6pgu

Crystal structure of the p300 acetyltransferase domain with allosteric inhibitor CPI-076 and CoA

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 90.9 Å Quality: EXCELLENT

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone acetyltransferase p300

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1287–1519 链 A； UniProt 1582–1663	突变：Y1467F, loop deletion	COA COENZYME A × 1 OK7 N-(thiophen-2-yl)acetamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；277 K；20% MPD, 0.1 M Tris pH 8, 7.5% PEG-MME 5000	分辨率 1.72 Å R-free 0.206
2	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1287–1519 链 B； UniProt 1582–1663	突变：Y1467F, loop deletion	COA COENZYME A × 1 OK7 N-(thiophen-2-yl)acetamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION；277 K；20% MPD, 0.1 M Tris pH 8, 7.5% PEG-MME 5000	分辨率 1.72 Å R-free 0.206

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6PGU	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1L3E NMR Structures of the HIF-1alpha CTAD/p300 CH1 Complex 提交 2002-02-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 323–423（101 aa）片段：cysteine/histidine-rich 1 domain (CH1)	未记录	ZN ZINC ION × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM NaCl；压力 ambient NMR样品组成 1mM CTAD/CH1 complex U-15N,13C; 0.1mM ZnSO4; 1mM DTT \| 90% D2O, 10% H2O NMR样品组成 1mM CTAD/CH1 complex U-15N,13C; 0.1mM ZnSO4; 1mM DTT \| 99.9% D2O NMR样品组成 1mM CTAD/CH1 complex U-15N; 0.1mM ZnSO4; 1mM DTT \| 90% D2O, 10% H2O NMR样品组成 1mM CTAD/CH1 complex; 0.1mM ZnSO4; 1mM DTT \| 99.9% D2O NMR样品组成 1mM CTAD/CH1 complex 10% U-13C; 0.1mM ZnSO4; 1mM DTT \| 99.9% D2O	分辨率未提供
1P4Q Solution structure of the CITED2 transactivation domain in complex with the p300 CH1 domain 提交 2003-04-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 323–423（101 aa）片段：cysteine/histidine-rich 1 (CH1) domain	未记录	ZN ZINC ION × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM NaCl；压力 ambient NMR样品组成 1mM CITED/p300;10mM deut-MES, pH 6.0; 100mM NaCl; 0.1mM ZnSO4 \| 99.9% D2O NMR样品组成 1mM CITED/p300 U-15N;10mM deut-MES, pH 6.0; 100mM NaCl; 0.1mM ZnSO4 \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1mM CITED/p300 U-15N;10mM deut-MES, pH 6.0; 100mM NaCl; 0.1mM ZnSO4 \| 99.9% D2O NMR样品组成 1mM CITED/p300 U-15N,13C;10mM deut-MES, pH 6.0; 100mM NaCl; 0.1mM ZnSO4 \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1mM CITED/p300 U-15N,13C;10mM deut-MES, pH 6.0; 100mM NaCl; 0.1mM ZnSO4 \| 99.9% D2O NMR样品组成 1mM CITED/p300 10%13C;10mM deut-MES, pH 6.0; 100mM NaCl; 0.1mM ZnSO4 \| 99.9% D2O	分辨率未提供
2K8F Structural Basis for the Regulation of p53 Function by p300 提交 2008-09-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1723–1812（90 aa）片段：UNP residues 1723-1812	突变：C1738A, C1746A, C1789A, C1790A	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.3；308 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 ambient NMR样品组成 1.1 mM TAZ2, 1.0 mM [U-100% 15N] TAD(1-39), 1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TAD(1-39), 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.0 mM [U-100% 15N] TAZ2, 1.1 mM TAD(1-39), 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TAZ2, 1.1 mM TAD(1-39), 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.0 mM TAZ2, 1.1 mM TAD(1-39), 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
2MH0 Solution NMR structure of the p300 Taz2:ETAD1 complex 提交 2013-11-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1723–1812（90 aa）片段：TAZ-type 2 zinc finger residues 1723-1812	突变：C1738A, C1746A, C1789A, C1790A	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；288 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient NMR样品组成 1.4 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] ETAD1, 2 mM Taz2, 20 mM MES, 1 mM sodium azide, 5 mM beta-mercaptoethanol, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 3078 uM ETAD1, 1038 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] Taz2, 20 mM MES, 1 mM sodium azide, 5 mM beta-mercaptoethanol, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2MZD Characterization of the p300 Taz2-p53 TAD2 Complex and Comparison with the p300 Taz2-p53 TAD1 Complex 提交 2015-02-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1723–1812（90 aa）片段：UNP residues 1723-1812	突变：C16A, C24A, C67A, C68A	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.3；308 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 ambient NMR样品组成 1.1 mM Taz2 domain of Histone Acetyltransferase p300, 1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TAD2 sub-domain of Cellular Tumor Antigen p53, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.0 mM [U-100% 15N] Taz2 domain of Histone Acetyltransferase p300, 1.1 mM TAD2 sub-domain of Cellular Tumor Antigen p53, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Taz2 domain of Histone Acetyltransferase p300, 1.1 mM TAD2 sub-domain of Cellular Tumor Antigen p53, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 1.0 mM Taz2 domain of Histone Acetyltransferase p300, 1.1 mM TAD2 sub-domain of Cellular Tumor Antigen p53, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
3BIY Crystal structure of p300 histone acetyltransferase domain in complex with a bisubstrate inhibitor, Lys-CoA 提交 2007-12-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1287–1666（380 aa）片段：acetyltransferase domain	突变：K1637R, M1652G	BR BROMIDE ION × 5 01K [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)tetrahydrofuran-2-yl]methyl (3R,20R)-20-carbamoyl-3-hydroxy-2,2-dimethyl-4,8,14,22-tetraoxo-12-thia-5,9,15,21-tetraazatricos-1-yl dihydrogen diphosphate × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES sodium pH 7.5, 20% w/v polyethylene glycol 4,000, 10% v/v 2-Propanol , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 1.70 Å R-free 0.213
