6r7f

Structural basis of Cullin-2 RING E3 ligase regulation by the COP9 signalosome

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

COP9 signalosome complex subunit 1

Homo sapiens

UniProt Q13098

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 14 COP9 signalosome complex subunit 2 × 1 (P61201) COP9 signalosome complex subunit 3 × 1 (Q9UNS2) COP9 signalosome complex subunit 4 × 1 (Q9BT78) COP9 signalosome complex subunit 5 × 1 (Q92905) COP9 signalosome complex subunit 6 × 1 (Q7L5N1) COP9 signalosome complex subunit 8 × 1 (Q99627) COP9 signalosome complex subunit 7b × 1 (Q9H9Q2) von Hippel-Lindau disease tumor suppressor × 1 (P40337) Elongin-B × 1 (Q15370) Elongin-C × 1 (Q15369) Cullin-2 × 1 (Q13617) E3 ubiquitin-protein ligase RBX1 × 1 NEDD8 × 1 (Q15843) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 CSN1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–433; UniProt 37–469

COP9 signalosome complex subunit 2

Homo sapiens

UniProt P61201

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 14 COP9 signalosome complex subunit 1 × 1 (Q13098) COP9 signalosome complex subunit 3 × 1 (Q9UNS2) COP9 signalosome complex subunit 4 × 1 (Q9BT78) COP9 signalosome complex subunit 5 × 1 (Q92905) COP9 signalosome complex subunit 6 × 1 (Q7L5N1) COP9 signalosome complex subunit 8 × 1 (Q99627) COP9 signalosome complex subunit 7b × 1 (Q9H9Q2) von Hippel-Lindau disease tumor suppressor × 1 (P40337) Elongin-B × 1 (Q15370) Elongin-C × 1 (Q15369) Cullin-2 × 1 (Q13617) E3 ubiquitin-protein ligase RBX1 × 1 NEDD8 × 1 (Q15843) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 CSN2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–443; UniProt 1–443

COP9 signalosome complex subunit 3

Homo sapiens

UniProt Q9UNS2

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 14 COP9 signalosome complex subunit 1 × 1 (Q13098) COP9 signalosome complex subunit 2 × 1 (P61201) COP9 signalosome complex subunit 4 × 1 (Q9BT78) COP9 signalosome complex subunit 5 × 1 (Q92905) COP9 signalosome complex subunit 6 × 1 (Q7L5N1) COP9 signalosome complex subunit 8 × 1 (Q99627) COP9 signalosome complex subunit 7b × 1 (Q9H9Q2) von Hippel-Lindau disease tumor suppressor × 1 (P40337) Elongin-B × 1 (Q15370) Elongin-C × 1 (Q15369) Cullin-2 × 1 (Q13617) E3 ubiquitin-protein ligase RBX1 × 1 NEDD8 × 1 (Q15843) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 CSN3_HUMAN
Isoform Q9UNS2-2
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–403; UniProt 1–403

COP9 signalosome complex subunit 4

Homo sapiens

UniProt Q9BT78

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 14 COP9 signalosome complex subunit 1 × 1 (Q13098) COP9 signalosome complex subunit 2 × 1 (P61201) COP9 signalosome complex subunit 3 × 1 (Q9UNS2) COP9 signalosome complex subunit 5 × 1 (Q92905) COP9 signalosome complex subunit 6 × 1 (Q7L5N1) COP9 signalosome complex subunit 8 × 1 (Q99627) COP9 signalosome complex subunit 7b × 1 (Q9H9Q2) von Hippel-Lindau disease tumor suppressor × 1 (P40337) Elongin-B × 1 (Q15370) Elongin-C × 1 (Q15369) Cullin-2 × 1 (Q13617) E3 ubiquitin-protein ligase RBX1 × 1 NEDD8 × 1 (Q15843) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 CSN4_HUMAN
Isoform Q9BT78-2
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–406; UniProt 1–406

COP9 signalosome complex subunit 5

Homo sapiens

UniProt Q92905

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 14 COP9 signalosome complex subunit 1 × 1 (Q13098) COP9 signalosome complex subunit 2 × 1 (P61201) COP9 signalosome complex subunit 3 × 1 (Q9UNS2) COP9 signalosome complex subunit 4 × 1 (Q9BT78) COP9 signalosome complex subunit 6 × 1 (Q7L5N1) COP9 signalosome complex subunit 8 × 1 (Q99627) COP9 signalosome complex subunit 7b × 1 (Q9H9Q2) von Hippel-Lindau disease tumor suppressor × 1 (P40337) Elongin-B × 1 (Q15370) Elongin-C × 1 (Q15369) Cullin-2 × 1 (Q13617) E3 ubiquitin-protein ligase RBX1 × 1 NEDD8 × 1 (Q15843) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CSN5_HUMAN
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–311; UniProt 24–334

