanamide × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 IF2G_HUMAN
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 S; PDB构建体 1–472; UniProt 1–472

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6o85
沉积日期 deposition_date2019-03-08
结构标题 titleElectron cryo-microscopy of the eukaryotic translation initiation factor 2B bound to eukaryotic translation initiation factor 2 from Homo sapiens
关键词 keywordseukaryotic translation initiation factor 2B, eukaryotic translation initiation factor 2, TRANSLATION; TRANSLATION
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6o85__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6o85__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

6o85__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)57.27 Å
Rg(电子密度)56.10 Å
总 Rg55.54 Å
原子数28546
残基数4114
排除体积504870 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 6o85__assembly_1__model_1 tridecameric (13) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (9)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id6o85A01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology550 — Spore Coat Polysaccharide Biosynthesis Protein SpsA; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Spore Coat Polysaccharide Biosynthesis Protein SpsA; Chain A
结构域编号 domain_id6o85B01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology550 — Spore Coat Polysaccharide Biosynthesis Protein SpsA; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Spore Coat Polysaccharide Biosynthesis Protein SpsA; Chain A
结构域编号 domain_id6o85G01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1070 — Translation initiation factor eIF-2B, N-terminal domain
结构域编号 domain_id6o85G02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10470 — Translation initiation factor eif-2b; domain 2
结构域编号 domain_id6o85H01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1070 — Translation initiation factor eIF-2B, N-terminal domain
结构域编号 domain_id6o85H02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10470 — Translation initiation factor eif-2b; domain 2
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7. 引用文献 (1)