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1040–1161（122 aa）片段：UNP RESIDUES 1040-1161	未记录	CL CHLORIDE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 10 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 J 1040–1161（122 aa）片段：UNP RESIDUES 1040-1161	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 11 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 K 1040–1161（122 aa）片段：UNP RESIDUES 1040-1161	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 12 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 L 1040–1161（122 aa）片段：UNP RESIDUES 1040-1161	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1040–1161（122 aa）片段：UNP RESIDUES 1040-1161	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1040–1161（122 aa）片段：UNP RESIDUES 1040-1161	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1040–1161（122 aa）片段：UNP RESIDUES 1040-1161	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 1040–1161（122 aa）片段：UNP RESIDUES 1040-1161	未记录	CL CHLORIDE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 F 1040–1161（122 aa）片段：UNP RESIDUES 1040-1161	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 G 1040–1161（122 aa）片段：UNP RESIDUES 1040-1161	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 H 1040–1161（122 aa）片段：UNP RESIDUES 1040-1161	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3I3J Crystal Structure of the Bromodomain of Human EP300 提交 2009-06-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 9 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 I 1040–1161（122 aa）片段：UNP RESIDUES 1040-1161	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；30w/v PEG 3350, 0.2M ammonium_sulfate, 5.5pH Bis-Tris, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 2.33 Å R-free 0.275
3IO2 Crystal structure of the Taz2 domain of p300 提交 2009-08-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1723–1836（114 aa）片段：residues 1723-1836	突变：C1738A, C1746A, C1789A, C1790A	ZN ZINC ION × 3 SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 6.3；277 K；Protein solution: 30 mg/ml Taz2, 25 mM MES pH 6.3, 100 mM NaCl, 6% glycerol, 10% TCEP. Precipitating solution: 3.2 M AMS in MES buffer pH 6.0, 10 % ethylene glycol. Both solutions mixed 1:1 and kept under oil, Microbatch, temperature 277K	分辨率 2.50 Å R-free 0.236
3P57 Crystal structure of the p300 TAZ2 domain bound to MEF2 on DNA 提交 2010-10-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：tridecameric	链 P 1726–1835（110 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；288 K；16% PEG 1000, pH 6.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K	分辨率 2.19 Å R-free 0.272
3T92 Crystal structure of the Taz2:C/EBPepsilon-TAD chimera protein 提交 2011-08-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1723–1818（96 aa）片段：unp residues 1723-1818; unp residues 37-61	突变：C1738A, C1746A, C1789A, C1790A,	ZN ZINC ION × 3 TCE 3,3',3''-phosphanetriyltripropanoic acid × 1 TAM TRIS(HYDROXYETHYL)AMINOMETHANE × 1 ACN ACETONE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 Micro batch under oil；pH 8.5；277 K；200mM NaCl, 5mM TCEP and 20% isopropanol, pH 8.5, Micro batch under oil, temperature 277K	分辨率 1.50 Å R-free 0.228
4BHW Structural basis for autoinhibition of the acetyltransferase activity of p300 提交 2013-04-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1043–1519（477 aa）片段：P300 CORE, RESIDUES 1043-1519,1581-1666 链 A 1581–1666（86 aa）片段：P300 CORE, RESIDUES 1043-1519,1581-1666 链 B 1043–1519（477 aa）片段：P300 CORE, RESIDUES 1043-1519,1581-1666 链 B 1581–1666（86 aa）片段：P300 CORE, RESIDUES 1043-1519,1581-1666	突变：YES 突变：YES 突变：YES 突变：YES	ZN ZINC ION × 7 01K [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)tetrahydrofuran-2-yl]methyl (3R,20R)-20-carbamoyl-3-hydroxy-2,2-dimethyl-4,8,14,22-tetraoxo-12-thia-5,9,15,21-tetraazatricos-1-yl dihydrogen diphosphate × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7.5；100 MM HEPES, PH 7.5, 20% PEG3350, 0.2M NACL	分辨率 2.80 Å R-free 0.244
4PZR Crystal structure of p300 histone acetyltransferase domain in complex with Coenzyme A 提交 2014-03-31	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1287–1664（378 aa）片段：acetyltransferase domain (UNP residues 1287-1664)	突变：Y1467F	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 COA COENZYME A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M HEPES, pH 7.5, 16% PEG3350, 3-10% isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.10 Å R-free 0.219
4PZS Crystal structure of p300 histone acetyltransferase domain in complex with Acetyl-Coenzyme A 提交 2014-03-31	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1287–1664（378 aa）片段：acetyltransferase domain (UNP residues 1287-1664)	突变：Y1467F	ACO ACETYL COENZYME A × 1 DMS* DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M HEPES, pH 7.5, 16% PEG3350, 3-10% isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.94 Å R-free 0.230
4PZT Crystal structure of p300 histone acetyltransferase domain in complex with an inhibitor, Acetonyl-Coenzyme A 提交 2014-03-31	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1287–1664（378 aa）片段：acetyltransferase domain (UNP residues 1287-1664)	突变：Y1467F	SOP [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-AMINO-9H-PURIN-9-YL)-4-HYDROXY-3-(PHOSPHONOOXY)TETRAHYDROFURAN-2-YL]METHYL (3R)-3-HYDROXY-2,2-DIMETHYL-4-OXO-4-{[3-OXO-3-({2-[(2-OXOPROPYL)THIO]ETHYL}AMINO)PROPYL]AMINO}BUTYL DIHYDROGEN DIPHOSPHATE × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M HEPES, pH 7.5, 16% PEG3350, 3-10% isopropanol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.80 Å R-free 0.236