COP9 signalosome complex subunit 6

Homo sapiens

UniProt Q7L5N1

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 14 COP9 signalosome complex subunit 1 × 1 (Q13098) COP9 signalosome complex subunit 2 × 1 (P61201) COP9 signalosome complex subunit 3 × 1 (Q9UNS2) COP9 signalosome complex subunit 4 × 1 (Q9BT78) COP9 signalosome complex subunit 5 × 1 (Q92905) COP9 signalosome complex subunit 8 × 1 (Q99627) COP9 signalosome complex subunit 7b × 1 (Q9H9Q2) von Hippel-Lindau disease tumor suppressor × 1 (P40337) Elongin-B × 1 (Q15370) Elongin-C × 1 (Q15369) Cullin-2 × 1 (Q13617) E3 ubiquitin-protein ligase RBX1 × 1 NEDD8 × 1 (Q15843) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CSN6_HUMAN
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 1–288; UniProt 29–316

COP9 signalosome complex subunit 8

Homo sapiens

UniProt Q99627

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 14 COP9 signalosome complex subunit 1 × 1 (Q13098) COP9 signalosome complex subunit 2 × 1 (P61201) COP9 signalosome complex subunit 3 × 1 (Q9UNS2) COP9 signalosome complex subunit 4 × 1 (Q9BT78) COP9 signalosome complex subunit 5 × 1 (Q92905) COP9 signalosome complex subunit 6 × 1 (Q7L5N1) COP9 signalosome complex subunit 7b × 1 (Q9H9Q2) von Hippel-Lindau disease tumor suppressor × 1 (P40337) Elongin-B × 1 (Q15370) Elongin-C × 1 (Q15369) Cullin-2 × 1 (Q13617) E3 ubiquitin-protein ligase RBX1 × 1 NEDD8 × 1 (Q15843) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 CSN8_HUMAN
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–209; UniProt 1–209

COP9 signalosome complex subunit 7b

Homo sapiens

UniProt Q9H9Q2

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 14 COP9 signalosome complex subunit 1 × 1 (Q13098) COP9 signalosome complex subunit 2 × 1 (P61201) COP9 signalosome complex subunit 3 × 1 (Q9UNS2) COP9 signalosome complex subunit 4 × 1 (Q9BT78) COP9 signalosome complex subunit 5 × 1 (Q92905) COP9 signalosome complex subunit 6 × 1 (Q7L5N1) COP9 signalosome complex subunit 8 × 1 (Q99627) von Hippel-Lindau disease tumor suppressor × 1 (P40337) Elongin-B × 1 (Q15370) Elongin-C × 1 (Q15369) Cullin-2 × 1 (Q13617) E3 ubiquitin-protein ligase RBX1 × 1 NEDD8 × 1 (Q15843) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 CSN7B_HUMAN
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–208; UniProt 8–215

von Hippel-Lindau disease tumor suppressor

Homo sapiens

UniProt P40337

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 14 COP9 signalosome complex subunit 1 × 1 (Q13098) COP9 signalosome complex subunit 2 × 1 (P61201) COP9 signalosome complex subunit 3 × 1 (Q9UNS2) COP9 signalosome complex subunit 4 × 1 (Q9BT78) COP9 signalosome complex subunit 5 × 1 (Q92905) COP9 signalosome complex subunit 6 × 1 (Q7L5N1) COP9 signalosome complex subunit 8 × 1 (Q99627) COP9 signalosome complex subunit 7b × 1 (Q9H9Q2) Elongin-B × 1 (Q15370) Elongin-C × 1 (Q15369) Cullin-2 × 1 (Q13617) E3 ubiquitin-protein ligase RBX1 × 1 NEDD8 × 1 (Q15843) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 VHL_HUMAN
Isoform P40337-3
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 V; PDB构建体 1–160; UniProt 1–160

