SAXSdb — 6qnt

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Fiber protein

Human adenovirus B serotype 3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Desmoglein-2 × 1 （Q14126）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SPIKE_ADE03
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–49； UniProt 130–318 作者链 B； PDB构建体 1–49； UniProt 130–318 作者链 C； PDB构建体 1–49； UniProt 130–318

Desmoglein-2

Homo sapiens

UniProt Q14126

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Fiber protein × 3 （P04501）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	DSG2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–195； UniProt 157–380

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6qnt
沉积日期 deposition_date	2019-02-12
结构标题 title	Human Adenovirus type 3 fiber knob in complex with one copy of Desmoglein-2
关键词 keywords	virus receptor, adenovirus, vector, VIRAL PROTEIN; VIRAL PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6qnt__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6qnt__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6qnt__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	30.06 Å
Rg（电子密度）	29.05 Å
总 Rg	29.83 Å
原子数	5774
残基数	733
排除体积	103410 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6qnt__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Fiber protein
分子量 formula_weight	20954.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C
原子数 atom_count	5774

NNTLWTGPKPEANCIIEYGKQNPDSKLTLILVKNGGIVNGYVTLMGASDYVNTLFKNKNVSINVELYFDATGHILPDSSSLKTDLELKYKQTADFSARGFMPSTTAYPFVLPNGTHNENYIFGQCYYKASDGALFPLEVTVMLNKRLPDSRTSYVMTFLWSLNAGLAPETTQATLITSPFTFSYIRED

来源 Source

来源生物 organism	Human adenovirus B serotype 3
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	45659
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Desmoglein-2
分子量 formula_weight	23268.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

PVFTQDVFVGSVEELSAAHTLVMKINATDAEPNTLSKISYRIVSLEPAYPPVFYLNKDTGEIYTTSVTLDREEHSSYTLTVEARDGVKQAQVQIRILDVNDNIPVVELEGMVEENQVNVEVTRIKVFDADEIGSDNWLANFTFASGNEGGYFHIETDAQTNEGIVTLIKEVYMKNLDFSVIVANKAAFHKSIRSKYKPTPIPIKVKVK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id	6qntA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	90 — Adenovirus Type 5 Fiber Protein (Receptor Binding Domain)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Adenovirus pIV-related, attachment domain

结构域编号 domain_id	6qntB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	90 — Adenovirus Type 5 Fiber Protein (Receptor Binding Domain)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Adenovirus pIV-related, attachment domain

结构域编号 domain_id	6qntC00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	90 — Adenovirus Type 5 Fiber Protein (Receptor Binding Domain)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Adenovirus pIV-related, attachment domain

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.50 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	139958

Human Adenovirus type 3 fiber knob in complex with one copy of Desmoglein-2

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Fiber protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Desmoglein-2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6qnt__assembly_1__model_1

6qnt__assembly_1__model_1 | I(q)

6qnt__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (1)

Human Adenovirus type 3 fiber knob in complex with one copy of Desmoglein-2

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Fiber protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Desmoglein-2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6qnt__assembly_1__model_1

6qnt__assembly_1__model_1 | I(q)

6qnt__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (1)