5BT3 Crystal structure of EP300 bromodomain in complex with SGC-CBP30 chemical probe 提交 2015-06-02	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1048–1161（114 aa）片段：bromodomain, UNP residues 1048-1161	未记录	2LO 2-[2-(3-chloro-4-methoxyphenyl)ethyl]-5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-[(2S)-2-(morpholin-4-yl)propyl]-1H-benzimidazole × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；277 K；0.1 M tri-sodium citrate dihydrate pH 5.6, 20% iso-propanol, 20% PEG 4000	分辨率 1.05 Å R-free 0.178
5KJ2 The novel p300/CBP inhibitor A-485 uncovers a unique mechanism of action to target AR in castrate resistant prostate cancer 提交 2016-06-17	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1287–1666（380 aa）	未记录	6TF N-[(4-fluorophenyl)methyl]-2-{(1R)-5-[(methylcarbamoyl)amino]-2',4'-dioxo-2,3-dihydro-3'H-spiro[indene-1,5'-[1,3]oxazolidin]-3'-yl}-N-[(2S)-1,1,1-trifluoropropan-2-yl]acetamide × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；290 K；25% (w/v) PEG3350, 0.2M Sodium Chloride, 0.1M BIS-TRIS buffer pH5.5	分辨率 1.95 Å R-free 0.260
5LKT Crystal structure of the p300 acetyltransferase catalytic core with butyryl-coenzyme A. 提交 2016-07-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1043–1519（477 aa）片段：UNP residues 1043-1519,UNP residues 1581-1666 链 A 1581–1666（86 aa）片段：UNP residues 1043-1519,UNP residues 1581-1666	突变：Y1467F,Y1467F 突变：Y1467F,Y1467F	ZN ZINC ION × 4 BCO Butyryl Coenzyme A × 1 GOL GLYCEROL × 3 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Tris, PEG MME 2000	分辨率 2.04 Å R-free 0.204
5LKU Crystal structure of the p300 acetyltransferase catalytic core with coenzyme A. 提交 2016-07-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1043–1519（477 aa）链 A 1581–1666（86 aa）	突变：Y1467F,Y1467F 突变：Y1467F,Y1467F	ZN ZINC ION × 4 COA COENZYME A × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Tris, PEG MME 2000	分辨率 3.50 Å R-free 0.242
5LKX Crystal structure of the p300 acetyltransferase catalytic core with propionyl-coenzyme A. 提交 2016-07-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1043–1519（477 aa）链 A 1581–1666（86 aa）	突变：Y1467F,Y1467F 突变：Y1467F,Y1467F	ZN ZINC ION × 4 1VU propionyl Coenzyme A × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Tris, PEG MME 2000, DMSO	分辨率 2.52 Å R-free 0.239
5LKZ Crystal structure of the p300 acetyltransferase catalytic core with crotonyl-coenzyme A. 提交 2016-07-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1043–1519（477 aa）片段：UNP residues 1043-1519,UNP residues 1581-1666,UNP residues 1043-1519,UNP residues 1581-1666 链 A 1581–1666（86 aa）片段：UNP residues 1043-1519,UNP residues 1581-1666,UNP residues 1043-1519,UNP residues 1581-1666	突变：Y1467F,Y1467F,Y1467F,Y1467F 突变：Y1467F,Y1467F,Y1467F,Y1467F	ZN ZINC ION × 4 COO CROTONYL COENZYME A × 1 GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；Tris, PEG MME 2000	分辨率 2.50 Å R-free 0.234
5LPK Crystal structure of the bromodomain of human EP300 bound to the inhibitor XDM1 提交 2016-08-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1040–1161（122 aa）片段：bromodomain, UNP residues 1040-1161	未记录	XDM ~{N}-[(3-chlorophenyl)methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；277 K；PEG 3350, NaCl	分辨率 2.10 Å R-free 0.203
5LPK Crystal structure of the bromodomain of human EP300 bound to the inhibitor XDM1 提交 2016-08-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1040–1161（122 aa）片段：bromodomain, UNP residues 1040-1161	未记录	XDM ~{N}-[(3-chlorophenyl)methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；277 K；PEG 3350, NaCl	分辨率 2.10 Å R-free 0.203
5LPK Crystal structure of the bromodomain of human EP300 bound to the inhibitor XDM1 提交 2016-08-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1040–1161（122 aa）片段：bromodomain, UNP residues 1040-1161	未记录	XDM ~{N}-[(3-chlorophenyl)methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；277 K；PEG 3350, NaCl	分辨率 2.10 Å R-free 0.203
5LPK Crystal structure of the bromodomain of human EP300 bound to the inhibitor XDM1 提交 2016-08-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1040–1161（122 aa）片段：bromodomain, UNP residues 1040-1161	未记录	XDM ~{N}-[(3-chlorophenyl)methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；277 K；PEG 3350, NaCl	分辨率 2.10 Å R-free 0.203
5LPK Crystal structure of the bromodomain of human EP300 bound to the inhibitor XDM1 提交 2016-08-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 1040–1161（122 aa）片段：bromodomain, UNP residues 1040-1161	未记录	XDM ~{N}-[(3-chlorophenyl)methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 2 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；277 K；PEG 3350, NaCl	分辨率 2.10 Å R-free 0.203
5LPK Crystal structure of the bromodomain of human EP300 bound to the inhibitor XDM1 提交 2016-08-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 F 1040–1161（122 aa）片段：bromodomain, UNP residues 1040-1161	未记录	XDM ~{N}-[(3-chlorophenyl)methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 SO4 SULFATE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；277 K；PEG 3350, NaCl	分辨率 2.10 Å R-free 0.203
5LPK Crystal structure of the bromodomain of human EP300 bound to the inhibitor XDM1 提交 2016-08-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 G 1040–1161（122 aa）片段：bromodomain, UNP residues 1040-1161	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；277 K；PEG 3350, NaCl	分辨率 2.10 Å R-free 0.203