Elongin-B

Homo sapiens

UniProt Q15370

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 14 COP9 signalosome complex subunit 1 × 1 (Q13098) COP9 signalosome complex subunit 2 × 1 (P61201) COP9 signalosome complex subunit 3 × 1 (Q9UNS2) COP9 signalosome complex subunit 4 × 1 (Q9BT78) COP9 signalosome complex subunit 5 × 1 (Q92905) COP9 signalosome complex subunit 6 × 1 (Q7L5N1) COP9 signalosome complex subunit 8 × 1 (Q99627) COP9 signalosome complex subunit 7b × 1 (Q9H9Q2) von Hippel-Lindau disease tumor suppressor × 1 (P40337) Elongin-C × 1 (Q15369) Cullin-2 × 1 (Q13617) E3 ubiquitin-protein ligase RBX1 × 1 NEDD8 × 1 (Q15843) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ELOB_HUMAN
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 P; PDB构建体 1–118; UniProt 1–118

Elongin-C

Homo sapiens

UniProt Q15369

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 14 COP9 signalosome complex subunit 1 × 1 (Q13098) COP9 signalosome complex subunit 2 × 1 (P61201) COP9 signalosome complex subunit 3 × 1 (Q9UNS2) COP9 signalosome complex subunit 4 × 1 (Q9BT78) COP9 signalosome complex subunit 5 × 1 (Q92905) COP9 signalosome complex subunit 6 × 1 (Q7L5N1) COP9 signalosome complex subunit 8 × 1 (Q99627) COP9 signalosome complex subunit 7b × 1 (Q9H9Q2) von Hippel-Lindau disease tumor suppressor × 1 (P40337) Elongin-B × 1 (Q15370) Cullin-2 × 1 (Q13617) E3 ubiquitin-protein ligase RBX1 × 1 NEDD8 × 1 (Q15843) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ELOC_HUMAN
Isoform —
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 Q; PDB构建体 1–112; UniProt 1–112

Cullin-2

Homo sapiens

UniProt Q13617

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 14 COP9 signalosome complex subunit 1 × 1 (Q13098) COP9 signalosome complex subunit 2 × 1 (P61201) COP9 signalosome complex subunit 3 × 1 (Q9UNS2) COP9 signalosome complex subunit 4 × 1 (Q9BT78) COP9 signalosome complex subunit 5 × 1 (Q92905) COP9 signalosome complex subunit 6 × 1 (Q7L5N1) COP9 signalosome complex subunit 8 × 1 (Q99627) COP9 signalosome complex subunit 7b × 1 (Q9H9Q2) von Hippel-Lindau disease tumor suppressor × 1 (P40337) Elongin-B × 1 (Q15370) Elongin-C × 1 (Q15369) E3 ubiquitin-protein ligase RBX1 × 1 NEDD8 × 1 (Q15843) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CUL2_HUMAN
Isoform Q13617-2
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 O; PDB构建体 1–745; UniProt 20–764

NEDD8

Homo sapiens

UniProt Q15843

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 14 COP9 signalosome complex subunit 1 × 1 (Q13098) COP9 signalosome complex subunit 2 × 1 (P61201) COP9 signalosome complex subunit 3 × 1 (Q9UNS2) COP9 signalosome complex subunit 4 × 1 (Q9BT78) COP9 signalosome complex subunit 5 × 1 (Q92905) COP9 signalosome complex subunit 6 × 1 (Q7L5N1) COP9 signalosome complex subunit 8 × 1 (Q99627) COP9 signalosome complex subunit 7b × 1 (Q9H9Q2) von Hippel-Lindau disease tumor suppressor × 1 (P40337) Elongin-B × 1 (Q15370) Elongin-C × 1 (Q15369) Cullin-2 × 1 (Q13617) E3 ubiquitin-protein ligase RBX1 × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NEDD8_HUMAN
Isoform —
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 N; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6r7f
沉积日期 deposition_date2019-03-28
结构标题 titleStructural basis of Cullin-2 RING E3 ligase regulation by the COP9 signalosome
关键词 keywordsCullin-Ring E3 Ligase COP9 signalosome neddylation, LIGASE; LIGASE
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6r7f__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6r7f__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

6r7f__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)59.60 Å
Rg(电子密度)59.31 Å
总 Rg59.41 Å
原子数31558
残基数3931
排除体积563520 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 6r7f__assembly_1__model_1 tetradecameric (14) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (14)

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7. 引用文献 (1)