5LPM Crystal structure of the bromodomain of human Ep300 bound to the inhibitor XDM3d 提交 2016-08-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1048–1161（114 aa）片段：bromodomain, UNP residues 1048-1161	未记录	71Y ~{N}-[(1~{S},2~{S})-7-chloranyl-2-oxidanyl-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole -2-carboxamide × 2 ACT ACETATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；277 K；NaCl, PEG 3350	分辨率 1.50 Å R-free 0.187
5LPM Crystal structure of the bromodomain of human Ep300 bound to the inhibitor XDM3d 提交 2016-08-13	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1048–1161（114 aa）片段：bromodomain, UNP residues 1048-1161	未记录	71Y ~{N}-[(1~{S},2~{S})-7-chloranyl-2-oxidanyl-1,2,3,4-tetrahydronaphthalen-1-yl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole -2-carboxamide × 2 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 5.5；277 K；NaCl, PEG 3350	分辨率 1.50 Å R-free 0.187
5NU5 Crystal structure of the human bromodomain of EP300 bound to the inhibitor XDM-CBP 提交 2017-04-28	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1048–1161（114 aa）片段：bromodomain	未记录	99E ~{N}-[[2,8-bis(oxidanyl)naphthalen-1-yl]methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；277 K；KSCN, NaBr, PEG 6000, PEG 8000, PEG 10000	分辨率 1.60 Å R-free 0.185
5NU5 Crystal structure of the human bromodomain of EP300 bound to the inhibitor XDM-CBP 提交 2017-04-28	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1048–1161（114 aa）片段：bromodomain	未记录	99E ~{N}-[[2,8-bis(oxidanyl)naphthalen-1-yl]methyl]-4-ethanoyl-3-ethyl-5-methyl-1~{H}-pyrrole-2-carboxamide × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 6.5；277 K；KSCN, NaBr, PEG 6000, PEG 8000, PEG 10000	分辨率 1.60 Å R-free 0.185
5XZC Cryo-EM structure of p300-p53 protein complex 提交 2017-07-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1046–1664（619 aa）片段：UNP residues 1046-1664	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 10.70 Å
6DS6 Crystal structure of p300 ZZ domain in complex with histone H3 peptide 提交 2018-06-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1663–1713（51 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.1 M HEPES and 70% MPD (pH 7.5)	分辨率 1.95 Å R-free 0.253
6FGN Solution Structure of p300Taz2-p63TA 提交 2018-01-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1723–1812（90 aa）片段：Taz2,transactivation domain	未记录	ZN ZINC ION × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.3；303 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 AMBIENT NMR样品组成 1200 mM [U-13C; U-15N] Fusion construct of p300 Taz2 and the transactivation domain of p63, 25 mM MES, 200 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
6FGS Solution structure of p300Taz2-p73TA1 提交 2018-01-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1723–1812（90 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.3；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 AMBIENT NMR样品组成 700 uM [U-13C; U-15N] Fusion construct of p300 Taz2 and the transactivation domain 1 of p73, 25 mM MES, 50 mM NaCl, 0.5 mM TCEP, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
6GYR Transcription factor dimerization activates the p300 acetyltransferase 提交 2018-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1046–1664（619 aa）链 C 1046–1664（619 aa）	突变：Y1467F 突变：Y1467F	ZN ZINC ION × 7 01K [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)tetrahydrofuran-2-yl]methyl (3R,20R)-20-carbamoyl-3-hydroxy-2,2-dimethyl-4,8,14,22-tetraoxo-12-thia-5,9,15,21-tetraazatricos-1-yl dihydrogen diphosphate × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；100 mM HEPES, pH 7.5, 18-22% polyethylene glycol 3350, 0.2 M NaCl	分辨率 3.10 Å R-free 0.265
6GYR Transcription factor dimerization activates the p300 acetyltransferase 提交 2018-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 1046–1664（619 aa）链 D 1046–1664（619 aa）	突变：Y1467F 突变：Y1467F	ZN ZINC ION × 7 01K [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-4-hydroxy-3-(phosphonooxy)tetrahydrofuran-2-yl]methyl (3R,20R)-20-carbamoyl-3-hydroxy-2,2-dimethyl-4,8,14,22-tetraoxo-12-thia-5,9,15,21-tetraazatricos-1-yl dihydrogen diphosphate × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277 K；100 mM HEPES, pH 7.5, 18-22% polyethylene glycol 3350, 0.2 M NaCl	分辨率 3.10 Å R-free 0.265
6GYT Transcription factor dimerization activates the p300 acetyltransferase 提交 2018-07-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1047–1168（122 aa）链 B 1047–1168（122 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 EVAPORATION；294 K；1.6 M Ammonium Sulfate, 100 mM Bicine, pH 9.0	分辨率 2.50 Å R-free 0.288
6K4N Cryo-EM structure of p300 提交 2019-05-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1046–1664（619 aa）片段：UNP RESIDUES 1046-1664	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 9.80 Å
6PF1 Crystal structure of the p300 acetyltransferase domain with allosteric inhibitor CPI-090 and CoA 提交 2019-06-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1287–1513（227 aa）链 A 1581–1663（83 aa）	突变：Y1467F 突变：Y1467F	COA COENZYME A × 1 OJ7 3-[3-chloro-5-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]-2-methyl-1H-indole × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；0.1 M CHES pH 9.5, 30% w/v PEG 3000	分辨率 2.32 Å R-free 0.247
6PF1 Crystal structure of the p300 acetyltransferase domain with allosteric inhibitor CPI-090 and CoA 提交 2019-06-21	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1287–1513（227 aa）链 B 1581–1663（83 aa）	突变：Y1467F 突变：Y1467F	COA COENZYME A × 1 OJ7 3-[3-chloro-5-(trifluoromethyl)pyridin-2-yl]-2-methyl-1H-indole × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9.5；277 K；0.1 M CHES pH 9.5, 30% w/v PEG 3000	分辨率 2.32 Å R-free 0.247
6V8B Crystal structure of the p300 acetyltransferase domain with AcCoA competitive inhibitor 1 提交 2019-12-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1287–1666（380 aa）	突变：M1652G	QRY 4-(2-{[(1R)-2-(1H-indol-3-yl)-2-oxo-1-phenylethyl]amino}ethyl)benzene-1-sulfonamide × 1 CL CHLORIDE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；INDEX F6. 25% PEG3350, 0.2 M Ammonium sulfate, 0.1 M BisTris pH 5.5	分辨率 3.13 Å R-free 0.316
6V8K Crystal structure of the p300 acetyltransferase domain with peptide-competitive inhibitor 2 提交 2019-12-11	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1287–1519（233 aa）链 A 1581–1663（83 aa）	突变：Y1467F 突变：Y1467F	COA COENZYME A × 1 QS4 1-(2-methyl-1H-indol-3-yl)-2-[(2R)-2-methylpiperidin-1-yl]ethan-1-one × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；0.24 mM HAT, 0.12 mM CoA, 0.75 mM ligand. 200+150 (+20) nL sitting drops. Internal focus screen with microseeding. 17.5% MPD, 0.1 M Tris pH 8, 2.5 % PEG3350. Cryo 30% MPD, 5% PEG 3350, 1 mM ligand	分辨率 1.84 Å R-free 0.213
6V8N Crystal structure of the p300 acetyltransferase domain with AcCoA competitive inhibitor 17 提交 2019-12-11	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1287–1666（380 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 QS1 (2R)-2-{[(2S)-2-(4-cyanophenyl)propyl]amino}-N-[5-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)pyridin-2-yl]-2-phenylacetamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；277 K；0.2 M Ammonium Sulfate, 0.1 M BisTris pH 5.5, 20% PEG 3350, streak-seed with loop	分辨率 2.30 Å R-free 0.247
6V90 Crystal structure of the p300 acetyltransferase domain with AcCoA competitive inhibitor 12 提交 2019-12-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1287–1666（380 aa）	突变：M1652G	QSD (2R)-2-{[2-(4-cyanophenyl)ethyl]amino}-N-[5-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)pyridin-2-yl]-2-phenylacetamide × 1 SO4 SULFATE ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；INDEX F6. 0.1 M Bis-Tris pH 5.5, 0.2 M ammonium sulfate 25% w/v PEG 3350. The crystal was cryoprotected with MiTeGen Low Viscosity Cryo Oil	分辨率 2.04 Å R-free 0.241
7LJE Discovery of Spirohydantoins as Selective, Orally Bioavailable Inhibitors of p300/CBP Histone Acetyltransferases 提交 2021-01-29	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1287–1666（380 aa）片段：acetyltransferase domain (UNP residues 1287-1666)	未记录	Y2P 2-[4-[(3'R,4S)-3'-fluoro-1-[2-[(4-fluorophenyl)methyl-[(1S)-2,2,2-trifluoro-1-methyl-ethyl]amino]-2-oxo-ethyl]-2,5-dioxo-spiro[imidazolidine-4,1'-indane]-5'-yl]pyrazol-1-yl]-N-methyl-acetamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；290 K；25% PEG 3350, 0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M Bis-Tris HCl pH 5.5	分辨率 2.61 Å R-free 0.265
7LJE Discovery of Spirohydantoins as Selective, Orally Bioavailable Inhibitors of p300/CBP Histone Acetyltransferases 提交 2021-01-29	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1287–1666（380 aa）片段：acetyltransferase domain (UNP residues 1287-1666)	未记录	Y2P 2-[4-[(3'R,4S)-3'-fluoro-1-[2-[(4-fluorophenyl)methyl-[(1S)-2,2,2-trifluoro-1-methyl-ethyl]amino]-2-oxo-ethyl]-2,5-dioxo-spiro[imidazolidine-4,1'-indane]-5'-yl]pyrazol-1-yl]-N-methyl-acetamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；290 K；25% PEG 3350, 0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M Bis-Tris HCl pH 5.5	分辨率 2.61 Å R-free 0.265
7LJE Discovery of Spirohydantoins as Selective, Orally Bioavailable Inhibitors of p300/CBP Histone Acetyltransferases 提交 2021-01-29	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 1287–1666（380 aa）片段：acetyltransferase domain (UNP residues 1287-1666)	未记录	Y2P 2-[4-[(3'R,4S)-3'-fluoro-1-[2-[(4-fluorophenyl)methyl-[(1S)-2,2,2-trifluoro-1-methyl-ethyl]amino]-2-oxo-ethyl]-2,5-dioxo-spiro[imidazolidine-4,1'-indane]-5'-yl]pyrazol-1-yl]-N-methyl-acetamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；290 K；25% PEG 3350, 0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M Bis-Tris HCl pH 5.5	分辨率 2.61 Å R-free 0.265
7LJE Discovery of Spirohydantoins as Selective, Orally Bioavailable Inhibitors of p300/CBP Histone Acetyltransferases 提交 2021-01-29	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 1287–1666（380 aa）片段：acetyltransferase domain (UNP residues 1287-1666)	未记录	Y2P 2-[4-[(3'R,4S)-3'-fluoro-1-[2-[(4-fluorophenyl)methyl-[(1S)-2,2,2-trifluoro-1-methyl-ethyl]amino]-2-oxo-ethyl]-2,5-dioxo-spiro[imidazolidine-4,1'-indane]-5'-yl]pyrazol-1-yl]-N-methyl-acetamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；290 K；25% PEG 3350, 0.2 M Ammonium Acetate, 0.1 M Bis-Tris HCl pH 5.5	分辨率 2.61 Å R-free 0.265
7SS8 Human P300 complexed with a proline-based inhibitor 提交 2021-11-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1048–1519（472 aa）链 A 1582–1664（83 aa）	突变：Y1467F, residues 1520-1581 replaced with SGGSG 突变：Y1467F, residues 1520-1581 replaced with SGGSG	ZN ZINC ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 C0C 1-[1-(4-chlorophenyl)cyclopentane-1-carbonyl]-N-{[3-(methylcarbamoyl)phenyl]methyl}-D-prolinamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；20% PEG3350, 0.1 M MES pH 6.5	分辨率 2.15 Å R-free 0.230
7SSK Human P300 complexed with a glycine-based inhibitor 提交 2021-11-11	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1048–1519（472 aa）链 A 1582–1664（83 aa）	突变：Y1467F, residues 1520-1581 replaced with SGGSG 突变：Y1467F, residues 1520-1581 replaced with SGGSG	ZN ZINC ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 C3I N-[2-(4-methoxyanilino)-2-oxoethyl]-N-methyl-1-phenylcyclopentane-1-carboxamide × 1 ACT ACETATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；277 K；20% PEG3350, 0.1 M MES pH 6.5	分辨率 2.36 Å R-free 0.235
7SZQ Human P300 complexed with an azaindazole inhibitor 提交 2021-11-29	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1279–1666（388 aa）	突变：Y1467F	ETL 1-[1-(4-chlorophenyl)cyclopentane-1-carbonyl]-N-1H-pyrazolo[4,3-b]pyridin-5-yl-D-prolinamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 9.5；277 K；30% PEG400, 0.1 M CHES pH 9.5	分辨率 2.80 Å R-free 0.235
7UGI Bromodomain of EP300 liganded with BMS-536924 提交 2022-03-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1048–1161（114 aa）	未记录	N6I (3M)-4-{[(2S)-2-(3-chlorophenyl)-2-hydroxyethyl]amino}-3-[4-methyl-6-(morpholin-4-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]pyridin-2(1H)-one × 1 PE5 3,6,9,12,15,18,21,24-OCTAOXAHEXACOSAN-1-OL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；0.05M Potassium phosphate monobasic 20% w/v Polyethylene glycol 8,000	分辨率 2.00 Å R-free 0.274
7UGI Bromodomain of EP300 liganded with BMS-536924 提交 2022-03-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1048–1161（114 aa）	未记录	N6I (3M)-4-{[(2S)-2-(3-chlorophenyl)-2-hydroxyethyl]amino}-3-[4-methyl-6-(morpholin-4-yl)-1H-benzimidazol-2-yl]pyridin-2(1H)-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；0.05M Potassium phosphate monobasic 20% w/v Polyethylene glycol 8,000	分辨率 2.00 Å R-free 0.274
7VHY Crystal structure of EP300 HAT domain in complex with compound (+)-3 提交 2021-09-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1159–1519（361 aa）片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666) 链 A 1581–1666（86 aa）片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)	突变：Y1467E 突变：Y1467E	ZN ZINC ION × 3 6QI [(6R)-6-(1H-indazol-4-ylmethyl)-1,4-oxazepan-4-yl]-[1-(4-methoxyphenyl)cyclopentyl]methanone × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；15% PEG3350, 0.1 M HEPES (pH7.0)	分辨率 2.30 Å R-free 0.250
7VHY Crystal structure of EP300 HAT domain in complex with compound (+)-3 提交 2021-09-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1159–1519（361 aa）片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666) 链 B 1581–1666（86 aa）片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)	突变：Y1467E 突变：Y1467E	ZN ZINC ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；15% PEG3350, 0.1 M HEPES (pH7.0)	分辨率 2.30 Å R-free 0.250
7VHZ Crystal structure of EP300 HAT domain in complex with compound 7 提交 2021-09-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1159–1519（361 aa）片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666) 链 A 1581–1666（86 aa）片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)	突变：Y1467E 突变：Y1467E	ZN ZINC ION × 3 6TI (2R)-N-(2H-indazol-4-yl)-1-[1-(4-methoxyphenyl)cyclopentyl]carbonyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；16% PEG3350, 0.1 M HEPES (pH 7.0)	分辨率 2.00 Å R-free 0.219
7VHZ Crystal structure of EP300 HAT domain in complex with compound 7 提交 2021-09-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1159–1519（361 aa）片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666) 链 B 1581–1666（86 aa）片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)	突变：Y1467E 突变：Y1467E	ZN ZINC ION × 3 6TI (2R)-N-(2H-indazol-4-yl)-1-[1-(4-methoxyphenyl)cyclopentyl]carbonyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；16% PEG3350, 0.1 M HEPES (pH 7.0)	分辨率 2.00 Å R-free 0.219
7VI0 Crystal structure of EP300 HAT domain in complex with compound 11 提交 2021-09-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1159–1519（361 aa）片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666) 链 A 1581–1666（86 aa）片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)	突变：Y1467E 突变：Y1467E	ZN ZINC ION × 3 6YI (4S)-N-(3H-indazol-4-yl)-3-[1-(4-methoxyphenyl)cyclopentyl]carbonyl-1,1-bis(oxidanylidene)-1,3-thiazolidine-4-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；12% PEG3350, 0.1 M HEPES (pH 7.0)	分辨率 2.10 Å R-free 0.235
7VI0 Crystal structure of EP300 HAT domain in complex with compound 11 提交 2021-09-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1159–1519（361 aa）片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666) 链 B 1581–1666（86 aa）片段：(UNP residues 1159-1519)-linker-(UNP residues 1581-1666)	突变：Y1467E 突变：Y1467E	ZN ZINC ION × 3 6YI (4S)-N-(3H-indazol-4-yl)-3-[1-(4-methoxyphenyl)cyclopentyl]carbonyl-1,1-bis(oxidanylidene)-1,3-thiazolidine-4-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；12% PEG3350, 0.1 M HEPES (pH 7.0)	分辨率 2.10 Å R-free 0.235
7W9V Cryo-EM structure of nucleosome in complex with p300 acetyltransferase catalytic core (complex I) 提交 2021-12-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 K 1035–1519（485 aa）链 K 1581–1720（140 aa）	突变：Y1467F 突变：Y1467F	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.95 Å
7XEZ NMR solution structures of p300 TAZ2 domain in complex with BRD4-NUT F1c domain binding motif #2 提交 2022-03-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1723–1812（90 aa）	突变：C1738A, C1746A, C1789A, C1790A	ZN ZINC ION × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.3；298 K；压力 1 NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] p300 TAZ2 domain in fusion with BRD4-NUT F1c domain binding motif #2, 200 mM sodium phosphate, 3 mM [U-100% 2H] DTT, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] p300 TAZ2 domain in fusion with BRD4-NUT F1c domain binding motif #2, 200 mM sodium phosphate, 3 mM [U-100% 2H] DTT, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
7XFG NMR solution structures of p300 TAZ2 domain in complex with BRD4-NUT F1c domain binding motif #1 提交 2022-04-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1723–1812（90 aa）片段：TAZ2 domain	突变：C1738A, C1746A, C1789A, C1790A	ZN ZINC ION × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.3；298 K；离子强度（mmCIF原始值）null；压力 1 NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] p300 TAZ2 domain, 1.5 mM BRD4-NUT fusion protein F1c domain binding motif #1, 200 mM sodium phosphate, 3.0 mM [U-100% 2H] DTT, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] p300 TAZ2 domain, 1.5 mM BRD4-NUT fusion protein F1c domain binding motif #1, 200 mM sodium phosphate, 3.0 mM [U-100% 2H] DTT, 100% D2O \| 100% D2O	分辨率未提供
8E1D NMR-derived ensemble of the TAZ2 domain of p300 bound to the microphthalmia-associated transcription factor 提交 2022-08-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 1723–1812（90 aa）	突变：C1738A C1746A C1789A C1790A	ZN ZINC ION × 3	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6；308 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1 NMR样品组成 20 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid (MES), 5 mM beta mercaptoethanol, 10 uM Zinc chloride, 1 mM [U-13C; U-15N] Microphthalmia-associated transcription factor, 1.2 mM TAZ2 domain of p300, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O NMR样品组成 20 mM 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid (MES), 5 mM beta mercaptoethanol, 10 mM Zinc chloride, 1.15 mM Microphthalmia-associated transcription factor, 0.95 mM [U-13C; U-15N] TAZ2 domain of p300, 95% H2O/5% D2O \| 95% H2O/5% D2O	分辨率未提供
8FVF Bromodomain of EP300 liganded with CCS-1477 提交 2023-01-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1048–1161（114 aa）片段：bromodomain	未记录	JHL (6S)-1-[3,4-bis(fluoranyl)phenyl]-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-(4-methoxycyclohexyl)benzimidazol-2-yl]piperidin-2-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NI NICKEL (II) ION × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1M Sodium chloride, 0.1M HEPES pH7.5, 1.6M Ammonium sulfate	分辨率 2.10 Å R-free 0.239
8FVF Bromodomain of EP300 liganded with CCS-1477 提交 2023-01-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1048–1161（114 aa）片段：bromodomain	未记录	JHL (6S)-1-[3,4-bis(fluoranyl)phenyl]-6-[5-(3,5-dimethyl-1,2-oxazol-4-yl)-1-(4-methoxycyclohexyl)benzimidazol-2-yl]piperidin-2-one × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 NI NICKEL (II) ION × 3 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；0.1M Sodium chloride, 0.1M HEPES pH7.5, 1.6M Ammonium sulfate	分辨率 2.10 Å R-free 0.239
8GZC Crystal structure of EP300 HAT domain in complex with compound 10 提交 2022-09-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1159–1519（361 aa）链 A 1581–1666（86 aa）	突变：Y1467E 突变：Y1467E	ZN ZINC ION × 3 KQO (2~{R},4~{R})-4-fluoranyl-1-[1-(4-methoxyphenyl)cyclohexyl]carbonyl-~{N}-(1~{H}-pyrazolo[4,3-b]pyridin-5-yl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；15% PEG3350, 0.1 M HEPES	分辨率 2.00 Å R-free 0.227
8GZC Crystal structure of EP300 HAT domain in complex with compound 10 提交 2022-09-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1159–1519（361 aa）链 B 1581–1666（86 aa）	突变：Y1467E 突变：Y1467E	ZN ZINC ION × 3 KQO (2~{R},4~{R})-4-fluoranyl-1-[1-(4-methoxyphenyl)cyclohexyl]carbonyl-~{N}-(1~{H}-pyrazolo[4,3-b]pyridin-5-yl)pyrrolidine-2-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；15% PEG3350, 0.1 M HEPES	分辨率 2.00 Å R-free 0.227
8HAG Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 1 (3.2 angstrom resolution) 提交 2022-10-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 K 1048–1836（789 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8HAH Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 2 (3.9 angstrom resolution) 提交 2022-10-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 K 1048–1836（789 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
8HAI Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 1 (4.7 angstrom resolution) 提交 2022-10-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 K 1048–1836（789 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.70 Å
8HAJ Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 2 (4.8 angstrom resolution) 提交 2022-10-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 K 1048–1836（789 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.80 Å
8HAK Cryo-EM structure of the p300 catalytic core bound to the H4K12acK16ac nucleosome, class 4 (4.5 angstrom resolution) 提交 2022-10-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric	链 N 1048–1836（789 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å
9IT5 p300 KAT domain in complex with KB528 提交 2024-07-19	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1287–1666（380 aa）片段：KAT domain	突变：K1637R/M1652G	A1L3B 4-[(2~{S})-1-[[(~{R})-[(3~{S})-7-(1-methylpyrazol-4-yl)-2,3-dihydro-1~{H}-pyrido[2,3-b][1,4]oxazin-3-yl]-phenyl-methyl]amino]propan-2-yl]benzenecarbonitrile × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；HM(PEGs-E9)-D6 (0.18M NH4Cl, 24% PEG 3350)	分辨率 2.00 Å R-free 0.238
9IT5 p300 KAT domain in complex with KB528 提交 2024-07-19	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 1287–1666（380 aa）片段：KAT domain	突变：K1637R/M1652G	A1L3B 4-[(2~{S})-1-[[(~{R})-[(3~{S})-7-(1-methylpyrazol-4-yl)-2,3-dihydro-1~{H}-pyrido[2,3-b][1,4]oxazin-3-yl]-phenyl-methyl]amino]propan-2-yl]benzenecarbonitrile × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；HM(PEGs-E9)-D6 (0.18M NH4Cl, 24% PEG 3350)	分辨率 2.00 Å R-free 0.238
9JEJ Crystal structure of human EP300 KIX domain (L644C mutant) 提交 2024-09-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 566–652（87 aa）片段：KIX domain	突变：L644C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium Chloride, 0.1 M Sodium Citrate : Citric Acid pH5.5, 1 M Ammonium Phosphate Dibasic	分辨率 2.90 Å R-free 0.281
9JEJ Crystal structure of human EP300 KIX domain (L644C mutant) 提交 2024-09-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 566–652（87 aa）片段：KIX domain	突变：L644C	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium Chloride, 0.1 M Sodium Citrate : Citric Acid pH5.5, 1 M Ammonium Phosphate Dibasic	分辨率 2.90 Å R-free 0.281
9JEJ Crystal structure of human EP300 KIX domain (L644C mutant) 提交 2024-09-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 566–652（87 aa）片段：KIX domain	突变：L644C	ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Sodium Chloride, 0.1 M Sodium Citrate : Citric Acid pH5.5, 1 M Ammonium Phosphate Dibasic	分辨率 2.90 Å R-free 0.281
9JUT X-ray crystal structure of Y16524 in EP300 提交 2024-10-08	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1040–1161（122 aa）	未记录	A1EDM (6~{S})-1-(3-chloranyl-4-methoxy-phenyl)-6-[4-(3-methyl-1,2-benzoxazol-5-yl)-1-[(2~{S})-2-morpholin-4-ylpropyl]imidazol-2-yl]piperidin-2-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；60% v/v Tacsimate pH 7.0, 0.1 M BIS-TRIS propane pH 7.0	分辨率 2.13 Å R-free 0.234
9MZA Chemically Hijacked BCL6-TCIP3-p300 Complex 提交 2025-01-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1040–1161（122 aa）链 D 1040–1161（122 aa）	未记录	A1BUC 1-{1-[5-({1-[5-chloro-4-({8-methoxy-1-methyl-3-[2-(methylamino)-2-oxoethoxy]-2-oxo-1,2-dihydroquinolin-6-yl}amino)pyrimidin-2-yl]piperidine-4-carbonyl}amino)pentanoyl]piperidin-4-yl}-3-[(6M)-7-(difluoromethyl)-6-(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)-3,4-dihydroquinolin-1(2H)-yl]-N-methyl-1,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridine-5-carboxamide × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；0.15 M DL-Malic acid pH 7.0, PEG 3,350 20%	分辨率 2.10 Å R-free 0.277

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	EP300_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–235； UniProt 1287–1519 作者链 A； PDB构建体 242–323； UniProt 1582–1663 作者链 B； PDB构建体 3–235； UniProt 1287–1519 作者链 B； PDB构建体 242–323； UniProt 1582–1663

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6pgu
沉积日期 deposition_date	2019-06-24
结构标题 title	Crystal structure of the p300 acetyltransferase domain with allosteric inhibitor CPI-076 and CoA
关键词 keywords	;EP300, p300 acetyltransferase, chromatin modification, epigenetics, inhibitor, allosteric, TRANSFERASE, TRANSFERASE-INHIBITOR complex ;; TRANSFERASE/INHIBITOR
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	29.30 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	28.32 Å
零角强度 I(0) i0	90090100.00
分子量 molecular_weight	74548.0 kDa
排除体积 excluded_volume	93222 Å³
包络体积 envelope_volume	114820 Å³
水化壳体积 shell_volume	33744 Å³
包络直径 envelope_diameter	97.2 Å
壳层 Rg shell_rg	35.54 Å
包络 Rg envelope_rg	28.07 Å
形状 Rg shape_rg	28.29 Å
总 Rg total_rg	29.11 Å
总原子数 total_atoms	5242
残基数 n_residues	628
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	90.9 Å
Rg (实空间) rg_real	29.25 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.67 Å
I(0) (实空间) i0_real	9.0090e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.3720e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	29.28 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	90090000.0000
解质量估计 total_estimate	0.9087
解质量评级 solution_quality	EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	30.3 Å
偏度 Skewness skewness	0.253
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.578
角度范围 angular_range	— – 0.2700 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	22520000.0000
实空间数据点数 n_real_points	55
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.955; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.944

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Histone acetyltransferase p300
分子量 formula_weight	37185.5 kDa
EC 编号 ec_number	2.3.1.48,2.3.1.-
突变 mutation	Y1467F, loop deletion
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	5754

GSKFSAKRLPSTRLGTFLENRVNDFLRRQNHPESGEVTVRVVHASDKTVEVKPGMKARFVDSGEMAESFPYRTKALFAFEEIDGVDLCFFGMHVQEYGSDCPPPNQRRVYISYLDSVHFFRPKCLRTAVYHEILIGYLEYVKKLGYTTGHIWACPPSEGDDYIFHCHPPDQKIPKPKRLQEWFKKMLDKAVSERIVHDYKDIFKQATEDRLTSAKELPYFEGDFWPNVLEESIKESGGSGSQKLYATMEKHKEVFFVIRLIAGPAANSLPPIVDPDPLIPCDLMDGRDAFLTLARDKHLEFSSLRRAQWSTMCMLVELHTQSQ

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	COENZYME A
分子量 formula_weight	767.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	N-(thiophen-2-yl)acetamide
分子量 formula_weight	141.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	459

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	66.253 Å
晶胞边长 b length_b	97.599 Å
晶胞边长 c length_c	105.932 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.720 Å
最低分辨率 resolution_low	50.000 Å
R 因子 r_factor	0.1673
R_work r_work	0.1652
R_free r_free	0.2063

fit	/app/data/saxs_computation/pg/6pgu/6pgu.fit
pddf	/app/data/pr_computation/pg/6pgu/6pgu.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/pg/6pgu/6pgu.dat